Oryza meridionalis (Oryza_meridionalis_v1.3) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 2: 9,025,787-9,034,470 reverse strand.
This transcript has 16 exons, is annotated with 31 domains and features and maps to 20 oligo probes.
This transcript is a product of gene OMERI02G10490 Show transcript tableHide transcript table
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1 CACATCATTTGGCCACCCCCAACCCCACCACCCCTCCCCTTCCATCCCCCATCGATCTCC 60 ............................................................ ............................................................ 61 TCCCCCCATTCTTCCAGAACCTTCCAGAACCTCCTCCCGATCCCTCCCCTTCCCTCCCCC 120 ............................................................ ............................................................ 121 CCGCGCCATGGTGTCGTGACGTCGGCGGCGGCGGAAGATGGACCCCTCCTCCAAGTCCCC 180 .....................................ATGGACCCCTCCTCCAAGTCCCC 23 .....................................-M--D--P--S--S--K--S--P 8 181 CGACGACGACGACCGCCGCCCCGAGGCGGAGGCGGCGAGGCGGCCGCAGCCGCAGCCGCA 240 24 CGACGACGACGACCGCCGCCCCGAGGCGGAGGCGGCGAGGCGGCCGCAGCCGCAGCCGCA 83 8 --D--D--D--D--R--R--P--E--A--E--A--A--R--R--P--Q--P--Q--P--Q 28 241 GCCGCGGGAGTGGCGGTTCGCGCAGGTCTTCGGGGAGCGCGCGGCGGGGGAGGACGTGCA 300 84 GCCGCGGGAGTGGCGGTTCGCGCAGGTCTTCGGGGAGCGCGCGGCGGGGGAGGACGTGCA 143 28 --P--R--E--W--R--F--A--Q--V--F--G--E--R--A--A--G--E--D--V--Q 48 301 GGAAGTTGACATCATCTCTGCAATTGAGTTTGACAAATCCGGTGACCATCTTGCCACTGG 360 144 GGAAGTTGACATCATCTCTGCAATTGAGTTTGACAAATCCGGTGACCATCTTGCCACTGG 203 48 --E--V--D--I--I--S--A--I--E--F--D--K--S--G--D--H--L--A--T--G 68 361 AGATAGAGGTGGTCGTGTAGTTTTATTTGAAAGGACTGACTCCAGGGATAGCGCCAGTCG 420 204 AGATAGAGGTGGTCGTGTAGTTTTATTTGAAAGGACTGACTCCAGGGATAGCGCCAGTCG 263 68 --D--R--G--G--R--V--V--L--F--E--R--T--D--S--R--D--S--A--S--R 88 421 GAGTGAACTTGAGAGACAAGATTACCCGATTGCCAGGCATCCTGAATTCCGTTACAAGAC 480 264 GAGTGAACTTGAGAGACAAGATTACCCGATTGCCAGGCATCCTGAATTCCGTTACAAGAC 323 88 --S--E--L--E--R--Q--D--Y--P--I--A--R--H--P--E--F--R--Y--K--T 108 481 TGAATTTCAGAGTCATGAACCTGAGTTCGACTACCTAAAAAGTTTGGAAATAGAGGAGAA 540 324 TGAATTTCAGAGTCATGAACCTGAGTTCGACTACCTAAAAAGTTTGGAAATAGAGGAGAA 383 108 --E--F--Q--S--H--E--P--E--F--D--Y--L--K--S--L--E--I--E--E--K 