Oryza meridionalis (Oryza_meridionalis_v1.3) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 3: 33,903,236-33,908,084 forward strand.
This transcript has 5 exons, is annotated with 17 domains and features and maps to 16 oligo probes.
This transcript is a product of gene OMERI03G32680 Show transcript tableHide transcript table
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1 ATGGCGCCTGCCAGGTCCATTGTCCAGCACACGCAGGCACGCCCACGCACTACACTGACA 60 1 ATGGCGCCTGCCAGGTCCATTGTCCAGCACACGCAGGCACGCCCACGCACTACACTGACA 60 1 -M--A--P--A--R--S--I--V--Q--H--T--Q--A--R--P--R--T--T--L--T- 20 61 TGCTGCCTGGGTATTGACACAGAAGCCTCTCTTTTTCAGGCGGTGAGGAAGCAGCCGGAT 120 61 TGCTGCCTGGGTATTGACACAGAAGCCTCTCTTTTTCAGGCGGTGAGGAAGCAGCCGGAT 120 21 -C--C--L--G--I--D--T--E--A--S--L--F--Q--A--V--R--K--Q--P--D- 40 121 TTGGGGCTCACCTTCCAGAGTTGTTGCCTTGTGATGAGCACTGATCTACTCCATCCACCA 180 121 TTGGGGCTCACCTTCCAGAGTTGTTGCCTTGTGATGAGCACTGATCTACTCCATCCACCA 180 41 -L--G--L--T--F--Q--S--C--C--L--V--M--S--T--D--L--L--H--P--P- 60 181 GCGGCAGCTGGAGTTCAAAGTTCAAAATCCAGGTTCTGCACCACCGGACTCCCCAGCGAC 240 181 GCGGCAGCTGGAGTTCAAAGTTCAAAATCCAGGTTCTGCACCACCGGACTCCCCAGCGAC 240 61 -A--A--A--G--V--Q--S--S--K--S--R--F--C--T--T--G--L--P--S--D- 80 241 GTCGTGATCGAGGTCGGCGACATGACATTCCATCTCCACAAGTTCCCGTTAATGTCGAGG 300 241 GTCGTGATCGAGGTCGGCGACATGACATTCCATCTCCACAAGTTCCCGTTAATGTCGAGG 300 81 -V--V--I--E--V--G--D--M--T--F--H--L--H--K--F--P--L--M--S--R- 100 301 AGCAAGAAGCTCCACGACCTCATCACCAACAGGGAGTCGCGAGCGGCCGGCGGAGGAGAG 360 301 AGCAAGAAGCTCCACGACCTCATCACCAACAGGGAGTCGCGAGCGGCCGGCGGAGGAGAG 360 101 -S--K--K--L--H--D--L--I--T--N--R--E--S--R--A--A--G--G--G--E- 120 361 CAAGATGAGGAGGAGGATGATGATGCCGGCGAGATCAGGGAGGAGGAGGTGGTGCTGGAG 420 361 CAAGATGAGGAGGAGGATGATGATGCCGGCGAGATCAGGGAGGAGGAGGTGGTGCTGGAG 420 121 -Q--D--E--E--E--D--D--D--A--G--E--I--R--E--E--E--V--V--L--E- 140 421 GTCGACGAGGACTCCGACGTGCACCGCATCCGCCTCCCGGACTTCCCCGGCGGCGCGGAG 480 421 GTCGACGAGGACTCCGACGTGCACCGCATCCGCCTCCCGGACTTCCCCGGCGGCGCGGAG 480 141 -V--D--E--D--S--D--V--H--R--I--R--L--P--D--F--P--G--G--A--E- 160 481 GCGTTCGAGCAGGCGGCCAAGTTCTGCTACGGCGTCAAGCTGGACCTCACGCCGGCCACC 540 481 GCGTTCGAGCAGGCGGCCAAGTTCTGCTACGGCGTCAAGCTGGACCTCACGCCGGCCACC 540 161 -A--F--E--Q--A--A--K--F--C--Y--G--V--K--L--D--L--T--P--A--T- 180 541 GCCGCGCCGCTCCGCTGCGCCGCCGAGCGCCTCGGCATGTCCGACGACCACTCCGACGAC 600 541 GCCGCGCCGCTCCGCTGCGCCGCCGAGCGCCTCGGCATGTCCGACGACCACTCCGACGAC 600 181 -A--A--P--L--R--C--A--A--E--R--L--G--M--S--D--D--H--S--D--D- 200 601 AACCTCGTCTCCCGCGCCGACAGGTTCATGTCCCACACCGTCCTGAGGAACCCCAGGGAC 660 601 AACCTCGTCTCCCGCGCCGACAGGTTCATGTCCCACACCGTCCTGAGGAACCCCAGGGAC 660 201 -N--L--V--S--R--A--D--R--F--M--S--H--T--V--L--R--N--P--R--D- 220 661 GCCATCCGCGCCCTCAGGTCGTGCGAGGGCCTCCTCCCCCTCGCCGACAACCTCGGCCTC 720 661 GCCATCCGCGCCCTCAGGTCGTGCGAGGGCCTCCTCCCCCTCGCCGACAACCTCGGCCTC 