Oryza nivara (Oryza_nivara_v1.0)
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This transcript has 11 exons and is annotated with 22 domains and features.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-ONIVA01G38650.11569522aa
 
Protein coding
A0A0E0FUE4 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
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Other
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     1 ATGCCCGCGCAGAAGCGCCGGCTCTCGTCGTCGCCGTCTTCGAGGCCCCGCGACCACGTG     60
     1 ATGCCCGCGCAGAAGCGCCGGCTCTCGTCGTCGCCGTCTTCGAGGCCCCGCGACCACGTG     60
     1 -M--P--A--Q--K--R--R--L--S--S--S--P--S--S--R--P--R--D--H--V-     20

                                                                          
    61 GAGACTAACGGGATGACTGGTGCTTCGAAGGCCGCCGCCGGCAGCGGCGGCGGAGGAGGA    120
    61 GAGACTAACGGGATGACTGGTGCTTCGAAGGCCGCCGCCGGCAGCGGCGGCGGAGGAGGA    120
    21 -E--T--N--G--M--T--G--A--S--K--A--A--A--G--S--G--G--G--G--G-     40

                                                                          
   121 GGAGGAAGCGGAGGGGGAGTTCCGCTGCCGCCGAGGGGAGGTTCCGCCGCCGCCGCCGCC    180
   121 GGAGGAAGCGGAGGGGGAGTTCCGCTGCCGCCGAGGGGAGGTTCCGCCGCCGCCGCCGCC    180
    41 -G--G--S--G--G--G--V--P--L--P--P--R--G--G--S--A--A--A--A--A-     60

                                                                          
   181 GCCGCCGCCAAGCGGGCGGCTGACCCGCAGCCTCAGCGCGAAGGCGATTCGGACGCGGAG    240
   181 GCCGCCGCCAAGCGGGCGGCTGACCCGCAGCCTCAGCGCGAAGGCGATTCGGACGCGGAG    240
    61 -A--A--A--K--R--A--A--D--P--Q--P--Q--R--E--G--D--S--D--A--E-     80

                                                                          
   241 TTCGGCGGCGGCGTGGACGGCGACAGCGAGTCGTCGCAGAGCGACGGCGACATGGACGAG    300
   241 TTCGGCGGCGGCGTGGACGGCGACAGCGAGTCGTCGCAGAGCGACGGCGACATGGACGAG    300
    81 -F--G--G--G--V--D--G--D--S--E--S--S--Q--S--D--G--D--M--D--E-    100

                                                                          
   301 TTCATAATAGTGAAATTAGCAGAAATACGAAAGGAGGTCCAATGCCCTATCTGTTTAGGG    360
   301 TTCATAATAGTGAAATTAGCAGAAATACGAAAGGAGGTCCAATGCCCTATCTGTTTAGGG    360
   101 -F--I--I--V--K--L--A--E--I--R--K--E--V--Q--C--P--I--C--L--G-    120

                                                                          
   361 ATTATCCGGAAAACAAGAACTGTTATGGAGTGTTTACATCGGTTTTGCAGGGATTGCATA    420
   361 ATTATCCGGAAAACAAGAACTGTTATGGAGTGTTTACATCGGTTTTGCAGGGATTGCATA    420
   121 -I--I--R--K--T--R--T--V--M--E--C--L--H--R--F--C--R--D--C--I-    140

                                                                          
   421 GATAAATCTATGCGGCTAGGAAATAATGAATGCCCAGCATGCCGCACTCACTGTGCAAGT    480
   421 GATAAATCTATGCGGCTAGGAAATAATGAATGCCCAGCATGCCGCACTCACTGTGCAAGT    480
   141 -D--K--S--M--R--L--G--N--N--E--C--P--A--C--R--T--H--C--A--S-    160

