Oryza meridionalis (Oryza_meridionalis_v1.3) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 2: 28,968,170-28,973,254 forward strand.
This transcript has 4 exons, is annotated with 15 domains and features and maps to 38 oligo probes.
This transcript is a product of gene OMERI02G26960 Show transcript tableHide transcript table
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1 ATGGCCACCATCGCCCAGCCCGACCCCAGCAGCAGCAGCCGCCGCACCGCCGCTCTTATA 60 1 ATGGCCACCATCGCCCAGCCCGACCCCAGCAGCAGCAGCCGCCGCACCGCCGCTCTTATA 60 1 -M--A--T--I--A--Q--P--D--P--S--S--S--S--R--R--T--A--A--L--I- 20 61 CGCCGCAGCGGCAGCGTCCTGCTCGAGCAACCAGGTGTTGGGGGGAAGATGCTGGGGTCG 120 61 CGCCGCAGCGGCAGCGTCCTGCTCGAGCAACCAGGTGTTGGGGGGAAGATGCTGGGGTCG 120 21 -R--R--S--G--S--V--L--L--E--Q--P--G--V--G--G--K--M--L--G--S- 40 121 GGGCTGAATCTGGTGACCACGGTGATCGGCTTCGGGATGAGCGCCACCTTCATCGTCTTC 180 121 GGGCTGAATCTGGTGACCACGGTGATCGGCTTCGGGATGAGCGCCACCTTCATCGTCTTC 180 41 -G--L--N--L--V--T--T--V--I--G--F--G--M--S--A--T--F--I--V--F- 60 181 GTCTGCGCGCGCCTCATCTGCGGCCGCGCCGCGCGGGCCGACGCCGAGGCCGACGCCGCC 240 181 GTCTGCGCGCGCCTCATCTGCGGCCGCGCCGCGCGGGCCGACGCCGAGGCCGACGCCGCC 240 61 -V--C--A--R--L--I--C--G--R--A--A--R--A--D--A--E--A--D--A--A- 80 241 GAGGGCAGGGTCGCGGCCGCGCGGGCCATGGCGGCTGGCCCCGCGCCGTTCGACTTCGAC 300 241 GAGGGCAGGGTCGCGGCCGCGCGGGCCATGGCGGCTGGCCCCGCGCCGTTCGACTTCGAC 300 81 -E--G--R--V--A--A--A--R--A--M--A--A--G--P--A--P--F--D--F--D- 100 301 GTCGAGTTCCGGGCCACGGATCTCGACCGCACGATTGAGCATACTCGTAGTGGATTGGAA 360 301 GTCGAGTTCCGGGCCACGGATCTCGACCGCACGATTGAGCATACTCGTAGTGGATTGGAA 360 101 -V--E--F--R--A--T--D--L--D--R--T--I--E--H--T--R--S--G--L--E- 120 361 CCTTTTGTTGTTGCTGCAATTCCTACAATGAAGTACAGCTACGAGGCCTTCCAATCAAAA 420 361 CCTTTTGTTGTTGCTGCAATTCCTACAATGAAGTACAGCTACGAGGCCTTCCAATCAAAA 420 121 -P--F--V--V--A--A--I--P--T--M--K--Y--S--Y--E--A--F--Q--S--K- 140 421 GATGATGCCCAGTGCTCCATATGTTTAGGTGAATACAATGAGAAAGAGATTCTGCGCATC 480 421 GATGATGCCCAGTGCTCCATATGTTTAGGTGAATACAATGAGAAAGAGATTCTGCGCATC 480 141 -D--D--A--Q--C--S--I--C--L--G--E--Y--N--E--K--E--I--L--R--I- 160 481 ATGCCCAAATGCCGTCATAATTTTCATCTTTCCTGTATAGATGTATGGTTACAAAAGCAA 540 481 ATGCCCAAATGCCGTCATAATTTTCATCTTTCCTGTATAGATGTATGGTTACAAAAGCAA 540 161 -M--P--K--C--R--H--N--F--H--L--S--C--I--D--V--W--L--Q--K--Q- 180 541 ACTACTTGTCCGATATGCCGGATCTCATTGAAGGACCTACCCAGTGGAAAACCTGCCGAG 600 541 ACTACTTGTCCGATATGCCGGATCTCATTGAAGGACCTACCCAGTGGAAAACCTGCCGAG 600 181 -T--T--C--P--I--C--R--I--S--L--K--D--L--P--S--G--K--P--A--E- 200 601 TCCCCTGTCCGTAATCTCCCTCAACTATTCAGCCACCCTGAAAGCTCAGTGAGTCGATCA 660 601 TCCCCTGTCCGTAATCTCCCTCAACTATTCAGCCACCCTGAAAGCTCAGTGAGTCGATCA 660 201 -S--P--V--R--N--L--P--Q--L--F--S--H--P--E--S--S--V--S--R--S- 220 661 CCTCATTGGATACTTCCTATCCATCGTGATCGTACTGGAGGTAGAGAAAGCAGCCCGGCT 720 661 CCTCATTGGATACTTCCTATCCATCGTGATCGTACTGGAGGTAGAGAAAGCAGCCCGGCT 720 221 -P--H--W--I--L--P--I--H--R--D--R--T--G--G--R--E--S--S--P--A- 240 721 TCACAAGAGACAGTAGAGGTGGTCATTGAAATCCAACAAGAAATGCACTGAGGACATGGA 780 721 TCACAAGAGACAGTAGAGGTGGTCATTGAAATCCAACAAGAAATGCACTGA......... 771 241 -S--Q--E--T--V--E--V--V--I--E--I--Q--Q--E--M--H--*-......... 256 781 TGTATAGAGGCGAGATATCGATAGAAGTTGATGAAACTATTTTTTTTCGGTTGAGCAACA 840 ............................................................ ............................................................ 841 AAGATATCTTCTATTGCAGAAACGCCGTGCGTTCTTCCAGCAGCAGGGCAGCACGTACAC 900 ............................................................ ............................................................ 901 GGCTTTGGCACAGAATTGCAAGGAATTTGTTTACGACAGGACTGGATTTTAGGCATTCTT 960 ............................................................ ............................................................ 961 TGTACATTTGAGGGTGTAGATTAGCGGGTTGCCTTTTGCCCCTCTGTTCAGTTTTTATGT 1020 ............................................................ ............................................................ 1021 GTCCTTGATGTATAGTGTAAAAGGAAGCATTAACAATACTGATCAGATTCGGGGCCGCGA 1080 ............................................................ ............................................................ 1081 AAATATTTGTAGCAGCGCCGTTGTTCAGATATCATCAGTTCATCACTGCTATCTTCAGCT 1140 ............................................................ ............................................................ 1141 TGAACAGGGCGTCTTAGGTCGAGTTTAGTTTCAAACTTTTTTTTTTCAAGCTTCCAACTT 1200 ............................................................ ............................................................ 1201 TTCTATCACATAAAACTTTCCTACACACATAAACT 1235 ................................... ...................................
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