Oryza meridionalis (Oryza_meridionalis_v1.3)
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About this transcript

This transcript has 1 exon, is annotated with 14 domains and features and maps to 24 oligo probes.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OMERI01G36430.1528175aa
 
Protein coding
A0A0E0CB65 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Variants
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Other
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Markup
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     1 ATGGATAATGGCGCAAGAGCACTCATCGAGTTGTCACAGGGCACTCCAGGGAGCTTTTGT     60
     1 ATGGATAATGGCGCAAGAGCACTCATCGAGTTGTCACAGGGCACTCCAGGGAGCTTTTGT     60
     1 -M--D--N--G--A--R--A--L--I--E--L--S--Q--G--T--P--G--S--F--C-     20

                                                                          
    61 AAGGTGTGCAATGAGGTTGAAAAACCTGACAAGAGGTTCTTGATATGTGCCCACTCCCTC    120
    61 AAGGTGTGCAATGAGGTTGAAAAACCTGACAAGAGGTTCTTGATATGTGCCCACTCCCTC    120
    21 -K--V--C--N--E--V--E--K--P--D--K--R--F--L--I--C--A--H--S--L-     40

                                                                          
   121 TGTCCATACAAGTTCTACCATATCAGGTGCCTAAAGTACGAACAGATCGCGAGCAGTGAA    180
   121 TGTCCATACAAGTTCTACCATATCAGGTGCCTAAAGTACGAACAGATCGCGAGCAGTGAA    180
    41 -C--P--Y--K--F--Y--H--I--R--C--L--K--Y--E--Q--I--A--S--S--E-     60

                                                                          
   181 CAGCAGGGCAACGAGTATTGGTATTGCCCATCTTGTCTCTGTCGAGTTTGCAAAGTCGAT    240
   181 CAGCAGGGCAACGAGTATTGGTATTGCCCATCTTGTCTCTGTCGAGTTTGCAAAGTCGAT    240
    61 -Q--Q--G--N--E--Y--W--Y--C--P--S--C--L--C--R--V--C--K--V--D-     80

                                                                          
   241 AGGGATGATGAGCAGATCATCCTTTGTGATGGTTGTGATGAGGGATACCACCTCTACTGC    300
   241 AGGGATGATGAGCAGATCATCCTTTGTGATGGTTGTGATGAGGGATACCACCTCTACTGC    300
    81 -R--D--D--E--Q--I--I--L--C--D--G--C--D--E--G--Y--H--L--Y--C-    100

                                                                          
   301 TTGATCCCACCATTGACATTAGTGCCTGAAGGGGAATGGCACTGCTCGTCCTGCATAGTA    360
   301 TTGATCCCACCATTGACATTAGTGCCTGAAGGGGAATGGCACTGCTCGTCCTGCATAGTA    360
   101 -L--I--P--P--L--T--L--V--P--E--G--E--W--H--C--S--S--C--I--V-    120

                                                                          
   361 CAAGAGGAAAAGGAGACGAAGAGGAGGCTCCATGGGAAGGACATTGCCACCAATGTTTCC    420
   361 CAAGAGGAAAAGGAGACGAAGAGGAGGCTCCATGGGAAGGACATTGCCACCAATGTTTCC    420
   121 -Q--E--E--K--E--T--K--R--R--L--H--G--K--D--I--A--T--N--V--S-    140

                                                                          
   421 ATGCTCGAGACAGATGGCTTTGCTGAACTTGAAGCTGCCAATGTGCTCATGCTATCGAAG    480
   421 ATGCTCGAGACAGATGGCTTTGCTGAACTTGAAGCTGCCAATGTGCTCATGCTATCGAAG    480
   141 -M--L--E--T--D--G--F--A--E--L--E--A--A--N--V--L--M--L--S--K-    160

                                                                          
   481 AATTCGAGCACCAGTGGAGAGATTGTGGTGTCACCTGTGTCTCAGTAG                528
   481 AATTCGAGCACCAGTGGAGAGATTGTGGTGTCACCTGTGTCTCAGTAG                528
   161 -N--S--S--T--S--G--E--I--V--V--S--P--V--S--Q--*-                175