Transcript: BGIOSGA036928-TA
.
Show/hide columns (1 hidden)
- BGIOSGA036928-TA 1011 336aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
B8BLU4 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG GCG CCG CTC TCG TGG CGC CAC CAC ACG CTG TTG CAG GCG CTG CTC TCC CGC GGG CCC 60
1 ATGGCGCCGCTCTCGTGGCGCCACCACACGCTGTTGCAGGCGCTGCTCTCCCGCGGGCCC 60
1 -M--A--P--L--S--W--R--H--H--T--L--L--Q--A--L--L--S--R--G--P- 20
61 CTC TCG GAG CGC GAC TTC CAC GCC CTC TTC TCC GCC ATC TCC GGC GGC AAG AAC CCC G CC 120
61 CTCTCGGAGCGCGACTTCCACGCCCTCTTCTCCGCCATCTCCGGCGGCAAGAACCCCGCC 120
21 -L--S--E--R--D--F--H--A--L--F--S--A--I--S--G--G--K--N--P--A- 40
121 ACT CAT CGG CAT CTG TTC AAT GAT ACA CTC CTC AAG ATC AAC AAG GAG CTC GCA TAC TTG 180
121 ACTCATCGGCATCTGTTCAATGATACACTCCTCAAGATCAACAAGGAGCTCGCATACTTG 180
41 -T--H--R--H--L--F--N--D--T--L--L--K--I--N--K--E--L--A--Y--L- 60
181 CAG TTT GAG TTA AGA GCA GGC ATA AAC CAG TAT GAT GGT ACT GTG TAT TAT GGA GTG GTC 240
181 CAGTTTGAGTTAAGAGCAGGCATAAACCAGTATGATGGTACTGTGTATTATGGAGTGGTC 240
61 -Q--F--E--L--R--A--G--I--N--Q--Y--D--G--T--V--Y--Y--G--V--V- 80
241 AAT AAC ATT GCT GAT GAA GAG TCA AAG CTT GGA TCA AAG TTT TCT GTG CCA CAG ATT GCA 300
241 AATAACATTGCTGATGAAGAGTCAAAGCTTGGATCAAAGTTTTCTGTGCCACAGATTGCA 300
81 -N--N--I--A--D--E--E--S--K--L--G--S--K--F--S--V--P--Q--I--A- 100
301 TTC TAC AAG GGA TTG T TG GAA GCA ATA GTT CAT GAA GCT GGA AAT GAT GGG AGC ATA ACA 360
301 TTCTACAAGGGATTGTTGGAAGCAATAGTTCATGAAGCTGGAAATGATGGGAGCATAACA 360
101 -F--Y--K--G--L--L--E--A--I--V--H--E--A--G--N--D--G--S--I--T- 120
361 AAT ATC GAT GCT CTT AAC ACA CGG ATT GAG AAC CAG G TT GTA ATT GCA GAC GCT TCA CAG 420
361 AATATCGATGCTCTTAACACACGGATTGAGAACCAGGTTGTAATTGCAGACGCTTCACAG 420
121 -N--I--D--A--L--N--T--R--I--E--N--Q--V--V--I--A--D--A--S--Q- 140
421 GGC AGT CAA TCC CGT CTG CCT ACT TCC ATT ACC AAC TTC TCA TTG TCC CAA AAG GAG AAA 480
421 GGCAGTCAATCCCGTCTGCCTACTTCCATTACCAACTTCTCATTGTCCCAAAAGGAGAAA 480
141 -G--S--Q--S--R--L--P--T--S--I--T--N--F--S--L--S--Q--K--E--K- 160
481 ACT CTT AAT GAA CTC ATA CAG GAT CGT TGG CTG TCA TAC ACT CCC ACA GGA AAG ATT GGT 540
481 ACTCTTAATGAACTCATACAGGATCGTTGGCTGTCATACACTCCCACAGGAAAGATTGGT 540
161 -T--L--N--E--L--I--Q--D--R--W--L--S--Y--T--P--T--G--K--I--G- 180
541 CTT GGC ATA CGA TCA TTT CTT GAT CTC CGA AGT TGG TTA CGT AGT AAT GAT ATC CCA TCA 600
541 CTTGGCATACGATCATTTCTTGATCTCCGAAGTTGGTTACGTAGTAATGATATCCCATCA 600
181 -L--G--I--R--S--F--L--D--L--R--S--W--L--R--S--N--D--I--P--S- 200
601 TGT GAG GTC TGC AAT GAA GCT TGC ATA AAG G CA TCA TCT TGT CCT AAT GAG GGA TGC AAT 660
601 TGTGAGGTCTGCAATGAAGCTTGCATAAAGGCATCATCTTGTCCTAATGAGGGATGCAAT 660
201 -C--E--V--C--N--E--A--C--I--K--A--S--S--C--P--N--E--G--C--N- 220
661 GTA AGG ATT CAC GTG TAC TGT TTG AAG AAG AAA TTT TCT CAG AGA AAG G CC TCG AGA GCT 720
661 GTAAGGATTCACGTGTACTGTTTGAAGAAGAAATTTTCTCAGAGAAAGGCCTCGAGAGCT 720
221 -V--R--I--H--V--Y--C--L--K--K--K--F--S--Q--R--K--A--S--R--A- 240
721 TGT GGT TGT GGT ACT GAA TGG CCT CGG TTG GAG GGT GAA GAT GAC GGT GCT GAG GAT GTT 780
721 TGTGGTTGTGGTACTGAATGGCCTCGGTTGGAGGGTGAAGATGACGGTGCTGAGGATGTT 780
241 -C--G--C--G--T--E--W--P--R--L--E--G--E--D--D--G--A--E--D--V- 260
781 AAC GAA CCT GAG GAA GAT CAG GTC CCA TCA GCC AAC CAG CAT TCG AGG ACT AGA CGC AGA 840
781 AACGAACCTGAGGAAGATCAGGTCCCATCAGCCAACCAGCATTCGAGGACTAGACGCAGA 840
261 -N--E--P--E--E--D--Q--V--P--S--A--N--Q--H--S--R--T--R--R--R- 280
841 GGA GTC AAA TCT GAA CTG GTG GAA GAA AAT GAA AGA GCA GGC CCA TCA GCG AGG ATG ACA 900
841 GGAGTCAAATCTGAACTGGTGGAAGAAAATGAAAGAGCAGGCCCATCAGCGAGGATGACA 900
281 -G--V--K--S--E--L--V--E--E--N--E--R--A--G--P--S--A--R--M--T- 300
901 AGG AGG AGT TTG AGA AGC TCT AAA GCG GAA GCA GTT GAG GCT GCT CAA GAG GTG CCA TCT 960
901 AGGAGGAGTTTGAGAAGCTCTAAAGCGGAAGCAGTTGAGGCTGCTCAAGAGGTGCCATCT 960
301 -R--R--S--L--R--S--S--K--A--E--A--V--E--A--A--Q--E--V--P--S- 320
961 GCA GCA GGA CCT TCG CAG TCA ACC AGG GCA TCT AAG AGA AGA AAG AAC TAA 1011
961 GCAGCAGGACCTTCGCAGTCAACCAGGGCATCTAAGAGAAGAAAGAACTAA 1011
321 -A--A--G--P--S--Q--S--T--R--A--S--K--R--R--K--N--*- 336
.
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use