Transcript: ONIVA01G44470.1
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Description
RING-type E3 ubiquitin transferase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A0E0FWN9 ]
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- ONIVA01G44470.2 2838 945aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0FWN9 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical, - ONIVA01G44470.1 2700 899aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0FWN8 -
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG AGC ACA AAA AAG CGA GCG AGG TGG GAC CCA CCT CCT GAG GAG GAA AAC GGT GGG CCC 60
1 ATGAGCACAAAAAAGCGAGCGAGGTGGGACCCACCTCCTGAGGAGGAAAACGGTGGGCCC 60
1 -M--S--T--K--K--R--A--R--W--D--P--P--P--E--E--E--N--G--G--P- 20
61 ACC CGT CAG TCG GCG CAG GCC GGT ACA ACA GCA CTG CGA GAC TGC CGG TGG GGC CCT CGG 120
61 ACCCGTCAGTCGGCGCAGGCCGGTACAACAGCACTGCGAGACTGCCGGTGGGGCCCTCGG 120
21 -T--R--Q--S--A--Q--A--G--T--T--A--L--R--D--C--R--W--G--P--R- 40
121 GTC TCA GGT GGG GAG CAG TTG CTG CCG TCC TGC AGC CGC ATC CGC GCA CCC CGT GCA CCT 180
121 GTCTCAGGTGGGGAGCAGTTGCTGCCGTCCTGCAGCCGCATCCGCGCACCCCGTGCACCT 180
41 -V--S--G--G--E--Q--L--L--P--S--C--S--R--I--R--A--P--R--A--P- 60
181 GGT CTA CCG TAC GCC TCC CCC TAC CTG CAG ATG GGC CCT ACC T T G TCA TTG TCA CTA CTC 240
181 GGTCTACCGTACGCCTCCCCCTACCTGCAGATGGGCCCTACCTTGTCATTGTCACTACTC 240
61 -G--L--P--Y--A--S--P--Y--L--Q--M--G--P--T--L--S--L--S--L--L- 80
241 GAT AGT ATT TCA AAT TTC CGG GTG CTG TCT TCA AGC AAT GCC TCG AAA ACA GAG CTA GTT 300
241 GATAGTATTTCAAATTTCCGGGTGCTGTCTTCAAGCAATGCCTCGAAAACAGAGCTAGTT 300
81 -D--S--I--S--N--F--R--V--L--S--S--S--N--A--S--K--T--E--L--V- 100
301 AAG AAA TAT TGC CAA ACG ATG GAT GGC ATC CTT GAT CAC TTG GAG GTG GCC CTA AAC AGA 360
301 AAGAAATATTGCCAAACGATGGATGGCATCCTTGATCACTTGGAGGTGGCCCTAAACAGA 360
101 -K--K--Y--C--Q--T--M--D--G--I--L--D--H--L--E--V--A--L--N--R- 120
361 GCT TTT CCT CAG ATT ACT CCA GAT GGT GAA CTA AGT AAA GTG CTT GAA GAA CTT GGC GCT 420
361 GCTTTTCCTCAGATTACTCCAGATGGTGAACTAAGTAAAGTGCTTGAAGAACTTGGCGCT 420
121 -A--F--P--Q--I--T--P--D--G--E--L--S--K--V--L--E--E--L--G--A- 140
421 ACC ATC AAT GAA GCG ACT GAG CTA GTT GGA GGC TGG AAT CAA ATG ATG AGC AAG ATT TAT 480
