Transcript: ONIVA03G18210.1
.
Description
Zinc finger, RING-type;Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT1G09060) TAIR;Acc:AT1G09060]
Show/hide columns (1 hidden)
- ONIVA03G18210.1 3609 902aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0GMB6 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 AGGAGTTACTACTCCCCCGCACCAAAAACCAGGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACCA 60
............................................................
............................................................
61 GCAAGCGGAGAGGAGATGGAGACTACTACTACTCCTCCTACTTGCACCGCAGCCGCAGCC 120
............................................................
............................................................
121 GCAGCCCACCACCACCGTCCGCGCGCGCGGCTGCCTCCGCAACGCAACGAGGAGAAGAGT 180
............................................................
............................................................
181 CGAGGAGCCCAACCACCACCCGAGACTTGACCCCCACCCGCGACTCTCATTCGATCACGC 240
............................................................
............................................................
241 GGCGCCCACCCACGCTTTTACCCCTTCCTGGTTTCCTCTCCCCTCCTCCCCCTTCCCCTC 300
............................................................
............................................................
301 CCCGCGCGATCTCCCCAAACCCTAGAAACCCCCCTCCTCCGCCGCGGCGGCGCCGGCGGC 360
............................................................
............................................................
361 GGGGTGTGACGCCGCGGTGGGGGGACGGGG ATG GAG GCG GCG GCG GCG GCG GCC GCC GTG 420
..............................ATGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCGCCGTG 30
..............................-M--E--A--A--A--A--A--A--A--V- 10
421 CCG GAG GAG CTG CGG TGC AAG CGC TCC GAC GGC AAG CAG TGG CGA TGC AGC GCG CCC TCC 480
31 CCGGAGGAGCTGCGGTGCAAGCGCTCCGACGGCAAGCAGTGGCGATGCAGCGCGCCCTCC 90
11 -P--E--E--L--R--C--K--R--S--D--G--K--Q--W--R--C--S--A--P--S- 30
481 ATG CCC GAC AAG ACC GTC TGC GAG AAG CAC TAC GTC CAG GCC AAG AAG CGC GCC GCC TCC 540
91 ATGCCCGACAAGACCGTCTGCGAGAAGCACTACGTCCAGGCCAAGAAGCGCGCCGCCTCC 150
31 -M--P--D--K--T--V--C--E--K--H--Y--V--Q--A--K--K--R--A--A--S- 50
541 TCC GCG CTC CGG GCC TCC CTC CGC AGG TCC TCC GCC TCC GCC TCC GCC GCG CGG GGC ACG 600
151 TCCGCGCTCCGGGCCTCCCTCCGCAGGTCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCGCGCGGGGCACG 210
51 -S--A--L--R--A--S--L--R--R--S--S--A--S--A--S--A--A--R--G--T- 70
601 ACC CCG CCT GCG CGG ATG GCG GTC GCG AGG CCC ATC TAC GGC AGG GTC GCG GGG GAG CCG 660
211 ACCCCGCCTGCGCGGATGGCGGTCGCGAGGCCCATCTACGGCAGGGTCGCGGGGGAGCCG 270
71 -T--P--P--A--R--M--A--V--A--R--P--I--Y--G--R--V--A--G--E--P- 90
661 GTG TAC GTG GCG GAG CCG GCG CTG CCG CCG CCG CCG CCG CCA CGG AGG AGG CAA CCG GTC 720
