Oryza nivara (Oryza_nivara_v1.0)
Description

RING-type E3 ubiquitin transferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A0E0FWN9]

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About this transcript

This transcript has 9 exons, is annotated with 24 domains and features and maps to 40 oligo probes.

Gene
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  • UniProt
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-ONIVA01G44470.22838945aa
 
Protein coding
A0A0E0FWN9 Ensembl Canonical
-ONIVA01G44470.12700899aa
 
Protein coding
A0A0E0FWN8 -
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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  • Another exon
Variants
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Other
  • UTR
Markup
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     1 ATGAGCACAAAAAAGCGAGCGAGGTGGGACCCACCTCCTGAGGAGGAAAACGGTGGGCCC     60
     1 ATGAGCACAAAAAAGCGAGCGAGGTGGGACCCACCTCCTGAGGAGGAAAACGGTGGGCCC     60
     1 -M--S--T--K--K--R--A--R--W--D--P--P--P--E--E--E--N--G--G--P-     20

                                                                          
    61 ACCCGTCAGTCGGCGCAGGCCGGTACAACAGCACTGCGAGACTGCCGGTGGGGCCCTCGG    120
    61 ACCCGTCAGTCGGCGCAGGCCGGTACAACAGCACTGCGAGACTGCCGGTGGGGCCCTCGG    120
    21 -T--R--Q--S--A--Q--A--G--T--T--A--L--R--D--C--R--W--G--P--R-     40

                                                                          
   121 GTCTCAGGTGGGGAGCAGTTGCTGCCGTCCTGCAGCCGCATCCGCGCACCCCGTGCACCT    180
   121 GTCTCAGGTGGGGAGCAGTTGCTGCCGTCCTGCAGCCGCATCCGCGCACCCCGTGCACCT    180
    41 -V--S--G--G--E--Q--L--L--P--S--C--S--R--I--R--A--P--R--A--P-     60

                                                                          
   181 GGTCTACCGTACGCCTCCCCCTACCTGCAGATGGGCCCTACCTTGTCATTGTCACTACTC    240
   181 GGTCTACCGTACGCCTCCCCCTACCTGCAGATGGGCCCTACCTTGTCATTGTCACTACTC    240
    61 -G--L--P--Y--A--S--P--Y--L--Q--M--G--P--T--L--S--L--S--L--L-     80

                                                                          
   241 GATAGTATTTCAAATTTCCGGGTGCTGTCTTCAAGCAATGCCTCGAAAACAGAGCTAGTT    300
   241 GATAGTATTTCAAATTTCCGGGTGCTGTCTTCAAGCAATGCCTCGAAAACAGAGCTAGTT    300
    81 -D--S--I--S--N--F--R--V--L--S--S--S--N--A--S--K--T--E--L--V-    100

                                                                          
   301 AAGAAATATTGCCAAACGATGGATGGCATCCTTGATCACTTGGAGGTGGCCCTAAACAGA    360
   301 AAGAAATATTGCCAAACGATGGATGGCATCCTTGATCACTTGGAGGTGGCCCTAAACAGA    360
   101 -K--K--Y--C--Q--T--M--D--G--I--L--D--H--L--E--V--A--L--N--R-    120

                                                                          
   361 GCTTTTCCTCAGATTACTCCAGATGGTGAACTAAGTAAAGTGCTTGAAGAACTTGGCGCT    420
   361 GCTTTTCCTCAGATTACTCCAGATGGTGAACTAAGTAAAGTGCTTGAAGAACTTGGCGCT    420
   121 -A--F--P--Q--I--T--P--D--G--E--L--S--K--V--L--E--E--L--G--A-    140

                                                                          
   421 ACCATCAATGAAGCGACTGAGCTAGTTGGAGGCTGGAATCAAATGATGAGCAAGATTTAT    480
   421 ACCATCAATGAAGCGACTGAGCTAGTTGGAGGCTGGAATCAAATGATGAGCAAGATTTAT    480
   141 -T--I--N--E--A--T--E--L--V--G--G--W--N--Q--M--M--S--K--I--Y-    160

                                                                          
   481 TTTGTTATTCAGGCTGATTCAATTATTGCCAAGATGCAGATATATGTATTCGAATTATGC    540
   481 TTTGTTATTCAGGCTGATTCAATTATTGCCAAGATGCAGATATATGTATTCGAATTATGC    540
   161 -F--V--I--Q--A--D--S--I--I--A--K--M--Q--I--Y--V--F--E--L--C-    180

                                                                          
   541 CAAATTGTCAATTCTCTCATGCAGATTGAGTCAATGCATTTGGAGGATCTTGAACACGAT    600
   541 CAAATTGTCAATTCTCTCATGCAGATTGAGTCAATGCATTTGGAGGATCTTGAACACGAT    600
   181 -Q--I--V--N--S--L--M--Q--I--E--S--M--H--L--E--D--L--E--H--D-    200