                                                                          
   481 AGACGTTCTTTGAGGGATGATCCTAATTATGATGCATTGATTGCTGCCCTATATCCAGAT    540
   481 AGACGTTCTTTGAGGGATGATCCTAATTATGATGCATTGATTGCTGCCCTATATCCAGAT    540
   161 -R--R--S--L--R--D--D--P--N--Y--D--A--L--I--A--A--L--Y--P--D-    180

                                                                          
   541 ATTGATAAATACGAAGAAGAGGAACTTGCTTTCAGTGAAGAGGAGAGGAGTCGGAACAAA    600
   541 ATTGATAAATACGAAGAAGAGGAACTTGCTTTCAGTGAAGAGGAGAGGAGTCGGAACAAA    600
   181 -I--D--K--Y--E--E--E--E--L--A--F--S--E--E--E--R--S--R--N--K-    200

                                                                          
   601 AAGATCCAAGCAACAATTGAGGAAACAATTCGAAGACAGTCAGAGGCAGTTGGTAAAAAG    660
   601 AAGATCCAAGCAACAATTGAGGAAACAATTCGAAGACAGTCAGAGGCAGTTGGTAAAAAG    660
   201 -K--I--Q--A--T--I--E--E--T--I--R--R--Q--S--E--A--V--G--K--K-    220

                                                                          
   661 CGTTCCACAGCCAAAGCAACTGCCACTGTTTTCGCAAGGAAGTACAGGAGAAATATGCGA    720
   661 CGTTCCACAGCCAAAGCAACTGCCACTGTTTTCGCAAGGAAGTACAGGAGAAATATGCGA    720
   221 -R--S--T--A--K--A--T--A--T--V--F--A--R--K--Y--R--R--N--M--R-    240

                                                                          
   721 ACGCGTGGTAGAGGTAAAACCATTGCTCCTGATATCGCCCCTACTGGCTCAGACAATGAG    780
   721 ACGCGTGGTAGAGGTAAAACCATTGCTCCTGATATCGCCCCTACTGGCTCAGACAATGAG    780
   241 -T--R--G--R--G--K--T--I--A--P--D--I--A--P--T--G--S--D--N--E-    260

                                                                          
   781 GATAGAGAAGAAGGAAATGCCATTGATACCACCAAGGAGTCATCTTCTGCTGATGACCGC    840
   781 GATAGAGAAGAAGGAAATGCCATTGATACCACCAAGGAGTCATCTTCTGCTGATGACCGC    840
   261 -D--R--E--E--G--N--A--I--D--T--T--K--E--S--S--S--A--D--D--R-    280

                                                                          
   841 TCTTCAGATTTAATGCCAAAAAGAGGTAGGAAAAGGCCCGCATCACGAGCATCTCCTGCT    900
   841 TCTTCAGATTTAATGCCAAAAAGAGGTAGGAAAAGGCCCGCATCACGAGCATCTCCTGCT    900
   281 -S--S--D--L--M--P--K--R--G--R--K--R--P--A--S--R--A--S--P--A-    300

                                                                          
   901 AGAACCATTGGCAGCAGTGACCATGGCTTTGAGGAGAACGATGAGCTGATAGGCGGAAAA    960
   901 AGAACCATTGGCAGCAGTGACCATGGCTTTGAGGAGAACGATGAGCTGATAGGCGGAAAA    960
   301 -R--T--I--G--S--S--D--H--G--F--E--E--N--D--E--L--I--G--G--K-    320

                                                                          
   961 GAAAGTTTCACCACGTCTCCATTGCGGGGGGAGATGCTTGCATGGGGCAAAAATGGAACA   1020
   961 GAAAGTTTCACCACGTCTCCATTGCGGGGGGAGATGCTTGCATGGGGCAAAAATGGAACA   1020
   321 -E--S--F--T--T--S--P--L--R--G--E--M--L--A--W--G--K--N--G--T-    340

