Oryza nivara (Oryza_nivara_v1.0)
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About this transcript

This transcript has 5 exons, is annotated with 18 domains and features and maps to 50 oligo probes.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-ONIVA03G40570.1738245aa
 
Protein coding
A0A0E0GVL7 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGGCCCCCGCGGCGCAGGTGGCGTCGAACCCGCGGACGGTGGAGGACATCTTCAAGGAT     60
     1 ATGGCCCCCGCGGCGCAGGTGGCGTCGAACCCGCGGACGGTGGAGGACATCTTCAAGGAT     60
     1 -M--A--P--A--A--Q--V--A--S--N--P--R--T--V--E--D--I--F--K--D-     20

                                                                          
    61 TACTCGGCGCGGCGCGGCGCGCTCGTCCGCGCGCTCACCTCAGATGTGGACGAGTTCTTC    120
    61 TACTCGGCGCGGCGCGGCGCGCTCGTCCGCGCGCTCACCTCAGATGTGGACGAGTTCTTC    120
    21 -Y--S--A--R--R--G--A--L--V--R--A--L--T--S--D--V--D--E--F--F-     40

                                                                          
   121 GGGCTCTGCGACCCAGATAAGGAGAATTTGTGCCTGTACGGCCTCGCCAACGGGAGCTGG    180
   121 GGGCTCTGCGACCCAGATAAGGAGAATTTGTGCCTGTACGGCCTCGCCAACGGGAGCTGG    180
    41 -G--L--C--D--P--D--K--E--N--L--C--L--Y--G--L--A--N--G--S--W-     60

                                                                          
   181 GAGGTGGCGCTGCCGGCGGAGGAGGTGCCGCCGGAGCTGCCCGAGCCGGCGCTCGGCATC    240
   181 GAGGTGGCGCTGCCGGCGGAGGAGGTGCCGCCGGAGCTGCCCGAGCCGGCGCTCGGCATC    240
    61 -E--V--A--L--P--A--E--E--V--P--P--E--L--P--E--P--A--L--G--I-     80

                                                                          
   241 AACTTCGCCCGCGACGGGATGAACCGCCGGGACTGGCTCTCCCTCGTCGCCGTCCACTCC    300
   241 AACTTCGCCCGCGACGGGATGAACCGCCGGGACTGGCTCTCCCTCGTCGCCGTCCACTCC    300
    81 -N--F--A--R--D--G--M--N--R--R--D--W--L--S--L--V--A--V--H--S-    100

                                                                          
   301 GACTCGTGGCTCGTCTCCGTCGCCTTCTTCTTCGCCGCGCGGCTCAACGGAAACGAACGG    360
   301 GACTCGTGGCTCGTCTCCGTCGCCTTCTTCTTCGCCGCGCGGCTCAACGGAAACGAACGG    360
   101 -D--S--W--L--V--S--V--A--F--F--F--A--A--R--L--N--G--N--E--R-    120

                                                                          
   361 AAGCGGCTCTTCAACATGATCAATGATCTACCTACTGTATATGAAGCATTGGTTGACAGG    420
   361 AAGCGGCTCTTCAACATGATCAATGATCTACCTACTGTATATGAAGCATTGGTTGACAGG    420
   121 -K--R--L--F--N--M--I--N--D--L--P--T--V--Y--E--A--L--V--D--R-    140

                                                                          
   421 AAGCACGTCAGGGATAGGTCTGGTGTCGATAGCAGCGGAAAATCCAAACATTCAACAAAG    480
   421 AAGCACGTCAGGGATAGGTCTGGTGTCGATAGCAGCGGAAAATCCAAACATTCAACAAAG    480
   141 -K--H--V--R--D--R--S--G--V--D--S--S--G--K--S--K--H--S--T--K-    160

                                                                          
   481 AGAACAGGCGAAGGGCAGGTAAAGCGCTCCAGGGTTGTCGCAGAGGAGTACGAGGACGAC    540
   481 AGAACAGGCGAAGGGCAGGTAAAGCGCTCCAGGGTTGTCGCAGAGGAGTACGAGGACGAC    540
   161 -R--T--G--E--G--Q--V--K--R--S--R--V--V--A--E--E--Y--E--D--D-    180

                                                                          
   541 GACGAAGAACACAACGAGACATTCTGCGGAACTTGCGGTGGCCTCTACAACGCGAACGAG    600
   541 GACGAAGAACACAACGAGACATTCTGCGGAACTTGCGGTGGCCTCTACAACGCGAACGAG    600
   181 -D--E--E--H--N--E--T--F--C--G--T--C--G--G--L--Y--N--A--N--E-    200

                                                                          
   601 TTCTGGATCGGGTGCGACATCTGTGAGCGGTGGTTCCACGGCAAATGCGTCAGGATAACC    660
   601 TTCTGGATCGGGTGCGACATCTGTGAGCGGTGGTTCCACGGCAAATGCGTCAGGATAACC    660
   201 -F--W--I--G--C--D--I--C--E--R--W--F--H--G--K--C--V--R--I--T-    220

                                                                          
   661 CCGGCTAAGGCGGAGCACATCAAGCACTACAAGTGCCCTGACTGCAGCAGCAGCTCCTCC    720
   661 CCGGCTAAGGCGGAGCACATCAAGCACTACAAGTGCCCTGACTGCAGCAGCAGCTCCTCC    720
   221 -P--A--K--A--E--H--I--K--H--Y--K--C--P--D--C--S--S--S--S--S-    240

                                                                          
   721 AAGAAAACCAGGCTATAG                                              738
   721 AAGAAAACCAGGCTATAG                                              738
   241 -K--K--T--R--L--*-                                              245