421 ACCATCAATGAAGCGACTGAGCTAGTTGGAGGCTGGAATCAAATGATGAGCAAGATTTAT 480
141 -T--I--N--E--A--T--E--L--V--G--G--W--N--Q--M--M--S--K--I--Y- 160
481 TTT GTT ATT CAG GCT GAT TCA ATT ATT GCC AAG ATG CAG ATA TAT GTA TTC GAA TTA TGC 540
481 TTTGTTATTCAGGCTGATTCAATTATTGCCAAGATGCAGATATATGTATTCGAATTATGC 540
161 -F--V--I--Q--A--D--S--I--I--A--K--M--Q--I--Y--V--F--E--L--C- 180
541 CAA ATT GTC AAT TCT CTC ATG CAG ATT GAG TCA ATG CAT TTG GAG G AT CTT GAA CAC GAT 600
541 CAAATTGTCAATTCTCTCATGCAGATTGAGTCAATGCATTTGGAGGATCTTGAACACGAT 600
181 -Q--I--V--N--S--L--M--Q--I--E--S--M--H--L--E--D--L--E--H--D- 200
601 AGC TGT GGA AAA ATT TCA GAT GTC ATT AGG GAG GCT TCC AGG GCT TTA GCA GGG GAA GTT 660
601 AGCTGTGGAAAAATTTCAGATGTCATTAGGGAGGCTTCCAGGGCTTTAGCAGGGGAAGTT 660
201 -S--C--G--K--I--S--D--V--I--R--E--A--S--R--A--L--A--G--E--V- 220
661 ATG CCA AAT TCA GAG GAA TTT GGA AAG ATT CAA ACT ACT TTG AGC TTA TCC ACA AAT CAG 720
661 ATGCCAAATTCAGAGGAATTTGGAAAGATTCAAACTACTTTGAGCTTATCCACAAATCAG 720
221 -M--P--N--S--E--E--F--G--K--I--Q--T--T--L--S--L--S--T--N--Q- 240
721 GAG TTG CTG ATG GAA TAT GTT GCA CTT GTT AAG GTT AAA ACA AAA GGT AAT CAT GAA GAT 780
721 GAGTTGCTGATGGAATATGTTGCACTTGTTAAGGTTAAAACAAAAGGTAATCATGAAGAT 780
241 -E--L--L--M--E--Y--V--A--L--V--K--V--K--T--K--G--N--H--E--D- 260
781 AAC AAA GAA ATG GAT GAT ATT AAC GAT ATT GTT GAA TTA GTC AAC CAT ATG CTT GAC AAA 840
781 AACAAAGAAATGGATGATATTAACGATATTGTTGAATTAGTCAACCATATGCTTGACAAA 840
261 -N--K--E--M--D--D--I--N--D--I--V--E--L--V--N--H--M--L--D--K- 280
841 CAT GTG GAA GAA AAG CAA ACA CGT AGC ATT GAT GGA GTG ACC ATT CCT GCT GAT TTT TGT 900
841 CATGTGGAAGAAAAGCAAACACGTAGCATTGATGGAGTGACCATTCCTGCTGATTTTTGT 900
281 -H--V--E--E--K--Q--T--R--S--I--D--G--V--T--I--P--A--D--F--C- 300
901 TGT CCT CTT TCC CTT GAA CTA ATG TCG GAT CCA GTG ATT GTG GCA TCT GGT CAA ACG TAT 960
901 TGTCCTCTTTCCCTTGAACTAATGTCGGATCCAGTGATTGTGGCATCTGGTCAAACGTAT 960
301 -C--P--L--S--L--E--L--M--S--D--P--V--I--V--A--S--G--Q--T--Y- 320
961 GAG CAT GTT TTT ATC AGA AAA TGG TTT GAT CTG GGA TAC AAC ATT TGT CCA AAG ACA CGC 1020
961 GAGCATGTTTTTATCAGAAAATGGTTTGATCTGGGATACAACATTTGTCCAAAGACACGC 1020
321 -E--H--V--F--I--R--K--W--F--D--L--G--Y--N--I--C--P--K--T--R- 340
