Oryza meridionalis (Oryza_meridionalis_v1.3) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 11: 14,171,320-14,179,932 forward strand.
This transcript has 15 exons, is annotated with 23 domains and features and maps to 41 oligo probes.
This transcript is a product of gene OMERI11G11110 Show transcript tableHide transcript table
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1 CGAGGAGACAACAAATCAGAAGAGGCAAGCCCAGAAGGGGTGAATCCGGCTCCTCTCCTT 60 ............................................................ ............................................................ 61 CCTCCCATCCAAAGCCCACATCTCCTGCAGATCCAACCGCATCTCCGCTCCCCCCTCGCT 120 ............................................................ ............................................................ 121 GCCGCTTCCCGCCGCCGCCGCCGACCACCGCAGCGCTCCCTCGCCGCCGCCGGAGGCCGA 180 ............................................................ ............................................................ 181 CGCCGCGCAGTCGCGTCCGAGAAGCTCGGAGCTTTTTCAGGCAAGAGGCAGGGGGGGCCC 240 ............................................................ ............................................................ 241 CCAAACCCTAACCGTAGCTCCTCCTCCTCGTCTCCTCCGCCGGTGGTGGCGGTGGCGGAG 300 ............................................................ ............................................................ 301 ATGGAGATGGAGATGGTGGTGGCCGTGCCGTCGCCGGAGGTGCCCGCGGAGGAGGAGAGG 360 1 ATGGAGATGGAGATGGTGGTGGCCGTGCCGTCGCCGGAGGTGCCCGCGGAGGAGGAGAGG 60 1 -M--E--M--E--M--V--V--A--V--P--S--P--E--V--P--A--E--E--E--R- 20 361 GCGCTGATCCGGGACATCACCGTCGCCGCCGAGGCCCACGCCAAGGAAGGGGACACCTTC 420 61 GCGCTGATCCGGGACATCACCGTCGCCGCCGAGGCCCACGCCAAGGAAGGGGACACCTTC 120 21 -A--L--I--R--D--I--T--V--A--A--E--A--H--A--K--E--G--D--T--F- 40 421 TTCCTCATCACCCACAGGTGGTGGCAAAGTTGGATTGATTATGTCATTCAAGATTTGGCT 480 121 TTCCTCATCACCCACAGGTGGTGGCAAAGTTGGATTGATTATGTCATTCAAGATTTGGCT 180 41 -F--L--I--T--H--R--W--W--Q--S--W--I--D--Y--V--I--Q--D--L--A- 60 481 AATTCAACAAATAATGGTTCTCATCATCATGAGCATGGTTCTAATGTTCTGAGAAGACCA 540 181 AATTCAACAAATAATGGTTCTCATCATCATGAGCATGGTTCTAATGTTCTGAGAAGACCA 240 61 -N--S--T--N--N--G--S--H--H--H--E--H--G--S--N--V--L--R--R--P- 80 541 GGAGCAATTGACAATACAGATTTGATAGATGATACTGCATCTGAAGTCTCGAATATGGAG 600 241 GGAGCAATTGACAATACAGATTTGATAGATGATACTGCATCTGAAGTCTCGAATATGGAG 300 81 -G--A--I--D--N--T--D--L--I--D--D--T--A--S--E--V--S--N--M--E- 100 601 ATTGAACTACATGATACATTGGTTGAGGGTTGTGACTATATACTGCTTCCCCAACAAGAT 660 301 ATTGAACTACATGATACATTGGTTGAGGGTTGTGACTATATACTGCTTCCCCAACAAGAT 