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Oryza sativa Indica Group (ASM465v1)
Location
About this transcript

This transcript has 1 exon, is annotated with 18 domains and features, is associated with 4 variant alleles and maps to 52 oligo probes.

Gene
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  • Name
  • Transcript ID
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  • Biotype
  • UniProt
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-BGIOSGA032975-TA1113370aa
 
Protein coding
A2Z7J8 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGTCTTTCGCCGGCGTGTCTCTCGTCCGCGACGGGAGGCTGCAGTCGCCTTCGTCGTCA     60
     1 ATGTCTTTCGCCGGCGTGTCTCTCGTCCGCGACGGGAGGCTGCAGTCGCCTTCGTCGTCA     60
     1 -M--S--F--A--G--V--S--L--V--R--D--G--R--L--Q--S--P--S--S--S-     20

                                                                          
    61 GCCATCACCTCCGGCGCCACCAGCGGGTACTACCTCCTCGTGGTCGAAGGCTACTCGCGA    120
    61 GCCATCACCTCCGGCGCCACCAGCGGGTACTACCTCCTCGTGGTCGAAGGCTACTCGCGA    120
    21 -A--I--T--S--G--A--T--S--G--Y--Y--L--L--V--V--E--G--Y--S--R-     40

                                                                          
   121 ACCAAGGACACCGTCCCCAATGGCGACTTCATCAGGTCTCGTCCTTTCAGGGTTGGAGGC    180
   121 ACCAAGGACACCGTCCCCAATGGCGACTTCATCAGGTCTCGTCCTTTCAGGGTTGGAGGC    180
    41 -T--K--D--T--V--P--N--G--D--F--I--R--S--R--P--F--R--V--G--G-     60

                                                                          
   181 TATCGCTGGGTTATCGACTACTACCCCAATGGCGAAAGTTCGGATGATGCCGATTCCATC    240
   181 TATCGCTGGGTTATCGACTACTACCCCAATGGCGAAAGTTCGGATGATGCCGATTCCATC    240
    61 -Y--R--W--V--I--D--Y--Y--P--N--G--E--S--S--D--D--A--D--S--I-     80

                                                                          
   241 TCAGTTTCTCTTCAGCTTGATCAGGATAGTGAACGGCCTTTCATGGCGCATTACGAGTTT    300
   241 TCAGTTTCTCTTCAGCTTGATCAGGATAGTGAACGGCCTTTCATGGCGCATTACGAGTTT    300
    81 -S--V--S--L--Q--L--D--Q--D--S--E--R--P--F--M--A--H--Y--E--F-    100

                                                                          
   301 AGTTTCATCGACGAAACTGAGAGACAAAAGTCGACACATATTTGTTCGGAAGCATTATTC    360
   301 AGTTTCATCGACGAAACTGAGAGACAAAAGTCGACACATATTTGTTCGGAAGCATTATTC    360
   101 -S--F--I--D--E--T--E--R--Q--K--S--T--H--I--C--S--E--A--L--F-    120

                                                                          
   361 GACTTCTCTGATGACAATCGTTGGGGCTACACCAATTTCATTAGAAGGGAGGAGCTAGAA    420
   361 GACTTCTCTGATGACAATCGTTGGGGCTACACCAATTTCATTAGAAGGGAGGAGCTAGAA    420
   121 -D--F--S--D--D--N--R--W--G--Y--T--N--F--I--R--R--E--E--L--E-    140

                                                                          
   421 AAATCCAAGCATCTCAAGGATGATTGTTTCACCATCAGGTGTGACATCATCCTGAAGAAG    480
   421 AAATCCAAGCATCTCAAGGATGATTGTTTCACCATCAGGTGTGACATCATCCTGAAGAAG    480
   141 -K--S--K--H--L--K--D--D--C--F--T--I--R--C--D--I--I--L--K--K-    160

                                                                          
   481 GACGGCAGCAACACCACCGGCGACGACGTGGCGGCGCCGCTCGTCGCGGTGCCACCGTCC    540
   481 GACGGCAGCAACACCACCGGCGACGACGTGGCGGCGCCGCTCGTCGCGGTGCCACCGTCC    540
   161 -D--G--S--N--T--T--G--D--D--V--A--A--P--L--V--A--V--P--P--S-    180