1021 CAA ATA TTG GGA CAC ACC AAA TTG ATT CCT AAC TTC ACT GTC AAA CAG TTG ATT GAA AAT 1080
1021 CAAATATTGGGACACACCAAATTGATTCCTAACTTCACTGTCAAACAGTTGATTGAAAAT 1080
341 -Q--I--L--G--H--T--K--L--I--P--N--F--T--V--K--Q--L--I--E--N- 360
1081 TGG TGT GAG GTA CAT GGT ATA ATG CTA CCA GAT CCT GTT AAA CTC TTG AGT TTG TGC TTC 1140
1081 TGGTGTGAGGTACATGGTATAATGCTACCAGATCCTGTTAAACTCTTGAGTTTGTGCTTC 1140
361 -W--C--E--V--H--G--I--M--L--P--D--P--V--K--L--L--S--L--C--F- 380
1141 CCT GTT TCC CTC AAC ATC ACA GAT GGA AGT GCA AGT GCA GAC AAG TCT GGA TCA CCA GAA 1200
1141 CCTGTTTCCCTCAACATCACAGATGGAAGTGCAAGTGCAGACAAGTCTGGATCACCAGAA 1200
381 -P--V--S--L--N--I--T--D--G--S--A--S--A--D--K--S--G--S--P--E- 400
1201 CAC TGC CAA TTG GTA GCT GCA TTG CAT CCA AAA GCA CAG TGC GCA TCG GAT GAT AGT CAT 1260
1201 CACTGCCAATTGGTAGCTGCATTGCATCCAAAAGCACAGTGCGCATCGGATGATAGTCAT 1260
401 -H--C--Q--L--V--A--A--L--H--P--K--A--Q--C--A--S--D--D--S--H- 420
1261 CAT TAT AAT TTG ATG CAT GAA AAC TCT GAT TCA GAT GAT AGA GTG TCA TCA TTT GGA GAC 1320
1261 CATTATAATTTGATGCATGAAAACTCTGATTCAGATGATAGAGTGTCATCATTTGGAGAC 1320
421 -H--Y--N--L--M--H--E--N--S--D--S--D--D--R--V--S--S--F--G--D- 440
1321 ACA GAT GAT TCT GAA CCT GAT TCT TTA AGA TTA TCA ACA GAA ACT ACT GCA GCA AAC AAA 1380
1321 ACAGATGATTCTGAACCTGATTCTTTAAGATTATCAACAGAAACTACTGCAGCAAACAAA 1380
441 -T--D--D--S--E--P--D--S--L--R--L--S--T--E--T--T--A--A--N--K- 460
1381 TCT CTA CTT GAT GAA AAA ACT GAT CGT TCT GAT GGT CTT AAG CAA TTG AGA GAC AAT GGT 1440
1381 TCTCTACTTGATGAAAAAACTGATCGTTCTGATGGTCTTAAGCAATTGAGAGACAATGGT 1440
461 -S--L--L--D--E--K--T--D--R--S--D--G--L--K--Q--L--R--D--N--G- 480
1441 TTT CAA GTT TCT GAT GAG GAA CAG TAT CTC GAA AGG AAT GGT AAA AGT CAT ATC AGC AGC 1500
1441 TTTCAAGTTTCTGATGAGGAACAGTATCTCGAAAGGAATGGTAAAAGTCATATCAGCAGC 1500
481 -F--Q--V--S--D--E--E--Q--Y--L--E--R--N--G--K--S--H--I--S--S- 500
1501 CAT CAT CAA CTT GAA GTT GAT GGA GAG AAT GTC AGG GTA CAA GCA TCA AGT GAC ATC AAT 1560
1501 CATCATCAACTTGAAGTTGATGGAGAGAATGTCAGGGTACAAGCATCAAGTGACATCAAT 1560
501 -H--H--Q--L--E--V--D--G--E--N--V--R--V--Q--A--S--S--D--I--N- 520
1561 GCA TCT GAA GTT ATG CAA GAT GAT CCG GTC ACC ACA TGT TCA AAG GTA TCA GAT AAC CCT 1620
