Oryza nivara (Oryza_nivara_v1.0)
Description

Zinc finger, RING-type;Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT1G09060) TAIR;Acc:AT1G09060]

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This transcript has 13 exons, is annotated with 25 domains and features and maps to 58 oligo probes.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-ONIVA03G18210.13609902aa
 
Protein coding
A0A0E0GMB6 Ensembl Canonical
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     1 AGGAGTTACTACTCCCCCGCACCAAAAACCAGGCGCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACCA     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 GCAAGCGGAGAGGAGATGGAGACTACTACTACTCCTCCTACTTGCACCGCAGCCGCAGCC    120
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   121 GCAGCCCACCACCACCGTCCGCGCGCGCGGCTGCCTCCGCAACGCAACGAGGAGAAGAGT    180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   181 CGAGGAGCCCAACCACCACCCGAGACTTGACCCCCACCCGCGACTCTCATTCGATCACGC    240
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   241 GGCGCCCACCCACGCTTTTACCCCTTCCTGGTTTCCTCTCCCCTCCTCCCCCTTCCCCTC    300
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   301 CCCGCGCGATCTCCCCAAACCCTAGAAACCCCCCTCCTCCGCCGCGGCGGCGCCGGCGGC    360
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
   361 GGGGTGTGACGCCGCGGTGGGGGGACGGGGATGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCGCCGTG    420
       ..............................ATGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCCGCCGTG     30
       ..............................-M--E--A--A--A--A--A--A--A--V-     10

                                                                          
   421 CCGGAGGAGCTGCGGTGCAAGCGCTCCGACGGCAAGCAGTGGCGATGCAGCGCGCCCTCC    480
    31 CCGGAGGAGCTGCGGTGCAAGCGCTCCGACGGCAAGCAGTGGCGATGCAGCGCGCCCTCC     90
    11 -P--E--E--L--R--C--K--R--S--D--G--K--Q--W--R--C--S--A--P--S-     30

                                                                          
   481 ATGCCCGACAAGACCGTCTGCGAGAAGCACTACGTCCAGGCCAAGAAGCGCGCCGCCTCC    540
    91 ATGCCCGACAAGACCGTCTGCGAGAAGCACTACGTCCAGGCCAAGAAGCGCGCCGCCTCC    150
    31 -M--P--D--K--T--V--C--E--K--H--Y--V--Q--A--K--K--R--A--A--S-     50

                                                                          
   541 TCCGCGCTCCGGGCCTCCCTCCGCAGGTCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCGCGCGGGGCACG    600
   151 TCCGCGCTCCGGGCCTCCCTCCGCAGGTCCTCCGCCTCCGCCTCCGCCGCGCGGGGCACG    210
    51 -S--A--L--R--A--S--L--R--R--S--S--A--S--A--S--A--A--R--G--T-     70

                                                                          
   601 ACCCCGCCTGCGCGGATGGCGGTCGCGAGGCCCATCTACGGCAGGGTCGCGGGGGAGCCG    660
   211 ACCCCGCCTGCGCGGATGGCGGTCGCGAGGCCCATCTACGGCAGGGTCGCGGGGGAGCCG    270
    71 -T--P--P--A--R--M--A--V--A--R--P--I--Y--G--R--V--A--G--E--P-     90

                                                                          
   661 GTGTACGTGGCGGAGCCGGCGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCACGGAGGAGGCAACCGGTC    720
   271 GTGTACGTGGCGGAGCCGGCGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCCACGGAGGAGGCAACCGGTC    330
    91 -V--Y--V--A--E--P--A--L--P--P--P--P--P--P--R--R--R--Q--P--V-    110

                                                                          
   721 CACGGGCTGCCCATGGGCAATGCTGCCGGCGCGCGCACCGCGGCGGAGCTGGTCGGGAGG    780
   331 CACGGGCTGCCCATGGGCAATGCTGCCGGCGCGCGCACCGCGGCGGAGCTGGTCGGGAGG    390
   111 -H--G--L--P--M--G--N--A--A--G--A--R--T--A--A--E--L--V--G--R-    130

                                                                          
   781 GGCTCGGCGGGGCTGGTTGCCTGCAGCTCGGCGGCGGGGGCGGCAACGGCCGCAACCTGC    840
   391 GGCTCGGCGGGGCTGGTTGCCTGCAGCTCGGCGGCGGGGGCGGCAACGGCCGCAACCTGC    450
   131 -G--S--A--G--L--V--A--C--S--S--A--A--G--A--A--T--A--A--T--C-    150

