Oryza meridionalis (Oryza_meridionalis_v1.3)
Location
About this transcript

This transcript has 1 exon, is annotated with 13 domains and features and maps to 8 oligo probes.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OMERI04G19080.1525174aa
 
Protein coding
A0A0E0DHL1 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
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Variants
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Other
  • UTR
Markup
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     1 ATGGCGCGTTCCTGCAGCAGCAGCACCAGCAGCAGTAATCATAGTAGCTACGACCTCGCG     60
     1 ATGGCGCGTTCCTGCAGCAGCAGCACCAGCAGCAGTAATCATAGTAGCTACGACCTCGCG     60
     1 -M--A--R--S--C--S--S--S--T--S--S--S--N--H--S--S--Y--D--L--A-     20

                                                                          
    61 TTAACGTTGCGGCGGAAGCTCCTGCTCCTCCTCGATATCCTCGCCGTCCTCCGCTTCCTC    120
    61 TTAACGTTGCGGCGGAAGCTCCTGCTCCTCCTCGATATCCTCGCCGTCCTCCGCTTCCTC    120
    21 -L--T--L--R--R--K--L--L--L--L--L--D--I--L--A--V--L--R--F--L-     40

                                                                          
   121 GCGGCGGCCCTCCTCGAGCGTCTCGGCGTCGTGTCCTGCCAAGAGGACAATGAGCTCCCC    180
   121 GCGGCGGCCCTCCTCGAGCGTCTCGGCGTCGTGTCCTGCCAAGAGGACAATGAGCTCCCC    180
    41 -A--A--A--L--L--E--R--L--G--V--V--S--C--Q--E--D--N--E--L--P-     60

                                                                          
   181 AGCTGCCACTCCTGGTGCGACAGCGACGTCGTAGACACCGGCGCGATGGAGCGCCTCATG    240
   181 AGCTGCCACTCCTGGTGCGACAGCGACGTCGTAGACACCGGCGCGATGGAGCGCCTCATG    240
    61 -S--C--H--S--W--C--D--S--D--V--V--D--T--G--A--M--E--R--L--M-     80

                                                                          
   241 CAGGCGAAGCTCAGTACGTCGTGGTACAGGCTACGGCGGCGTGCTTCGCCGGGCGGAGAC    300
   241 CAGGCGAAGCTCAGTACGTCGTGGTACAGGCTACGGCGGCGTGCTTCGCCGGGCGGAGAC    300
    81 -Q--A--K--L--S--T--S--W--Y--R--L--R--R--R--A--S--P--G--G--D-    100

                                                                          
   301 AACATGGCCTCGCCGCACGGCGACACGAGCGCGGCCATCTGCACGATTTGCTTGGCGGAA    360
   301 AACATGGCCTCGCCGCACGGCGACACGAGCGCGGCCATCTGCACGATTTGCTTGGCGGAA    360
   101 -N--M--A--S--P--H--G--D--T--S--A--A--I--C--T--I--C--L--A--E-    120

                                                                          
   361 CTGGAGGCTGGAGGAGGAGGAGGAGGATGCCAGCGCCAGGTCGCGGAGCTGAGCAGCTGC    420
   361 CTGGAGGCTGGAGGAGGAGGAGGAGGATGCCAGCGCCAGGTCGCGGAGCTGAGCAGCTGC    420
   121 -L--E--A--G--G--G--G--G--G--C--Q--R--Q--V--A--E--L--S--S--C-    140

                                                                          
   421 TCGCACGCGTTCCACGCCGCGTGCATCGATGGTTGGGTGGTGGAGGCGGGAACCTGCCCT    480
   421 TCGCACGCGTTCCACGCCGCGTGCATCGATGGTTGGGTGGTGGAGGCGGGAACCTGCCCT    480
   141 -S--H--A--F--H--A--A--C--I--D--G--W--V--V--E--A--G--T--C--P-    160

                                                                          
   481 CTGTGCCGCACGCCGGTGCTCCCGCCTTGGCAAATGGCGGCATAG                   525
   481 CTGTGCCGCACGCCGGTGCTCCCGCCTTGGCAAATGGCGGCATAG                   525
   161 -L--C--R--T--P--V--L--P--P--W--Q--M--A--A--*-                   174