271 GTGTACGTGGCGGAGCCGGCGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCACGGAGGAGGCAACCGGTC 330
91 -V--Y--V--A--E--P--A--L--P--P--P--P--P--P--R--R--R--Q--P--V- 110
721 CAC GGG CTG CCC ATG GGC AAT GCT GCC GGC GCG CGC ACC GCG GCG G AG CTG GTC GGG AGG 780
331 CACGGGCTGCCCATGGGCAATGCTGCCGGCGCGCGCACCGCGGCGGAGCTGGTCGGGAGG 390
111 -H--G--L--P--M--G--N--A--A--G--A--R--T--A--A--E--L--V--G--R- 130
781 GGC TCG GCG GGG CTG GTT GCC TGC AGC TCG GCG GCG GGG GCG GCA ACG GCC GCA ACC TGC 840
391 GGCTCGGCGGGGCTGGTTGCCTGCAGCTCGGCGGCGGGGGCGGCAACGGCCGCAACCTGC 450
131 -G--S--A--G--L--V--A--C--S--S--A--A--G--A--A--T--A--A--T--C- 150
841 CAT CAG TGC CGG AGG GTC GCT AAT ACC ATT TGT TGT ACA AGC TGC GAC AGA AGG GGG TAC 900
451 CATCAGTGCCGGAGGGTCGCTAATACCATTTGTTGTACAAGCTGCGACAGAAGGGGGTAC 510
151 -H--Q--C--R--R--V--A--N--T--I--C--C--T--S--C--D--R--R--G--Y- 170
901 TGC ACC AAC TGC ATC TCG AGA TG G TAC TCT GAT ATC CCA ATT GAT GAT GTT CGA AAG G CA 960
511 TGCACCAACTGCATCTCGAGATGGTACTCTGATATCCCAATTGATGATGTTCGAAAGGCA 570
171 -C--T--N--C--I--S--R--W--Y--S--D--I--P--I--D--D--V--R--K--A- 190
961 AGG GTT CAG GAG ATA TCT GCT GTA GAT AAG TTG GAA TAT CTT CAT AGC ATT CTG GCA TCT 1020
571 AGGGTTCAGGAGATATCTGCTGTAGATAAGTTGGAATATCTTCATAGCATTCTGGCATCT 630
191 -R--V--Q--E--I--S--A--V--D--K--L--E--Y--L--H--S--I--L--A--S- 210
1021 GTC CTT CCA GTA TTA AAG CAG ATT TAT TCT GAT CAA TGT TTC GAA ATT GGT GTT GAT ACA 1080
631 GTCCTTCCAGTATTAAAGCAGATTTATTCTGATCAATGTTTCGAAATTGGTGTTGATACA 690
211 -V--L--P--V--L--K--Q--I--Y--S--D--Q--C--F--E--I--G--V--D--T- 230
1081 AAA GCT TAT G G A CTT AGG ACA GAT ATA ATC AGG GTG AAG GTC AAT CCT GAT GAG CAA AT T 1140
691 AAAGCTTATGGACTTAGGACAGATATAATCAGGGTGAAGGTCAATCCTGATGAGCAAATT 750
231 -K--A--Y--G--L--R--T--D--I--I--R--V--K--V--N--P--D--E--Q--I- 250
1141 GAC TTC TGC AAA GTG CCA GTA TTT GAT TAT CAC CGA CAC TGC CCA AGG TGT TTG TAT GAC 1200
751 GACTTCTGCAAAGTGCCAGTATTTGATTATCACCGACACTGCCCAAGGTGTTTGTATGAC 810
251 -D--F--C--K--V--P--V--F--D--Y--H--R--H--C--P--R--C--L--Y--D- 270
1201 TTA TGT CTT GAC TGT TGT CGA GAC ATA AGG CGA TCT AGG ACC AGT GTT GCA AGA GGA GAA 1260
811 TTATGTCTTGACTGTTGTCGAGACATAAGGCGATCTAGGACCAGTGTTGCAAGAGGAGAA 870
271 -L--C--L--D--C--C--R--D--I--R--R--S--R--T--S--V--A--R--G--E- 290
1261 TAT GCT GAA GGT CGT GTG GTA GAT AGA AGT AAA GAT ACT TCG AAT AAA AGA GCA AGA ATG 1320
871 TATGCTGAAGGTCGTGTGGTAGATAGAAGTAAAGATACTTCGAATAAAAGAGCAAGAATG 930
291 -Y--A--E--G--R--V--V--D--R--S--K--D--T--S--N--K--R--A--R--M- 310
1321 GAA CCA TCT GCA GAA AGT GCA AAT GAT AAG TCA GTC CCA CAA CGA AGG GAC ATA AAA AAT 1380
931 GAACCATCTGCAGAAAGTGCAAATGATAAGTCAGTCCCACAACGAAGGGACATAAAAAAT 990
311 -E--P--S--A--E--S--A--N--D--K--S--V--P--Q--R--R--D--I--K--N- 330
1381 ATT GAC ATT AGA TCT TTA TTC CCT ACA TGG AGA GTC AAT AAT GAT GGA AGC ATT ACT TGT 1440
