Oryza longistaminata (O_longistaminata_v1.0)
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This transcript has 1 exon, is annotated with 6 domains and features and maps to 5 oligo probes.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeFlags
-AMDW01038887.1_FGT001777259aa
 
Protein coding
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Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Other
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     1 ATGAATGCTAGGCTGGATCAGTGGGATTCAGATGACCAGGAAGATGTGGAAGAGTCTGGT     60
     1 ATGAATGCTAGGCTGGATCAGTGGGATTCAGATGACCAGGAAGATGTGGAAGAGTCTGGT     60
     1 -M--N--A--R--L--D--Q--W--D--S--D--D--Q--E--D--V--E--E--S--G-     20

                                                                          
    61 TTTGATGAAACAATAAACACCATGACCCAGCACCAGCAGCAATCACATGATATTCAGCTA    120
    61 TTTGATGAAACAATAAACACCATGACCCAGCACCAGCAGCAATCACATGATATTCAGCTA    120
    21 -F--D--E--T--I--N--T--M--T--Q--H--Q--Q--Q--S--H--D--I--Q--L-     40

                                                                          
   121 AGTGGATTGAGTGAGGACGAATCTGAAGATGGTGTATGGAATTGGAGTGTGGCTGTACGT    180
   121 AGTGGATTGAGTGAGGACGAATCTGAAGATGGTGTATGGAATTGGAGTGTGGCTGTACGT    180
    41 -S--G--L--S--E--D--E--S--E--D--G--V--W--N--W--S--V--A--V--R-     60

                                                                          
   181 CAAAGAGCAAACGTGACAAACTTGCTAGACGACATGGAAGGGCCAGAAATGAGGACAACT    240
   181 CAAAGAGCAAACGTGACAAACTTGCTAGACGACATGGAAGGGCCAGAAATGAGGACAACT    240
    61 -Q--R--A--N--V--T--N--L--L--D--D--M--E--G--P--E--M--R--T--T-     80

                                                                          
   241 TTTGTCGGGAATCCAGATGATTATGTTGATGCAAGGCAGTTCGAGATGCTCCTTGAGCAA    300
   241 TTTGTCGGGAATCCAGATGATTATGTTGATGCAAGGCAGTTCGAGATGCTCCTTGAGCAA    300
    81 -F--V--G--N--P--D--D--Y--V--D--A--R--Q--F--E--M--L--L--E--Q-    100

                                                                          
   301 TTTGCTGAGGACAACAGTTCCAGAAAAGGAGCTCCACCAGCTGCTACATCCTTTATTGAA    360
   301 TTTGCTGAGGACAACAGTTCCAGAAAAGGAGCTCCACCAGCTGCTACATCCTTTATTGAA    360
   101 -F--A--E--D--N--S--S--R--K--G--A--P--P--A--A--T--S--F--I--E-    120

                                                                          
   361 AATCTCCCCTCTGTGATTATCTCCGCAAGTCATCAGATAAATGATGATGTGATCTGTCCG    420
   361 AATCTCCCCTCTGTGATTATCTCCGCAAGTCATCAGATAAATGATGATGTGATCTGTCCG    420
   121 -N--L--P--S--V--I--I--S--A--S--H--Q--I--N--D--D--V--I--C--P-    140

                                                                          
   421 GTCTGCAAAGATCCAATTCCTACCAGAGCTAGAGCAAAACAGCTACCATGCATGCATCTT    480
   421 GTCTGCAAAGATCCAATTCCTACCAGAGCTAGAGCAAAACAGCTACCATGCATGCATCTT    480
   141 -V--C--K--D--P--I--P--T--R--A--R--A--K--Q--L--P--C--M--H--L-    160

                                                                          
   481 TATCATTCATCGTGCATCTTGCCATGGCTTAGTTCTAGAAATACATGTCCTGTCTGCCGA    540
   481 TATCATTCATCGTGCATCTTGCCATGGCTTAGTTCTAGAAATACATGTCCTGTCTGCCGA    540
   161 -Y--H--S--S--C--I--L--P--W--L--S--S--R--N--T--C--P--V--C--R-    180

                                                                          
   541 TATGAGCTTCCTACAGATGATGCAGAGTATGAAAGGTCCAAGCAAGCCACAACCAATGTA    600
   541 TATGAGCTTCCTACAGATGATGCAGAGTATGAAAGGTCCAAGCAAGCCACAACCAATGTA    600
   181 -Y--E--L--P--T--D--D--A--E--Y--E--R--S--K--Q--A--T--T--N--V-    200

                                                                          
   601 AGAGACATTCAGGTTGTGGAAGAAATTTCTGATGAACAAGAGGTCCGGGTAACTCGTCAG    660
   601 AGAGACATTCAGGTTGTGGAAGAAATTTCTGATGAACAAGAGGTCCGGGTAACTCGTCAG    660
   201 -R--D--I--Q--V--V--E--E--I--S--D--E--Q--E--V--R--V--T--R--Q-    220

                                                                          
   661 ATGGCTGTTGATGCTATCGAAGAGACTAATACAAGTGAACACAATGTTCGTGTTGATGAG    720
   661 ATGGCTGTTGATGCTATCGAAGAGACTAATACAAGTGAACACAATGTTCGTGTTGATGAG    720
   221 -M--A--V--D--A--I--E--E--T--N--T--S--E--H--N--V--R--V--D--E-    240

                                                                          
   721 CAACCAAACAGTGCACGCAGGCGCAGTGGATGGCTTTTTATTGCTGCTGCTCCAGTC       777
   721 CAACCAAACAGTGCACGCAGGCGCAGTGGATGGCTTTTTATTGCTGCTGCTCCAGTC       777
   241 -Q--P--N--S--A--R--R--R--S--G--W--L--F--I--A--A--A--P--V-       259