                                                                          
   601 AGCTGTGGAAAAATTTCAGATGTCATTAGGGAGGCTTCCAGGGCTTTAGCAGGGGAAGTT    660
   601 AGCTGTGGAAAAATTTCAGATGTCATTAGGGAGGCTTCCAGGGCTTTAGCAGGGGAAGTT    660
   201 -S--C--G--K--I--S--D--V--I--R--E--A--S--R--A--L--A--G--E--V-    220

                                                                          
   661 ATGCCAAATTCAGAGGAATTTGGAAAGATTCAAACTACTTTGAGCTTATCCACAAATCAG    720
   661 ATGCCAAATTCAGAGGAATTTGGAAAGATTCAAACTACTTTGAGCTTATCCACAAATCAG    720
   221 -M--P--N--S--E--E--F--G--K--I--Q--T--T--L--S--L--S--T--N--Q-    240

                                                                          
   721 GAGTTGCTGATGGAATATGTTGCACTTGTTAAGGTTAAAACAAAAGGTAATCATGAAGAT    780
   721 GAGTTGCTGATGGAATATGTTGCACTTGTTAAGGTTAAAACAAAAGGTAATCATGAAGAT    780
   241 -E--L--L--M--E--Y--V--A--L--V--K--V--K--T--K--G--N--H--E--D-    260

                                                                          
   781 AACAAAGAAATGGATGATATTAACGATATTGTTGAATTAGTCAACCATATGCTTGACAAA    840
   781 AACAAAGAAATGGATGATATTAACGATATTGTTGAATTAGTCAACCATATGCTTGACAAA    840
   261 -N--K--E--M--D--D--I--N--D--I--V--E--L--V--N--H--M--L--D--K-    280

                                                                          
   841 CATGTGGAAGAAAAGCAAACACGTAGCATTGATGGAGTGACCATTCCTGCTGATTTTTGT    900
   841 CATGTGGAAGAAAAGCAAACACGTAGCATTGATGGAGTGACCATTCCTGCTGATTTTTGT    900
   281 -H--V--E--E--K--Q--T--R--S--I--D--G--V--T--I--P--A--D--F--C-    300

                                                                          
   901 TGTCCTCTTTCCCTTGAACTAATGTCGGATCCAGTGATTGTGGCATCTGGTCAAACGTAT    960
   901 TGTCCTCTTTCCCTTGAACTAATGTCGGATCCAGTGATTGTGGCATCTGGTCAAACGTAT    960
   301 -C--P--L--S--L--E--L--M--S--D--P--V--I--V--A--S--G--Q--T--Y-    320

                                                                          
   961 GAGCATGTTTTTATCAGAAAATGGTTTGATCTGGGATACAACATTTGTCCAAAGACACGC   1020
   961 GAGCATGTTTTTATCAGAAAATGGTTTGATCTGGGATACAACATTTGTCCAAAGACACGC   1020
   321 -E--H--V--F--I--R--K--W--F--D--L--G--Y--N--I--C--P--K--T--R-    340

                                                                          
  1021 CAAATATTGGGACACACCAAATTGATTCCTAACTTCACTGTCAAACAGTTGATTGAAAAT   1080
  1021 CAAATATTGGGACACACCAAATTGATTCCTAACTTCACTGTCAAACAGTTGATTGAAAAT   1080
   341 -Q--I--L--G--H--T--K--L--I--P--N--F--T--V--K--Q--L--I--E--N-    360

                                                                          
  1081 TGGTGTGAGGTACATGGTATAATGCTACCAGATCCTGTTAAACTCTTGAGTTTGTGCTTC   1140
  1081 TGGTGTGAGGTACATGGTATAATGCTACCAGATCCTGTTAAACTCTTGAGTTTGTGCTTC   1140
   361 -W--C--E--V--H--G--I--M--L--P--D--P--V--K--L--L--S--L--C--F-    380

                                                                          
  1141 CCTGTTTCCCTCAACATCACAGATGGAAGTGCAAGTGCAGACAAGTCTGGATCACCAGAA   1200
  1141 CCTGTTTCCCTCAACATCACAGATGGAAGTGCAAGTGCAGACAAGTCTGGATCACCAGAA   1200
   381 -P--V--S--L--N--I--T--D--G--S--A--S--A--D--K--S--G--S--P--E-    400

                                                                          
  1201 CACTGCCAATTGGTAGCTGCATTGCATCCAAAAGCACAGTGCGCATCGGATGATAGTCAT   1260
  1201 CACTGCCAATTGGTAGCTGCATTGCATCCAAAAGCACAGTGCGCATCGGATGATAGTCAT   1260
   401 -H--C--Q--L--V--A--A--L--H--P--K--A--Q--C--A--S--D--D--S--H-    420

