Oryza longistaminata (O_longistaminata_v1.0)
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About this transcript

This transcript has 4 exons, is annotated with 7 domains and features and maps to 15 oligo probes.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeFlags
-KN540592.1_FGT004507168aa
 
Protein coding
Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Variants
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Other
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Markup
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     1 ATGCGTGAGCACATATCCTCATCGCTCATGGACTCGCCGCCGTTCCCCGACCTGCTACCA     60
     1 ATGCGTGAGCACATATCCTCATCGCTCATGGACTCGCCGCCGTTCCCCGACCTGCTACCA     60
     1 -M--R--E--H--I--S--S--S--L--M--D--S--P--P--F--P--D--L--L--P-     20

                                                                          
    61 CCACCACCACCCTCCGGCCGCCACCGCCATGGATACCGCCACCCCCACGTCGGCGCCGCC    120
    61 CCACCACCACCCTCCGGCCGCCACCGCCATGGATACCGCCACCCCCACGTCGGCGCCGCC    120
    21 -P--P--P--P--S--G--R--H--R--H--G--Y--R--H--P--H--V--G--A--A-     40

                                                                          
   121 GAGGAAGAGATCATGATGTTAAGAACACGGCTATTATGGGGAAGATTCGGTATGCATGAT    180
   121 GAGGAAGAGATCATGATGTTAAGAACACGGCTATTATGGGGAAGATTCGGTATGCATGAT    180
    41 -E--E--E--I--M--M--L--R--T--R--L--L--W--G--R--F--G--M--H--D-     60

                                                                          
   181 CAGCACCAGGATTGGCGACTCGACGTTGACAACATGACATATGAGGAGCTGCTGGATCTT    240
   181 CAGCACCAGGATTGGCGACTCGACGTTGACAACATGACATATGAGGAGCTGCTGGATCTT    240
    61 -Q--H--Q--D--W--R--L--D--V--D--N--M--T--Y--E--E--L--L--D--L-     80

                                                                          
   241 GAAGACAGAATTGGGTATGTAAGCACAGGGTTGCATGATGATGAAATCACTCGCAGCCTT    300
   241 GAAGACAGAATTGGGTATGTAAGCACAGGGTTGCATGATGATGAAATCACTCGCAGCCTT    300
    81 -E--D--R--I--G--Y--V--S--T--G--L--H--D--D--E--I--T--R--S--L-    100

                                                                          
   301 AGGATGGTCAAGTATTCAGCATTCAACCCCAAGCATTTTGCAACAGAAGTAGAAAGGAAT    360
   301 AGGATGGTCAAGTATTCAGCATTCAACCCCAAGCATTTTGCAACAGAAGTAGAAAGGAAT    360
   101 -R--M--V--K--Y--S--A--F--N--P--K--H--F--A--T--E--V--E--R--N-    120

                                                                          
   361 TGTAGTATTTGTCAGGAAGAATTTGAAGCAAATGAGGAAACAGGGAGGCTGATCTGTGGC    420
   361 TGTAGTATTTGTCAGGAAGAATTTGAAGCAAATGAGGAAACAGGGAGGCTGATCTGTGGC    420
   121 -C--S--I--C--Q--E--E--F--E--A--N--E--E--T--G--R--L--I--C--G-    140

                                                                          
   421 CACAGCTATCATGTGCAATGCATAAAGCAGTGGCTTTCTAGGAAGAACACCTGCCCTGTC    480
   421 CACAGCTATCATGTGCAATGCATAAAGCAGTGGCTTTCTAGGAAGAACACCTGCCCTGTC    480
   141 -H--S--Y--H--V--Q--C--I--K--Q--W--L--S--R--K--N--T--C--P--V-    160

                                                                          
   481 TGCAAAACTGCTATCTCAAAGACATGA                                     507
   481 TGCAAAACTGCTATCTCAAAGACATGA                                     507
   161 -C--K--T--A--I--S--K--T--*-                                     168