Transcript: ONIVA07G24910.1
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Description
ubiquitin-specific protease 24 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT4G30890) TAIR;Acc:AT4G30890]
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- ONIVA07G24910.1 2490 666aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0I589 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG GGC AGC GGC AAG GCC AAC CAC CCG GCG GCT TCC TCG TCC AAG GTC TCC TCC GTC TCC 60
1 ATGGGCAGCGGCAAGGCCAACCACCCGGCGGCTTCCTCGTCCAAGGTCTCCTCCGTCTCC 60
1 -M--G--S--G--K--A--N--H--P--A--A--S--S--S--K--V--S--S--V--S- 20
61 TCC TCC AAA CCC AAA CCC AAA CCC ACC CCG ATT AGA AAC CCT ACG CCT CCG CCT CCT CCT 120
61 TCCTCCAAACCCAAACCCAAACCCACCCCGATTAGAAACCCTACGCCTCCGCCTCCTCCT 120
21 -S--S--K--P--K--P--K--P--T--P--I--R--N--P--T--P--P--P--P--P- 40
121 CCT CGC CGC CGC ACG CCC CCA CCT CCG CCG CCG GGG TCG GGC CCG GGG CCG CAG CGA CCT 180
121 CCTCGCCGCCGCACGCCCCCACCTCCGCCGCCGGGGTCGGGCCCGGGGCCGCAGCGACCT 180
41 -P--R--R--R--T--P--P--P--P--P--P--G--S--G--P--G--P--Q--R--P- 60
181 TCC TAC CTC TCG GTA GCG CTC CGC CGC CGC GGG CCT CCC GCG GGC AGC GCG GCC GGG ACC 240
181 TCCTACCTCTCGGTAGCGCTCCGCCGCCGCGGGCCTCCCGCGGGCAGCGCGGCCGGGACC 240
61 -S--Y--L--S--V--A--L--R--R--R--G--P--P--A--G--S--A--A--G--T- 80
241 CCG GCG CCG CCG CGC GCC GCC GCC GCC TTT GAT GTC GCC CCC CCG GTC GCC GAG CGC ACG 300
241 CCGGCGCCGCCGCGCGCCGCCGCCGCCTTTGATGTCGCCCCCCCGGTCGCCGAGCGCACG 300
81 -P--A--P--P--R--A--A--A--A--F--D--V--A--P--P--V--A--E--R--T- 100
301 GAC CCC GTT GTC TTC CCC GCT TCA TTA GCC GAG ATG AGC GGC GGC GGC GGC AGC AGC AGC 360
301 GACCCCGTTGTCTTCCCCGCTTCATTAGCCGAGATGAGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCAGC 360
101 -D--P--V--V--F--P--A--S--L--A--E--M--S--G--G--G--G--S--S--S- 120
361 AGC GAC GAT CAG ATC CTT CTG TTT GGG AGC TTC ACA GAG GCT GAA ACC AAG TTG TGG CAG 420
361 AGCGACGATCAGATCCTTCTGTTTGGGAGCTTCACAGAGGCTGAAACCAAGTTGTGGCAG 420
121 -S--D--D--Q--I--L--L--F--G--S--F--T--E--A--E--T--K--L--W--Q- 140
421 CCT AAT GCA AAT AAA ACA CGG GAA CTC TCT GAG ATC CAG TTT GGG TCA CTG AAT TTC TCA 480
421 CCTAATGCAAATAAAACACGGGAACTCTCTGAGATCCAGTTTGGGTCACTGAATTTCTCA 480
141 -P--N--A--N--K--T--R--E--L--S--E--I--Q--F--G--S--L--N--F--S- 160
481 GCT CTA AAT TTA TCG AAA GAA TCA AAT TCT ATT ACT CAA GGT GCT GTC TAT CCT GCA AAA 540
481 GCTCTAAATTTATCGAAAGAATCAAATTCTATTACTCAAGGTGCTGTCTATCCTGCAAAA 540
