Oryza nivara (Oryza_nivara_v1.0)
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About this transcript

This transcript has 3 exons, is annotated with 20 domains and features and maps to 60 oligo probes.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-ONIVA08G25970.1771256aa
 
Protein coding
A0A0E0IFI6 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGGAGGCCGTAGCAGTGCACGCCAGCTTCTCGTCCTACTCCCCTCCGGTGGTCGCCGGC     60
     1 ATGGAGGCCGTAGCAGTGCACGCCAGCTTCTCGTCCTACTCCCCTCCGGTGGTCGCCGGC     60
     1 -M--E--A--V--A--V--H--A--S--F--S--S--Y--S--P--P--V--V--A--G-     20

                                                                          
    61 GGCCGCGACGACGCCGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGCATGTCCCGCCTGCCGGCTCGC    120
    61 GGCCGCGACGACGCCGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGAGCATGTCCCGCCTGCCGGCTCGC    120
    21 -G--R--D--D--A--G--S--S--S--S--S--R--S--M--S--R--L--P--A--R-     40

                                                                          
   121 GTCGCCGGCGCCGTAGCTCGCGGCATCGTCACCTTCGTCTTCGCCACAGTGGGCACGATC    180
   121 GTCGCCGGCGCCGTAGCTCGCGGCATCGTCACCTTCGTCTTCGCCACAGTGGGCACGATC    180
    41 -V--A--G--A--V--A--R--G--I--V--T--F--V--F--A--T--V--G--T--I-     60

                                                                          
   181 CTGGGGGCGATCACCGGCGGGCTGATCGGGCTGGCGACGGAGAGCGGCATGGTGCGGGGC    240
   181 CTGGGGGCGATCACCGGCGGGCTGATCGGGCTGGCGACGGAGAGCGGCATGGTGCGGGGC    240
    61 -L--G--A--I--T--G--G--L--I--G--L--A--T--E--S--G--M--V--R--G-     80

                                                                          
   241 ACCGGGATCGGGGCCATCTCCGGCGCGGTGGTCGCCATGGAGGTCGTCGACTCCTCCGTC    300
   241 ACCGGGATCGGGGCCATCTCCGGCGCGGTGGTCGCCATGGAGGTCGTCGACTCCTCCGTC    300
    81 -T--G--I--G--A--I--S--G--A--V--V--A--M--E--V--V--D--S--S--V-    100

                                                                          
   301 GCCATGTGGTGCTCCCACGACTCCGGGATCTGGAGCGTTCTCTACGTCCTTGACGTGATC    360
   301 GCCATGTGGTGCTCCCACGACTCCGGGATCTGGAGCGTTCTCTACGTCCTTGACGTGATC    360
   101 -A--M--W--C--S--H--D--S--G--I--W--S--V--L--Y--V--L--D--V--I-    120

                                                                          
   361 TGGAGCCTCCTGACGGGGCGGCTGGTGCGGGAGAAGGTGGATCCGGCGGTGCAGAACGCG    420
   361 TGGAGCCTCCTGACGGGGCGGCTGGTGCGGGAGAAGGTGGATCCGGCGGTGCAGAACGCG    420
   121 -W--S--L--L--T--G--R--L--V--R--E--K--V--D--P--A--V--Q--N--A-    140

                                                                          
   421 GTGGACAGCCAGATGAACGCCGCCGACGCGCCCTTCAGGGAGAGCGCGCCGACGCTGGCG    480
   421 GTGGACAGCCAGATGAACGCCGCCGACGCGCCCTTCAGGGAGAGCGCGCCGACGCTGGCG    480
   141 -V--D--S--Q--M--N--A--A--D--A--P--F--R--E--S--A--P--T--L--A-    160

                                                                          
   481 GAGATGTTCGACACCGGCATCCCCGGCGTCGCCGCCGCCGCCACGGGCATGCCGGCGGAC    540
   481 GAGATGTTCGACACCGGCATCCCCGGCGTCGCCGCCGCCGCCACGGGCATGCCGGCGGAC    540
   161 -E--M--F--D--T--G--I--P--G--V--A--A--A--A--T--G--M--P--A--D-    180

                                                                          
   541 GCCATCGCCGCGCTCCCGGTCACCACGTTCGCCGCCGCCGCCGGCGGCGACGACCGCGCC    600
   541 GCCATCGCCGCGCTCCCGGTCACCACGTTCGCCGCCGCCGCCGGCGGCGACGACCGCGCC    600
   181 -A--I--A--A--L--P--V--T--T--F--A--A--A--A--G--G--D--D--R--A-    200

                                                                          
   601 GGCTGCTCCGTGTGCCTCCAGGACTTGGAGGACGGCGAGCGGGCGCGGAGGCTGCCGGAG    660
   601 GGCTGCTCCGTGTGCCTCCAGGACTTGGAGGACGGCGAGCGGGCGCGGAGGCTGCCGGAG    660
   201 -G--C--S--V--C--L--Q--D--L--E--D--G--E--R--A--R--R--L--P--E-    220

                                                                          
   661 TGCGGCCACACGTTCCACCTCCACTGCATCGACAGCTGGCTGCTCAGGCACGCGTCGTGC    720
   661 TGCGGCCACACGTTCCACCTCCACTGCATCGACAGCTGGCTGCTCAGGCACGCGTCGTGC    720
   221 -C--G--H--T--F--H--L--H--C--I--D--S--W--L--L--R--H--A--S--C-    240

                                                                          
   721 CCCCTGTGCCGGCGCACGGTGGTCGCCGTCGACGACGTCGTCGTCGGCTGA             771
   721 CCCCTGTGCCGGCGCACGGTGGTCGCCGTCGACGACGTCGTCGTCGGCTGA             771
   241 -P--L--C--R--R--T--V--V--A--V--D--D--V--V--V--G--*-             256