                                                                          
   841 CATCAGTGCCGGAGGGTCGCTAATACCATTTGTTGTACAAGCTGCGACAGAAGGGGGTAC    900
   451 CATCAGTGCCGGAGGGTCGCTAATACCATTTGTTGTACAAGCTGCGACAGAAGGGGGTAC    510
   151 -H--Q--C--R--R--V--A--N--T--I--C--C--T--S--C--D--R--R--G--Y-    170

                                                                          
   901 TGCACCAACTGCATCTCGAGATGGTACTCTGATATCCCAATTGATGATGTTCGAAAGGCA    960
   511 TGCACCAACTGCATCTCGAGATGGTACTCTGATATCCCAATTGATGATGTTCGAAAGGCA    570
   171 -C--T--N--C--I--S--R--W--Y--S--D--I--P--I--D--D--V--R--K--A-    190

                                                                          
   961 AGGGTTCAGGAGATATCTGCTGTAGATAAGTTGGAATATCTTCATAGCATTCTGGCATCT   1020
   571 AGGGTTCAGGAGATATCTGCTGTAGATAAGTTGGAATATCTTCATAGCATTCTGGCATCT    630
   191 -R--V--Q--E--I--S--A--V--D--K--L--E--Y--L--H--S--I--L--A--S-    210

                                                                          
  1021 GTCCTTCCAGTATTAAAGCAGATTTATTCTGATCAATGTTTCGAAATTGGTGTTGATACA   1080
   631 GTCCTTCCAGTATTAAAGCAGATTTATTCTGATCAATGTTTCGAAATTGGTGTTGATACA    690
   211 -V--L--P--V--L--K--Q--I--Y--S--D--Q--C--F--E--I--G--V--D--T-    230

                                                                          
  1081 AAAGCTTATGGACTTAGGACAGATATAATCAGGGTGAAGGTCAATCCTGATGAGCAAATT   1140
   691 AAAGCTTATGGACTTAGGACAGATATAATCAGGGTGAAGGTCAATCCTGATGAGCAAATT    750
   231 -K--A--Y--G--L--R--T--D--I--I--R--V--K--V--N--P--D--E--Q--I-    250

                                                                          
  1141 GACTTCTGCAAAGTGCCAGTATTTGATTATCACCGACACTGCCCAAGGTGTTTGTATGAC   1200
   751 GACTTCTGCAAAGTGCCAGTATTTGATTATCACCGACACTGCCCAAGGTGTTTGTATGAC    810
   251 -D--F--C--K--V--P--V--F--D--Y--H--R--H--C--P--R--C--L--Y--D-    270

                                                                          
  1201 TTATGTCTTGACTGTTGTCGAGACATAAGGCGATCTAGGACCAGTGTTGCAAGAGGAGAA   1260
   811 TTATGTCTTGACTGTTGTCGAGACATAAGGCGATCTAGGACCAGTGTTGCAAGAGGAGAA    870
   271 -L--C--L--D--C--C--R--D--I--R--R--S--R--T--S--V--A--R--G--E-    290

                                                                          
  1261 TATGCTGAAGGTCGTGTGGTAGATAGAAGTAAAGATACTTCGAATAAAAGAGCAAGAATG   1320
   871 TATGCTGAAGGTCGTGTGGTAGATAGAAGTAAAGATACTTCGAATAAAAGAGCAAGAATG    930
   291 -Y--A--E--G--R--V--V--D--R--S--K--D--T--S--N--K--R--A--R--M-    310

                                                                          
  1321 GAACCATCTGCAGAAAGTGCAAATGATAAGTCAGTCCCACAACGAAGGGACATAAAAAAT   1380
   931 GAACCATCTGCAGAAAGTGCAAATGATAAGTCAGTCCCACAACGAAGGGACATAAAAAAT    990
   311 -E--P--S--A--E--S--A--N--D--K--S--V--P--Q--R--R--D--I--K--N-    330

                                                                          
  1381 ATTGACATTAGATCTTTATTCCCTACATGGAGAGTCAATAATGATGGAAGCATTACTTGT   1440
   991 ATTGACATTAGATCTTTATTCCCTACATGGAGAGTCAATAATGATGGAAGCATTACTTGT   1050
   331 -I--D--I--R--S--L--F--P--T--W--R--V--N--N--D--G--S--I--T--C-    350