161 -A--L--N--L--S--K--E--S--N--S--I--T--Q--G--A--V--Y--P--A--K- 180
541 TTA AGT GAC GGC CAG AAC AAA ATC ATC ATT ACA AAG GAT ATT GCA TGC AGC AAC AAA AAG 600
541 TTAAGTGACGGCCAGAACAAAATCATCATTACAAAGGATATTGCATGCAGCAACAAAAAG 600
181 -L--S--D--G--Q--N--K--I--I--I--T--K--D--I--A--C--S--N--K--K- 200
601 GAA ACA GTA GCT CCT ACA TTA CCA AAT GGC AAG CCA GTG CTA TTC AAT GGA TCT CCC ACT 660
601 GAAACAGTAGCTCCTACATTACCAAATGGCAAGCCAGTGCTATTCAATGGATCTCCCACT 660
201 -E--T--V--A--P--T--L--P--N--G--K--P--V--L--F--N--G--S--P--T- 220
661 GCC AAT GCC AAT GTG TCT CCC AAC AAT GGC GTC ATT GAG AAT AAT CAG AAG GCT GTA GCT 720
661 GCCAATGCCAATGTGTCTCCCAACAATGGCGTCATTGAGAATAATCAGAAGGCTGTAGCT 720
221 -A--N--A--N--V--S--P--N--N--G--V--I--E--N--N--Q--K--A--V--A- 240
721 GCA GTT CTC ACG AGT GTT CCT GCT AAA AAT GTC AGC AGC CCA GCA CCA CTT TCA GTG CCA 780
721 GCAGTTCTCACGAGTGTTCCTGCTAAAAATGTCAGCAGCCCAGCACCACTTTCAGTGCCA 780
241 -A--V--L--T--S--V--P--A--K--N--V--S--S--P--A--P--L--S--V--P- 260
781 GAG GTG GAC CAT GAT GGG ATC GAA CGC AAT CAA AAC AGC AGT TTA GTC CCA GAA ATA ACT 840
781 GAGGTGGACCATGATGGGATCGAACGCAATCAAAACAGCAGTTTAGTCCCAGAAATAACT 840
261 -E--V--D--H--D--G--I--E--R--N--Q--N--S--S--L--V--P--E--I--T- 280
841 GAA AAT GGA GGG CCA GCT ATT GAT ACA CCA ACT ACT GCA GCT CCA GTG GAT GAG CTT GTG 900
841 GAAAATGGAGGGCCAGCTATTGATACACCAACTACTGCAGCTCCAGTGGATGAGCTTGTG 900
281 -E--N--G--G--P--A--I--D--T--P--T--T--A--A--P--V--D--E--L--V- 300
901 ACA AGC TTA AAT AAA AAG GAC TTT CGG AAC AAG CCC TTG CTT CCT CAT GGT TTG AAG AAT 960
901 ACAAGCTTAAATAAAAAGGACTTTCGGAACAAGCCCTTGCTTCCTCATGGTTTGAAGAAT 960
301 -T--S--L--N--K--K--D--F--R--N--K--P--L--L--P--H--G--L--K--N- 320
961 ACA GGA AAT ATA TGC TTC CTG AAT TCA TCC TTG CAG GCA TTG CTC TCA TGC TGG CCT TTT 1020
961 ACAGGAAATATATGCTTCCTGAATTCATCCTTGCAGGCATTGCTCTCATGCTGGCCTTTT 1020
321 -T--G--N--I--C--F--L--N--S--S--L--Q--A--L--L--S--C--W--P--F- 340
1021 GTC CAG CTT TTA CAG AAC TTG AGG AAC CAG AAT ATA CCT AAG GCT GGT TAC CCA ACA CTG 1080
1021 GTCCAGCTTTTACAGAACTTGAGGAACCAGAATATACCTAAGGCTGGTTACCCAACACTG 1080
341 -V--Q--L--L--Q--N--L--R--N--Q--N--I--P--K--A--G--Y--P--T--L- 360
1081 AAT GCA TTT ATT GAG TTC ATC TCT CAA TTC GAC GTG CTC GAT GAT TCA AAT GTT AAG AAA 1140
1081 AATGCATTTATTGAGTTCATCTCTCAATTCGACGTGCTCGATGATTCAAATGTTAAGAAA 1140
361 -N--A--F--I--E--F--I--S--Q--F--D--V--L--D--D--S--N--V--K--K- 380
1141 GAC GAG AAG TTT GCT ACA ATA GCT TCA AAA TCA GTT ATT CCC TCC ATG TTT GAC ACA GTT 1200
