Oryza meridionalis (Oryza_meridionalis_v1.3)
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About this transcript

This transcript has 1 exon, is annotated with 21 domains and features and maps to 47 oligo probes.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OMERI09G14280.1612203aa
 
Protein coding
A0A0E0EUQ0 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGCGTCACTTGCTGCAGTCGTCGGAGCACCTGGCCGCCGCGACGGCGACGGCGGCGGCG     60
     1 ATGCGTCACTTGCTGCAGTCGTCGGAGCACCTGGCCGCCGCGACGGCGACGGCGGCGGCG     60
     1 -M--R--H--L--L--Q--S--S--E--H--L--A--A--A--T--A--T--A--A--A-     20

                                                                          
    61 TCCGGCGGCCGGGGCGTCCACACGGACACGTTCCTCATCCTCGCCGCCGTGCTCTGCTTC    120
    61 TCCGGCGGCCGGGGCGTCCACACGGACACGTTCCTCATCCTCGCCGCCGTGCTCTGCTTC    120
    21 -S--G--G--R--G--V--H--T--D--T--F--L--I--L--A--A--V--L--C--F-     40

                                                                          
   121 CTGCTCTGCGTCGTCGGGCTGGCGCTGGTGGCGCGGTGCTCGCGGCTGTGCAACCCGTCG    180
   121 CTGCTCTGCGTCGTCGGGCTGGCGCTGGTGGCGCGGTGCTCGCGGCTGTGCAACCCGTCG    180
    41 -L--L--C--V--V--G--L--A--L--V--A--R--C--S--R--L--C--N--P--S-     60

                                                                          
   181 TCGTTCGCCGTCGAGGCGGAGGAGGCAATGCCCCCGGCGCCGTGCAAGGGGCTCAAGAGG    240
   181 TCGTTCGCCGTCGAGGCGGAGGAGGCAATGCCCCCGGCGCCGTGCAAGGGGCTCAAGAGG    240
    61 -S--F--A--V--E--A--E--E--A--M--P--P--A--P--C--K--G--L--K--R-     80

                                                                          
   241 AAGGCGCTGCTGTCGCTGCCGACCGTGTCGTTCGCCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGAG    300
   241 AAGGCGCTGCTGTCGCTGCCGACCGTGTCGTTCGCCGAGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGAG    300
    81 -K--A--L--L--S--L--P--T--V--S--F--A--E--A--A--A--A--A--E--E-    100

                                                                          
   301 GAGGAGGAGCGGCCGGAGTGCGCCATTTGCCTCGCCGAGTTCGCGCGCGGCGACGAGGTC    360
   301 GAGGAGGAGCGGCCGGAGTGCGCCATTTGCCTCGCCGAGTTCGCGCGCGGCGACGAGGTC    360
   101 -E--E--E--R--P--E--C--A--I--C--L--A--E--F--A--R--G--D--E--V-    120

                                                                          
   361 CGCGTGCTCCCGCCGTGCGGCCACGGCTTCCACGCCGCCTGCGTCGACGTCTGGCTCGTG    420
   361 CGCGTGCTCCCGCCGTGCGGCCACGGCTTCCACGCCGCCTGCGTCGACGTCTGGCTCGTG    420
   121 -R--V--L--P--P--C--G--H--G--F--H--A--A--C--V--D--V--W--L--V-    140

                                                                          
   421 TCCACCTCCACCTGCCCCTCCTGCCGCCGCGCCATCGTCGTCCTCGCGGCGCCGTCGCCT    480
   421 TCCACCTCCACCTGCCCCTCCTGCCGCCGCGCCATCGTCGTCCTCGCGGCGCCGTCGCCT    480
   141 -S--T--S--T--C--P--S--C--R--R--A--I--V--V--L--A--A--P--S--P-    160

                                                                          
   481 GCAGTCGCCGCCGCCGCCGCCACCGACCCCCCGCCGCCGTGCTGCGCCGCCGACGCGGCA    540
   481 GCAGTCGCCGCCGCCGCCGCCACCGACCCCCCGCCGCCGTGCTGCGCCGCCGACGCGGCA    540
   161 -A--V--A--A--A--A--A--T--D--P--P--P--P--C--C--A--A--D--A--A-    180

                                                                          
   541 CAGGCGTCGTCACAGCCACCACAACCCACCGGCGCCAGCGACCGCGGCGGCTGCCGGACA    600
   541 CAGGCGTCGTCACAGCCACCACAACCCACCGGCGCCAGCGACCGCGGCGGCTGCCGGACA    600
   181 -Q--A--S--S--Q--P--P--Q--P--T--G--A--S--D--R--G--G--C--R--T-    200

                                                                          
   601 TCGGTGCCGTAG                                                    612
   601 TCGGTGCCGTAG                                                    612
   201 -S--V--P--*-                                                    203