                                                                          
  1441 GGGCCTCATGAGGCTGGTGGTTGTGGCTCCTCGAAGTTAGTGTTAAGGCGAATATTCAAA   1500
  1051 GGGCCTCATGAGGCTGGTGGTTGTGGCTCCTCGAAGTTAGTGTTAAGGCGAATATTCAAA   1110
   351 -G--P--H--E--A--G--G--C--G--S--S--K--L--V--L--R--R--I--F--K-    370

                                                                          
  1501 ATAAACTGGATTAGTAAGCTTGTAAAAAATTCTGAGGAAATGGTCAATGGTTGTAAAGTA   1560
  1111 ATAAACTGGATTAGTAAGCTTGTAAAAAATTCTGAGGAAATGGTCAATGGTTGTAAAGTA   1170
   371 -I--N--W--I--S--K--L--V--K--N--S--E--E--M--V--N--G--C--K--V-    390

                                                                          
  1561 CATGTTCTTGAGAATGGATGCTCATCCTGCAATGATGGCAGAACATTAGAGTTAACTGGT   1620
  1171 CATGTTCTTGAGAATGGATGCTCATCCTGCAATGATGGCAGAACATTAGAGTTAACTGGT   1230
   391 -H--V--L--E--N--G--C--S--S--C--N--D--G--R--T--L--E--L--T--G-    410

                                                                          
  1621 CATCGTAACTTTGGTGTCTCAACATGTTCAAATAATGGTGGTATTGATCGGTTCTGTGTG   1680
  1231 CATCGTAACTTTGGTGTCTCAACATGTTCAAATAATGGTGGTATTGATCGGTTCTGTGTG   1290
   411 -H--R--N--F--G--V--S--T--C--S--N--N--G--G--I--D--R--F--C--V-    430

                                                                          
  1681 TTCTCTCCTGTATTAGAGGACTTGAAATCTGAAGGTATTATTCATTTTCGTAAACACTGG   1740
  1291 TTCTCTCCTGTATTAGAGGACTTGAAATCTGAAGGTATTATTCATTTTCGTAAACACTGG   1350
   431 -F--S--P--V--L--E--D--L--K--S--E--G--I--I--H--F--R--K--H--W-    450

                                                                          
  1741 ATAAAAGGAGAACCTGTAGTTATCAGGAATGCGTTTGAGCCTTCTCTGTCATCAAGCTGG   1800
  1351 ATAAAAGGAGAACCTGTAGTTATCAGGAATGCGTTTGAGCCTTCTCTGTCATCAAGCTGG   1410
   451 -I--K--G--E--P--V--V--I--R--N--A--F--E--P--S--L--S--S--S--W-    470

                                                                          
  1801 GACCCACTAAATATTTGGCGAGGAATCCAGGAAATCATGGATGAAGAAGTGGATGACGAT   1860
  1411 GACCCACTAAATATTTGGCGAGGAATCCAGGAAATCATGGATGAAGAAGTGGATGACGAT   1470
   471 -D--P--L--N--I--W--R--G--I--Q--E--I--M--D--E--E--V--D--D--D-    490

                                                                          
  1861 GTCATTGTCAAAGCTGTGGATTACTCAAACCAAGCAGAGGTGGATATTGAGCTGAAACAG   1920
  1471 GTCATTGTCAAAGCTGTGGATTACTCAAACCAAGCAGAGGTGGATATTGAGCTGAAACAG   1530
   491 -V--I--V--K--A--V--D--Y--S--N--Q--A--E--V--D--I--E--L--K--Q-    510

                                                                          
  1921 TTTATCAAAGGTTATTCAGATGGTCACAAGGGGGAAGATGGGGAATTGATGATGCTGAAA   1980
  1531 TTTATCAAAGGTTATTCAGATGGTCACAAGGGGGAAGATGGGGAATTGATGATGCTGAAA   1590
   511 -F--I--K--G--Y--S--D--G--H--K--G--E--D--G--E--L--M--M--L--K-    530

                                                                          
  1981 TTGAAAGAGTGGCCCCCACCCAGTGTATTGGAGGAGTTTCTGCTATGCCAAAGACCAGAA   2040
  1591 TTGAAAGAGTGGCCCCCACCCAGTGTATTGGAGGAGTTTCTGCTATGCCAAAGACCAGAA   1650
   531 -L--K--E--W--P--P--P--S--V--L--E--E--F--L--L--C--Q--R--P--E-    550

