Oryza sativa Indica Group (ASM465v1)
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This transcript has 1 exon, is annotated with 33 domains and features, is associated with 5 variant alleles and maps to 20 oligo probes.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-BGIOSGA029609-TA1206401aa
 
Protein coding
A2Z274 Ensembl Canonical
Codons
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     1 ATGGCGCCAGCTCGAGTCCACAGCAATGGCCGCCTCCTCATGCTTCTCCTCCTGCTCGCC     60
     1 ATGGCGCCAGCTCGAGTCCACAGCAATGGCCGCCTCCTCATGCTTCTCCTCCTGCTCGCC     60
     1 -M--A--P--A--R--V--H--S--N--G--R--L--L--M--L--L--L--L--L--A-     20

                                                                          
    61 GTCGCCGGCTTTGCGGCGGCGCAGCCGAGCCAGGACAATCCTCCGGCGGGCTACTACGCG    120
    61 GTCGCCGGCTTTGCGGCGGCGCAGCCGAGCCAGGACAATCCTCCGGCGGGCTACTACGCG    120
    21 -V--A--G--F--A--A--A--Q--P--S--Q--D--N--P--P--A--G--Y--Y--A-     40

                                                                          
   121 ACCAACTTCAGCCCGTCCATGGCCATCGTCATCGTCGTCCTCATCGCCGCCTTCTTCTTC    180
   121 ACCAACTTCAGCCCGTCCATGGCCATCGTCATCGTCGTCCTCATCGCCGCCTTCTTCTTC    180
    41 -T--N--F--S--P--S--M--A--I--V--I--V--V--L--I--A--A--F--F--F-     60

                                                                          
   181 CTCGGCTTCTTCTCCATCTACGTCCGCCACTGCTACGGCGGCCGCGGCGACTACTCGACC    240
   181 CTCGGCTTCTTCTCCATCTACGTCCGCCACTGCTACGGCGGCCGCGGCGACTACTCGACC    240
    61 -L--G--F--F--S--I--Y--V--R--H--C--Y--G--G--R--G--D--Y--S--T-     80

                                                                          
   241 ACCCCGCTGCCCCGGTCCGGCGCCGCGCGGTCGCGGCGGCAGCGCGGGCTCGACCAGTCC    300
   241 ACCCCGCTGCCCCGGTCCGGCGCCGCGCGGTCGCGGCGGCAGCGCGGGCTCGACCAGTCC    300
    81 -T--P--L--P--R--S--G--A--A--R--S--R--R--Q--R--G--L--D--Q--S-    100

                                                                          
   301 GTGCTCGCGACGTTCCCGACCATGGCGTACGCCGACGTGAAGGCGCACAAGTCCGTCAAG    360
   301 GTGCTCGCGACGTTCCCGACCATGGCGTACGCCGACGTGAAGGCGCACAAGTCCGTCAAG    360
   101 -V--L--A--T--F--P--T--M--A--Y--A--D--V--K--A--H--K--S--V--K-    120

                                                                          
   361 GGCGCGCTCGAGTGCGCCGTCTGCATCAGCGAGTTCGACGACGACGAGACGCTGCGGCTG    420
   361 GGCGCGCTCGAGTGCGCCGTCTGCATCAGCGAGTTCGACGACGACGAGACGCTGCGGCTG    420
   121 -G--A--L--E--C--A--V--C--I--S--E--F--D--D--D--E--T--L--R--L-    140

                                                                          
   421 CTGCCCAAGTGCTCCCACGTCTTCCACCAGGACTGCATCGACACGTGGCTCGCGTCGCAC    480
   421 CTGCCCAAGTGCTCCCACGTCTTCCACCAGGACTGCATCGACACGTGGCTCGCGTCGCAC    480
   141 -L--P--K--C--S--H--V--F--H--Q--D--C--I--D--T--W--L--A--S--H-    160

                                                                          
   481 GCCACCTGCCCGGTCTGCCGCGCCAACCTCGTCGACGGCGCGTCCGAGCCGGCGAGCGAT    540
   481 GCCACCTGCCCGGTCTGCCGCGCCAACCTCGTCGACGGCGCGTCCGAGCCGGCGAGCGAT    540
   161 -A--T--C--P--V--C--R--A--N--L--V--D--G--A--S--E--P--A--S--D-    180

                                                                          
   541 GTCGCCGCCGAGCTACCGACGGCGCCCGCTCCGCGCCCGGAAGGCGCGACGCCGTCCGAG    600
   541 GTCGCCGCCGAGCTACCGACGGCGCCCGCTCCGCGCCCGGAAGGCGCGACGCCGTCCGAG    600
   181 -V--A--A--E--L--P--T--A--P--A--P--R--P--E--G--A--T--P--S--E-    200