1561 GCATCTGAAGTTATGCAAGATGATCCGGTCACCACATGTTCAAAGGTATCAGATAACCCT 1620
521 -A--S--E--V--M--Q--D--D--P--V--T--T--C--S--K--V--S--D--N--P- 540
1621 CCT AGA TTG GGT GGT GTT CGT TCT CGA AAT CAG CCA AAC TGG TGG AGA CAG TCT AAT AAA 1680
1621 CCTAGATTGGGTGGTGTTCGTTCTCGAAATCAGCCAAACTGGTGGAGACAGTCTAATAAA 1680
541 -P--R--L--G--G--V--R--S--R--N--Q--P--N--W--W--R--Q--S--N--K- 560
1681 ACT ATT CCT AGG ATC GGA TTG TCA TCT TCG ACA GAT TCA AAA CCA GAT TTT TCT GGC AAT 1740
1681 ACTATTCCTAGGATCGGATTGTCATCTTCGACAGATTCAAAACCAGATTTTTCTGGCAAT 1740
561 -T--I--P--R--I--G--L--S--S--S--T--D--S--K--P--D--F--S--G--N- 580
1741 GAT GCT AAA GTG CGT AAT CTT ATC GAG GAA CTG AAA AGT GAT TCT GCT GAG GTC CAA AGG 1800
1741 GATGCTAAAGTGCGTAATCTTATCGAGGAACTGAAAAGTGATTCTGCTGAGGTCCAAAGG 1800
581 -D--A--K--V--R--N--L--I--E--E--L--K--S--D--S--A--E--V--Q--R- 600
1801 TCA GCA ACA GGA GAG CTC CGC ATT CTT TCT AGA CAC AGC TTG GAG AAT AGA ATT GCC ATC 1860
1801 TCAGCAACAGGAGAGCTCCGCATTCTTTCTAGACACAGCTTGGAGAATAGAATTGCCATC 1860
601 -S--A--T--G--E--L--R--I--L--S--R--H--S--L--E--N--R--I--A--I- 620
1861 GCA AAC TGC GGA GCA ATC CCC TTC TTG G TG GGA AAC CCC GAA GCG AAA GCC AAC TCA GCT 1920
1861 GCAAACTGCGGAGCAATCCCCTTCTTGGTGGGAAACCCCGAAGCGAAAGCCAACTCAGCT 1920
621 -A--N--C--G--A--I--P--F--L--V--G--N--P--E--A--K--A--N--S--A- 640
1921 GCA ACT TTA TTC AGC CTC TCA GTC ATT GAA GAG AAC AAG ATC AAG ATT GGA CGT TCC GGT 1980
1921 GCAACTTTATTCAGCCTCTCAGTCATTGAAGAGAACAAGATCAAGATTGGACGTTCCGGT 1980
641 -A--T--L--F--S--L--S--V--I--E--E--N--K--I--K--I--G--R--S--G- 660
1981 GCC ATC GAA CCA TTA GTA GAT TTA CTG GGA GAA GGT ACC CCG CAA GGG AAG AAG GAT GCA 2040
1981 GCCATCGAACCATTAGTAGATTTACTGGGAGAAGGTACCCCGCAAGGGAAGAAGGATGCA 2040
661 -A--I--E--P--L--V--D--L--L--G--E--G--T--P--Q--G--K--K--D--A- 680
2041 GCT ACT GCA CTC TTC AAT CTG TCG ATA TTT CAT GAA CAC AAG ACC CGC ATT GTT CAG GCT 2100
2041 GCTACTGCACTCTTCAATCTGTCGATATTTCATGAACACAAGACCCGCATTGTTCAGGCT 2100
681 -A--T--A--L--F--N--L--S--I--F--H--E--H--K--T--R--I--V--Q--A- 700
2101 GGG GCT GTC AAC CAC CTG GTG GAG CTG ATG GAT CCA GCT GCT GGG ATG GTT GAT AAA GCT 2160
2101 GGGGCTGTCAACCACCTGGTGGAGCTGATGGATCCAGCTGCTGGGATGGTTGATAAAGCT 2160