991 ATTGACATTAGATCTTTATTCCCTACATGGAGAGTCAATAATGATGGAAGCATTACTTGT 1050
331 -I--D--I--R--S--L--F--P--T--W--R--V--N--N--D--G--S--I--T--C- 350
1441 GGG CCT CAT GAG GCT GGT GGT TGT GGC TCC TCG AAG TTA GTG TTA AGG CGA ATA TTC AAA 1500
1051 GGGCCTCATGAGGCTGGTGGTTGTGGCTCCTCGAAGTTAGTGTTAAGGCGAATATTCAAA 1110
351 -G--P--H--E--A--G--G--C--G--S--S--K--L--V--L--R--R--I--F--K- 370
1501 ATA AAC TGG ATT AGT AAG CTT GTA AAA AAT TCT GAG GAA ATG GTC AAT GGT TGT AAA GTA 1560
1111 ATAAACTGGATTAGTAAGCTTGTAAAAAATTCTGAGGAAATGGTCAATGGTTGTAAAGTA 1170
371 -I--N--W--I--S--K--L--V--K--N--S--E--E--M--V--N--G--C--K--V- 390
1561 CAT GTT CTT GAG AAT GGA TGC TCA TCC TGC AAT GAT GGC AGA ACA TTA GAG TTA ACT GGT 1620
1171 CATGTTCTTGAGAATGGATGCTCATCCTGCAATGATGGCAGAACATTAGAGTTAACTGGT 1230
391 -H--V--L--E--N--G--C--S--S--C--N--D--G--R--T--L--E--L--T--G- 410
1621 CAT CGT AAC TTT GGT GTC TCA ACA TGT TCA AAT AAT GGT GGT ATT GAT CGG TTC TGT GTG 1680
1231 CATCGTAACTTTGGTGTCTCAACATGTTCAAATAATGGTGGTATTGATCGGTTCTGTGTG 1290
411 -H--R--N--F--G--V--S--T--C--S--N--N--G--G--I--D--R--F--C--V- 430
1681 TTC TCT CCT GTA TTA GAG GAC TTG AAA TCT GAA GGT ATT ATT CAT TTT CGT AAA CAC TGG 1740
1291 TTCTCTCCTGTATTAGAGGACTTGAAATCTGAAGGTATTATTCATTTTCGTAAACACTGG 1350
431 -F--S--P--V--L--E--D--L--K--S--E--G--I--I--H--F--R--K--H--W- 450
1741 ATA AAA GGA GAA CCT GTA GTT ATC AGG AAT GCG TTT GAG CCT TCT CTG TCA TCA AGC TGG 1800
1351 ATAAAAGGAGAACCTGTAGTTATCAGGAATGCGTTTGAGCCTTCTCTGTCATCAAGCTGG 1410
451 -I--K--G--E--P--V--V--I--R--N--A--F--E--P--S--L--S--S--S--W- 470
1801 GAC CCA CTA AAT ATT TGG CGA GGA ATC CAG GAA ATC ATG GAT GAA GAA GTG GAT GAC GAT 1860
1411 GACCCACTAAATATTTGGCGAGGAATCCAGGAAATCATGGATGAAGAAGTGGATGACGAT 1470
471 -D--P--L--N--I--W--R--G--I--Q--E--I--M--D--E--E--V--D--D--D- 490
1861 GTC ATT GTC AAA GCT GTG GAT TAC TCA AAC CAA GCA GAG G TG GAT ATT GAG CTG AAA CAG 1920
1471 GTCATTGTCAAAGCTGTGGATTACTCAAACCAAGCAGAGGTGGATATTGAGCTGAAACAG 1530
491 -V--I--V--K--A--V--D--Y--S--N--Q--A--E--V--D--I--E--L--K--Q- 510
1921 TTT ATC AAA GGT TAT TCA GAT GGT CAC AAG GGG GAA GAT GGG GAA TTG ATG ATG CTG AAA 1980
1531 TTTATCAAAGGTTATTCAGATGGTCACAAGGGGGAAGATGGGGAATTGATGATGCTGAAA 1590
511 -F--I--K--G--Y--S--D--G--H--K--G--E--D--G--E--L--M--M--L--K- 530
1981 TTG AAA GAG TGG CCC CCA CCC AGT GTA TTG GAG GAG TTT CTG CTA TGC CAA AGA CCA GAA 2040
1591 TTGAAAGAGTGGCCCCCACCCAGTGTATTGGAGGAGTTTCTGCTATGCCAAAGACCAGAA 1650
531 -L--K--E--W--P--P--P--S--V--L--E--E--F--L--L--C--Q--R--P--E- 550
2041 TTT ATT GTC AAT TTT CCA TTA GTT GAT TTT ATA CAT TCC AGG TGG GGG CTC CTA AAT CTT 2100
1651 TTTATTGTCAATTTTCCATTAGTTGATTTTATACATTCCAGGTGGGGGCTCCTAAATCTT 1710
551 -F--I--V--N--F--P--L--V--D--F--I--H--S--R--W--G--L--L--N--L- 570
2101 TCT GCT AAA TTG CCC CCA GAC ACC CTA CAA CCT GAA GTT GGC TTG AAG CTG TTA ATT GCA 2160