360 101 -I--E--L--H--D--T--L--V--E--G--C--D--Y--I--L--L--P--Q--Q--D- 120 661 ACAGTTGGCGAACTCCATAAGAAGGCTTGTGAGGTTTTTGATTTGATACCTGATGAGGTC 720 361 ACAGTTGGCGAACTCCATAAGAAGGCTTGTGAGGTTTTTGATTTGATACCTGATGAGGTC 420 121 -T--V--G--E--L--H--K--K--A--C--E--V--F--D--L--I--P--D--E--V- 140 721 TGCATTTGGGACTACTATGGCCGAACAAGACATTCTTTGATGGATAACTTAGAGAAAACC 780 421 TGCATTTGGGACTACTATGGCCGAACAAGACATTCTTTGATGGATAACTTAGAGAAAACC 480 141 -C--I--W--D--Y--Y--G--R--T--R--H--S--L--M--D--N--L--E--K--T- 160 781 CTTGATGATGCCAACATTCAGATGGATCAAGATATTCTAGTGGAGGTTACTACCGATGCA 840 481 CTTGATGATGCCAACATTCAGATGGATCAAGATATTCTAGTGGAGGTTACTACCGATGCA 540 161 -L--D--D--A--N--I--Q--M--D--Q--D--I--L--V--E--V--T--T--D--A- 180 841 AATGGTAGTTTGGATGGTGGTTGCATTGGTTCAATCCAAGACAATGAATATTTAGAACGA 900 541 AATGGTAGTTTGGATGGTGGTTGCATTGGTTCAATCCAAGACAATGAATATTTAGAACGA 600 181 -N--G--S--L--D--G--G--C--I--G--S--I--Q--D--N--E--Y--L--E--R- 200 901 GAATCAACTTCCTTGATTGCAGATGCTTCGAAATCAGGATTATCAAATGAGAATTTTGCA 960 601 GAATCAACTTCCTTGATTGCAGATGCTTCGAAATCAGGATTATCAAATGAGAATTTTGCA 660 201 -E--S--T--S--L--I--A--D--A--S--K--S--G--L--S--N--E--N--F--A- 220 961 TCAAACAATTATACTTCCAGAAGCTACAGCTCTAGTCTTACACAAAGCCAGTACCTGCGA 1020 661 TCAAACAATTATACTTCCAGAAGCTACAGCTCTAGTCTTACACAAAGCCAGTACCTGCGA 720 221 -S--N--N--Y--T--S--R--S--Y--S--S--S--L--T--Q--S--Q--Y--L--R- 240 1021 TCTTCGAATGGGGACTTAGATAACATGCATGGTACTAGTGCCATGATCACCAGAGGATCT 1080 721 TCTTCGAATGGGGACTTAGATAACATGCATGGTACTAGTGCCATGATCACCAGAGGATCT 780 241 -S--S--N--G--D--L--D--N--M--H--G--T--S--A--M--I--T--R--G--S- 260 1081 CCTTTAGGTCTTACAGGGCTACTCAACTTGGGAAATACATGTTTCATGAATAGTGCTATA 1140 781 CCTTTAGGTCTTACAGGGCTACTCAACTTGGGAAATACATGTTTCATGAATAGTGCTATA 840 261 -P--L--G--L--T--G--L--L--N--L--G--N--T--C--F--M--N--S--A--I- 280 1141 CAATGCCTTGTGCACACACCAGAATTCGCTAGATATTTTCGTGAAGATTACCACCGTGAA 1200 841 CAATGCCTTGTGCACACACCAGAATTCGCTAGATATTTTCGTGAAGATTACCACCGTGAA 900 281 -Q--C--L--V--H--T--P--E--F--A--R--Y--F--R--E--D--Y--H--R--E- 300 1201 ATAAATTGGCAAAATCCCCTGGGTATGGTGGGTGAACTTGCATTAGCCTTTGGTGAGCTA 1260 901 ATAAATTGGCAAAATCCCCTGGGTATGGTGGGTGAACTTGCATTAGCCTTTGGTGAGCTA 960 301 -I--N--W--Q--N--P--L--G--M--V--G--E--L--A--L--A--F--G--E--L- 320 1261 CTGAGAAAACTGTGGGCTCCTGGACGTACACCAGTTTCTCCTCGACCATTCAAAACAAAG 1320 961 CTGAGAAAACTGTGGGCTCCTGGACGTACACCAGTTTCTCCTCGACCATTCAAAACAAAG 1020 321 -L--R--K--L--W--A--P--G--R--T--P--V--S--P--R--P--F--K--T--K- 340 1321 CTGTCTCGCTTTGCACCTCAGTTCAGTGGATACAACCAACATGATTCACAGGAGTTGTTG 1380 1021 CTGTCTCGCTTTGCACCTCAGTTCAGTGGATACAACCAACATGATTCACAGGAGTTGTTG 