128 541 GATTAACAAGATCAAGTGGTGCCAAACAGCCAACAACGCCCTCTTTCTCTTATCTACAAA 600 384 GATTAACAAGATCAAGTGGTGCCAAACAGCCAACAACGCCCTCTTTCTCTTATCTACAAA 443 128 --I--N--K--I--K--W--C--Q--T--A--N--N--A--L--F--L--L--S--T--N 148 601 TGATAAAACAATCAAGTATTGGAAGGTGCAAGAGAGGAAAGTAAAACGAATTTCAGTGAT 660 444 TGATAAAACAATCAAGTATTGGAAGGTGCAAGAGAGGAAAGTAAAACGAATTTCAGTGAT 503 148 --D--K--T--I--K--Y--W--K--V--Q--E--R--K--V--K--R--I--S--V--M 168 661 GAATTTGAATACCTCTCAAAGTTCAGGCAATGGCACAACTTCTAGTTCGAGCAGCAGTAG 720 504 GAATTTGAATACCTCTCAAAGTTCAGGCAATGGCACAACTTCTAGTTCGAGCAGCAGTAG 563 168 --N--L--N--T--S--Q--S--S--G--N--G--T--T--S--S--S--S--S--S--S 188 721 TTCTAGAGCGATTCTTCCAAATGGTGGATGCTCAGAGAAGTTATACAACTTCCCAAACAA 780 564 TTCTAGAGCGATTCTTCCAAATGGTGGATGCTCAGAGAAGTTATACAACTTCCCAAACAA 623 188 --S--R--A--I--L--P--N--G--G--C--S--E--K--L--Y--N--F--P--N--N 208 781 CGACCTATTATTTCCTCCTGGAGGATGCACATCATTGCGTCTGCCTGTGGTCACTGGCCA 840 624 CGACCTATTATTTCCTCCTGGAGGATGCACATCATTGCGTCTGCCTGTGGTCACTGGCCA 683 208 --D--L--L--F--P--P--G--G--C--T--S--L--R--L--P--V--V--T--G--Q 228 841 AGATTTGAACCTTGTACCAAGATGCCGGCGTGTATATTCACATGCTCATGATTACCATAT 900 684 AGATTTGAACCTTGTACCAAGATGCCGGCGTGTATATTCACATGCTCATGATTACCATAT 743 228 --D--L--N--L--V--P--R--C--R--R--V--Y--S--H--A--H--D--Y--H--I 248 901 TAATTCCATTTCAAATAATAGTGACGGGGAGACATACATATCCGCAGATGATCTGCGAAT 960 744 TAATTCCATTTCAAATAATAGTGACGGGGAGACATACATATCCGCAGATGATCTGCGAAT 803 248 --N--S--I--S--N--N--S--D--G--E--T--Y--I--S--A--D--D--L--R--I 268 961 AAATCTTTGGAACCTGGAAATTAGCAACCAAAGCTTTAATATTGTTGATGTGAAGCCTGC 1020 804 AAATCTTTGGAACCTGGAAATTAGCAACCAAAGCTTTAATATTGTTGATGTGAAGCCTGC 863 268 --N--L--W--N--L--E--I--S--N--Q--S--F--N--I--V--D--V--K--P--A 288 1021 AAACATGGAGGATCTAACTGAGGTGATCACATGTGCGGAGTTCCACCCAACTCATTGTAA 1080 864 AAACATGGAGGATCTAACTGAGGTGATCACATGTGCGGAGTTCCACCCAACTCATTGTAA 923 288 --N--M--E--D--L--T--E--V--I--T--C--A--E--F--H--P--T--H--C--N 308 1081 TACATTAGCCTATAGTAGCTCGAAGGGCTCTATCAGGCTTATTGATCTGCGGCAATCAGC 1140 924 TACATTAGCCTATAGTAGCTCGAAGGGCTCTATCAGGCTTATTGATCTGCGGCAATCAGC 983 308 --T--L--A--Y--S--S--S--K--G--S--I--R--L--I--D--L--R--Q--S--A 328 1141 ACTATGTGACAACCATTCTAAGTTATTTGAGGAGCATGAGGCACCTGGATCGAGATCCTT 1200 