Transcript: ONIVA08G02510.3
.
Description
WD40 Polycomb protein of the PRC2 complex, Regulation of vegetative and reproductive developmen [Source: Projected from Oryza sativa (Os08g0137100)]
Show/hide columns (1 hidden)
- ONIVA08G02510.4 1992 584aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0I739 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - ONIVA08G02510.1 3252 464aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0I737 - - ONIVA08G02510.2 3171 464aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0I737 - - ONIVA08G02510.5 1888 350aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0I740 - - ONIVA08G02510.3 1698 565aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0I738 -
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG AAA AAA CTC CAG CCT CAT GGG CCT GTG CAT ATG ACC CAT AGG CAG GCG ACA CCG CGG 60
1 ATGAAAAAACTCCAGCCTCATGGGCCTGTGCATATGACCCATAGGCAGGCGACACCGCGG 60
1 -M--K--K--L--Q--P--H--G--P--V--H--M--T--H--R--Q--A--T--P--R- 20
61 CAG CAG AGC GCT GCA CGA CCT CCG CCT CCC CAA TCC GTC CCG TCT CCT CGC CCG CCG CCC 120
61 CAGCAGAGCGCTGCACGACCTCCGCCTCCCCAATCCGTCCCGTCTCCTCGCCCGCCGCCC 120
21 -Q--Q--S--A--A--R--P--P--P--P--Q--S--V--P--S--P--R--P--P--P- 40
121 TCG ACT CCC GTC TCC TCG CCT GCC GCT GGC GCC GAT CTC CAT CCT GCT AGC AGA GGT GGC 180
121 TCGACTCCCGTCTCCTCGCCTGCCGCTGGCGCCGATCTCCATCCTGCTAGCAGAGGTGGC 180
41 -S--T--P--V--S--S--P--A--A--G--A--D--L--H--P--A--S--R--G--G- 60
181 GCC GGC GTC CTC CTG CTC CCG CCG CAT TCG CTC ACC GGT GAG CAT CCT AAT CCA TCC CAT 240
181 GCCGGCGTCCTCCTGCTCCCGCCGCATTCGCTCACCGGTGAGCATCCTAATCCATCCCAT 240
61 -A--G--V--L--L--L--P--P--H--S--L--T--G--E--H--P--N--P--S--H- 80
241 CCG GTC TCG GTC TCG GCC TCG GCC TCG AAT TTC GTC TCC TCG CCC GCC GCT TGC GCC GAT 300
241 CCGGTCTCGGTCTCGGCCTCGGCCTCGAATTTCGTCTCCTCGCCCGCCGCTTGCGCCGAT 300
81 -P--V--S--V--S--A--S--A--S--N--F--V--S--S--P--A--A--C--A--D- 100
301 CCC CAT CCT GCG AGC AGA GGT GGC GCC CGG CGT CCT CCT TCT TCC ACC GCA TCG TCG CTC 360
301 CCCCATCCTGCGAGCAGAGGTGGCGCCCGGCGTCCTCCTTCTTCCACCGCATCGTCGCTC 360
101 -P--H--P--A--S--R--G--G--A--R--R--P--P--S--S--T--A--S--S--L- 120
361 GCC GGT GAG CAT CCC TCC CTA CCC ACA CCT CAT CAG GTA TTC TGC GTT ATC CCT CAA AAA 420
361 GCCGGTGAGCATCCCTCCCTACCCACACCTCATCAGGTATTCTGCGTTATCCCTCAAAAA 420
121 -A--G--E--H--P--S--L--P--T--P--H--Q--V--F--C--V--I--P--Q--K- 140
421 GTT TGG GGG TTC AAC CGA AAC AGG GTT AGA TCT GCC TCT GCC CAG CTC CAC CTA CTT TCA 480