                                                                          
   541 GACATGCACCGGCAGTTCACCGATCTGCTCCTGACCAAGGTCGGCGCCGATGTGACGTTC    600
   541 GACATGCACCGGCAGTTCACCGATCTGCTCCTGACCAAGGTCGGCGCCGATGTGACGTTC    600
   181 -D--M--H--R--Q--F--T--D--L--L--L--T--K--V--G--A--D--V--T--F-    200

                                                                          
   601 CAGGTCGGCGGCGAGACGTTCGCCGCGCACCGGTGCGTGCTCGCGGCGCGGTCCACCGTC    660
   601 CAGGTCGGCGGCGAGACGTTCGCCGCGCACCGGTGCGTGCTCGCGGCGCGGTCCACCGTC    660
   201 -Q--V--G--G--E--T--F--A--A--H--R--C--V--L--A--A--R--S--T--V-    220

                                                                          
   661 TTCATGGTGGAGCTCTTTGGCCCCATGAAGGAGGGCGCAACGACAGCAAGCGTACATATC    720
   661 TTCATGGTGGAGCTCTTTGGCCCCATGAAGGAGGGCGCAACGACAGCAAGCGTACATATC    720
   221 -F--M--V--E--L--F--G--P--M--K--E--G--A--T--T--A--S--V--H--I-    240

                                                                          
   721 AGCGAAATGGTGCCCGAAGCATTCAAGGCCATGCTTGCATTCATCTACAACGACACCCCG    780
   721 AGCGAAATGGTGCCCGAAGCATTCAAGGCCATGCTTGCATTCATCTACAACGACACCCCG    780
   241 -S--E--M--V--P--E--A--F--K--A--M--L--A--F--I--Y--N--D--T--P-    260

                                                                          
   781 CCGCCGGAGACGGAGGAAGACGAAGACGGCAAGGTCGCCATGTGGCAGCACCTGCTCGTC    840
   781 CCGCCGGAGACGGAGGAAGACGAAGACGGCAAGGTCGCCATGTGGCAGCACCTGCTCGTC    840
   261 -P--P--E--T--E--E--D--E--D--G--K--V--A--M--W--Q--H--L--L--V-    280

                                                                          
   841 GCGGCGGACAGGTACGATCTCCCGAGGCTGAAGCTGATATGCGAGGAGAAGCTGTGCGGC    900
   841 GCGGCGGACAGGTACGATCTCCCGAGGCTGAAGCTGATATGCGAGGAGAAGCTGTGCGGC    900
   281 -A--A--D--R--Y--D--L--P--R--L--K--L--I--C--E--E--K--L--C--G-    300

                                                                          
   901 CACATCGGCGTCGGCACGGCGACCACCATCCTCTTGCTGGCCGACAAGCACCATTGCCGC    960
   901 CACATCGGCGTCGGCACGGCGACCACCATCCTCTTGCTGGCCGACAAGCACCATTGCCGC    960
   301 -H--I--G--V--G--T--A--T--T--I--L--L--L--A--D--K--H--H--C--R-    320

                                                                          
   961 GGGCTGAAGGAGGCGTGCCTGGAGTTCCTCAGCTCTCCTGCGAACCTGGAAGAAGTAATG   1020
   961 GGGCTGAAGGAGGCGTGCCTGGAGTTCCTCAGCTCTCCTGCGAACCTGGAAGAAGTAATG   1020
   321 -G--L--K--E--A--C--L--E--F--L--S--S--P--A--N--L--E--E--V--M-    340

                                                                          
  1021 GAGCATGGCGGATTGGAGGACGTCGTGGGAACATGCCCGTCAGTTCTCGTGGAGCTCATT   1080
  1021 GAGCATGGCGGATTGGAGGACGTCGTGGGAACATGCCCGTCAGTTCTCGTGGAGCTCATT   1080
   341 -E--H--G--G--L--E--D--V--V--G--T--C--P--S--V--L--V--E--L--I-    360

                                                                          
  1081 GCGAAGCTTGCTCTGCTCAGGACTCAGGTTTGA                              1113
  1081 GCGAAGCTTGCTCTGCTCAGGACTCAGGTTTGA                              1113
   361 -A--K--L--A--L--L--R--T--Q--V--*-                               370