984 ACTATGTGACAACCATTCTAAGTTATTTGAGGAGCATGAGGCACCTGGATCGAGATCCTT 1043 328 --L--C--D--N--H--S--K--L--F--E--E--H--E--A--P--G--S--R--S--F 348 1201 TTTTACAGAGATAATTGCATCGGTTTCAGATATAAAATTTGCAAGGGATGGAAGGCACAT 1260 1044 TTTTACAGAGATAATTGCATCGGTTTCAGATATAAAATTTGCAAGGGATGGAAGGCACAT 1103 348 --F--T--E--I--I--A--S--V--S--D--I--K--F--A--R--D--G--R--H--I 368 1261 TCTTAGTCGTGATTATATGACTCTCAAGTTATGGGATATAAACATGGATTCAGGCCCAGT 1320 1104 TCTTAGTCGTGATTATATGACTCTCAAGTTATGGGATATAAACATGGATTCAGGCCCAGT 1163 368 --L--S--R--D--Y--M--T--L--K--L--W--D--I--N--M--D--S--G--P--V 388 1321 TGCAACTTTCCAAGTTCATGAATATTTAAGACCTAAGCTCTGTGATCTATATGAAAATGA 1380 1164 TGCAACTTTCCAAGTTCATGAATATTTAAGACCTAAGCTCTGTGATCTATATGAAAATGA 1223 388 --A--T--F--Q--V--H--E--Y--L--R--P--K--L--C--D--L--Y--E--N--D 408 1381 TTCAATATTTGACAAATTTGAATGTTGTCTGAGTGGGGATGGACTTCGTGTTGCAACTGG 1440 1224 TTCAATATTTGACAAATTTGAATGTTGTCTGAGTGGGGATGGACTTCGTGTTGCAACTGG 1283 408 --S--I--F--D--K--F--E--C--C--L--S--G--D--G--L--R--V--A--T--G 428 1441 CTCTTACAGCAATTTATTTCGTGTTTTTGGTTGTACTCCTGGAAGTGCGGAGGCAACCAC 1500 1284 CTCTTACAGCAATTTATTTCGTGTTTTTGGTTGTACTCCTGGAAGTGCGGAGGCAACCAC 1343 428 --S--Y--S--N--L--F--R--V--F--G--C--T--P--G--S--A--E--A--T--T 448 1501 CTTGGAAGCAAGCAGAAATCCTATGAGGCGCCAGGTTGCTAATCCAACAAGGCCTGCACG 1560 1344 CTTGGAAGCAAGCAGAAATCCTATGAGGCGCCAGGTTGCTAATCCAACAAGGCCTGCACG 1403 448 --L--E--A--S--R--N--P--M--R--R--Q--V--A--N--P--T--R--P--A--R 468 1561 GACCCTGACCTCATTGACCCGTGCCGTGAGGAGAGGTGGGGAAAATCCGGGAGTTGATGC 1620 1404 GACCCTGACCTCATTGACCCGTGCCGTGAGGAGAGGTGGGGAAAATCCGGGAGTTGATGC 1463 468 --T--L--T--S--L--T--R--A--V--R--R--G--G--E--N--P--G--V--D--A 488 1621 TAATGGAAATTCTTACGATCTTTCAACAAAGTTGCTCCATCTTGCATGGCACCCAACTGA 1680 1464 TAATGGAAATTCTTACGATCTTTCAACAAAGTTGCTCCATCTTGCATGGCACCCAACTGA 1523 488 --N--G--N--S--Y--D--L--S--T--K--L--L--H--L--A--W--H--P--T--E 508 1681 GAATTCCATCGCGTGTGCTGCTGCAAATAGCTTTTTGGGGACCCAGTAA 1729 1524 GAATTCCATCGCGTGTGCTGCTGCAAATAGCTTTTTGGGGACCCAGTAA 1572 508 --N--S--I--A--C--A--A--A--N--S--F--L--G--T--Q--*- 523
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Ensembl Plants release 61 - May 2025 © EMBL-EBI EMBL-EBI
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