421 GTTTGGGGGTTCAACCGAAACAGGGTTAGATCTGCCTCTGCCCAGCTCCACCTACTTTCA 480
141 -V--W--G--F--N--R--N--R--V--R--S--A--S--A--Q--L--H--L--L--S- 160
481 A A T GTA ATT TGG TTA TTG AAT CTC ATC CAA ACA CCC TTA GAA CGA AAA AT C CGT TAT GAA 540
481 AATGTAATTTGGTTATTGAATCTCATCCAAACACCCTTAGAACGAAAAATCCGTTATGAA 540
161 -N--V--I--W--L--L--N--L--I--Q--T--P--L--E--R--K--I--R--Y--E- 180
541 CTT CCA AAT TTG GTT CCA AAC TCT GAA CTT TTG CTC GCC CTA CTA ATC CCC CTC ACA AAT 600
541 CTTCCAAATTTGGTTCCAAACTCTGAACTTTTGCTCGCCCTACTAATCCCCCTCACAAAT 600
181 -L--P--N--L--V--P--N--S--E--L--L--L--A--L--L--I--P--L--T--N- 200
601 CAC CCA AAA TCC GAA CGA CGC CGC CGC CGG AAT CCG CCA CCG CCG CCG ACG GAA GCA AGG 660
601 CACCCAAAATCCGAACGACGCCGCCGCCGGAATCCGCCACCGCCGCCGACGGAAGCAAGG 660
201 -H--P--K--S--E--R--R--R--R--R--N--P--P--P--P--P--T--E--A--R- 220
661 GCA GGT CAG GCC GTC GTC GGG AGG GGG GGA GAG GAG AGG CGC ATG GCG AAG CTG GGG CCG 720
661 GCAGGTCAGGCCGTCGTCGGGAGGGGGGGAGAGGAGAGGCGCATGGCGAAGCTGGGGCCG 720
221 -A--G--Q--A--V--V--G--R--G--G--E--E--R--R--M--A--K--L--G--P- 240
721 GGG CAG GGG CTG GGG TGC GAG GCG GCG GTG GGG TTG CTG GCG CCA AGC AGG AAG AGG GAG 780
721 GGGCAGGGGCTGGGGTGCGAGGCGGCGGTGGGGTTGCTGGCGCCAAGCAGGAAGAGGGAG 780
241 -G--Q--G--L--G--C--E--A--A--V--G--L--L--A--P--S--R--K--R--E- 260
781 TAC AAG GCG TGC AAC AAG CTC ACC GAG GGG AAG CGG CCG CTC TAC GCC ATC GGA TTC AAC 840
781 TACAAGGCGTGCAACAAGCTCACCGAGGGGAAGCGGCCGCTCTACGCCATCGGATTCAAC 840
261 -Y--K--A--C--N--K--L--T--E--G--K--R--P--L--Y--A--I--G--F--N- 280
841 TTC CTC GAC GTC CGC TAC TAC GAG GTC TTC GCC ACC GTC GGC GGC AAC CGC GTG ACA ACC 900
841 TTCCTCGACGTCCGCTACTACGAGGTCTTCGCCACCGTCGGCGGCAACCGCGTGACAACC 900
281 -F--L--D--V--R--Y--Y--E--V--F--A--T--V--G--G--N--R--V--T--T- 300
901 TAC AGC TGC CTC AAG GAT GGT AAT TTT GCT ATC CTG CAA GCA TAT ATT GAT GAG GAT A AG 960
901 TACAGCTGCCTCAAGGATGGTAATTTTGCTATCCTGCAAGCATATATTGATGAGGATAAG 960
301 -Y--S--C--L--K--D--G--N--F--A--I--L--Q--A--Y--I--D--E--D--K- 320
961 GAT GAA TCG TTC TAC ACA CTG AGT TGG GCT TGT GAT CTT GAT GGC ACA CCG CTG TTA GTG 1020
961 GATGAATCGTTCTACACACTGAGTTGGGCTTGTGATCTTGATGGCACACCGCTGTTAGTG 1020
321 -D--E--S--F--Y--T--L--S--W--A--C--D--L--D--G--T--P--L--L--V- 340
1021 GCT GCA GGA AGC AAT GGG ATC ATT CGG GTC ATC AAC TGT GCC ACT GAG AAG TTA CTC AAG 1080
1021 GCTGCAGGAAGCAATGGGATCATTCGGGTCATCAACTGTGCCACTGAGAAGTTACTCAAG 1080
341 -A--A--G--S--N--G--I--I--R--V--I--N--C--A--T--E--K--L--L--K- 360
