Oryza meridionalis (Oryza_meridionalis_v1.3) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 7: 13,919,510-13,927,836 reverse strand.
This transcript has 10 exons, is annotated with 9 domains and features and maps to 17 oligo probes.
This transcript is a product of gene OMERI07G11150 Show transcript tableHide transcript table
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1 TCTAAGCTTTGGAAAATACACTCAAAGGACGCATATTTGTTAAGTTTGTTTCTTAAAGTA 60 ............................................................ ............................................................ 61 TTCAATTTATTCATATAATTAAGTATATAATCAGTAGCAGTAATCTGCCTAATAATCCAA 120 ............................................................ ............................................................ 121 ATCAAACATAGCTCAAGTCCAAACTCTACAGCTTTGAGTTTTCTCTAGGCTGGAGCAATA 180 ............................................................ ............................................................ 181 CCAAACATGTCAATAGATAGATAAAGATATGTTCGATTGATGATTAACATTGCCAAACCT 240 ............................................................ ............................................................ 241 CATATTACATAAGGTGAAGCTTTAGGCAAAGTGTTGCAAAAAATTGTGTCTTTGAAATAG 300 ............................................................ ............................................................ 301 GCCGATGAAAAATATAGCTACCCATAACAATGGCATCAACTAAACAACTGCAAAACAACC 360 ............................................................ ............................................................ 361 ACCTAAAGTTGGGATTTGGCAAGTTGAAGGCATCATCCAACCATAACATAGTTCTCCCTC 420 ............................................................ ............................................................ 421 CGAAAAGAAATAATACTAACATCATACTAACTCCATCCCAAAATATAATAACTTTTAGTA 480 ............................................................ ............................................................ 481 CGAATCTAGACATGCACTTGTCCAAATTCATAGCTAAAAGTTATTACTCCCTTCATCCCA 540 ............................................................ ............................................................ 541 ATATATAGAAATATAGTATCAGATTTGATATTTTAAAATACTACGAATCTAATCATGTTT 600 ............................................................ ............................................................ 601 CATATTTATATTCGTAGTACTATAAAATGTATAATGCACTTTTAGTAACTTTTAGCTACG 660 ............................................................ ............................................................ 661 AATCTATACATGCACTTTGTCTAAATTGATAGCTAAAATTTATTACTCCATTCATTCCAA 720 ............................................................ ............................................................ 721 TATATAGAAACTAGCATCAGACGAATATGATCAGAGGTTTCCTGTTCATATTCATATTAC 780 ............................................................ ............................................................ 781 TATAAAATATCTAATCTGGTATATGGCTTTCACATTTAGGACAAAGAGAGAGTACTAATC 840 ............................................................ ............................................................ 841 TATTTTAGGAAAGAAACAATATTACAGATAACCCTTAGGACTGAAACGCACAATTCTCCC 900 ............................................................ ............................................................ 901 GTATTAAACCCGTCAAATATCTAGACTTTAATTAACATAATTAATTCCAATCTATCCATC 960 ............................................................ ............................................................ 961 CCGTCGTCAATAATTTTGTCCCCCTGGCTCCCCCCCACCTTCCTCTTCCTCCCCTCAATC 1020 ............................................................ ............................................................ 1021 CCCCCTTTTCTCACGGCGTCGCGGCCCCCCCGAAATAAAGCCGTCGTCGACACCTCCCCC 1080 ............................................................ ............................................................ 1081 GAGCCGCAAGCAACCCCGCGATTCCCCCGCATCGCCGGCGAATCGGCGGCGGCGACGACG 1140 ............................................................ ............................................................ 1141 AGGACGACGAGGAGGCCATAGGGTTGTGGAGGAGGGGGGGGGGACCTGTCTTCGATGCGC 1200 ............................................................ ............................................................ 1201 GGCGCATGGCGGCGGTGAACAGCCTCTACGTCGCCGCGGCATCCACCGCGGCCAGCGCCG 1260 .....ATGGCGGCGGTGAACAGCCTCTACGTCGCCGCGGCATCCACCGCGGCCAGCGCCG 55 .....-M--A--A--V--N--S--L--Y--V--A--A--A--S--T--A--A--S--A-- 18 1261 CGGCGCTGCAGTGGTGGGCGGGGTCCCTCCTCGACGGGGATGCCGACGCGGCGGGCGGGG 1320 56 CGGCGCTGCAGTGGTGGGCGGGGTCCCTCCTCGACGGGGATGCCGACGCGGCGGGCGGGG 115 19 A--A--L--Q--W--W--A--G--S--L--L--D--G--D--A--D--A--A--G--G-- 38 1321 GAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGGGACTGGCTCGGCACGGTGCTGGGCTCGCACGTGACCG 1380 116 GAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGGGACTGGCTCGGCACGGTGCTGGGCTCGCACGTGACCG 175 39 G--G--G--G--G--G--G--G--D--W--L--G--T--V--L--G--S--H--V--T-- 58 1381 TCGCGCTCCTGGCGAATCTGGCGGCGCACGTGTTCCTCGTCCTCATCCTCTCCCTCAAGA 1440 176 TCGCGCTCCTGGCGAATCTGGCGGCGCACGTGTTCCTCGTCCTCATCCTCTCCCTCAAGA 235 59 V--A--L--L--A--N--L--A--A--H--V--F--L--V--L--I--L--S--L--K-- 78 1441 CACTATTTTTTGTTCAATTAACCTCTTCTGAGACTAGAAAGGTGTTGGAACACATCATTA 1500 236 CACTATTTTTTGTTCAATTAACCTCTTCTGAGACTAGAAAGGTGTTGGAACACATCATTA 295 79 T--L--F--F--V--Q--L--T--S--S--E--T--R--K--V--L--E--H--I--I-- 98 1501 ACTATGTGCTTTACAAGATGTTTCAATCATTGGCTAGAGAACGCCTTGAACAGCTCAATG 1560 296 ACTATGTGCTTTACAAGATGTTTCAATCATTGGCTAGAGAACGCCTTGAACAGCTCAATG 355 99 N--Y--V--L--Y--K--M--F--Q--S--L--A--R--E--R--L--E--Q--L--N-- 118 1561 CTTCACCATCAGCGACTCCATCAAAATACTTTCGTGTATATTCTGCACTATTGCTGGTTC 1620 356 CTTCACCATCAGCGACTCCATCAAAATACTTTCGTGTATATTCTGCACTATTGCTGGTTC 415 119 A--S--P--S--A--T--P--S--K--Y--F--R--V--Y--S--A--L--L--L--V-- 138 1621 TATCGGCTGATGTACTATGGATAAAGCTTTGTGTTGGGTTCTGCAAGTCGTGTAATTCTC 1680 416 TATCGGCTGATGTACTATGGATAAAGCTTTGTGTTGGGTTCTGCAAGTCGTGTAATTCTC 475 139 L--S--A--D--V--L--W--I--K--L--C--V--G--F--C--K--S--C--N--S-- 158 1681 AACTATTTTGGCTTATGTTTTTTGAGCCACTTAGTATTGGCTTTGAGACACTGCAGTCAA 1740 476 AACTATTTTGGCTTATGTTTTTTGAGCCACTTAGTATTGGCTTTGAGACACTGCAGTCAA 535 159 Q--L--F--W--L--M--F--F--E--P--L--S--I--G--F--E--T--L--Q--S-- 178 1741 TCATGGTGCATGGATTTCAGTTGTTTGACATATGGCAACGACATCAAATGGACAGTGGTG 1800 536 TCATGGTGCATGGATTTCAGTTGTTTGACATATGGCAACGACATCAAATGGACAGTGGTG 595 179 I--M--V--H--G--F--Q--L--F--D--I--W--Q--R--H--Q--M--D--S--G-- 198 1801 TGGACTATCTTGATTTCCAAAAAACTTATAAGCAAGCAGCAGGATCTTTTTCTGAGTGGA 1860 596 TGGACTATCTTGATTTCCAAAAAACTTATAAGCAAGCAGCAGGATCTTTTTCTGAGTGGA 655 199 V--D--Y--L--D--F--Q--K--T--Y--K--Q--A--A--G--S--F--S--E--W-- 218 1861 GAGGCAGACTAGTCAGAAATTTTGGTTTTGTCATTGACTTGATAAGCTTATTGATGTCAC 1920 656 GAGGCAGACTAGTCAGAAATTTTGGTTTTGTCATTGACTTGATAAGCTTATTGATGTCAC 715 219 R--G--R--L--V--R--N--F--G--F--V--I--D--L--I--S--L--L--M--S-- 238 1921 TTGGTCATTACTCAATGATCTTCTGGCTCCGTGGTATGGCGTTTCATCTGGTTGACGCTG 1980 716 TTGGTCATTACTCAATGATCTTCTGGCTCCGTGGTATGGCGTTTCATCTGGTTGACGCTG 775 239 L--G--H--Y--S--M--I--F--W--L--R--G--M--A--F--H--L--V--D--A-- 258 1981 TTCTCCTATTGAACTTGCGCGCTCTTATAGCTTCATTTTGGAAGCGGATAAAAACTTATG 2040 776 TTCTCCTATTGAACTTGCGCGCTCTTATAGCTTCATTTTGGAAGCGGATAAAAACTTATG 835 259 V--L--L--L--N--L--R--A--L--I--A--S--F--W--K--R--I--K--T--Y-- 278 2041 CCAAGTTACGAAAGGCACTTAGTTCACTCGACGGAGCACTTCCAGATGCTACATATGATG 2100 836 CCAAGTTACGAAAGGCACTTAGTTCACTCGACGGAGCACTTCCAGATGCTACATATGATG 895 279 A--K--L--R--K--A--L--S--S--L--D--G--A--L--P--D--A--T--Y--D-- 298 2101 AAATCTGTGCATACGACGATGAGTGTGCCATCTGTAGGGTTGGACCAAGGATTAATGGAT 2160 896 AAATCTGTGCATACGACGATGAGTGTGCCATCTGTAGGGTTGGACCAAGGATTAATGGAT 955 299 E--I--C--A--Y--D--D--E--C--A--I--C--R--V--G--P--R--I--N--G-- 318 2161 GGTTACTCATGTCCAACTTGTCGAAGACCTCTCTTTCTGTCATCTCAAGGTCACACAAGA 2220 956 GGTTACTCATGTCCAACTTGTCGAAGACCTCTCTTTCTGTCATCTCAAGGTCACACAAGA 1015 319 W--L--L--M--S--N--L--S--K--T--S--L--S--V--I--S--R--S--H--K-- 338 2221 TCTACAGCAGAGAACAACTTAATGCGGGGTTGAATCAGCAGAGGGTTCCTGGTCATGAAC 2280 1016 TCTACAGCAGAGAACAACTTAATGCGGGGTTGAATCAGCAGAGGGTTCCTGGTCATGAAC 1075 339 I--Y--S--R--E--Q--L--N--A--G--L--N--Q--Q--R--V--P--G--H--E-- 358 2281 ATCCTATTGAACATCAGAATCCTGCAGATGCTGTTTGGAGGCAGGCCTAG 2330 1076 ATCCTATTGAACATCAGAATCCTGCAGATGCTGTTTGGAGGCAGGCCTAG 1125 359 H--P--I--E--H--Q--N--P--A--D--A--V--W--R--Q--A--*- 374
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