Transcript: OMERI03G08870.1
.
Show/hide columns (1 hidden)
- OMERI03G08870.1 1380 459aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A0A0E0CXK0 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG CCG CAG TAC CAG GAG CTT CCC TGC GGC GGG CAG GTG CTC GAC ATC GAC ACC GCG CTC 60
1 ATGCCGCAGTACCAGGAGCTTCCCTGCGGCGGGCAGGTGCTCGACATCGACACCGCGCTC 60
1 -M--P--Q--Y--Q--E--L--P--C--G--G--Q--V--L--D--I--D--T--A--L- 20
61 AAG GAC GGC ATC CTT GGG GGT GGC CCG GAG CTC GGG GAC GCG GCG GCG GGG GAC GGA GGG 120
61 AAGGACGGCATCCTTGGGGGTGGCCCGGAGCTCGGGGACGCGGCGGCGGGGGACGGAGGG 120
21 -K--D--G--I--L--G--G--G--P--E--L--G--D--A--A--A--G--D--G--G- 40
121 AAG CAG CCG GTG GAG CTG AGG AAG ATG ATG GAC GAG CTG GAC GCG GCG GGG GAC GGC GGC 180
121 AAGCAGCCGGTGGAGCTGAGGAAGATGATGGACGAGCTGGACGCGGCGGGGGACGGCGGC 180
41 -K--Q--P--V--E--L--R--K--M--M--D--E--L--D--A--A--G--D--G--G- 60
181 GGG GAC GAG GCG GTG CCG GCG GTG TTC ATC TGC CCG ATC TCG CTC GAG CCC ATG GTG GAT 240
181 GGGGACGAGGCGGTGCCGGCGGTGTTCATCTGCCCGATCTCGCTCGAGCCCATGGTGGAT 240
61 -G--D--E--A--V--P--A--V--F--I--C--P--I--S--L--E--P--M--V--D- 80
241 CCG GTG ACG CTG TGC ACC GGG CAG ACG TAC GAG AGC GCC AAC ATC TCG CGG TGG CTC GCC 300
241 CCGGTGACGCTGTGCACCGGGCAGACGTACGAGAGCGCCAACATCTCGCGGTGGCTCGCC 300
81 -P--V--T--L--C--T--G--Q--T--Y--E--S--A--N--I--S--R--W--L--A- 100
301 CTC GGC CAC CGG ACG TGC CCC ACC ACG ATG CAG GAG CTC TGG GAC GTC ACG CCC ATC CCC 360
301 CTCGGCCACCGGACGTGCCCCACCACGATGCAGGAGCTCTGGGACGTCACGCCCATCCCC 360
101 -L--G--H--R--T--C--P--T--T--M--Q--E--L--W--D--V--T--P--I--P- 120
361 AAC ACC ACG CTC CGG CAG CTC ATC GCC GCC TGG TTC TCC CGC CGC TAC ACC CGC TTC AAG 420
361 AACACCACGCTCCGGCAGCTCATCGCCGCCTGGTTCTCCCGCCGCTACACCCGCTTCAAG 420
121 -N--T--T--L--R--Q--L--I--A--A--W--F--S--R--R--Y--T--R--F--K- 140
421 AAG CGC TCC GCC GAC TTC CAC GGC CGG GCC GCG GAG CTC GTC CAC GCG CTC CGC GGC ACG 480
421 AAGCGCTCCGCCGACTTCCACGGCCGGGCCGCGGAGCTCGTCCACGCGCTCCGCGGCACG 480
141 -K--R--S--A--D--F--H--G--R--A--A--E--L--V--H--A--L--R--G--T- 160
481 GCC GTC CCG AAG AGG CAG CCC CTC AAG GGG CAG GCC AGG GTA GCC GCG CTC CGG GAG CTG 540
481 GCCGTCCCGAAGAGGCAGCCCCTCAAGGGGCAGGCCAGGGTAGCCGCGCTCCGGGAGCTG 540
161 -A--V--P--K--R--Q--P--L--K--G--Q--A--R--V--A--A--L--R--E--L- 180
541 CGG TCC CTC GCC GCC GCC CAC CAG TCC GTG ACC AAG GCC ATC GCC GAG GCC GGC GGC GTC 600
541 CGGTCCCTCGCCGCCGCCCACCAGTCCGTGACCAAGGCCATCGCCGAGGCCGGCGGCGTC 600
181 -R--S--L--A--A--A--H--Q--S--V--T--K--A--I--A--E--A--G--G--V- 200
601 GGG CTG TTG ACC TCC CTC CTC GGC CCC TTC ACG TCA CAC GCC GTG GGG TCC GAG GCG GTC 660
601 GGGCTGTTGACCTCCCTCCTCGGCCCCTTCACGTCACACGCCGTGGGGTCCGAGGCGGTC 660
201 -G--L--L--T--S--L--L--G--P--F--T--S--H--A--V--G--S--E--A--V- 220
661 GCC ATT CTC GTG AGC GGC GTG CCG CTC GAC GCC GAC GCC AAG GCC GCA TTG ATG CAG CCG 720
