Transcript: ONIVA05G03350.1
.
Description
tetratricopeptide repeat (TPR)-containing protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT2G39090) TAIR;Acc:AT2G39090]
Show/hide columns (1 hidden)
- ONIVA05G03350.1 2744 586aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0H9F9 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - ONIVA05G03350.3 3528 561aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0H9G1 - - ONIVA05G03350.2 2885 561aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0H9G1 -
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 G GAGTGGACAAATCTCCGAACCACAAATTCCAATTCAAAAACTTTTTCCCCGAGTAGCCT 60
............................................................
............................................................
61 CGCCGTCGCCGTCGCCGGAG ATG GAG GCG GCG CGG GAG TCA ATG GCG GCG CTC GTC GAC G 120
....................ATGGAGGCGGCGCGGGAGTCAATGGCGGCGCTCGTCGACG 40
....................-M--E--A--A--R--E--S--M--A--A--L--V--D-- 13
121 CC GGC CTC TAC GAC TGC GCC CAG ACG CTC G GG TGC TTT CTT GTG TCT TCA TCA CCT GCG A 180
41 CCGGCCTCTACGACTGCGCCCAGACGCTCGGGTGCTTTCTTGTGTCTTCATCACCTGCGA 100
14 A--G--L--Y--D--C--A--Q--T--L--G--C--F--L--V--S--S--S--P--A-- 33
181 GC AGC GAG GCT GGT ATG TCC ATG AAG GTG GAA AGC TTG G TA CTG CAT GGT GAT GCT TTG C 240
101 GCAGCGAGGCTGGTATGTCCATGAAGGTGGAAAGCTTGGTACTGCATGGTGATGCTTTGC 160
34 S--S--E--A--G--M--S--M--K--V--E--S--L--V--L--H--G--D--A--L-- 53
241 AT GGA GAG AAA GAA TTT CGC AGG GCA CTG AGT GCC TAC AAA CAA GCT ATG CAA TAC AGC A 300
161 ATGGAGAGAAAGAATTTCGCAGGGCACTGAGTGCCTACAAACAAGCTATGCAATACAGCA 220
54 H--G--E--K--E--F--R--R--A--L--S--A--Y--K--Q--A--M--Q--Y--S-- 73
301 AA AAC ATT CCT AGG CAA GCA ACA AGT AAT ACT AGA AGC TCA GTA ACT GCC ACT GGC CGG T 360
221 AAAACATTCCTAGGCAAGCAACAAGTAATACTAGAAGCTCAGTAACTGCCACTGGCCGGT 280
74 K--N--I--P--R--Q--A--T--S--N--T--R--S--S--V--T--A--T--G--R-- 93
361 CT CCT TCT CCA AAT TCT TCA AGT CTT GCA CCA CTC AAT GAA AAT GAG GTG AAA TTT AAA A 420
281 CTCCTTCTCCAAATTCTTCAAGTCTTGCACCACTCAATGAAAATGAGGTGAAATTTAAAA 340
94 S--P--S--P--N--S--S--S--L--A--P--L--N--E--N--E--V--K--F--K-- 113
421 TT GCA CTT TGC TAT TCT GCT CTA CGT GAG CAT CGT GAA GCA CTT CAA GAG A TG GAA GGG A 480
341 TTGCACTTTGCTATTCTGCTCTACGTGAGCATCGTGAAGCACTTCAAGAGATGGAAGGGA 400
114 I--A--L--C--Y--S--A--L--R--E--H--R--E--A--L--Q--E--M--E--G-- 133
481 TT CCT TCT AAA GCG AGG ACT CTA AAA ATG AAT CTG ATG TTA GGG AAG CTA TAT CGG ATA T 540
401 TTCCTTCTAAAGCGAGGACTCTAAAAATGAATCTGATGTTAGGGAAGCTATATCGGATAT 460
134 I--P--S--K--A--R--T--L--K--M--N--L--M--L--G--K--L--Y--R--I-- 153
541 CC AGA AAT AAT CGT GCA GCT GCT GTA TGT TAT AAA GAG TGC CTG AG G CAA TGC CCT TAT G 600