701 -G--A--V--N--H--L--V--E--L--M--D--P--A--A--G--M--V--D--K--A- 720
2161 GTT GCT GTT CTG GCA AAC CTT GCG ACT GTG CAT GAT GGA AGG AAT GCC ATT GCT CAG GCA 2220
2161 GTTGCTGTTCTGGCAAACCTTGCGACTGTGCATGATGGAAGGAATGCCATTGCTCAGGCA 2220
721 -V--A--V--L--A--N--L--A--T--V--H--D--G--R--N--A--I--A--Q--A- 740
2221 GGA GGC ATC CGG GTA CTG GTT GAG GTT GTT GAG CTG GGT TCT GCA CGT TCA AAG GAG AAT 2280
2221 GGAGGCATCCGGGTACTGGTTGAGGTTGTTGAGCTGGGTTCTGCACGTTCAAAGGAGAAT 2280
741 -G--G--I--R--V--L--V--E--V--V--E--L--G--S--A--R--S--K--E--N- 760
2281 GCC GCT GCT GCC CTG CTA CAA CTC TGC ACA AAC AGT AAC AGG TTT TGC ACC CTG GTT CTT 2340
2281 GCCGCTGCTGCCCTGCTACAACTCTGCACAAACAGTAACAGGTTTTGCACCCTGGTTCTT 2340
761 -A--A--A--A--L--L--Q--L--C--T--N--S--N--R--F--C--T--L--V--L- 780
2341 CAA GAA GGC GTC GTG CCA CCT TTG GTT GCA TTG TCG CAA TCA GGC ACA GCC CGT GCA AGA 2400
2341 CAAGAAGGCGTCGTGCCACCTTTGGTTGCATTGTCGCAATCAGGCACAGCCCGTGCAAGA 2400
781 -Q--E--G--V--V--P--P--L--V--A--L--S--Q--S--G--T--A--R--A--R- 800
2401 GAG AAG GCT CAG GTT CTT CTA AGC TAT TTT CGC AAC CAG CGC CAC GTC AGG GTT GGG AGA 2460
2401 GAGAAGGCTCAGGTTCTTCTAAGCTATTTTCGCAACCAGCGCCACGTCAGGGTTGGGAGA 2460
801 -E--K--A--Q--V--L--L--S--Y--F--R--N--Q--R--H--V--R--V--G--R- 820
2461 GG G CCC ATG GCC TCT GTT AGC AGG ACG GAA TCA TTC TGT GTC TGG CCT AAT CTC CAC ACC 2520
2461 GGGCCCATGGCCTCTGTTAGCAGGACGGAATCATTCTGTGTCTGGCCTAATCTCCACACC 2520
821 -G--P--M--A--S--V--S--R--T--E--S--F--C--V--W--P--N--L--H--T- 840
2521 CTG AAG TCC GGA GGG AAG AAG CGA TTC CGG TGC CAG TTC CGC ATA TGC TCC ATT ACC CAG 2580
2521 CTGAAGTCCGGAGGGAAGAAGCGATTCCGGTGCCAGTTCCGCATATGCTCCATTACCCAG 2580
841 -L--K--S--G--G--K--K--R--F--R--C--Q--F--R--I--C--S--I--T--Q- 860
2581 GAA TGC CAC CAT TAC AAA GGT CTT TAC CAG AAA AAA TAT TTG AGG AGA AGG CAG AGG CAC 2640
2581 GAATGCCACCATTACAAAGGTCTTTACCAGAAAAAATATTTGAGGAGAAGGCAGAGGCAC 2640
861 -E--C--H--H--Y--K--G--L--Y--Q--K--K--Y--L--R--R--R--Q--R--H- 880
2641 AGA ATA ACC TTC TGG AGG TTC CTC TTC AAC AAC CTC CAA GAT ATC AGC TAC TTG TCC TGA 2700
2641 AGAATAACCTTCTGGAGGTTCCTCTTCAACAACCTCCAAGATATCAGCTACTTGTCCTGA 2700
881 -R--I--T--F--W--R--F--L--F--N--N--L--Q--D--I--S--Y--L--S--*- 899
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