                                                                          
  1261 CATTATAATTTGATGCATGAAAACTCTGATTCAGATGATAGAGTGTCATCATTTGGAGAC   1320
  1261 CATTATAATTTGATGCATGAAAACTCTGATTCAGATGATAGAGTGTCATCATTTGGAGAC   1320
   421 -H--Y--N--L--M--H--E--N--S--D--S--D--D--R--V--S--S--F--G--D-    440

                                                                          
  1321 ACAGATGATTCTGAACCTGATTCTTTAAGATTATCAACAGAAACTACTGCAGCAAACAAA   1380
  1321 ACAGATGATTCTGAACCTGATTCTTTAAGATTATCAACAGAAACTACTGCAGCAAACAAA   1380
   441 -T--D--D--S--E--P--D--S--L--R--L--S--T--E--T--T--A--A--N--K-    460

                                                                          
  1381 TCTCTACTTGATGAAAAAACTGATCGTTCTGATGGTCTTAAGCAATTGAGAGACAATGGT   1440
  1381 TCTCTACTTGATGAAAAAACTGATCGTTCTGATGGTCTTAAGCAATTGAGAGACAATGGT   1440
   461 -S--L--L--D--E--K--T--D--R--S--D--G--L--K--Q--L--R--D--N--G-    480

                                                                          
  1441 TTTCAAGTTTCTGATGAGGAACAGTATCTCGAAAGGAATGGTAAAAGTCATATCAGCAGC   1500
  1441 TTTCAAGTTTCTGATGAGGAACAGTATCTCGAAAGGAATGGTAAAAGTCATATCAGCAGC   1500
   481 -F--Q--V--S--D--E--E--Q--Y--L--E--R--N--G--K--S--H--I--S--S-    500

                                                                          
  1501 CATCATCAACTTGAAGTTGATGGAGAGAATGTCAGGGTACAAGCATCAAGTGACATCAAT   1560
  1501 CATCATCAACTTGAAGTTGATGGAGAGAATGTCAGGGTACAAGCATCAAGTGACATCAAT   1560
   501 -H--H--Q--L--E--V--D--G--E--N--V--R--V--Q--A--S--S--D--I--N-    520

                                                                          
  1561 GCATCTGAAGTTATGCAAGATGATCCGGTCACCACATGTTCAAAGGTATCAGATAACCCT   1620
  1561 GCATCTGAAGTTATGCAAGATGATCCGGTCACCACATGTTCAAAGGTATCAGATAACCCT   1620
   521 -A--S--E--V--M--Q--D--D--P--V--T--T--C--S--K--V--S--D--N--P-    540

                                                                          
  1621 CCTAGATTGGGTGGTGTTCGTTCTCGAAATCAGCCAAACTGGTGGAGACAGTCTAATAAA   1680
  1621 CCTAGATTGGGTGGTGTTCGTTCTCGAAATCAGCCAAACTGGTGGAGACAGTCTAATAAA   1680
   541 -P--R--L--G--G--V--R--S--R--N--Q--P--N--W--W--R--Q--S--N--K-    560

                                                                          
  1681 ACTATTCCTAGGATCGGATTGTCATCTTCGACAGATTCAAAACCAGATTTTTCTGGCAAT   1740
  1681 ACTATTCCTAGGATCGGATTGTCATCTTCGACAGATTCAAAACCAGATTTTTCTGGCAAT   1740
   561 -T--I--P--R--I--G--L--S--S--S--T--D--S--K--P--D--F--S--G--N-    580

                                                                          
  1741 GATGCTAAAGTGCGTAATCTTATCGAGGAACTGAAAAGTGATTCTGCTGAGGTCCAAAGG   1800
  1741 GATGCTAAAGTGCGTAATCTTATCGAGGAACTGAAAAGTGATTCTGCTGAGGTCCAAAGG   1800
   581 -D--A--K--V--R--N--L--I--E--E--L--K--S--D--S--A--E--V--Q--R-    600

                                                                          
  1801 TCAGCAACAGGAGAGCTCCGCATTCTTTCTAGACACAGCTTGGAGAATAGAATTGCCATC   1860
  1801 TCAGCAACAGGAGAGCTCCGCATTCTTTCTAGACACAGCTTGGAGAATAGAATTGCCATC   1860
   601 -S--A--T--G--E--L--R--I--L--S--R--H--S--L--E--N--R--I--A--I-    620

                                                                          
  1861 GCAAACTGCGGAGCAATCCCCTTCTTGGTGGGAAACCCCGAAGCGAAAGCCAACTCAGCT   1920
  1861 GCAAACTGCGGAGCAATCCCCTTCTTGGTGGGAAACCCCGAAGCGAAAGCCAACTCAGCT   1920
   621 -A--N--C--G--A--I--P--F--L--V--G--N--P--E--A--K--A--N--S--A-    640

