Oryza meridionalis (Oryza_meridionalis_v1.3)
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About this transcript

This transcript has 1 exon, is annotated with 20 domains and features and maps to 36 oligo probes.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OMERI03G08870.11380459aa
 
Protein coding
A0A0E0CXK0 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Other
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Markup
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     1 ATGCCGCAGTACCAGGAGCTTCCCTGCGGCGGGCAGGTGCTCGACATCGACACCGCGCTC     60
     1 ATGCCGCAGTACCAGGAGCTTCCCTGCGGCGGGCAGGTGCTCGACATCGACACCGCGCTC     60
     1 -M--P--Q--Y--Q--E--L--P--C--G--G--Q--V--L--D--I--D--T--A--L-     20

                                                                          
    61 AAGGACGGCATCCTTGGGGGTGGCCCGGAGCTCGGGGACGCGGCGGCGGGGGACGGAGGG    120
    61 AAGGACGGCATCCTTGGGGGTGGCCCGGAGCTCGGGGACGCGGCGGCGGGGGACGGAGGG    120
    21 -K--D--G--I--L--G--G--G--P--E--L--G--D--A--A--A--G--D--G--G-     40

                                                                          
   121 AAGCAGCCGGTGGAGCTGAGGAAGATGATGGACGAGCTGGACGCGGCGGGGGACGGCGGC    180
   121 AAGCAGCCGGTGGAGCTGAGGAAGATGATGGACGAGCTGGACGCGGCGGGGGACGGCGGC    180
    41 -K--Q--P--V--E--L--R--K--M--M--D--E--L--D--A--A--G--D--G--G-     60

                                                                          
   181 GGGGACGAGGCGGTGCCGGCGGTGTTCATCTGCCCGATCTCGCTCGAGCCCATGGTGGAT    240
   181 GGGGACGAGGCGGTGCCGGCGGTGTTCATCTGCCCGATCTCGCTCGAGCCCATGGTGGAT    240
    61 -G--D--E--A--V--P--A--V--F--I--C--P--I--S--L--E--P--M--V--D-     80

                                                                          
   241 CCGGTGACGCTGTGCACCGGGCAGACGTACGAGAGCGCCAACATCTCGCGGTGGCTCGCC    300
   241 CCGGTGACGCTGTGCACCGGGCAGACGTACGAGAGCGCCAACATCTCGCGGTGGCTCGCC    300
    81 -P--V--T--L--C--T--G--Q--T--Y--E--S--A--N--I--S--R--W--L--A-    100

                                                                          
   301 CTCGGCCACCGGACGTGCCCCACCACGATGCAGGAGCTCTGGGACGTCACGCCCATCCCC    360
   301 CTCGGCCACCGGACGTGCCCCACCACGATGCAGGAGCTCTGGGACGTCACGCCCATCCCC    360
   101 -L--G--H--R--T--C--P--T--T--M--Q--E--L--W--D--V--T--P--I--P-    120

                                                                          
   361 AACACCACGCTCCGGCAGCTCATCGCCGCCTGGTTCTCCCGCCGCTACACCCGCTTCAAG    420
   361 AACACCACGCTCCGGCAGCTCATCGCCGCCTGGTTCTCCCGCCGCTACACCCGCTTCAAG    420
   121 -N--T--T--L--R--Q--L--I--A--A--W--F--S--R--R--Y--T--R--F--K-    140

                                                                          
   421 AAGCGCTCCGCCGACTTCCACGGCCGGGCCGCGGAGCTCGTCCACGCGCTCCGCGGCACG    480
   421 AAGCGCTCCGCCGACTTCCACGGCCGGGCCGCGGAGCTCGTCCACGCGCTCCGCGGCACG    480
   141 -K--R--S--A--D--F--H--G--R--A--A--E--L--V--H--A--L--R--G--T-    160

                                                                          
   481 GCCGTCCCGAAGAGGCAGCCCCTCAAGGGGCAGGCCAGGGTAGCCGCGCTCCGGGAGCTG    540
   481 GCCGTCCCGAAGAGGCAGCCCCTCAAGGGGCAGGCCAGGGTAGCCGCGCTCCGGGAGCTG    540
   161 -A--V--P--K--R--Q--P--L--K--G--Q--A--R--V--A--A--L--R--E--L-    180

                                                                          
   541 CGGTCCCTCGCCGCCGCCCACCAGTCCGTGACCAAGGCCATCGCCGAGGCCGGCGGCGTC    600
   541 CGGTCCCTCGCCGCCGCCCACCAGTCCGTGACCAAGGCCATCGCCGAGGCCGGCGGCGTC    600
   181 -R--S--L--A--A--A--H--Q--S--V--T--K--A--I--A--E--A--G--G--V-    200

                                                                          
   601 GGGCTGTTGACCTCCCTCCTCGGCCCCTTCACGTCACACGCCGTGGGGTCCGAGGCGGTC    660
   601 GGGCTGTTGACCTCCCTCCTCGGCCCCTTCACGTCACACGCCGTGGGGTCCGAGGCGGTC    660
   201 -G--L--L--T--S--L--L--G--P--F--T--S--H--A--V--G--S--E--A--V-    220