461 CCAGAAATAATCGTGCAGCTGCTGTATGTTATAAAGAGTGCCTGAGGCAATGCCCTTATG 520
154 S--R--N--N--R--A--A--A--V--C--Y--K--E--C--L--R--Q--C--P--Y-- 173
601 TT TTT GAG GCT ATT ACA GCT TTG GCT GAA ATG GGG CTT TCT TCA AAG GAG TTC TCT TTG A 660
521 TTTTTGAGGCTATTACAGCTTTGGCTGAAATGGGGCTTTCTTCAAAGGAGTTCTCTTTGA 580
174 V--F--E--A--I--T--A--L--A--E--M--G--L--S--S--K--E--F--S--L-- 193
661 TA TTC TCA CAA G CA CCA AAT CGA GGA GGC AAG GCT CCA GGT GAC TCT TTA GAT GCA CAG C 720
581 TATTCTCACAAGCACCAAATCGAGGAGGCAAGGCTCCAGGTGACTCTTTAGATGCACAGC 640
194 I--F--S--Q--A--P--N--R--G--G--K--A--P--G--D--S--L--D--A--Q-- 213
721 GT TGG TGG AAC C GC TAT GTT GAG GCC CAA TGT TGC ATT GCT TCA CAT GAT TAT AAA G G T G 780
641 GTTGGTGGAACCGCTATGTTGAGGCCCAATGTTGCATTGCTTCACATGATTATAAAGGTG 700
214 R--W--W--N--R--Y--V--E--A--Q--C--C--I--A--S--H--D--Y--K--G-- 233
781 GC CTT GAC ATA TAT CTA GAC TTA ATG CAG CGA TTC CCG AAC AAT GTG CAC ATC TTG CTG G 840
701 GCCTTGACATATATCTAGACTTAATGCAGCGATTCCCGAACAATGTGCACATCTTGCTGG 760
234 G--L--D--I--Y--L--D--L--M--Q--R--F--P--N--N--V--H--I--L--L-- 253
841 AA ATT GCT AAG GTT GAA GCC ATC ATA GGT AGG AAT GAT GAA GCT ATC ATG AAC TTT GAA A 900
761 AAATTGCTAAGGTTGAAGCCATCATAGGTAGGAATGATGAAGCTATCATGAACTTTGAAA 820
254 E--I--A--K--V--E--A--I--I--G--R--N--D--E--A--I--M--N--F--E-- 273
901 AG GCT CGG TTA ATT GAT CCA AAC ATC ATG ACA TAT ATG GAT GAG TAT GCA ATT CTC CTT A 960
821 AGGCTCGGTTAATTGATCCAAACATCATGACATATATGGATGAGTATGCAATTCTCCTTA 880
274 K--A--R--L--I--D--P--N--I--M--T--Y--M--D--E--Y--A--I--L--L-- 293
961 AG TCA AAA TCT GAC TAC ACA AAG CTT AAC AAG TTG GTA CAT GAT ATG CTG CAT ATT GAC C 1020
881 AGTCAAAATCTGACTACACAAAGCTTAACAAGTTGGTACATGATATGCTGCATATTGACC 940
294 K--S--K--S--D--Y--T--K--L--N--K--L--V--H--D--M--L--H--I--D-- 313
1021 CT GCA AGA CCA GAA ACA TGT CTT GCT CTT GCA GCA TTG TGG GAA AGA AAA GAT GAA AGA A 1080
941 CTGCAAGACCAGAAACATGTCTTGCTCTTGCAGCATTGTGGGAAAGAAAAGATGAAAGAA 1000
314 P--A--R--P--E--T--C--L--A--L--A--A--L--W--E--R--K--D--E--R-- 333
1081 AA GCT TTG ACA TAT GCT GAA AAG A GT CTC CGA GTT GAT GAT AGA CAT ATA ACT GGA TAT A 1140
1001 AAGCTTTGACATATGCTGAAAAGAGTCTCCGAGTTGATGATAGACATATAACTGGATATA 1060
334 K--A--L--T--Y--A--E--K--S--L--R--V--D--D--R--H--I--T--G--Y-- 353
1141 TC ATG AAG GGA AAT CTT CAT CTT TTG TTG AAT CGA CCT GAT TTG GCA GTC ACA GAC TTC A 1200
1061 TCATGAAGGGAAATCTTCATCTTTTGTTGAATCGACCTGATTTGGCAGTCACAGACTTCA 1120
354 I--M--K--G--N--L--H--L--L--L--N--R--P--D--L--A--V--T--D--F-- 373
1201 GG GGA GCT CAA GAA CTT AGG GCC GAT CTT CGC TCT TAT CAA G GA TTG GTA CGT GCT TAT C 1260
1121 GGGGAGCTCAAGAACTTAGGGCCGATCTTCGCTCTTATCAAGGATTGGTACGTGCTTATC 1180