                                                                          
  1921 GCAACTTTATTCAGCCTCTCAGTCATTGAAGAGAACAAGATCAAGATTGGACGTTCCGGT   1980
  1921 GCAACTTTATTCAGCCTCTCAGTCATTGAAGAGAACAAGATCAAGATTGGACGTTCCGGT   1980
   641 -A--T--L--F--S--L--S--V--I--E--E--N--K--I--K--I--G--R--S--G-    660

                                                                          
  1981 GCCATCGAACCATTAGTAGATTTACTGGGAGAAGGTACCCCGCAAGGGAAGAAGGATGCA   2040
  1981 GCCATCGAACCATTAGTAGATTTACTGGGAGAAGGTACCCCGCAAGGGAAGAAGGATGCA   2040
   661 -A--I--E--P--L--V--D--L--L--G--E--G--T--P--Q--G--K--K--D--A-    680

                                                                          
  2041 GCTACTGCACTCTTCAATCTGTCGATATTTCATGAACACAAGACCCGCATTGTTCAGGCT   2100
  2041 GCTACTGCACTCTTCAATCTGTCGATATTTCATGAACACAAGACCCGCATTGTTCAGGCT   2100
   681 -A--T--A--L--F--N--L--S--I--F--H--E--H--K--T--R--I--V--Q--A-    700

                                                                          
  2101 GGGGCTGTCAACCACCTGGTGGAGCTGATGGATCCAGCTGCTGGGATGGTTGATAAAGCT   2160
  2101 GGGGCTGTCAACCACCTGGTGGAGCTGATGGATCCAGCTGCTGGGATGGTTGATAAAGCT   2160
   701 -G--A--V--N--H--L--V--E--L--M--D--P--A--A--G--M--V--D--K--A-    720

                                                                          
  2161 GTTGCTGTTCTGGCAAACCTTGCGACTGTGCATGATGGAAGGAATGCCATTGCTCAGGCA   2220
  2161 GTTGCTGTTCTGGCAAACCTTGCGACTGTGCATGATGGAAGGAATGCCATTGCTCAGGCA   2220
   721 -V--A--V--L--A--N--L--A--T--V--H--D--G--R--N--A--I--A--Q--A-    740

                                                                          
  2221 GGAGGCATCCGGGTACTGGTTGAGGTTGTTGAGCTGGGTTCTGCACGTTCAAAGGAGAAT   2280
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   741 -G--G--I--R--V--L--V--E--V--V--E--L--G--S--A--R--S--K--E--N-    760

                                                                          
  2281 GCCGCTGCTGCCCTGCTACAACTCTGCACAAACAGTAACAGGTTTTGCACCCTGGTTCTT   2340
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   761 -A--A--A--A--L--L--Q--L--C--T--N--S--N--R--F--C--T--L--V--L-    780

                                                                          
  2341 CAAGAAGGCGTCGTGCCACCTTTGGTTGCATTGTCGCAATCAGGCACAGCCCGTGCAAGA   2400
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   781 -Q--E--G--V--V--P--P--L--V--A--L--S--Q--S--G--T--A--R--A--R-    800

                                                                          
  2401 GAGAAGGCTCAGGTTCTTCTAAGCTATTTTCGCAACCAGCGCCACGTCAGGGTTGGGAGA   2460
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   801 -E--K--A--Q--V--L--L--S--Y--F--R--N--Q--R--H--V--R--V--G--R-    820

                                                                          
  2461 GGGCCCATGGCCTCTGTTAGCAGGACGGAATCATTCTGTGTCTGGCCTAATCTCCACACC   2520
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   821 -G--P--M--A--S--V--S--R--T--E--S--F--C--V--W--P--N--L--H--T-    840

                                                                          
  2521 CTGAAGTCCGGAGGGAAGAAGCGATTCCGGTGCCAGTTCCGCATATGCTCCATTACCCAG   2580
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   841 -L--K--S--G--G--K--K--R--F--R--C--Q--F--R--I--C--S--I--T--Q-    860

                                                                          
  2581 GAATGCCACCATTACAAAGGTCTTTACCAGAAAAAATATTTGAGGAGAAGGCAGAGGCAC   2640
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   861 -E--C--H--H--Y--K--G--L--Y--Q--K--K--Y--L--R--R--R--Q--R--H-    880

                                                                          
  2641 AGAATAACCTTCTGGAGGTTCCTCTTCAACAACCTCCAAGATATCAGCTACTTGTCCTGA   2700
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   881 -R--I--T--F--W--R--F--L--F--N--N--L--Q--D--I--S--Y--L--S--*-    899