Transcript: BGIOSGA029901-TA
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Description
THO complex subunit 6 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT2G19430) UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8L4M1]
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- BGIOSGA029901-TA 921 306aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
B8BEZ4 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG TGC CGC GTC CTC A CC CAC CCG GAT GCC GCG GTC TCT CTG GTT GAT CCC GTC TGC ATC 60
1 ATGTGCCGCGTCCTCACCCACCCGGATGCCGCGGTCTCTCTGGTTGATCCCGTCTGCATC 60
1 -M--C--R--V--L--T--H--P--D--A--A--V--S--L--V--D--P--V--C--I- 20
61 GTC CAA GCG CAC AGT GGC CCG GCC TAC GAC GTC AGG TTC TAC CCG GAT TCG CAG CAG CCG 120
61 GTCCAAGCGCACAGTGGCCCGGCCTACGACGTCAGGTTCTACCCGGATTCGCAGCAGCCG 120
21 -V--Q--A--H--S--G--P--A--Y--D--V--R--F--Y--P--D--S--Q--Q--P- 40
121 CTG CTC TTC AG C GGC GGG GAT GAC GGG CGC CTT CGG GGA TGG AGA TGG CAC GAG ATG CAG 180
121 CTGCTCTTCAGCGGCGGGGATGACGGGCGCCTTCGGGGATGGAGATGGCACGAGATGCAG 180
41 -L--L--F--S--G--G--D--D--G--R--L--R--G--W--R--W--H--E--M--Q- 60
181 AGC TGC CTT GTG CCG CTA TCT CTG CAA G G G GAT CAT TTG GAG CCA GTA CTT GAT TTG GTG 240
181 AGCTGCCTTGTGCCGCTATCTCTGCAAGGGGATCATTTGGAGCCAGTACTTGATTTGGTG 240
61 -S--C--L--V--P--L--S--L--Q--G--D--H--L--E--P--V--L--D--L--V- 80
241 AAC CCT CAG CAT GA G GGT CCT TGG GGT GCT CGC TCT CCA ATA CCT GAA AAC AAC GCC ATT 300
241 AACCCTCAGCATGAGGGTCCTTGGGGTGCTCGCTCTCCAATACCTGAAAACAACGCCATT 300
81 -N--P--Q--H--E--G--P--W--G--A--R--S--P--I--P--E--N--N--A--I- 100
301 GCG ATT AAC AAA CAG G AA GGA TCT GTT TAT GCA GCG GCC GGG GAT GCA TGT GCT TAT TGC 360
301 GCGATTAACAAACAGGAAGGATCTGTTTATGCAGCGGCCGGGGATGCATGTGCTTATTGC 360
101 -A--I--N--K--Q--E--G--S--V--Y--A--A--A--G--D--A--C--A--Y--C- 120
361 TGG GAT GTG GAG AGT GGT AAA TGT AAA ATG ACC TTC AAG GGA CAT ACT GAC TAT TTG CAC 420
361 TGGGATGTGGAGAGTGGTAAATGTAAAATGACCTTCAAGGGACATACTGACTATTTGCAC 420
121 -W--D--V--E--S--G--K--C--K--M--T--F--K--G--H--T--D--Y--L--H- 140
421 AGC ATT GCA GTC CGC GAA GCG AAC CGC CAG GTA GTT ACA GGA TCA GAG GAT GGC ACA GCC 480
421 AGCATTGCAGTCCGCGAAGCGAACCGCCAGGTAGTTACAGGATCAGAGGATGGCACAGCC 480
141 -S--I--A--V--R--E--A--N--R--Q--V--V--T--G--S--E--D--G--T--A- 160
481 CGT ATC TGG G AT TGC AGA AGT GGA AAG TGC ACT CAG GTT ATA CGT CCG GTG AAA AAC AAG 540
481 CGTATCTGGGATTGCAGAAGTGGAAAGTGCACTCAGGTTATACGTCCGGTGAAAAACAAG 540
161 -R--I--W--D--C--R--S--G--K--C--T--Q--V--I--R--P--V--K--N--K- 180
541 ACT TTT GAG GGG TCA TGG GTC AGT TGT GTT GCC ATT GAT GCA AGT GAA AGC TGG CTG GCT 600
541 ACTTTTGAGGGGTCATGGGTCAGTTGTGTTGCCATTGATGCAAGTGAAAGCTGGCTGGCT 600
181 -T--F--E--G--S--W--V--S--C--V--A--I--D--A--S--E--S--W--L--A- 200
601 TGT GGT ACT TCT AGT GGT ATA TCA GTT TGG AGC CTT CTT TCA AAT GAG TGC ATC TTT AAT 660
601 TGTGGTACTTCTAGTGGTATATCAGTTTGGAGCCTTCTTTCAAATGAGTGCATCTTTAAT 660
201 -C--G--T--S--S--G--I--S--V--W--S--L--L--S--N--E--C--I--F--N- 220
661 GTG GAT TGC CAT GCT CCT GTT CAA GAT TTG CTG TTT GAC AGA AAC CAA ATC TTA GCA GTC 720
661 GTGGATTGCCATGCTCCTGTTCAAGATTTGCTGTTTGACAGAAACCAAATCTTAGCAGTC 720
221 -V--D--C--H--A--P--V--Q--D--L--L--F--D--R--N--Q--I--L--A--V- 240
721 GGT GCT GAA CCT CTG CTC TCT CGT TTC TCT ATC AAT GGG ACT CTT CTT TCA CAA ATT AAG 780
721 GGTGCTGAACCTCTGCTCTCTCGTTTCTCTATCAATGGGACTCTTCTTTCACAAATTAAG 780
241 -G--A--E--P--L--L--S--R--F--S--I--N--G--T--L--L--S--Q--I--K- 260
781 TGT GCT CCT CAC TCA GCA TTT TCT GTC TCC ATA CAT TCT TCA GGG ATG GCA GCT GTT GCT 840
781 TGTGCTCCTCACTCAGCATTTTCTGTCTCCATACATTCTTCAGGGATGGCAGCTGTTGCT 840
261 -C--A--P--H--S--A--F--S--V--S--I--H--S--S--G--M--A--A--V--A- 280
841 GGA TAT GGA GGC CTT GTG GAT GTA ATA TCA CAA TTT GGG AGT CAT TTG TGC ACT TTT GGC 900
841 GGATATGGAGGCCTTGTGGATGTAATATCACAATTTGGGAGTCATTTGTGCACTTTTGGC 900
281 -G--Y--G--G--L--V--D--V--I--S--Q--F--G--S--H--L--C--T--F--G- 300
901 TGC CGG AGC CTG GAT AAG TAA 921
901 TGCCGGAGCCTGGATAAGTAA 921
301 -C--R--S--L--D--K--*- 306
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