Oryza sativa Indica Group (ASM465v1)
Description

THO complex subunit 6 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT2G19430) UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8L4M1]

Location
About this transcript

This transcript has 12 exons, is annotated with 17 domains and features, is associated with 10 variant alleles and maps to 49 oligo probes.

Gene
Show/hide columns (1 hidden)
  • Name
  • Transcript ID
  • bp
  • Protein
  • Translation ID
  • Biotype
  • UniProt
  • Flags
NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-BGIOSGA029901-TA921306aa
 
Protein coding
B8BEZ4 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGTGCCGCGTCCTCACCCACCCGGATGCCGCGGTCTCTCTGGTTGATCCCGTCTGCATC     60
     1 ATGTGCCGCGTCCTCACCCACCCGGATGCCGCGGTCTCTCTGGTTGATCCCGTCTGCATC     60
     1 -M--C--R--V--L--T--H--P--D--A--A--V--S--L--V--D--P--V--C--I-     20

                                                                          
    61 GTCCAAGCGCACAGTGGCCCGGCCTACGACGTCAGGTTCTACCCGGATTCGCAGCAGCCG    120
    61 GTCCAAGCGCACAGTGGCCCGGCCTACGACGTCAGGTTCTACCCGGATTCGCAGCAGCCG    120
    21 -V--Q--A--H--S--G--P--A--Y--D--V--R--F--Y--P--D--S--Q--Q--P-     40

                                                                          
   121 CTGCTCTTCAGCGGCGGGGATGACGGGCGCCTTCGGGGATGGAGATGGCACGAGATGCAG    180
   121 CTGCTCTTCAGCGGCGGGGATGACGGGCGCCTTCGGGGATGGAGATGGCACGAGATGCAG    180
    41 -L--L--F--S--G--G--D--D--G--R--L--R--G--W--R--W--H--E--M--Q-     60

                                                                          
   181 AGCTGCCTTGTGCCGCTATCTCTGCAAGGGGATCATTTGGAGCCAGTACTTGATTTGGTG    240
   181 AGCTGCCTTGTGCCGCTATCTCTGCAAGGGGATCATTTGGAGCCAGTACTTGATTTGGTG    240
    61 -S--C--L--V--P--L--S--L--Q--G--D--H--L--E--P--V--L--D--L--V-     80

                                                                          
   241 AACCCTCAGCATGAGGGTCCTTGGGGTGCTCGCTCTCCAATACCTGAAAACAACGCCATT    300
   241 AACCCTCAGCATGAGGGTCCTTGGGGTGCTCGCTCTCCAATACCTGAAAACAACGCCATT    300
    81 -N--P--Q--H--E--G--P--W--G--A--R--S--P--I--P--E--N--N--A--I-    100

                                                                          
   301 GCGATTAACAAACAGGAAGGATCTGTTTATGCAGCGGCCGGGGATGCATGTGCTTATTGC    360
   301 GCGATTAACAAACAGGAAGGATCTGTTTATGCAGCGGCCGGGGATGCATGTGCTTATTGC    360
   101 -A--I--N--K--Q--E--G--S--V--Y--A--A--A--G--D--A--C--A--Y--C-    120

                                                                          
   361 TGGGATGTGGAGAGTGGTAAATGTAAAATGACCTTCAAGGGACATACTGACTATTTGCAC    420
   361 TGGGATGTGGAGAGTGGTAAATGTAAAATGACCTTCAAGGGACATACTGACTATTTGCAC    420
   121 -W--D--V--E--S--G--K--C--K--M--T--F--K--G--H--T--D--Y--L--H-    140

                                                                          
   421 AGCATTGCAGTCCGCGAAGCGAACCGCCAGGTAGTTACAGGATCAGAGGATGGCACAGCC    480
   421 AGCATTGCAGTCCGCGAAGCGAACCGCCAGGTAGTTACAGGATCAGAGGATGGCACAGCC    480
   141 -S--I--A--V--R--E--A--N--R--Q--V--V--T--G--S--E--D--G--T--A-    160

                                                                          
   481 CGTATCTGGGATTGCAGAAGTGGAAAGTGCACTCAGGTTATACGTCCGGTGAAAAACAAG    540
   481 CGTATCTGGGATTGCAGAAGTGGAAAGTGCACTCAGGTTATACGTCCGGTGAAAAACAAG    540
   161 -R--I--W--D--C--R--S--G--K--C--T--Q--V--I--R--P--V--K--N--K-    180

                                                                          
   541 ACTTTTGAGGGGTCATGGGTCAGTTGTGTTGCCATTGATGCAAGTGAAAGCTGGCTGGCT    600
   541 ACTTTTGAGGGGTCATGGGTCAGTTGTGTTGCCATTGATGCAAGTGAAAGCTGGCTGGCT    600
   181 -T--F--E--G--S--W--V--S--C--V--A--I--D--A--S--E--S--W--L--A-    200

                                                                          
   601 TGTGGTACTTCTAGTGGTATATCAGTTTGGAGCCTTCTTTCAAATGAGTGCATCTTTAAT    660
   601 TGTGGTACTTCTAGTGGTATATCAGTTTGGAGCCTTCTTTCAAATGAGTGCATCTTTAAT    660
   201 -C--G--T--S--S--G--I--S--V--W--S--L--L--S--N--E--C--I--F--N-    220

                                                                          
   661 GTGGATTGCCATGCTCCTGTTCAAGATTTGCTGTTTGACAGAAACCAAATCTTAGCAGTC    720
   661 GTGGATTGCCATGCTCCTGTTCAAGATTTGCTGTTTGACAGAAACCAAATCTTAGCAGTC    720
   221 -V--D--C--H--A--P--V--Q--D--L--L--F--D--R--N--Q--I--L--A--V-    240

                                                                          
   721 GGTGCTGAACCTCTGCTCTCTCGTTTCTCTATCAATGGGACTCTTCTTTCACAAATTAAG    780
   721 GGTGCTGAACCTCTGCTCTCTCGTTTCTCTATCAATGGGACTCTTCTTTCACAAATTAAG    780
   241 -G--A--E--P--L--L--S--R--F--S--I--N--G--T--L--L--S--Q--I--K-    260

                                                                          
   781 TGTGCTCCTCACTCAGCATTTTCTGTCTCCATACATTCTTCAGGGATGGCAGCTGTTGCT    840
   781 TGTGCTCCTCACTCAGCATTTTCTGTCTCCATACATTCTTCAGGGATGGCAGCTGTTGCT    840
   261 -C--A--P--H--S--A--F--S--V--S--I--H--S--S--G--M--A--A--V--A-    280

                                                                          
   841 GGATATGGAGGCCTTGTGGATGTAATATCACAATTTGGGAGTCATTTGTGCACTTTTGGC    900
   841 GGATATGGAGGCCTTGTGGATGTAATATCACAATTTGGGAGTCATTTGTGCACTTTTGGC    900
   281 -G--Y--G--G--L--V--D--V--I--S--Q--F--G--S--H--L--C--T--F--G-    300

                                                                          
   901 TGCCGGAGCCTGGATAAGTAA                                           921
   901 TGCCGGAGCCTGGATAAGTAA                                           921
   301 -C--R--S--L--D--K--*-                                           306