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Oryza punctata (Oryza_punctata_v1.2)
Description

RING-type E3 ubiquitin transferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A0E0JRF4]

Location
About this transcript

This transcript has 1 exon, is annotated with 16 domains and features and maps to 14 oligo probes.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OPUNC01G37150.11212403aa
 
Protein coding
A0A0E0JRF4 Ensembl Canonical
Variants
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Markup
  • loaded
                                                                          
     1 ATGGCGAGCGCGGCGGCCGAGGTGCCGTCCTACTTCGTCTGCCCGATCTCGCTGCAGCTC     60
     1 ATGGCGAGCGCGGCGGCCGAGGTGCCGTCCTACTTCGTCTGCCCGATCTCGCTGCAGCTC     60
     1 -M--A--S--A--A--A--E--V--P--S--Y--F--V--C--P--I--S--L--Q--L-     20

                                                                          
    61 ATGCGCGACCCCGTCACGCTCCCCACGGGGATCTCGTATGACCGCGCCGCGATCGCGCGG    120
    61 ATGCGCGACCCCGTCACGCTCCCCACGGGGATCTCGTATGACCGCGCCGCGATCGCGCGG    120
    21 -M--R--D--P--V--T--L--P--T--G--I--S--Y--D--R--A--A--I--A--R-     40

                                                                          
   121 TGGCTCGCCGCGCCGGCTCGCCGGACGTGTCCCGTCACGCGGCAGCCGCTCGAGCTCGGG    180
   121 TGGCTCGCCGCGCCGGCTCGCCGGACGTGTCCCGTCACGCGGCAGCCGCTCGAGCTCGGG    180
    41 -W--L--A--A--P--A--R--R--T--C--P--V--T--R--Q--P--L--E--L--G-     60

                                                                          
   181 CTGGAGCTCACGCCCAACCACACCCTCCGCCGCCTGATCCAGTCGTGGGCGGCCTCCGTC    240
   181 CTGGAGCTCACGCCCAACCACACCCTCCGCCGCCTGATCCAGTCGTGGGCGGCCTCCGTC    240
    61 -L--E--L--T--P--N--H--T--L--R--R--L--I--Q--S--W--A--A--S--V-     80

                                                                          
   241 TCCCCCGGGTCGGCCGTGGACGAGGAGGTGGCCGCGCTACGCCCCGTGTCGAGCGACGAG    300
   241 TCCCCCGGGTCGGCCGTGGACGAGGAGGTGGCCGCGCTACGCCCCGTGTCGAGCGACGAG    300
    81 -S--P--G--S--A--V--D--E--E--V--A--A--L--R--P--V--S--S--D--E-    100

                                                                          
   301 GTTGCGTCGCTCCTGTCCGACGCCACCGCGGCGCAGGTCGGCGCGCTCAGGAGGCTGCGG    360
   301 GTTGCGTCGCTCCTGTCCGACGCCACCGCGGCGCAGGTCGGCGCGCTCAGGAGGCTGCGG    360
   101 -V--A--S--L--L--S--D--A--T--A--A--Q--V--G--A--L--R--R--L--R-    120

                                                                          
   361 GAGCTGGCGGCCGAGTGCGAAGATAGCAGGGCAATGCTGGAGTCCCAGGACGGGGTGTTC    420
   361 GAGCTGGCGGCCGAGTGCGAAGATAGCAGGGCAATGCTGGAGTCCCAGGACGGGGTGTTC    420
   121 -E--L--A--A--E--C--E--D--S--R--A--M--L--E--S--Q--D--G--V--F-    140

                                                                          
   421 GACGTGCTGTCTCGTGTCGTGACCAACGGCAGCGCCTGCTCGACGGCGCGGGAGGAGGCG    480
   421 GACGTGCTGTCTCGTGTCGTGACCAACGGCAGCGCCTGCTCGACGGCGCGGGAGGAGGCG    480
   141 -D--V--L--S--R--V--V--T--N--G--S--A--C--S--T--A--R--E--E--A-    160

                                                                          
   481 GTTGGTGTCCTCGCGTCGCTCCGGATCCCGGAGCAGGAGCTGGTCGGCGTCTCGACCAGG    540
   481 GTTGGTGTCCTCGCGTCGCTCCGGATCCCGGAGCAGGAGCTGGTCGGCGTCTCGACCAGG    540
   161 -V--G--V--L--A--S--L--R--I--P--E--Q--E--L--V--G--V--S--T--R-    180

                                                                          
   541 CACGGTAACCTGGCGGAGTCCCTCACGGCCGTGCTCCGCTCGTCGAACCTCCAGTCGCGG    600
   541 CACGGTAACCTGGCGGAGTCCCTCACGGCCGTGCTCCGCTCGTCGAACCTCCAGTCGCGG    600
   181 -H--G--N--L--A--E--S--L--T--A--V--L--R--S--S--N--L--Q--S--R-    200