374 R--G--A--Q--E--L--R--A--D--L--R--S--Y--Q--G--L--V--R--A--Y-- 393
1261 TA GCG CTC TCT AAA TGC AAA GAT GCA TTA TTC ACT GCA CGT GAA GCA ATG AAG GTT ATG C 1320
1181 TAGCGCTCTCTAAATGCAAAGATGCATTATTCACTGCACGTGAAGCAATGAAGGTTATGC 1240
394 L--A--L--S--K--C--K--D--A--L--F--T--A--R--E--A--M--K--V--M-- 413
1321 AT CAG TCT GCA AAA GCT CTC AAA TTA GTT GGT GAT GTG CAT GCT ATC AGT TCC AGT GGA A 1380
1241 ATCAGTCTGCAAAAGCTCTCAAATTAGTTGGTGATGTGCATGCTATCAGTTCCAGTGGAA 1300
414 H--Q--S--A--K--A--L--K--L--V--G--D--V--H--A--I--S--S--S--G-- 433
1381 GA GAG AAG G CT AGG AAG TTC TAT GAA TCC GCC ATT CGT CTT GAA CCT GGA TTT CTG GGA G 1440
1301 GAGAGAAGGCTAGGAAGTTCTATGAATCCGCCATTCGTCTTGAACCTGGATTTCTGGGAG 1360
434 R--E--K--A--R--K--F--Y--E--S--A--I--R--L--E--P--G--F--L--G-- 453
1441 CT GCA TTG GCT TTG GCT GAT CTG CAT GTC GCT GAA GGA CGA AAT AAG GAT GCA GTA TTG C 1500
1361 CTGCATTGGCTTTGGCTGATCTGCATGTCGCTGAAGGACGAAATAAGGATGCAGTATTGC 1420
454 A--A--L--A--L--A--D--L--H--V--A--E--G--R--N--K--D--A--V--L-- 473
1501 TG CTT GAA AGA TAT CTA AGA CAG TGG GCA GAT GAT TCT CTA CAC ATC AAG TTG GCT CAA G 1560
1421 TGCTTGAAAGATATCTAAGACAGTGGGCAGATGATTCTCTACACATCAAGTTGGCTCAAG 1480
474 L--L--E--R--Y--L--R--Q--W--A--D--D--S--L--H--I--K--L--A--Q-- 493
1561 TT TTT GCA GCA ACG AAT ATG CTT TCT GAT GCA CTT TCC CAC TAC CAA TCT GCT CTA AG G A 1620
1481 TTTTTGCAGCAACGAATATGCTTTCTGATGCACTTTCCCACTACCAATCTGCTCTAAGGA 1540
494 V--F--A--A--T--N--M--L--S--D--A--L--S--H--Y--Q--S--A--L--R-- 513
1621 TA AAC CCA CAT AAT GAG GCC GCA AAG AAA GGA TTG GAA CGC TTA GAG AAG CAA ATG AAG G 1680
1541 TAAACCCACATAATGAGGCCGCAAAGAAAGGATTGGAACGCTTAGAGAAGCAAATGAAGG 1600
514 I--N--P--H--N--E--A--A--K--K--G--L--E--R--L--E--K--Q--M--K-- 533
1681 GA GTA GAC CCG GAC GCG CCT GAA GAG GAC GAA GAG AAC GAA GCT GAC GAT GTC GAC GGT G 1740
1601 GAGTAGACCCGGACGCGCCTGAAGAGGACGAAGAGAACGAAGCTGACGATGTCGACGGTG 1660
534 G--V--D--P--D--A--P--E--E--D--E--E--N--E--A--D--D--V--D--G-- 553
1741 AT CAA GAC GAC GCT GAA CTA CT G CAC GGC AAC TGG AAG ACG AGT GAC GAC GAC GGG TGC C 1800
1661 ATCAAGACGACGCTGAACTACTGCACGGCAACTGGAAGACGAGTGACGACGACGGGTGCC 1720
554 D--Q--D--D--A--E--L--L--H--G--N--W--K--T--S--D--D--D--G--C-- 573
1801 TC TCC CTT ACC GCG A T G ATC AGA TAC GTA CGG TAT GTA TAA GTACGGCGATTCTACCACG 1860
1721 TCTCCCTTACCGCGATGATCAGATACGTACGGTATGTATAA................... 1761
574 L--S--L--T--A--M--I--R--Y--V--R--Y--V--*-................... 586
1861 CACAGTGGTACATACGTATACGTACACTAGCCAGCAGCTGGAGCTGGCTGGCTTCTCTAC 1920
............................................................
............................................................
1921 TACACTGGCATGCAGCTTGGTGTGGCAGGCTACACCCAGAGCGCGCCGGCGTCGCGGAGG 1980
