Oryza longistaminata (O_longistaminata_v1.0)
Description

Josephin-like protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT2G29640) UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O82391]

Location
About this transcript

This transcript has 2 exons, is annotated with 6 domains and features and maps to 14 oligo probes.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeFlags
-KN538688.1_FGT040558185aa
 
Protein coding
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Codons
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Markup
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     1 ATGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCAGAAGCAGCAAGGTGTATCACGAGAGGCAACGG     60
     1 ATGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGCAGAAGCAGCAAGGTGTATCACGAGAGGCAACGG     60
     1 -M--G--G--G--G--G--G--G--S--R--S--S--K--V--Y--H--E--R--Q--R-     20

                                                                          
    61 CTGCAGTTCTGCCTCCTCCACGCCCTCAACAACCTTATGCAGGAAAAGGAATCTTTCACC    120
    61 CTGCAGTTCTGCCTCCTCCACGCCCTCAACAACCTTATGCAGGAAAAGGAATCTTTCACC    120
    21 -L--Q--F--C--L--L--H--A--L--N--N--L--M--Q--E--K--E--S--F--T-     40

                                                                          
   121 CGAGCTGAGTTGGATGGGATTGCTGGAAATCTCGTCCAGATTGATCCAAATAAGGAGCAC    180
   121 CGAGCTGAGTTGGATGGGATTGCTGGAAATCTCGTCCAGATTGATCCAAATAAGGAGCAC    180
    41 -R--A--E--L--D--G--I--A--G--N--L--V--Q--I--D--P--N--K--E--H-     60

                                                                          
   181 TGGACTCCTATGTCATTGATTTTTAAGCCCCACCACAACGTATTCACCGGGAACTATGAT    240
   181 TGGACTCCTATGTCATTGATTTTTAAGCCCCACCACAACGTATTCACCGGGAACTATGAT    240
    61 -W--T--P--M--S--L--I--F--K--P--H--H--N--V--F--T--G--N--Y--D-     80

                                                                          
   241 GTAAATGTACTCATCACAGCATTAGAAGCTAGAAAGAAGAAGGTAGTCTGGCATGATCAT    300
   241 GTAAATGTACTCATCACAGCATTAGAAGCTAGAAAGAAGAAGGTAGTCTGGCATGATCAT    300
    81 -V--N--V--L--I--T--A--L--E--A--R--K--K--K--V--V--W--H--D--H-    100

                                                                          
   301 CGGAAAGGGGCTTCTTCAATCGATATGGATGCAGATGCATTGTTTGGTCTGATGATCAAT    360
   301 CGGAAAGGGGCTTCTTCAATCGATATGGATGCAGATGCATTGTTTGGTCTGATGATCAAT    360
   101 -R--K--G--A--S--S--I--D--M--D--A--D--A--L--F--G--L--M--I--N-    120

                                                                          
   361 GTACCCGTCAGGAGGTTCAGAGGGCTTTGGACTGGCCGGCATTGGGTGGCAATCCGAAGC    420
   361 GTACCCGTCAGGAGGTTCAGAGGGCTTTGGACTGGCCGGCATTGGGTGGCAATCCGAAGC    420
   121 -V--P--V--R--R--F--R--G--L--W--T--G--R--H--W--V--A--I--R--S-    140

                                                                          
   421 ATTAATGGCACTTGGTTTAATTTGGATAGTGATTTTTCTGCACCCAAGGAGTTTCAGGAC    480
   421 ATTAATGGCACTTGGTTTAATTTGGATAGTGATTTTTCTGCACCCAAGGAGTTTCAGGAC    480
   141 -I--N--G--T--W--F--N--L--D--S--D--F--S--A--P--K--E--F--Q--D-    160

                                                                          
   481 AAAGAAAAACTTATTGCATTTCTAGACAGCATTCTCAGTCAAGGTGGAGAAGTCATGATA    540
   481 AAAGAAAAACTTATTGCATTTCTAGACAGCATTCTCAGTCAAGGTGGAGAAGTCATGATA    540
   161 -K--E--K--L--I--A--F--L--D--S--I--L--S--Q--G--G--E--V--M--I-    180

                                                                          
   541 GTGCTGCAAGATGAATAA                                              558
   541 GTGCTGCAAGATGAATAA                                              558
   181 -V--L--Q--D--E--*-                                              185