                                                                          
   661 GCCATTCTCGTGAGCGGCGTGCCGCTCGACGCCGACGCCAAGGCCGCATTGATGCAGCCG    720
   661 GCCATTCTCGTGAGCGGCGTGCCGCTCGACGCCGACGCCAAGGCCGCATTGATGCAGCCG    720
   221 -A--I--L--V--S--G--V--P--L--D--A--D--A--K--A--A--L--M--Q--P-    240

                                                                          
   721 GCGAAGGTGTCGCTCTTGGTGGACATGCTCAATGAGGGTGCGGTGGACACCAAGATCAAC    780
   721 GCGAAGGTGTCGCTCTTGGTGGACATGCTCAATGAGGGTGCGGTGGACACCAAGATCAAC    780
   241 -A--K--V--S--L--L--V--D--M--L--N--E--G--A--V--D--T--K--I--N-    260

                                                                          
   781 TGCGTCCGCCTCATCCGCATACTCATGGAGGAGAAAGGCTTCCGGCCGGACACAGTAGCC    840
   781 TGCGTCCGCCTCATCCGCATACTCATGGAGGAGAAAGGCTTCCGGCCGGACACAGTAGCC    840
   261 -C--V--R--L--I--R--I--L--M--E--E--K--G--F--R--P--D--T--V--A-    280

                                                                          
   841 AGCCTGAGCCTGCTAGTTGGAGTCATGCGCCTCGTTCGAGACAAGCGGCATCCGGACGGC    900
   841 AGCCTGAGCCTGCTAGTTGGAGTCATGCGCCTCGTTCGAGACAAGCGGCATCCGGACGGC    900
   281 -S--L--S--L--L--V--G--V--M--R--L--V--R--D--K--R--H--P--D--G-    300

                                                                          
   901 GTCGCTGCGGGGCTTGAGCTGCTCAATTCGATATGCGCAGTGCACAAGCCTGCAAGAAGT    960
   901 GTCGCTGCGGGGCTTGAGCTGCTCAATTCGATATGCGCAGTGCACAAGCCTGCAAGAAGT    960
   301 -V--A--A--G--L--E--L--L--N--S--I--C--A--V--H--K--P--A--R--S-    320

                                                                          
   961 TTGATTGTTAGCATCGGTGCGGTACCGCAACTAGTAGAATTGCTGCCAGAGCTGCCAACG   1020
   961 TTGATTGTTAGCATCGGTGCGGTACCGCAACTAGTAGAATTGCTGCCAGAGCTGCCAACG   1020
   321 -L--I--V--S--I--G--A--V--P--Q--L--V--E--L--L--P--E--L--P--T-    340

                                                                          
  1021 GAGTGTGTAGAGCCAGCCTTGGATATCTTGGATGCGCTTGCCGCAGTCCCGGAGGGTCGG   1080
  1021 GAGTGTGTAGAGCCAGCCTTGGATATCTTGGATGCGCTTGCCGCAGTCCCGGAGGGTCGG   1080
   341 -E--C--V--E--P--A--L--D--I--L--D--A--L--A--A--V--P--E--G--R-    360

                                                                          
  1081 ATAGCGCTGAAGGATTGCCCCAGGACAATAACCAATGCTGTGAGATTGTTGATGAGGGTT   1140
  1081 ATAGCGCTGAAGGATTGCCCCAGGACAATAACCAATGCTGTGAGATTGTTGATGAGGGTT   1140
   361 -I--A--L--K--D--C--P--R--T--I--T--N--A--V--R--L--L--M--R--V-    380

                                                                          
  1141 TCAGAAGCATGCACACGGCGAGCTTTGTCAATGCTGTGGGTGGTGTGTAGGATGGCGCCT   1200
  1141 TCAGAAGCATGCACACGGCGAGCTTTGTCAATGCTGTGGGTGGTGTGTAGGATGGCGCCT   1200
   381 -S--E--A--C--T--R--R--A--L--S--M--L--W--V--V--C--R--M--A--P-    400

                                                                          
  1201 GAAGAATGCGCGCCCGCTGCTCTAGATGCCGGGCTGGGGGCCAAGCTTCTCTTGGTCATA   1260
  1201 GAAGAATGCGCGCCCGCTGCTCTAGATGCCGGGCTGGGGGCCAAGCTTCTCTTGGTCATA   1260
   401 -E--E--C--A--P--A--A--L--D--A--G--L--G--A--K--L--L--L--V--I-    420

                                                                          
  1261 CAGAGTGGGTGTGGACCAGAGCTGAAGCAGCAAGCGTCCGAACTGCTCAAGCTGTGCACC   1320
  1261 CAGAGTGGGTGTGGACCAGAGCTGAAGCAGCAAGCGTCCGAACTGCTCAAGCTGTGCACC   1320
   421 -Q--S--G--C--G--P--E--L--K--Q--Q--A--S--E--L--L--K--L--C--T-    440

                                                                          
  1321 ATGAATTGCACATCGACGGTATTCATCTCCAAGTGCAAGCTTACGAAGACAATCCAGTGA   1380
  1321 ATGAATTGCACATCGACGGTATTCATCTCCAAGTGCAAGCTTACGAAGACAATCCAGTGA   1380
   441 -M--N--C--T--S--T--V--F--I--S--K--C--K--L--T--K--T--I--Q--*-    459