............................................................
............................................................
1981 AGCGGGACAAGGCCGCCGGCGACGTGGAGCGACATGACCCGGTCGGTGGAGCCGACGAGC 2040
............................................................
............................................................
2041 CTGCCGCCGATGAACACTGTCGGCACCACGACGCCGCGGCCGCGGCCACCGCCGTTGGCG 2100
............................................................
............................................................
2101 GCGGTGCCGGCGAGCAACATCCCGGCGAGCGCGTTCTCCATGTCGGCGCCGGCGGGCTCC 2160
............................................................
............................................................
2161 TCGTCGAGCTCCACCACGCGGGCGTCGACGCCGAGCTCCCGGAGCAGGCGCGTCACGGCG 2220
............................................................
............................................................
2221 TGGGACATGCCGCACGAGCTCTTGCTGAACACCACCACCGCCTTCTGCGACGCCAGCCTT 2280
............................................................
............................................................
2281 GTCACCCTGTCCATCTCTATATATGCAAATGTCTATGTGCCTAGTGTCTTCTTCCCCGTC 2340
............................................................
............................................................
2341 TCCGGCGACTACGACCTGGCCGCGGAATGCGCCGGGATCTTTGGCTGGATGGATGTCACC 2400
............................................................
............................................................
2401 GGCGGTGATCGCCCGATTGATCGAGGTTGTGTCACTTGTCAGTGATGCTGATCTGCTGGT 2460
............................................................
............................................................
2461 TGTGCTTGCATTTGAGAGGTTAGGGAAGGCATGCTTATATAGTGTTCTTATGCATGTTGG 2520
............................................................
............................................................
2521 CGAAATGGTATATCGCGCGTGCAAATGCTGGGTGAAGATGGAGTTAAAGAATCTTCAGAG 2580
............................................................
............................................................
2581 GAATAATTAAAGGCGATCGATCGATTTATGCATTTCTGCGGGTTTTTTTTTTCTTCTCTC 2640
............................................................
............................................................
2641 TCTCTTTTGGTTTTGGGATAATGCTTGGCACCATTTCTGGGTTGTGAAAAAGATGAGCTG 2700
............................................................
............................................................
2701 ATAGATAGGTTGGTAAGGAATATGGAACATTTTGGCGGCGACGG 2744
............................................
............................................
.
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use