                                                                          
   601 GCGCACGCGGTGCAGCTCGTGAGGACACTCGCCGACGCGGTGGTCCCGGCGTGGGTGATC    660
   601 GCGCACGCGGTGCAGCTCGTGAGGACACTCGCCGACGCGGTGGTCCCGGCGTGGGTGATC    660
   201 -A--H--A--V--Q--L--V--R--T--L--A--D--A--V--V--P--A--W--V--I-    220

                                                                          
   661 GACCTCAACACGGAGCTCCTCGCCGAGGTGGTCGGCGTGGTCCGCGACCGCGTCTCGACG    720
   661 GACCTCAACACGGAGCTCCTCGCCGAGGTGGTCGGCGTGGTCCGCGACCGCGTCTCGACG    720
   221 -D--L--N--T--E--L--L--A--E--V--V--G--V--V--R--D--R--V--S--T-    240

                                                                          
   721 CGGGCCACCAAGGCGTCCCTCCACGCGCTCGCCGCGCTGTGCCCGTACGGCCGGCACCGC    780
   721 CGGGCCACCAAGGCGTCCCTCCACGCGCTCGCCGCGCTGTGCCCGTACGGCCGGCACCGC    780
   241 -R--A--T--K--A--S--L--H--A--L--A--A--L--C--P--Y--G--R--H--R-    260

                                                                          
   781 GTGAAGATCGTGGGCGCCGGCGCGGTGGCGGCGCTGGTGGAGCTGCTGCTGGACGAGCCC    840
   781 GTGAAGATCGTGGGCGCCGGCGCGGTGGCGGCGCTGGTGGAGCTGCTGCTGGACGAGCCC    840
   261 -V--K--I--V--G--A--G--A--V--A--A--L--V--E--L--L--L--D--E--P-    280

                                                                          
   841 GAGCGGCGCGTGTGCGAGCTGGCGCTGGCCGTGCTGGACCGGCTGTGCACGTGCGCGGAG    900
   841 GAGCGGCGCGTGTGCGAGCTGGCGCTGGCCGTGCTGGACCGGCTGTGCACGTGCGCGGAG    900
   281 -E--R--R--V--C--E--L--A--L--A--V--L--D--R--L--C--T--C--A--E-    300

                                                                          
   901 GGGCGCGCGGAGCTGGTGGCGCACGCGGCGGGAGTGGCCGTGGTGGGGAAGAAGGTGCTG    960
   901 GGGCGCGCGGAGCTGGTGGCGCACGCGGCGGGAGTGGCCGTGGTGGGGAAGAAGGTGCTG    960
   301 -G--R--A--E--L--V--A--H--A--A--G--V--A--V--V--G--K--K--V--L-    320

                                                                          
   961 CGGGTGTCGGAGGCGGCGAGCGAGCGGGCGGTGCGCGTGCTGCGGTCGGTGGCGCGGCAC   1020
   961 CGGGTGTCGGAGGCGGCGAGCGAGCGGGCGGTGCGCGTGCTGCGGTCGGTGGCGCGGCAC   1020
   321 -R--V--S--E--A--A--S--E--R--A--V--R--V--L--R--S--V--A--R--H-    340

                                                                          
  1021 GCGGCGACGCCGGCGGTGCTGCAGGAGATGGCGCAGTGCGGCGTGGTGGGGAAGCTGTGC   1080
  1021 GCGGCGACGCCGGCGGTGCTGCAGGAGATGGCGCAGTGCGGCGTGGTGGGGAAGCTGTGC   1080
   341 -A--A--T--P--A--V--L--Q--E--M--A--Q--C--G--V--V--G--K--L--C-    360

                                                                          
  1081 CTGGCGCTGCGGTCGGAGCAGTGCGGGGTGAAGACCAAGGAGAAGGCGCACGAGGTGCTC   1140
  1081 CTGGCGCTGCGGTCGGAGCAGTGCGGGGTGAAGACCAAGGAGAAGGCGCACGAGGTGCTC   1140
   361 -L--A--L--R--S--E--Q--C--G--V--K--T--K--E--K--A--H--E--V--L-    380

                                                                          
  1141 AAGCTGCACTGCAGGGTCTGGAGGGCCTCGCCATGCTTGTCTCCCAGCTTCTTGGCGCTC   1200
  1141 AAGCTGCACTGCAGGGTCTGGAGGGCCTCGCCATGCTTGTCTCCCAGCTTCTTGGCGCTC   1200
   381 -K--L--H--C--R--V--W--R--A--S--P--C--L--S--P--S--F--L--A--L-    400

                                                                          
  1201 TACCCATCATGA                                                   1212
  1201 TACCCATCATGA                                                   1212
   401 -Y--P--S--*-                                                    403