1141 GACGAGAAGTTTGCTACAATAGCTTCAAAATCAGTTATTCCCTCCATGTTTGACACAGTT 1200
381 -D--E--K--F--A--T--I--A--S--K--S--V--I--P--S--M--F--D--T--V- 400
1201 CTG AGA AAT TTT ACT CCA GAT GTG CCA GCT GGA ACA GCT TCT AGG CCA AG G CAG GAA GAT 1260
1201 CTGAGAAATTTTACTCCAGATGTGCCAGCTGGAACAGCTTCTAGGCCAAGGCAGGAAGAT 1260
401 -L--R--N--F--T--P--D--V--P--A--G--T--A--S--R--P--R--Q--E--D- 420
1261 GCT CAA GAA TTC TTA AGT TTT GCG ATG GAT AGA ATG CAT GAT GAA CTA GTG AAG CTT AAT 1320
1261 GCTCAAGAATTCTTAAGTTTTGCGATGGATAGAATGCATGATGAACTAGTGAAGCTTAAT 1320
421 -A--Q--E--F--L--S--F--A--M--D--R--M--H--D--E--L--V--K--L--N- 440
1321 GGC AAT GGC TCA AAT TCA AAG GAG GGT ATG ATT GTT TCA TCA AAT GAT GAT GAT GCT TGG 1380
1321 GGCAATGGCTCAAATTCAAAGGAGGGTATGATTGTTTCATCAAATGATGATGATGCTTGG 1380
441 -G--N--G--S--N--S--K--E--G--M--I--V--S--S--N--D--D--D--A--W- 460
1381 GAG ACT GTT GGA AAG AAG AAC AAG TCT GCC ATA ATG AGG AGT CAG AGT TTT GTT CCC TCC 1440
1381 GAGACTGTTGGAAAGAAGAACAAGTCTGCCATAATGAGGAGTCAGAGTTTTGTTCCCTCC 1440
461 -E--T--V--G--K--K--N--K--S--A--I--M--R--S--Q--S--F--V--P--S- 480
1441 GAG TTA ACT GCT ATT TTT GGA GGC CAG CTG CAA AGC TGT GTG AAA GCT ACT G G T AAC AAA 1500
1441 GAGTTAACTGCTATTTTTGGAGGCCAGCTGCAAAGCTGTGTGAAAGCTACTGGTAACAAA 1500
481 -E--L--T--A--I--F--G--G--Q--L--Q--S--C--V--K--A--T--G--N--K- 500
1501 GCA TCA GTC ACC GTT CAG CCT TTT CGA CTG ATC CAT CTT GAC ATA TTC CCA GAT GCT GTT 1560
1501 GCATCAGTCACCGTTCAGCCTTTTCGACTGATCCATCTTGACATATTCCCAGATGCTGTT 1560
501 -A--S--V--T--V--Q--P--F--R--L--I--H--L--D--I--F--P--D--A--V- 520
1561 CAG AAA CTT GAT GAT GCC CTT CGT CTG TTT GCT GCT CCT GAA TCT TTG GAA GGA TAC AGA 1620
1561 CAGAAACTTGATGATGCCCTTCGTCTGTTTGCTGCTCCTGAATCTTTGGAAGGATACAGA 1620
521 -Q--K--L--D--D--A--L--R--L--F--A--A--P--E--S--L--E--G--Y--R- 540
1621 ACA GCT GCT GGA AAG G CT GGG TTG GTG ACG GCT AGA AAA TCA GTG AAG ATA CAC TCA CTT 1680
1621 ACAGCTGCTGGAAAGGCTGGGTTGGTGACGGCTAGAAAATCAGTGAAGATACACTCACTT 1680
541 -T--A--A--G--K--A--G--L--V--T--A--R--K--S--V--K--I--H--S--L- 560
1681 TCA AAG ATA ATG ATA CTG CAC CTG AAG AGG TTT AGT TAT GGA AGT CAT GGC TGC ACG AAA 1740
1681 TCAAAGATAATGATACTGCACCTGAAGAGGTTTAGTTATGGAAGTCATGGCTGCACGAAA 1740
561 -S--K--I--M--I--L--H--L--K--R--F--S--Y--G--S--H--G--C--T--K- 580
1741 CTC TTC AAG CCA ATT CAC TTC CCT CTT GAG CTG GTT CTT AGT CGT GAT CTG CTG AGT TCG 1800
1741 CTCTTCAAGCCAATTCACTTCCCTCTTGAGCTGGTTCTTAGTCGTGATCTGCTGAGTTCG 1800