1081 ACT TTT GTT GGC CAT GGC GAT TCA ATA AAC GAG ATA AGA ACT CAA GCA TTA AAG CCT TCG 1140
1081 ACTTTTGTTGGCCATGGCGATTCAATAAACGAGATAAGAACTCAAGCATTAAAGCCTTCG 1140
361 -T--F--V--G--H--G--D--S--I--N--E--I--R--T--Q--A--L--K--P--S- 380
1141 CTC ATC ATT TCT GCA AGC AAG G AT GAA TCT GTT AGG CTG TGG AAT GTT CAC ACA GGG ATC 1200
1141 CTCATCATTTCTGCAAGCAAGGATGAATCTGTTAGGCTGTGGAATGTTCACACAGGGATC 1200
381 -L--I--I--S--A--S--K--D--E--S--V--R--L--W--N--V--H--T--G--I- 400
1201 TGC ATT TTG ATT TTT GCT GGA GCA GGA GGT CAC CGG AAT GAA GTA TTG AGT GTT GAC TTC 1260
1201 TGCATTTTGATTTTTGCTGGAGCAGGAGGTCACCGGAATGAAGTATTGAGTGTTGACTTC 1260
401 -C--I--L--I--F--A--G--A--G--G--H--R--N--E--V--L--S--V--D--F- 420
1261 CAC CCA TCT GAT ATC TAC CGC ATA GCA AGT TGT GGC ATG GAT AAC ACT GTT AAA ATA TGG 1320
1261 CACCCATCTGATATCTACCGCATAGCAAGTTGTGGCATGGATAACACTGTTAAAATATGG 1320
421 -H--P--S--D--I--Y--R--I--A--S--C--G--M--D--N--T--V--K--I--W- 440
1321 TCA ATG AAG G A A TTC TGG CCA TAT GTT GAG CAA TCC TTT ACA TGG ACT GAC CTT CCA TCA 1380
1321 TCAATGAAGGAATTCTGGCCATATGTTGAGCAATCCTTTACATGGACTGACCTTCCATCA 1380
441 -S--M--K--E--F--W--P--Y--V--E--Q--S--F--T--W--T--D--L--P--S- 460
1381 AAA TTT CCA ACA AAA TAT GTG CAA TTT CCG AGT GTT GAC AAT GAA ATT GTG CTG TGG GAG 1440
1381 AAATTTCCAACAAAATATGTGCAATTTCCGAGTGTTGACAATGAAATTGTGCTGTGGGAG 1440
461 -K--F--P--T--K--Y--V--Q--F--P--S--V--D--N--E--I--V--L--W--E- 480
1441 CCA AAA ACA AAA GAA CAA AGC CCC GGG GAG GGT AGC ATT GAT ATT CTT CAG AAG TAT CCT 1500
1441 CCAAAAACAAAAGAACAAAGCCCCGGGGAGGGTAGCATTGATATTCTTCAGAAGTATCCT 1500
481 -P--K--T--K--E--Q--S--P--G--E--G--S--I--D--I--L--Q--K--Y--P- 500
1501 GTG CCA GAA TGT GAT ATC TGG TTT ATC AAA TTC TCA TGC GAT TTT CAC TTC AAT CAA TTG 1560
1501 GTGCCAGAATGTGATATCTGGTTTATCAAATTCTCATGCGATTTTCACTTCAATCAATTG 1560
501 -V--P--E--C--D--I--W--F--I--K--F--S--C--D--F--H--F--N--Q--L- 520
1561 GCA ATA G G C AAC CGT GAA GGA AAA GTC TTT GTC TGG GAA GTA CAG TCC AGT CCT CCT GTT 1620
1561 GCAATAGGCAACCGTGAAGGAAAAGTCTTTGTCTGGGAAGTACAGTCCAGTCCTCCTGTT 1620
521 -A--I--G--N--R--E--G--K--V--F--V--W--E--V--Q--S--S--P--P--V- 540
1621 TTA ACT GCT CG G CTG ACT AAT CCG CAA TGC AAA TCT GCG ATA AGG CAG ACT GCC GTG TCA 1680
1621 TTAACTGCTCGGCTGACTAATCCGCAATGCAAATCTGCGATAAGGCAGACTGCCGTGTCA 1680
541 -L--T--A--R--L--T--N--P--Q--C--K--S--A--I--R--Q--T--A--V--S- 560
1681 TTT GAT GGA AG G TTG TGA 1698
1681 TTTGATGGAAGGTTGTGA 1698
561 -F--D--G--R--L--*- 565
.
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use