Oryza nivara (Oryza_nivara_v1.0)
Location
About this transcript

This transcript has 8 exons, is annotated with 10 domains and features and maps to 36 oligo probes.

Gene
Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-ONIVA01G31250.31071356aa
 
Protein coding
A0A0E0FRK8 Ensembl Canonical
-ONIVA01G31250.21056351aa
 
Protein coding
A0A0E0FRK7 -
-ONIVA01G31250.1716237aa
 
Protein coding
A0A0E0FRK6 -
-ONIVA01G31250.4702233aa
 
Protein coding
A0A0E0FRK9 -
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGCTGGATACTCTTGCTGAGCTGATCAGAAATGTTGCCGGATGCGGGCAAGGAGTGCTG     60
     1 ATGCTGGATACTCTTGCTGAGCTGATCAGAAATGTTGCCGGATGCGGGCAAGGAGTGCTG     60
     1 -M--L--D--T--L--A--E--L--I--R--N--V--A--G--C--G--Q--G--V--L-     20

                                                                          
    61 GAGCACACCTGGGAATGCCAAGCAATAATCATGATGTTTCAGACAAGAGTTCTGTTGGGA    120
    61 GAGCACACCTGGGAATGCCAAGCAATAATCATGATGTTTCAGACAAGAGTTCTGTTGGGA    120
    21 -E--H--T--W--E--C--Q--A--I--I--M--M--F--Q--T--R--V--L--L--G-     40

                                                                          
   121 GGAATGAGCATGTATGATCGGTACCAGGATTGGCGCCTTGATGTTGATAACATGACATAC    180
   121 GGAATGAGCATGTATGATCGGTACCAGGATTGGCGCCTTGATGTTGATAACATGACATAC    180
    41 -G--M--S--M--Y--D--R--Y--Q--D--W--R--L--D--V--D--N--M--T--Y-     60

                                                                          
   181 GAGGAGTTGCTTGAGCTTGGAGATAAAATAGGTTATGTCAACACTGGATTGCGTGAGGAT    240
   181 GAGGAGTTGCTTGAGCTTGGAGATAAAATAGGTTATGTCAACACTGGATTGCGTGAGGAT    240
    61 -E--E--L--L--E--L--G--D--K--I--G--Y--V--N--T--G--L--R--E--D-     80

                                                                          
   241 GAGATAGTTCGCAACCTTAGGAAGGTCAAACACCCAGCCTTTGACTCCTCGTTCCGGTAT    300
   241 GAGATAGTTCGCAACCTTAGGAAGGTCAAACACCCAGCCTTTGACTCCTCGTTCCGGTAT    300
    81 -E--I--V--R--N--L--R--K--V--K--H--P--A--F--D--S--S--F--R--Y-    100

                                                                          
   301 TCAACAGAAATGGAAAAGAAATGCAGTATTTGTCAAGAAGAGTTTGAAGCCAATGAAGAG    360
   301 TCAACAGAAATGGAAAAGAAATGCAGTATTTGTCAAGAAGAGTTTGAAGCCAATGAAGAG    360
   101 -S--T--E--M--E--K--K--C--S--I--C--Q--E--E--F--E--A--N--E--E-    120

                                                                          
   361 ATGGGGAGGCTGGATTGCGGTCACAGCTACCATGTTTACTGCATTAAGCAATGGCTTTCT    420
   361 ATGGGGAGGCTGGATTGCGGTCACAGCTACCATGTTTACTGCATTAAGCAATGGCTTTCT    420
   121 -M--G--R--L--D--C--G--H--S--Y--H--V--Y--C--I--K--Q--W--L--S-    140

                                                                          
   421 CAGAAGAACGTTTGCCCAGTTTGCAAGACTGCCGTGTCAATATTGGCACAGTCCGGGACG    480
   421 CAGAAGAACGTTTGCCCAGTTTGCAAGACTGCCGTGTCAATATTGGCACAGTCCGGGACG    480
   141 -Q--K--N--V--C--P--V--C--K--T--A--V--S--I--L--A--Q--S--G--T-    160

                                                                          
   481 GCAGCTAGTGTCTTGTGCAACCTCATTCGATCCTTCACGTGCGATGATCAGTGCCACCGT    540
   481 GCAGCTAGTGTCTTGTGCAACCTCATTCGATCCTTCACGTGCGATGATCAGTGCCACCGT    540
   161 -A--A--S--V--L--C--N--L--I--R--S--F--T--C--D--D--Q--C--H--R-    180

                                                                          
   541 GCCCGTACAGGCGTTCTTGCCAACCAAATAGCCGAGGTGATATATTCTGTTGACCTTCCC    600
   541 GCCCGTACAGGCGTTCTTGCCAACCAAATAGCCGAGGTGATATATTCTGTTGACCTTCCC    600
   181 -A--R--T--G--V--L--A--N--Q--I--A--E--V--I--Y--S--V--D--L--P-    200

                                                                          
   601 CAAGAATATTCACAAGACGTTGACTTAAATGGCTTATTTGATCTGATATTGCTGATGTTT    660
   601 CAAGAATATTCACAAGACGTTGACTTAAATGGCTTATTTGATCTGATATTGCTGATGTTT    660
   201 -Q--E--Y--S--Q--D--V--D--L--N--G--L--F--D--L--I--L--L--M--F-    220

                                                                          
   661 GTGGCAATTCCAGTAAGCCCAAAATTTTTTCTGAGACTTCCTCAAGACTACTAGTT        716
   661 GTGGCAATTCCAGTAAGCCCAAAATTTTTTCTGAGACTTCCTCAAGACTACTAG..        714
   221 -V--A--I--P--V--S--P--K--F--F--L--R--L--P--Q--D--Y--*-..        237