581 -L--F--K--P--I--H--F--P--L--E--L--V--L--S--R--D--L--L--S--S- 600
1801 CCA TCA TCA GAG A GT AGA AGA TAT GAG CTT GTT GCA ACC ATC ACG CAT CTT GGG GCA AAC 1860
1801 CCATCATCAGAGAGTAGAAGATATGAGCTTGTTGCAACCATCACGCATCTTGGGGCAAAC 1860
601 -P--S--S--E--S--R--R--Y--E--L--V--A--T--I--T--H--L--G--A--N- 620
1861 CCG TCC AGG GGC CAT TAC ACT GCC GAT GCA AAG TCT GCC AGT GGG CAG TGG CTT CGC TTC 1920
1861 CCGTCCAGGGGCCATTACACTGCCGATGCAAAGTCTGCCAGTGGGCAGTGGCTTCGCTTC 1920
621 -P--S--R--G--H--Y--T--A--D--A--K--S--A--S--G--Q--W--L--R--F- 640
1921 GAC GAT GAT AAC GTC ACA CCT GTC AGT CTG AAC AAG GTC TTG CAT GAC CAA GCA TAT GTC 1980
1921 GACGATGATAACGTCACACCTGTCAGTCTGAACAAGGTCTTGCATGACCAAGCATATGTC 1980
641 -D--D--D--N--V--T--P--V--S--L--N--K--V--L--H--D--Q--A--Y--V- 660
1981 CTG TTC TAC AAA CAA TTA TAA GTTTGGGGGTATTGCTACGGAGTTGATTAGCGGTTCTCT 2040
1981 CTGTTCTACAAACAATTATAA....................................... 2001
661 -L--F--Y--K--Q--L--*-....................................... 666
2041 TATTGCTTGAACAGCTAGATATATACTAACTATATCGCCCAGTTAATGTAGCTGCCGTGT 2100
............................................................
............................................................
2101 AACTGAGAATCTTGTGTCAAGTGCCTGGTTTCCTGCGTTTATTTATATATGCTTGATCAC 2160
............................................................
............................................................
2161 ATAGTGGGGGATTTTTGTTCAGGCCATTGTTGAGGTTTTGTAAAATGCAAATGTCATCTT 2220
............................................................
............................................................
2221 GGTAATGACCATTAAAGTAACCATGAGATGATATCACTCGTTGGCCCTAAGAAACTATAT 2280
............................................................
............................................................
2281 TGATCATGTTATTGCGGTGTTGCATTTGATTATATTAAAACGTGATTAAAACGTCCAGCT 2340
............................................................
............................................................
2341 TGTGAGCTTGACGATTGCTGAAATATGGCTCTATGGCTGCCTACTGCGCTTCAGGTTTCA 2400
............................................................
............................................................
2401 GTGGCTGTCAATCAGTTTGGAAAGCTGAAGCTGTAGAGATCAACCTGAAACTGTGAATTT 2460
............................................................
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2461 GTGAAGCAGTTTATGCCTACTATATACGAG 2490
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