1711 TCTGCTAAATTGCCCCCAGACACCCTACAACCTGAAGTTGGCTTGAAGCTGTTAATTGCA 1770
571 -S--A--K--L--P--P--D--T--L--Q--P--E--V--G--L--K--L--L--I--A- 590
2161 TAT GGA AGA CAT CAA GAA GCT GGT AAA GGT GAT TCA GTG ACA AAT CTA ATG ATT AAC ATG 2220
1771 TATGGAAGACATCAAGAAGCTGGTAAAGGTGATTCAGTGACAAATCTAATGATTAACATG 1830
591 -Y--G--R--H--Q--E--A--G--K--G--D--S--V--T--N--L--M--I--N--M- 610
2221 GCT GAT GTG G TG CAT ATG CTA ATG CAT ACA GCC AAA GGG CAT GAC GTA TGT CCA AAG AGG 2280
1831 GCTGATGTGGTGCATATGCTAATGCATACAGCCAAAGGGCATGACGTATGTCCAAAGAGG 1890
611 -A--D--V--V--H--M--L--M--H--T--A--K--G--H--D--V--C--P--K--R- 630
2281 CTA CAA CCT GAG CAA TCT GAA AAG ATT GCC AAT GGA ATG ACA ATG CAT GTA AAT GCT CAT 2340
1891 CTACAACCTGAGCAATCTGAAAAGATTGCCAATGGAATGACAATGCATGTAAATGCTCAT 1950
631 -L--Q--P--E--Q--S--E--K--I--A--N--G--M--T--M--H--V--N--A--H- 650
2341 GCA CCT GTT CAA AAT TTG AAT GTG GAT ATG GGG CAA CAA TCA CCT GAC CAT GTA AGC TCA 2400
1951 GCACCTGTTCAAAATTTGAATGTGGATATGGGGCAACAATCACCTGACCATGTAAGCTCA 2010
651 -A--P--V--Q--N--L--N--V--D--M--G--Q--Q--S--P--D--H--V--S--S- 670
2401 AAG TTT GAT GAA AGA GCG CAT GCG TCT GCC TTG CGA TTA CAA GAG AAG TCT TCA GAT GCC 2460
2011 AAGTTTGATGAAAGAGCGCATGCGTCTGCCTTGCGATTACAAGAGAAGTCTTCAGATGCC 2070
671 -K--F--D--E--R--A--H--A--S--A--L--R--L--Q--E--K--S--S--D--A- 690
2461 AAA CTT AAT TGT GGT TTC GAA GGC TCT TCA ACT GAG TTA TCT TGC TCG TCA CAT TCA GAG 2520
2071 AAACTTAATTGTGGTTTCGAAGGCTCTTCAACTGAGTTATCTTGCTCGTCACATTCAGAG 2130
691 -K--L--N--C--G--F--E--G--S--S--T--E--L--S--C--S--S--H--S--E- 710
2521 GAA CCA AAA GTT AAT GGT TCA GAA AGA AGT CAG GCT GGT GCT GTT TGG GAT GTG TTC CGC 2580
2131 GAACCAAAAGTTAATGGTTCAGAAAGAAGTCAGGCTGGTGCTGTTTGGGATGTGTTCCGC 2190
711 -E--P--K--V--N--G--S--E--R--S--Q--A--G--A--V--W--D--V--F--R- 730
2581 AGG CAG GAT ATT TCA AAG CTG AAT GAA TAT TTA ACT GCT AAC TGG GAA GAA CTG GCA GCT 2640
2191 AGGCAGGATATTTCAAAGCTGAATGAATATTTAACTGCTAACTGGGAAGAACTGGCAGCT 2250
731 -R--Q--D--I--S--K--L--N--E--Y--L--T--A--N--W--E--E--L--A--A- 750
2641 AGT AGT CAG G TT AAG AAT CCT ATT TAT GAA CAA TCT ATA TAT CTC AAC AAG TAT CAT AAA 2700
2251 AGTAGTCAGGTTAAGAATCCTATTTATGAACAATCTATATATCTCAACAAGTATCATAAA 2310
751 -S--S--Q--V--K--N--P--I--Y--E--Q--S--I--Y--L--N--K--Y--H--K- 770
2701 AGG ATA CTG AAG GAT CAA TAT G G A ATT GAA CCC TGG ACA TTC CAA CAA CAT ATC GGT GAG 2760
2311 AGGATACTGAAGGATCAATATGGAATTGAACCCTGGACATTCCAACAACATATCGGTGAG 2370
771 -R--I--L--K--D--Q--Y--G--I--E--P--W--T--F--Q--Q--H--I--G--E- 790
2761 GCT GTA TTT GTT CCT GCT GGC TGC CCA TTC CAA GTG AAA AAT CTC CAG TCT ACG GTT CAA 2820
2371 GCTGTATTTGTTCCTGCTGGCTGCCCATTCCAAGTGAAAAATCTCCAGTCTACGGTTCAA 2430
791 -A--V--F--V--P--A--G--C--P--F--Q--V--K--N--L--Q--S--T--V--Q- 810