                                                                          
  1021 CGAAGCCAAACAAGACATGGCAGTGTTGGTGGTTCAAATGGCAGAATGGCAAAGGGTGGA   1080
  1021 CGAAGCCAAACAAGACATGGCAGTGTTGGTGGTTCAAATGGCAGAATGGCAAAGGGTGGA   1080
   341 -R--S--Q--T--R--H--G--S--V--G--G--S--N--G--R--M--A--K--G--G-    360

                                                                          
  1081 CGCGTTGCAAAGTTGGTGGACCACCTCCGTACTACTGATGATATGGATAAGGAGTTCAAC   1140
  1081 CGCGTTGCAAAGTTGGTGGACCACCTCCGTACTACTGATGATATGGATAAGGAGTTCAAC   1140
   361 -R--V--A--K--L--V--D--H--L--R--T--T--D--D--M--D--K--E--F--N-    380

                                                                          
  1141 TTGTATCTTGTTCTCCTTCCTCTTGATGAACAAAGTATGCCTAACTTGGAGAAGCCCTAT   1200
  1141 TTGTATCTTGTTCTCCTTCCTCTTGATGAACAAAGTATGCCTAACTTGGAGAAGCCCTAT   1200
   381 -L--Y--L--V--L--L--P--L--D--E--Q--S--M--P--N--L--E--K--P--Y-    400

                                                                          
  1201 TTGTCTCGGCAAGTTGAAGAACTTGATATCTTTATGAGGATAGACCACTGCAATGGAAGT   1260
  1201 TTGTCTCGGCAAGTTGAAGAACTTGATATCTTTATGAGGATAGACCACTGCAATGGAAGT   1260
   401 -L--S--R--Q--V--E--E--L--D--I--F--M--R--I--D--H--C--N--G--S-    420

                                                                          
  1261 GTTACAACACAGGACTGCACTACAGGTGTTGCAAAAATGCGTTTATCTGATGGCCTGGAA   1320
  1261 GTTACAACACAGGACTGCACTACAGGTGTTGCAAAAATGCGTTTATCTGATGGCCTGGAA   1320
   421 -V--T--T--Q--D--C--T--T--G--V--A--K--M--R--L--S--D--G--L--E-    440

                                                                          
  1321 AGAATAAGGGAGGATAAACTTCTTTCAGAGCTTCACCCTTCTTTTACTTCTCATCACAGT   1380
  1321 AGAATAAGGGAGGATAAACTTCTTTCAGAGCTTCACCCTTCTTTTACTTCTCATCACAGT   1380
   441 -R--I--R--E--D--K--L--L--S--E--L--H--P--S--F--T--S--H--H--S-    460

                                                                          
  1381 GATCTGGCTAGATCAGAATTTCTTGACACCGCATTCGTCACTGTCGTTACAGAGGCCTTC   1440
  1381 GATCTGGCTAGATCAGAATTTCTTGACACCGCATTCGTCACTGTCGTTACAGAGGCCTTC   1440
   461 -D--L--A--R--S--E--F--L--D--T--A--F--V--T--V--V--T--E--A--F-    480

                                                                          
  1441 GTTCATACAGAGATATCGCTTGTCTGGGAGCAGTCACCATTCTCTCATTGCCATGTGCCT   1500
  1441 GTTCATACAGAGATATCGCTTGTCTGGGAGCAGTCACCATTCTCTCATTGCCATGTGCCT   1500
   481 -V--H--T--E--I--S--L--V--W--E--Q--S--P--F--S--H--C--H--V--P-    500

                                                                          
  1501 CTGCGATTTGTTTTGGTGAAATATACTCCCTTCGTTTCAAAATATATAACACTATTGACT   1560
  1501 CTGCGATTTGTTTTGGTGAAATATACTCCCTTCGTTTCAAAATATATAACACTATTGACT   1560
   501 -L--R--F--V--L--V--K--Y--T--P--F--V--S--K--Y--I--T--L--L--T-    520

                                                                          
  1561 TTTGCATAA                                                      1569
  1561 TTTGCATAA                                                      1569
   521 -F--A--*-                                                       522