720 221 -A--I--R--A--L--R--S--C--E--G--L--L--P--L--A--D--N--L--G--L- 240 721 GTGTCGCGCTGCGTCGACGCCATCGCCGCCAAGGCCGCCGCGTCCACGCCCACCGCACTG 780 721 GTGTCGCGCTGCGTCGACGCCATCGCCGCCAAGGCCGCCGCGTCCACGCCCACCGCACTG 780 241 -V--S--R--C--V--D--A--I--A--A--K--A--A--A--S--T--P--T--A--L- 260 781 TTCGGTTGGCCCATCAACGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCGACCGTCCGCGC 840 781 TTCGGTTGGCCCATCAACGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCGACCGTCCGCGC 840 261 -F--G--W--P--I--N--D--A--A--A--A--A--A--A--A--G--D--R--P--R- 280 841 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-E--Q--K--A--L--L--E--T--V--I--A--N--L--P--E--E--T--I--K--S- 380 1141 AACGCCCACACTGGCACGGCCGTGGGCGCCACGACGGCGCGCGTCCTCTTCGGCCTCCTC 1200 1141 AACGCCCACACTGGCACGGCCGTGGGCGCCACGACGGCGCGCGTCCTCTTCGGCCTCCTC 1200 381 -N--A--H--T--G--T--A--V--G--A--T--T--A--R--V--L--F--G--L--L- 400 1201 CGCACGACGAGCATCCTCCAGGCGTCGGAGTCCGCCCGCGACATGCTCGAGCGGCGCATA 1260 1201 CGCACGACGAGCATCCTCCAGGCGTCGGAGTCCGCCCGCGACATGCTCGAGCGGCGCATA 1260 401 -R--T--T--S--I--L--Q--A--S--E--S--A--R--D--M--L--E--R--R--I- 420 1261 GCCGCGAGGCTCCCCGACGCGGCCGTCGACGACCTGCTCATCCCGAGCTACTCCTACCTC 1320 1261 GCCGCGAGGCTCCCCGACGCGGCCGTCGACGACCTGCTCATCCCGAGCTACTCCTACCTC 1320 421 -A--A--R--L--P--D--A--A--V--D--D--L--L--I--P--S--Y--S--Y--L- 440 1321 GTCGAGACGCTCTACGACGTGGAGTGCGTCGAGCGCATCGTGCGCTACTTCCTCGAAGGC 1380 1321 GTCGAGACGCTCTACGACGTGGAGTGCGTCGAGCGCATCGTGCGCTACTTCCTCGAAGGC 1380 441 -V--E--T--L--Y--D--V--E--C--V--E--R--I--V--R--Y--F--L--E--G- 460 1381 CGAGACGCCGACGACGGCAACGACGACGGCAGCGAGCCGGAGACACCGGGCAGAGAGGCC 1440 1381 CGAGACGCCGACGACGGCAACGACGACGGCAGCGAGCCGGAGACACCGGGCAGAGAGGCC 1440 461 -R--D--A--D--D--G--N--D--D--G--S--E--P--E--T--P--G--R--E--A- 480 1441 AGCCGACGAGCCATGCTCGCCGTTGGGAGGCTGATGGATGCCTACCTGGGCGAGATCGCC 1500 1441 AGCCGACGAGCCATGCTCGCCGTTGGGAGGCTGATGGATGCCTACCTGGGCGAGATCGCC 1500 481 -S--R--R--A--M--L--A--V--G--R--L--M--D--A--Y--L--G--E--I--A- 500 1501 GCAGATGCCAACCTGAAGCCGGACAAATTCTGCGACCTCGCCTGGGCATTGCCGGACGGC 1560 1501 GCAGATGCCAACCTGAAGCCGGACAAATTCTGCGACCTCGCCTGGGCATTGCCGGACGGC 1560 501 -A--D--A--N--L--K--P--D--K--F--C--D--L--A--W--A--L--P--D--G- 520 1561 GCCCGCGTCTACGACGACGGCCTCTACCGTGCGGTAGACATCTATCTCAAGGCTCATCCT 1620 1561 GCCCGCGTCTACGACGACGGCCTCTACCGTGCGGTAGACATCTATCTCAAGGCTCATCCT 1620 521 -A--R--V--Y--D--D--G--L--Y--R--A--V--D--I--Y--L--K--A--H--P- 540 1621 GGATTGAGGGAAGAAGAGAAGGAGAAGGTGAGCGGTGTCGTCGACGGCCGCAAGCTGACG 1680 1621 GGATTGAGGGAAGAAGAGAAGGAGAAGGTGAGCGGTGTCGTCGACGGCCGCAAGCTGACG 1680 541 -G--L--R--E--E--E--K--E--K--V--S--G--V--V--D--G--R--K--L--T- 560 1681 CTAGAAGCGTGCACGCACGCGGCGCAGAACGAGCGGCTGCCGCTGCGGACAGTGGTGCAG 1740 1681 CTAGAAGCGTGCACGCACGCGGCGCAGAACGAGCGGCTGCCGCTGCGGACAGTGGTGCAG 1740 561 -L--E--A--C--T--H--A--A--Q--N--E--R--L--P--L--R--T--V--V--Q- 