661 GCCATTCTCGTGAGCGGCGTGCCGCTCGACGCCGACGCCAAGGCCGCATTGATGCAGCCG 720
221 -A--I--L--V--S--G--V--P--L--D--A--D--A--K--A--A--L--M--Q--P- 240
721 GCG AAG GTG TCG CTC TTG GTG GAC ATG CTC AAT GAG GGT GCG GTG GAC ACC AAG ATC AAC 780
721 GCGAAGGTGTCGCTCTTGGTGGACATGCTCAATGAGGGTGCGGTGGACACCAAGATCAAC 780
241 -A--K--V--S--L--L--V--D--M--L--N--E--G--A--V--D--T--K--I--N- 260
781 TGC GTC CGC CTC ATC CGC ATA CTC ATG GAG GAG AAA GGC TTC CGG CCG GAC ACA GTA GCC 840
781 TGCGTCCGCCTCATCCGCATACTCATGGAGGAGAAAGGCTTCCGGCCGGACACAGTAGCC 840
261 -C--V--R--L--I--R--I--L--M--E--E--K--G--F--R--P--D--T--V--A- 280
841 AGC CTG AGC CTG CTA GTT GGA GTC ATG CGC CTC GTT CGA GAC AAG CGG CAT CCG GAC GGC 900
841 AGCCTGAGCCTGCTAGTTGGAGTCATGCGCCTCGTTCGAGACAAGCGGCATCCGGACGGC 900
281 -S--L--S--L--L--V--G--V--M--R--L--V--R--D--K--R--H--P--D--G- 300
901 GTC GCT GCG GGG CTT GAG CTG CTC AAT TCG ATA TGC GCA GTG CAC AAG CCT GCA AGA AGT 960
901 GTCGCTGCGGGGCTTGAGCTGCTCAATTCGATATGCGCAGTGCACAAGCCTGCAAGAAGT 960
301 -V--A--A--G--L--E--L--L--N--S--I--C--A--V--H--K--P--A--R--S- 320
961 TTG ATT GTT AGC ATC GGT GCG GTA CCG CAA CTA GTA GAA TTG CTG CCA GAG CTG CCA ACG 1020
961 TTGATTGTTAGCATCGGTGCGGTACCGCAACTAGTAGAATTGCTGCCAGAGCTGCCAACG 1020
321 -L--I--V--S--I--G--A--V--P--Q--L--V--E--L--L--P--E--L--P--T- 340
1021 GAG TGT GTA GAG CCA GCC TTG GAT ATC TTG GAT GCG CTT GCC GCA GTC CCG GAG GGT CGG 1080
1021 GAGTGTGTAGAGCCAGCCTTGGATATCTTGGATGCGCTTGCCGCAGTCCCGGAGGGTCGG 1080
341 -E--C--V--E--P--A--L--D--I--L--D--A--L--A--A--V--P--E--G--R- 360
1081 ATA GCG CTG AAG GAT TGC CCC AGG ACA ATA ACC AAT GCT GTG AGA TTG TTG ATG AGG GTT 1140
1081 ATAGCGCTGAAGGATTGCCCCAGGACAATAACCAATGCTGTGAGATTGTTGATGAGGGTT 1140
361 -I--A--L--K--D--C--P--R--T--I--T--N--A--V--R--L--L--M--R--V- 380
1141 TCA GAA GCA TGC ACA CGG CGA GCT TTG TCA ATG CTG TGG GTG GTG TGT AGG ATG GCG CCT 1200
1141 TCAGAAGCATGCACACGGCGAGCTTTGTCAATGCTGTGGGTGGTGTGTAGGATGGCGCCT 1200
381 -S--E--A--C--T--R--R--A--L--S--M--L--W--V--V--C--R--M--A--P- 400
1201 GAA GAA TGC GCG CCC GCT GCT CTA GAT GCC GGG CTG GGG GCC AAG CTT CTC TTG GTC ATA 1260
1201 GAAGAATGCGCGCCCGCTGCTCTAGATGCCGGGCTGGGGGCCAAGCTTCTCTTGGTCATA 1260
401 -E--E--C--A--P--A--A--L--D--A--G--L--G--A--K--L--L--L--V--I- 420
1261 CAG AGT GGG TGT GGA CCA GAG CTG AAG CAG CAA GCG TCC GAA CTG CTC AAG CTG TGC ACC 1320
1261 CAGAGTGGGTGTGGACCAGAGCTGAAGCAGCAAGCGTCCGAACTGCTCAAGCTGTGCACC 1320
421 -Q--S--G--C--G--P--E--L--K--Q--Q--A--S--E--L--L--K--L--C--T- 440
1321 ATG AAT TGC ACA TCG ACG GTA TTC ATC TCC AAG TGC AAG CTT ACG AAG ACA ATC CAG TGA 1380
1321 ATGAATTGCACATCGACGGTATTCATCTCCAAGTGCAAGCTTACGAAGACAATCCAGTGA 1380
441 -M--N--C--T--S--T--V--F--I--S--K--C--K--L--T--K--T--I--Q--*- 459
.
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use