Oryza meridionalis (Oryza_meridionalis_v1.3)
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This transcript has 8 exons, is annotated with 14 domains and features and maps to 22 oligo probes.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OMERI02G36280.21377458aa
 
Protein coding
A0A0E0CTL9 Ensembl Canonical
-OMERI02G36280.12017423aa
 
Protein coding
A0A0E0CTL8 -
-OMERI02G36280.31829423aa
 
Protein coding
A0A0E0CTL8 -
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Other
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     1 ATGGCCCCTCCACCGCCGTCTCCGTCCCCGTCTCCGGCGAGCGGCGCGCAGTACGCGCAC     60
     1 ATGGCCCCTCCACCGCCGTCTCCGTCCCCGTCTCCGGCGAGCGGCGCGCAGTACGCGCAC     60
     1 -M--A--P--P--P--P--S--P--S--P--S--P--A--S--G--A--Q--Y--A--H-     20

                                                                          
    61 CAGTTCCTGAACACGGCGCTCTCCCAGCGCGGGCCCTCCGCCCTGCCCTACGCGGAGGAC    120
    61 CAGTTCCTGAACACGGCGCTCTCCCAGCGCGGGCCCTCCGCCCTGCCCTACGCGGAGGAC    120
    21 -Q--F--L--N--T--A--L--S--Q--R--G--P--S--A--L--P--Y--A--E--D-     40

                                                                          
   121 GTGAAGTGGCTGATCCGCAACCACCTCGTCGCCCTCGCCGACGCCTTCCCTTCGCTCCAC    180
   121 GTGAAGTGGCTGATCCGCAACCACCTCGTCGCCCTCGCCGACGCCTTCCCTTCGCTCCAC    180
    41 -V--K--W--L--I--R--N--H--L--V--A--L--A--D--A--F--P--S--L--H-     60

                                                                          
   181 CCCAAGGCCGCCCTCTTCACCCACAACGACGGCCGCGCCGCCCACCTCCTCCAGGCCGAC    240
   181 CCCAAGGCCGCCCTCTTCACCCACAACGACGGCCGCGCCGCCCACCTCCTCCAGGCCGAC    240
    61 -P--K--A--A--L--F--T--H--N--D--G--R--A--A--H--L--L--Q--A--D-     80

                                                                          
   241 GGCACCATCCCCATCCACCACGCCGGCGCCTCCTACAACCTCCCCGCTGTCCTCTGGCTC    300
   241 GGCACCATCCCCATCCACCACGCCGGCGCCTCCTACAACCTCCCCGCTGTCCTCTGGCTC    300
    81 -G--T--I--P--I--H--H--A--G--A--S--Y--N--L--P--A--V--L--W--L-    100

                                                                          
   301 CCGGAGCCCTACCCGCGGTCGCCGCCCCTCGTCTTCCTCTCCCCAACACGCGACATGGTC    360
   301 CCGGAGCCCTACCCGCGGTCGCCGCCCCTCGTCTTCCTCTCCCCAACACGCGACATGGTC    360
   101 -P--E--P--Y--P--R--S--P--P--L--V--F--L--S--P--T--R--D--M--V-    120

                                                                          
   361 ATCAAGCCCCACCACCCCCTCGTCGACCGCTCCGGCCTCGTCGCCAACGCCCCTTACCTC    420
   361 ATCAAGCCCCACCACCCCCTCGTCGACCGCTCCGGCCTCGTCGCCAACGCCCCTTACCTC    420
   121 -I--K--P--H--H--P--L--V--D--R--S--G--L--V--A--N--A--P--Y--L-    140

                                                                          
   421 CGCTCTTGGGTTTTCCCCTCCTCCAACCTCGTCGATCTTGTCCGATCCCTCTCTCACCTA    480
   421 CGCTCTTGGGTTTTCCCCTCCTCCAACCTCGTCGATCTTGTCCGATCCCTCTCTCACCTA    480
   141 -R--S--W--V--F--P--S--S--N--L--V--D--L--V--R--S--L--S--H--L-    160

                                                                          
   481 TTCCCTGCCTCGCCCCAGCTTGCCGCGCGCCCCCCACCCACCGAAGACCCCGCTGAGGTC    540
   481 TTCCCTGCCTCGCCCCAGCTTGCCGCGCGCCCCCCACCCACCGAAGACCCCGCTGAGGTC    540
   161 -F--P--A--S--P--Q--L--A--A--R--P--P--P--T--E--D--P--A--E--V-    180

                                                                          
   541 TACAAGCGCAATGCCATCGCTAAGCTCGTTGACATGGCCTATGCCGATGCTGCCACGCTG    600
   541 TACAAGCGCAATGCCATCGCTAAGCTCGTTGACATGGCCTATGCCGATGCTGCCACGCTG    600
   181 -Y--K--R--N--A--I--A--K--L--V--D--M--A--Y--A--D--A--A--T--L-    200

                                                                          
   601 CGCCCCGCCCGCGAGACTGAGGTCGACACTCTCTTCGCCATGCAGGCTACGCTGCGCAGC    660
   601 CGCCCCGCCCGCGAGACTGAGGTCGACACTCTCTTCGCCATGCAGGCTACGCTGCGCAGC    660
   201 -R--P--A--R--E--T--E--V--D--T--L--F--A--M--Q--A--T--L--R--S-    220