                                                                          
  2041 TTTATTGTCAATTTTCCATTAGTTGATTTTATACATTCCAGGTGGGGGCTCCTAAATCTT   2100
  1651 TTTATTGTCAATTTTCCATTAGTTGATTTTATACATTCCAGGTGGGGGCTCCTAAATCTT   1710
   551 -F--I--V--N--F--P--L--V--D--F--I--H--S--R--W--G--L--L--N--L-    570

                                                                          
  2101 TCTGCTAAATTGCCCCCAGACACCCTACAACCTGAAGTTGGCTTGAAGCTGTTAATTGCA   2160
  1711 TCTGCTAAATTGCCCCCAGACACCCTACAACCTGAAGTTGGCTTGAAGCTGTTAATTGCA   1770
   571 -S--A--K--L--P--P--D--T--L--Q--P--E--V--G--L--K--L--L--I--A-    590

                                                                          
  2161 TATGGAAGACATCAAGAAGCTGGTAAAGGTGATTCAGTGACAAATCTAATGATTAACATG   2220
  1771 TATGGAAGACATCAAGAAGCTGGTAAAGGTGATTCAGTGACAAATCTAATGATTAACATG   1830
   591 -Y--G--R--H--Q--E--A--G--K--G--D--S--V--T--N--L--M--I--N--M-    610

                                                                          
  2221 GCTGATGTGGTGCATATGCTAATGCATACAGCCAAAGGGCATGACGTATGTCCAAAGAGG   2280
  1831 GCTGATGTGGTGCATATGCTAATGCATACAGCCAAAGGGCATGACGTATGTCCAAAGAGG   1890
   611 -A--D--V--V--H--M--L--M--H--T--A--K--G--H--D--V--C--P--K--R-    630

                                                                          
  2281 CTACAACCTGAGCAATCTGAAAAGATTGCCAATGGAATGACAATGCATGTAAATGCTCAT   2340
  1891 CTACAACCTGAGCAATCTGAAAAGATTGCCAATGGAATGACAATGCATGTAAATGCTCAT   1950
   631 -L--Q--P--E--Q--S--E--K--I--A--N--G--M--T--M--H--V--N--A--H-    650

                                                                          
  2341 GCACCTGTTCAAAATTTGAATGTGGATATGGGGCAACAATCACCTGACCATGTAAGCTCA   2400
  1951 GCACCTGTTCAAAATTTGAATGTGGATATGGGGCAACAATCACCTGACCATGTAAGCTCA   2010
   651 -A--P--V--Q--N--L--N--V--D--M--G--Q--Q--S--P--D--H--V--S--S-    670

                                                                          
  2401 AAGTTTGATGAAAGAGCGCATGCGTCTGCCTTGCGATTACAAGAGAAGTCTTCAGATGCC   2460
  2011 AAGTTTGATGAAAGAGCGCATGCGTCTGCCTTGCGATTACAAGAGAAGTCTTCAGATGCC   2070
   671 -K--F--D--E--R--A--H--A--S--A--L--R--L--Q--E--K--S--S--D--A-    690

                                                                          
  2461 AAACTTAATTGTGGTTTCGAAGGCTCTTCAACTGAGTTATCTTGCTCGTCACATTCAGAG   2520
  2071 AAACTTAATTGTGGTTTCGAAGGCTCTTCAACTGAGTTATCTTGCTCGTCACATTCAGAG   2130
   691 -K--L--N--C--G--F--E--G--S--S--T--E--L--S--C--S--S--H--S--E-    710

                                                                          
  2521 GAACCAAAAGTTAATGGTTCAGAAAGAAGTCAGGCTGGTGCTGTTTGGGATGTGTTCCGC   2580
  2131 GAACCAAAAGTTAATGGTTCAGAAAGAAGTCAGGCTGGTGCTGTTTGGGATGTGTTCCGC   2190
   711 -E--P--K--V--N--G--S--E--R--S--Q--A--G--A--V--W--D--V--F--R-    730

                                                                          
  2581 AGGCAGGATATTTCAAAGCTGAATGAATATTTAACTGCTAACTGGGAAGAACTGGCAGCT   2640
  2191 AGGCAGGATATTTCAAAGCTGAATGAATATTTAACTGCTAACTGGGAAGAACTGGCAGCT   2250
   731 -R--Q--D--I--S--K--L--N--E--Y--L--T--A--N--W--E--E--L--A--A-    750

                                                                          
  2641 AGTAGTCAGGTTAAGAATCCTATTTATGAACAATCTATATATCTCAACAAGTATCATAAA   2700
  2251 AGTAGTCAGGTTAAGAATCCTATTTATGAACAATCTATATATCTCAACAAGTATCATAAA   2310
   751 -S--S--Q--V--K--N--P--I--Y--E--Q--S--I--Y--L--N--K--Y--H--K-    770