1080 341 -L--S--R--F--A--P--Q--F--S--G--Y--N--Q--H--D--S--Q--E--L--L- 360 1381 GCATTCCTCTTGGATGGACTTCATGAAGACTTGAACCGTGTGAAACATAGGCCTTACATA 1440 1081 GCATTCCTCTTGGATGGACTTCATGAAGACTTGAACCGTGTGAAACATAGGCCTTACATA 1140 361 -A--F--L--L--D--G--L--H--E--D--L--N--R--V--K--H--R--P--Y--I- 380 1441 AAGTCCAAAGACGCTGATGGTCGATCAGATGATGAGGTCGCAGATGAATATTGGGCCAAT 1500 1141 AAGTCCAAAGACGCTGATGGTCGATCAGATGATGAGGTCGCAGATGAATATTGGGCCAAT 1200 381 -K--S--K--D--A--D--G--R--S--D--D--E--V--A--D--E--Y--W--A--N- 400 1501 CATATTGCCAGAAACAATTCAATCATTGTTGATGTATGCCAGGGACAGTACAAGTCAACT 1560 1201 CATATTGCCAGAAACAATTCAATCATTGTTGATGTATGCCAGGGACAGTACAAGTCAACT 1260 401 -H--I--A--R--N--N--S--I--I--V--D--V--C--Q--G--Q--Y--K--S--T- 420 1561 TTGGTATGCCCAGCCTGTGGAAAGGTTTCAGTGACTTTTGACCCATTCATGTATCTTTCC 1620 1261 TTGGTATGCCCAGCCTGTGGAAAGGTTTCAGTGACTTTTGACCCATTCATGTATCTTTCC 1320 421 -L--V--C--P--A--C--G--K--V--S--V--T--F--D--P--F--M--Y--L--S- 440 1621 TTGCCTCTACAATTTACATCAACCCGGAGCATGACCGTTATGGTCTTTACTTTTGATGGG 1680 1321 TTGCCTCTACAATTTACATCAACCCGGAGCATGACCGTTATGGTCTTTACTTTTGATGGG 1380 441 -L--P--L--Q--F--T--S--T--R--S--M--T--V--M--V--F--T--F--D--G- 460 1681 AGTACTCCACCAACACCATACACTGTAAATGTTCCCAAGCAAGGAAGGTGCAGAGATCTT 1740 1381 AGTACTCCACCAACACCATACACTGTAAATGTTCCCAAGCAAGGAAGGTGCAGAGATCTT 1440 461 -S--T--P--P--T--P--Y--T--V--N--V--P--K--Q--G--R--C--R--D--L- 480 1741 ATCCAAGCCATCAGCAATGCATGCTCACTTAGAAATGGGGAGAGACTTGTAATTGCCGAG 1800 1441 ATCCAAGCCATCAGCAATGCATGCTCACTTAGAAATGGGGAGAGACTTGTAATTGCCGAG 1500 481 -I--Q--A--I--S--N--A--C--S--L--R--N--G--E--R--L--V--I--A--E- 500 1801 ATACGTAATCATAGGATCCATCGTCTACTTGATGATCCAGTGGTTCAACTATCAACAATT 1860 1501 ATACGTAATCATAGGATCCATCGTCTACTTGATGATCCAGTGGTTCAACTATCAACAATT 1560 501 -I--R--N--H--R--I--H--R--L--L--D--D--P--V--V--Q--L--S--T--I- 520 1861 AATGATGATGATCACTTGGCAGTTTATAGGCTTCCAAAAATGGAAAAAAAGCCAAATTAC 1920 1561 AATGATGATGATCACTTGGCAGTTTATAGGCTTCCAAAAATGGAAAAAAAGCCAAATTAC 1620 521 -N--D--D--D--H--L--A--V--Y--R--L--P--K--M--E--K--K--P--N--Y- 540 1921 ATTCAGGACAACGGAAACAATATCAGCGTAACAGCTTGGAAACCCTACGGTGTTCCTCTT 1980 1621 ATTCAGGACAACGGAAACAATATCAGCGTAACAGCTTGGAAACCCTACGGTGTTCCTCTT 1680 541 -I--Q--D--N--G--N--N--I--S--V--T--A--W--K--P--Y--G--V--P--L- 560 1981 CTGGCACAAGTATCTCGTAACGAAACTGTCACGGGTATGCATATCCATGAGATGGTCCGT 2040 1681 CTGGCACAAGTATCTCGTAACGAAACTGTCACGGGTATGCATATCCATGAGATGGTCCGT 1740 561 -L--A--Q--V--S--R--N--E--T--V--T--G--M--H--I--H--E--M--V--R- 580 2041 AAAATGCTTGCACCTATGCAGAAGAATCAGGAATCCCAACATTCGGTTCAAAGCTCTGTT 2100 1741 