2821 TTG GCT CTT GAT TTC CTG TCA CCG GAA AGT TTG GGG GAG TCG GCC CGA ATG GCC CAG GAG 2880
2431 TTGGCTCTTGATTTCCTGTCACCGGAAAGTTTGGGGGAGTCGGCCCGAATGGCCCAGGAG 2490
811 -L--A--L--D--F--L--S--P--E--S--L--G--E--S--A--R--M--A--Q--E- 830
2881 ATT CGC TGC CTA CCA AAT GAT CAT GAT GCA AAA CTG AAG ATG CTC GAG A TT GGA AAA ATC 2940
2491 ATTCGCTGCCTACCAAATGATCATGATGCAAAACTGAAGATGCTCGAGATTGGAAAAATC 2550
831 -I--R--C--L--P--N--D--H--D--A--K--L--K--M--L--E--I--G--K--I- 850
2941 TCT TTA TAT GCA GCC AGT TCT GCT GTC AGA GAA ATT CAG AGA ATA ACC CTC GAT CCC AA G 3000
2551 TCTTTATATGCAGCCAGTTCTGCTGTCAGAGAAATTCAGAGAATAACCCTCGATCCCAAG 2610
851 -S--L--Y--A--A--S--S--A--V--R--E--I--Q--R--I--T--L--D--P--K- 870
3001 TTT AAT CTA GAC CTT AAA TTC GAG GAT CAG AAT CTA ACT CAG GCG GTT TCT GAG AAC TTG 3060
2611 TTTAATCTAGACCTTAAATTCGAGGATCAGAATCTAACTCAGGCGGTTTCTGAGAACTTG 2670
871 -F--N--L--D--L--K--F--E--D--Q--N--L--T--Q--A--V--S--E--N--L- 890
3061 GCT AGA GTC ACC AAA CAA CGG AAT GTA CCA TGC AGC TGA GATACTCCATTTAAATTAGAT 3120
2671 GCTAGAGTCACCAAACAACGGAATGTACCATGCAGCTGA..................... 2709
891 -A--R--V--T--K--Q--R--N--V--P--C--S--*-..................... 902
3121 ATAGCAATTGTACATGTATTACATGGTGTCATATGAAAGGAACACAATGACACATTCTAA 3180
............................................................
............................................................
3181 TTGTTATCAGATAGCATAAGCCCTCACCTGTATATTGGAATTGGACTAGGACTAACGGCT 3240
............................................................
............................................................
3241 GAGCTCATGTAAACAGAATAAACGTGGAGCAATTATTTAGCATTAGATTGTCAGAATGAG 3300
............................................................
............................................................
3301 ATTTACTGGGTTGCTTAGAGACTGTCACTTTGATACAACTAATTCTTCTGCCGCTTCTGG 3360
............................................................
............................................................
3361 GAGAAATTTTACATCTGTTGACTGTTATTAAGTAACTTTGCTTAACATGTTGAACTTGTT 3420
............................................................
............................................................
3421 ACAGTGAGCAAGCTGTATTCTGGAGATTGGCACTGTTTTATCATGGTGAATGTGCATTTT 3480
............................................................
............................................................
3481 CTCGAAAGAGAACTAGTCTCCTTCCATTGCAGATAAACTAGATTACGAAGTACTCCCTCC 3540
............................................................
............................................................
3541 GTCCCATAATATAAGGGATTTTGAGTTTTTGCTTGTCCTGTTTGACCACTCACCTTATTA 3600
............................................................
............................................................
3601 AAAAAATTT 3609
.........
.........
.
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use