580 1741 GTGCTCTTCTTCGAGCAGCTCCAGCTGCGTCGCGCCATTGCAAGGACAATCATGGCGAAC 1800 1741 GTGCTCTTCTTCGAGCAGCTCCAGCTGCGTCGCGCCATTGCAAGGACAATCATGGCGAAC 1800 581 -V--L--F--F--E--Q--L--Q--L--R--R--A--I--A--R--T--I--M--A--N- 600 1801 GAAGGTGGAGCAGCTGGTCAAGGGGAGGAAGAAGGCGACAGCGATGCCGGTGGTACATGG 1860 1801 GAAGGTGGAGCAGCTGGTCAAGGGGAGGAAGAAGGCGACAGCGATGCCGGTGGTACATGG 1860 601 -E--G--G--A--A--G--Q--G--E--E--E--G--D--S--D--A--G--G--T--W- 620 1861 CGGGTGGCGACAAGGGGGAACCAAATGCTGAGGCTGGACATGGACAGCATGCGAAACCGG 1920 1861 CGGGTGGCGACAAGGGGGAACCAAATGCTGAGGCTGGACATGGACAGCATGCGAAACCGG 1920 621 -R--V--A--T--R--G--N--Q--M--L--R--L--D--M--D--S--M--R--N--R- 640 1921 GTGCAGGAGCTGGAGCGTGAGTGCACAAGCATGAGGAAAGCCATTGAGAAGATGGACCGG 1980 1921 GTGCAGGAGCTGGAGCGTGAGTGCACAAGCATGAGGAAAGCCATTGAGAAGATGGACCGG 1980 641 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............................................................ ............................................................ 2281 TGTAGCGGTGCACAATTGTTCAGTGCCATCTGGATGGCCAATGCATCAAGTCATATGTTG 2340 ............................................................ ............................................................ 2341 GCTAAGCAAAGTGAATCATCATTTCTTCATCACTGGCATGATCCAGTAGCAGTAACAATT 2400 ............................................................ ............................................................ 2401 TACAACCGTAGTGAAGGAATTCAACTATAACAATGGGTGTCAATGGCAGTAGTGGTGGAG 2460 ............................................................ ............................................................ 2461 AGATGGCTCACCTCACCAGTAATCGCCGCAGGAGCAGGCGCCGTCCTTGAAATGGTGGAA 2520 ............................................................ ............................................................ 2521 GCGCTTGTTGTCCCTGACGACGATCTCGCGACCGGTGACCTTGGCGATGAGCTTGACGGC 2580 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............................................................ ............................................................ 2881 GGCGCCGAGCTTGCAGTACAGCGTGGCGATCATGTGCAGGATGGGCGTGGCGATCTCGGG 2940 ............................................................ ............................................................ 2941 CAGGGACTTGGACAGCAATCGGTGCGCTCGCCTGAGCGACGCCAGCGACCGCGCCTCTCC 3000 ............................................................ ............................................................ 3001 GCAGGCCTGGAGAACTGCTGCTTGCTCCTCCGGCGCGATTTCCGCCAACGCGCCGGCGCC 3060 ............................................................ ............................................................ 3061 GCCTCGCACGAGCATTTCGTCGAGCAGGTTAACGGCTGCCTCCGGGTT 3108 ................................................ ................................................
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