                                                                          
  2701 AGGATACTGAAGGATCAATATGGAATTGAACCCTGGACATTCCAACAACATATCGGTGAG   2760
  2311 AGGATACTGAAGGATCAATATGGAATTGAACCCTGGACATTCCAACAACATATCGGTGAG   2370
   771 -R--I--L--K--D--Q--Y--G--I--E--P--W--T--F--Q--Q--H--I--G--E-    790

                                                                          
  2761 GCTGTATTTGTTCCTGCTGGCTGCCCATTCCAAGTGAAAAATCTCCAGTCTACGGTTCAA   2820
  2371 GCTGTATTTGTTCCTGCTGGCTGCCCATTCCAAGTGAAAAATCTCCAGTCTACGGTTCAA   2430
   791 -A--V--F--V--P--A--G--C--P--F--Q--V--K--N--L--Q--S--T--V--Q-    810

                                                                          
  2821 TTGGCTCTTGATTTCCTGTCACCGGAAAGTTTGGGGGAGTCGGCCCGAATGGCCCAGGAG   2880
  2431 TTGGCTCTTGATTTCCTGTCACCGGAAAGTTTGGGGGAGTCGGCCCGAATGGCCCAGGAG   2490
   811 -L--A--L--D--F--L--S--P--E--S--L--G--E--S--A--R--M--A--Q--E-    830

                                                                          
  2881 ATTCGCTGCCTACCAAATGATCATGATGCAAAACTGAAGATGCTCGAGATTGGAAAAATC   2940
  2491 ATTCGCTGCCTACCAAATGATCATGATGCAAAACTGAAGATGCTCGAGATTGGAAAAATC   2550
   831 -I--R--C--L--P--N--D--H--D--A--K--L--K--M--L--E--I--G--K--I-    850

                                                                          
  2941 TCTTTATATGCAGCCAGTTCTGCTGTCAGAGAAATTCAGAGAATAACCCTCGATCCCAAG   3000
  2551 TCTTTATATGCAGCCAGTTCTGCTGTCAGAGAAATTCAGAGAATAACCCTCGATCCCAAG   2610
   851 -S--L--Y--A--A--S--S--A--V--R--E--I--Q--R--I--T--L--D--P--K-    870

                                                                          
  3001 TTTAATCTAGACCTTAAATTCGAGGATCAGAATCTAACTCAGGCGGTTTCTGAGAACTTG   3060
  2611 TTTAATCTAGACCTTAAATTCGAGGATCAGAATCTAACTCAGGCGGTTTCTGAGAACTTG   2670
   871 -F--N--L--D--L--K--F--E--D--Q--N--L--T--Q--A--V--S--E--N--L-    890

                                                                          
  3061 GCTAGAGTCACCAAACAACGGAATGTACCATGCAGCTGAGATACTCCATTTAAATTAGAT   3120
  2671 GCTAGAGTCACCAAACAACGGAATGTACCATGCAGCTGA.....................   2709
   891 -A--R--V--T--K--Q--R--N--V--P--C--S--*-.....................    902

                                                                          
  3121 ATAGCAATTGTACATGTATTACATGGTGTCATATGAAAGGAACACAATGACACATTCTAA   3180
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3181 TTGTTATCAGATAGCATAAGCCCTCACCTGTATATTGGAATTGGACTAGGACTAACGGCT   3240
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3241 GAGCTCATGTAAACAGAATAAACGTGGAGCAATTATTTAGCATTAGATTGTCAGAATGAG   3300
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3301 ATTTACTGGGTTGCTTAGAGACTGTCACTTTGATACAACTAATTCTTCTGCCGCTTCTGG   3360
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3361 GAGAAATTTTACATCTGTTGACTGTTATTAAGTAACTTTGCTTAACATGTTGAACTTGTT   3420
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3421 ACAGTGAGCAAGCTGTATTCTGGAGATTGGCACTGTTTTATCATGGTGAATGTGCATTTT   3480
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3481 CTCGAAAGAGAACTAGTCTCCTTCCATTGCAGATAAACTAGATTACGAAGTACTCCCTCC   3540
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3541 GTCCCATAATATAAGGGATTTTGAGTTTTTGCTTGTCCTGTTTGACCACTCACCTTATTA   3600
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  3601 AAAAAATTT                                                      3609
       .........                                                          
       .........