                                                                          
   601 GCAGCAGCGCCAGGGGGGGAGGCGGCGGCGGCGGTGGTGATCGACGTGGAGGAGACCGAG    660
   601 GCAGCAGCGCCAGGGGGGGAGGCGGCGGCGGCGGTGGTGATCGACGTGGAGGAGACCGAG    660
   201 -A--A--A--P--G--G--E--A--A--A--A--V--V--I--D--V--E--E--T--E-    220

                                                                          
   661 GAAGAGAGGATCATAAGAGAGGAGGCGGCCGAGCTAACGCGCATCGGCAGCCTGAAGCGC    720
   661 GAAGAGAGGATCATAAGAGAGGAGGCGGCCGAGCTAACGCGCATCGGCAGCCTGAAGCGC    720
   221 -E--E--R--I--I--R--E--E--A--A--E--L--T--R--I--G--S--L--K--R-    240

                                                                          
   721 GCGCTGCGCTCGAAGTCCGGCCGCGCGCCCGCCGCGCGTTTCCCGCGCTCGCATTCGACG    780
   721 GCGCTGCGCTCGAAGTCCGGCCGCGCGCCCGCCGCGCGTTTCCCGCGCTCGCATTCGACG    780
   241 -A--L--R--S--K--S--G--R--A--P--A--A--R--F--P--R--S--H--S--T-    260

                                                                          
   781 GGGCACTCGCTCTCCTCCTCCGCCGCGGCGAGCGCCGGCGCCGAGAGGTTCACGCTGCGG    840
   781 GGGCACTCGCTCTCCTCCTCCGCCGCGGCGAGCGCCGGCGCCGAGAGGTTCACGCTGCGG    840
   261 -G--H--S--L--S--S--S--A--A--A--S--A--G--A--E--R--F--T--L--R-    280

                                                                          
   841 CTGCCCGAGCACGTGCTCCGGGAGGTCATCGCGGCGGGGCAGCTCCAGCGAACGACGAGC    900
   841 CTGCCCGAGCACGTGCTCCGGGAGGTCATCGCGGCGGGGCAGCTCCAGCGAACGACGAGC    900
   281 -L--P--E--H--V--L--R--E--V--I--A--A--G--Q--L--Q--R--T--T--S-    300

                                                                          
   901 CTCGTGGCGTTCCGCGCCGGCCGCCAGGGGAGCACGCGCCGTGGCCTCAGGTCGGGAGGC    960
   901 CTCGTGGCGTTCCGCGCCGGCCGCCAGGGGAGCACGCGCCGTGGCCTCAGGTCGGGAGGC    960
   301 -L--V--A--F--R--A--G--R--Q--G--S--T--R--R--G--L--R--S--G--G-    320

                                                                          
   961 GGCGGCGGCGGCGAAGGCAGCAGCCGCGCCGGGAAGAGCGTCCGGCTCGGCCAGTCTGGA   1020
   961 GGCGGCGGCGGCGAAGGCAGCAGCCGCGCCGGGAAGAGCGTCCGGCTCGGCCAGTCTGGA   1020
   321 -G--G--G--G--E--G--S--S--R--A--G--K--S--V--R--L--G--Q--S--G-    340

                                                                          
  1021 CGGTGGCCGTCGTTCCTGGCGCGGACGTTCTCGGCGAGGCTGCCGGCGTGGGGATCAAGG   1080
  1021 CGGTGGCCGTCGTTCCTGGCGCGGACGTTCTCGGCGAGGCTGCCGGCGTGGGGATCAAGG   1080
   341 -R--W--P--S--F--L--A--R--T--F--S--A--R--L--P--A--W--G--S--R-    360

                                                                          
  1081 TCGACGCGGAGGGGCGACGGCGACGGGTCCAGCAAGGGCGGCAGGACTGCCGGCTCCGGC   1140
  1081 TCGACGCGGAGGGGCGACGGCGACGGGTCCAGCAAGGGCGGCAGGACTGCCGGCTCCGGC   1140
   361 -S--T--R--R--G--D--G--D--G--S--S--K--G--G--R--T--A--G--S--G-    380

                                                                          
  1141 GCCGGCGCCGGCGGCAAGTCAGTGGTGTGCGACGACCAGGCGTGCGTGGTTGGGCAACGT   1200
  1141 GCCGGCGCCGGCGGCAAGTCAGTGGTGTGCGACGACCAGGCGTGCGTGGTTGGGCAACGT   1200
   381 -A--G--A--G--G--K--S--V--V--C--D--D--Q--A--C--V--V--G--Q--R-    400

                                                                          
  1201 GTTTGA                                                         1206
  1201 GTTTGA                                                         1206
   401 -V--*-                                                          401