                                                                          
   661 CGGGGGGAGGTGGTCTCTGATGGGGTGCGCAAGATGGGGGAGGAGAAGGAGGCACTTGAG    720
   661 CGGGGGGAGGTGGTCTCTGATGGGGTGCGCAAGATGGGGGAGGAGAAGGAGGCACTTGAG    720
   221 -R--G--E--V--V--S--D--G--V--R--K--M--G--E--E--K--E--A--L--E-    240

                                                                          
   721 CGCCGCCTGCAGGATGTAATGATGGCCACGGACCTCATGGAGGCATGGGTCATGGAGAAC    780
   721 CGCCGCCTGCAGGATGTAATGATGGCCACGGACCTCATGGAGGCATGGGTCATGGAGAAC    780
   241 -R--R--L--Q--D--V--M--M--A--T--D--L--M--E--A--W--V--M--E--N-    260

                                                                          
   781 ACCAAGGGTGCTGCCGGCGACACTGAAGCGGACGAGGCAATTGAGACCGCGGATGTACTG    840
   781 ACCAAGGGTGCTGCCGGCGACACTGAAGCGGACGAGGCAATTGAGACCGCGGATGTACTG    840
   261 -T--K--G--A--A--G--D--T--E--A--D--E--A--I--E--T--A--D--V--L-    280

                                                                          
   841 TCTAAGCAGATGCTTGAGTGCACTGCTGCGGATTTGGCACTCGAGGACACCATTTATGCA    900
   841 TCTAAGCAGATGCTTGAGTGCACTGCTGCGGATTTGGCACTCGAGGACACCATTTATGCA    900
   281 -S--K--Q--M--L--E--C--T--A--A--D--L--A--L--E--D--T--I--Y--A-    300

                                                                          
   901 CTTGACAAGGCCATTCAGGAGGGTTCTGTGCCATTTGATGGCTACCTCAGGAGCGTGCGC    960
   901 CTTGACAAGGCCATTCAGGAGGGTTCTGTGCCATTTGATGGCTACCTCAGGAGCGTGCGC    960
   301 -L--D--K--A--I--Q--E--G--S--V--P--F--D--G--Y--L--R--S--V--R-    320

                                                                          
   961 GCGCTTGCACGGGAGCAGTTTTTCCAACGCGTCCTGTCAACCAAGGTGAACAAGGCACAA   1020
   961 GCGCTTGCACGGGAGCAGTTTTTCCAACGCGTCCTGTCAACCAAGGTGAACAAGGCACAA   1020
   321 -A--L--A--R--E--Q--F--F--Q--R--V--L--S--T--K--V--N--K--A--Q-    340

                                                                          
  1021 CAGCAGGCTCAGGTTGCTAGAATGGCTGCTCGGGCACCACAGTGTCAGGCGCGAATAGAC   1080
  1021 CAGCAGGCTCAGGTTGCTAGAATGGCTGCTCGGGCACCACAGTGTCAGGCGCGAATAGAC   1080
   341 -Q--Q--A--Q--V--A--R--M--A--A--R--A--P--Q--C--Q--A--R--I--D-    360

                                                                          
  1081 AATGTTGAGCCCCCGAGTGAGGCCGTGGACGGTGCCATAGCCGCGGGACCCGAGGCCGAT   1140
  1081 AATGTTGAGCCCCCGAGTGAGGCCGTGGACGGTGCCATAGCCGCGGGACCCGAGGCCGAT   1140
   361 -N--V--E--P--P--S--E--A--V--D--G--A--I--A--A--G--P--E--A--D-    380

                                                                          
  1141 GCAGCTGTAGAGCAGCAGCCCCTGCCGGTACGGCAGTTGGGGTTATTTATGAAGATCACC   1200
  1141 GCAGCTGTAGAGCAGCAGCCCCTGCCGGTACGGCAGTTGGGGTTATTTATGAAGATCACC   1200
   381 -A--A--V--E--Q--Q--P--L--P--V--R--Q--L--G--L--F--M--K--I--T-    400

                                                                          
  1201 ATCAATCATCTTCAGTTGGATTGCTGCTTTCAGGCTATTGTGCTGGTGCAGTTGTGCAGC   1260
  1201 ATCAATCATCTTCAGTTGGATTGCTGCTTTCAGGCTATTGTGCTGGTGCAGTTGTGCAGC   1260
   401 -I--N--H--L--Q--L--D--C--C--F--Q--A--I--V--L--V--Q--L--C--S-    420

                                                                          
  1261 AGTGCAGGTAAGATGGCATACAGCTCACTATGCCAGCAAGAAAGAAAAGACTTCGAGGTT   1320
  1261 AGTGCAGGTAAGATGGCATACAGCTCACTATGCCAGCAAGAAAGAAAAGACTTCGAGGTT   1320
   421 -S--A--G--K--M--A--Y--S--S--L--C--Q--Q--E--R--K--D--F--E--V-    440

                                                                          
  1321 GTGATTGAGGATGGCAGTAGCATGATGACTATCCGCTACTGCCGCCCCGCCTATTGA      1377
  1321 GTGATTGAGGATGGCAGTAGCATGATGACTATCCGCTACTGCCGCCCCGCCTATTGA      1377
   441 -V--I--E--D--G--S--S--M--M--T--I--R--Y--C--R--P--A--Y--*-       458