AAAATGCTTGCACCTATGCAGAAGAATCAGGAATCCCAACATTCGGTTCAAAGCTCTGTT 1800 581 -K--M--L--A--P--M--Q--K--N--Q--E--S--Q--H--S--V--Q--S--S--V- 600 2101 TCCACAAGGACGCAGACTTATCATACTGACAGCACCAAATTTCAGCTACAGTTGATTGAC 2160 1801 TCCACAAGGACGCAGACTTATCATACTGACAGCACCAAATTTCAGCTACAGTTGATTGAC 1860 601 -S--T--R--T--Q--T--Y--H--T--D--S--T--K--F--Q--L--Q--L--I--D- 620 2161 GATAGCAACACAACTATTGAGCAATCCAATGATACTATTAGAGTTCCACAGTCTTCTCTT 2220 1861 GATAGCAACACAACTATTGAGCAATCCAATGATACTATTAGAGTTCCACAGTCTTCTCTT 1920 621 -D--S--N--T--T--I--E--Q--S--N--D--T--I--R--V--P--Q--S--S--L- 640 2221 GCAGCTGTAATCTTTGTCAATTGGTCTAAAGCAGATCTGAAGAAGTTAAACACTCATCAT 2280 1921 GCAGCTGTAATCTTTGTCAATTGGTCTAAAGCAGATCTGAAGAAGTTAAACACTCATCAT 1980 641 -A--A--V--I--F--V--N--W--S--K--A--D--L--K--K--L--N--T--H--H- 660 2281 TTGGAGAACCTTCCGGAGGTGTTCAAGTATGCTCCTCCTGCCAAGAGAACCCGTGGTGAA 2340 1981 TTGGAGAACCTTCCGGAGGTGTTCAAGTATGCTCCTCCTGCCAAGAGAACCCGTGGTGAA 2040 661 -L--E--N--L--P--E--V--F--K--Y--A--P--P--A--K--R--T--R--G--E- 680 2341 CCTCTCTCGCTTTATTCATGCTTGGATGCTTTCTTGAGAGAAGAACCTCTTGTTCCTGAA 2400 2041 CCTCTCTCGCTTTATTCATGCTTGGATGCTTTCTTGAGAGAAGAACCTCTTGTTCCTGAA 2100 681 -P--L--S--L--Y--S--C--L--D--A--F--L--R--E--E--P--L--V--P--E- 700 2401 GACATGTATTGTCCGAGGTGCAAGGAGCAAAGGCAAGCCAGCAAAAAGCTTGACTTATGG 2460 2101 GACATGTATTGTCCGAGGTGCAAGGAGCAAAGGCAAGCCAGCAAAAAGCTTGACTTATGG 2160 701 -D--M--Y--C--P--R--C--K--E--Q--R--Q--A--S--K--K--L--D--L--W- 720 2461 AGACTTCCAGAAGTGCTAGTTATACATTTGAAGAGATTCTCCTTTAGTAGGTCAACAAAG 2520 2161 AGACTTCCAGAAGTGCTAGTTATACATTTGAAGAGATTCTCCTTTAGTAGGTCAACAAAG 2220 721 -R--L--P--E--V--L--V--I--H--L--K--R--F--S--F--S--R--S--T--K- 740 2521 CAGAAGCTTGAAACATTTGTCAACTTCCCAATACATGATTTTGATTTGACAAACTATATT 2580 2221 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CCATGTCTCAGAGAGGGCTGGCCTCAGGGACATGGGAGTCAAATGCGGAATGAATTGGAC 2880 2521 CCATGTCTCAGAGAGGGCTGGCCTCAGGGACATGGGAGTCAAATGCGGAATGAATTGGAC 2580 841 -P--C--L--R--E--G--W--P--Q--G--H--G--S--Q--M--R--N--E--L--D- 860 2881 ATTGTGAACAACGGCACGAATTACTGCAGCTTTGGACACTTTACAGATGGGAATTCGCAT 2940 2581 ATTGTGAACAACGGCACGAATTACTGCAGCTTTGGACACTTTACAGATGGGAATTCGCAT 2640 861 -I--V--N--N--G--T--N--Y--C--S--F--G--H--F--T--D--G--N--S--H- 880 2941 AAGGAGAATGCGAGTGGTCATCCCAGACGTAGCGTCAGCCCTAATGGTGTTGAGGTGATG 3000 2641 AAGGAGAATGCGAGTGGTCATCCCAGACGTAGCGTCAGCCCTAATGGTGTTGAGGTGATG 2700 881 -K--E--N--A--S--G--H--P--R--R--S--V--S--P--N--G--V--E--V--M- 900 3001 GCTTATTTTGCGCTGAGGTGA 3021 2701 GCTTATTTTGCGCTGAGGTGA 2721 901 -A--Y--F--A--L--R--*- 906
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