Transcript: BGIOSGA029609-TA
.
Show/hide columns (1 hidden)
- BGIOSGA029609-TA 1206 401aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A2Z274 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG GCG CCA GCT CGA GTC CAC AGC AAT GGC CGC CTC CTC ATG CTT CTC CTC CTG CTC GCC 60
1 ATGGCGCCAGCTCGAGTCCACAGCAATGGCCGCCTCCTCATGCTTCTCCTCCTGCTCGCC 60
1 -M--A--P--A--R--V--H--S--N--G--R--L--L--M--L--L--L--L--L--A- 20
61 GTC GCC GGC TTT GCG GCG GCG CAG CCG AGC CAG GAC AAT CCT CCG GCG GGC TAC TAC GCG 120
61 GTCGCCGGCTTTGCGGCGGCGCAGCCGAGCCAGGACAATCCTCCGGCGGGCTACTACGCG 120
21 -V--A--G--F--A--A--A--Q--P--S--Q--D--N--P--P--A--G--Y--Y--A- 40
121 ACC AAC TTC AGC CCG TCC ATG GCC ATC GTC ATC GTC GTC CTC ATC GCC GCC TTC TTC TTC 180
121 ACCAACTTCAGCCCGTCCATGGCCATCGTCATCGTCGTCCTCATCGCCGCCTTCTTCTTC 180
41 -T--N--F--S--P--S--M--A--I--V--I--V--V--L--I--A--A--F--F--F- 60
181 CTC GGC TTC TTC TCC ATC TAC GTC CGC CAC TGC TAC GGC GGC CGC GGC GAC TAC TCG ACC 240
181 CTCGGCTTCTTCTCCATCTACGTCCGCCACTGCTACGGCGGCCGCGGCGACTACTCGACC 240
61 -L--G--F--F--S--I--Y--V--R--H--C--Y--G--G--R--G--D--Y--S--T- 80
241 ACC CCG CTG CCC CGG TCC GGC GCC GCG CGG TCG CGG CGG CAG CGC GGG CTC GAC CAG TCC 300
241 ACCCCGCTGCCCCGGTCCGGCGCCGCGCGGTCGCGGCGGCAGCGCGGGCTCGACCAGTCC 300
81 -T--P--L--P--R--S--G--A--A--R--S--R--R--Q--R--G--L--D--Q--S- 100
301 GTG CTC GCG ACG TTC CCG ACC ATG GCG TAC GCC GAC GTG AAG GCG CAC AAG TCC GTC AAG 360
301 GTGCTCGCGACGTTCCCGACCATGGCGTACGCCGACGTGAAGGCGCACAAGTCCGTCAAG 360
101 -V--L--A--T--F--P--T--M--A--Y--A--D--V--K--A--H--K--S--V--K- 120
361 GGC GCG CTC GAG TGC GCC GTC TGC ATC AGC GAG TTC GAC GAC GAC GAG ACG CTG CGG CTG 420
361 GGCGCGCTCGAGTGCGCCGTCTGCATCAGCGAGTTCGACGACGACGAGACGCTGCGGCTG 420
121 -G--A--L--E--C--A--V--C--I--S--E--F--D--D--D--E--T--L--R--L- 140
421 CTG CCC AAG TGC TCC CAC GTC TTC CAC CAG GAC TGC ATC GAC ACG TGG CTC GCG TCG CAC 480
421 CTGCCCAAGTGCTCCCACGTCTTCCACCAGGACTGCATCGACACGTGGCTCGCGTCGCAC 480
141 -L--P--K--C--S--H--V--F--H--Q--D--C--I--D--T--W--L--A--S--H- 160
481 GCC ACC TGC CCG GTC TGC CGC GCC AAC CTC GTC GAC GGC GCG TCC GAG CCG GCG AGC GAT 540
481 GCCACCTGCCCGGTCTGCCGCGCCAACCTCGTCGACGGCGCGTCCGAGCCGGCGAGCGAT 540
161 -A--T--C--P--V--C--R--A--N--L--V--D--G--A--S--E--P--A--S--D- 180
541 GTC GCC GCC GAG CTA CCG ACG GCG CCC GCT CCG CGC CCG GAA GGC GCG ACG CCG TCC GAG 600
541 GTCGCCGCCGAGCTACCGACGGCGCCCGCTCCGCGCCCGGAAGGCGCGACGCCGTCCGAG 600
181 -V--A--A--E--L--P--T--A--P--A--P--R--P--E--G--A--T--P--S--E- 200
601 GCA GCA GCG CCA GGG GGG GAG GCG GCG GCG GCG GTG GTG ATC GAC GTG GAG GAG ACC GAG 660
601 GCAGCAGCGCCAGGGGGGGAGGCGGCGGCGGCGGTGGTGATCGACGTGGAGGAGACCGAG 660
201 -A--A--A--P--G--G--E--A--A--A--A--V--V--I--D--V--E--E--T--E- 220
661 GAA GAG AGG ATC ATA AGA GAG GAG GCG GCC GAG CTA ACG CGC ATC GGC AGC CTG AAG CGC 720
661 GAAGAGAGGATCATAAGAGAGGAGGCGGCCGAGCTAACGCGCATCGGCAGCCTGAAGCGC 720
221 -E--E--R--I--I--R--E--E--A--A--E--L--T--R--I--G--S--L--K--R- 240
721 GCG CTG CGC TCG AAG TCC GGC CGC GCG CCC GCC GCG CGT TTC CCG CGC TCG CAT TCG ACG 780
721 GCGCTGCGCTCGAAGTCCGGCCGCGCGCCCGCCGCGCGTTTCCCGCGCTCGCATTCGACG 780
241 -A--L--R--S--K--S--G--R--A--P--A--A--R--F--P--R--S--H--S--T- 260
781 GGG CAC TCG CTC TCC TCC TCC GCC GCG GCG AGC GCC GGC GCC GAG AGG TTC ACG CTG CGG 840
781 GGGCACTCGCTCTCCTCCTCCGCCGCGGCGAGCGCCGGCGCCGAGAGGTTCACGCTGCGG 840
261 -G--H--S--L--S--S--S--A--A--A--S--A--G--A--E--R--F--T--L--R- 280
841 CTG CCC GAG CAC GTG CTC CGG GAG GTC ATC GCG GCG GGG CAG CTC CAG CGA ACG ACG AGC 900
841 CTGCCCGAGCACGTGCTCCGGGAGGTCATCGCGGCGGGGCAGCTCCAGCGAACGACGAGC 900
281 -L--P--E--H--V--L--R--E--V--I--A--A--G--Q--L--Q--R--T--T--S- 300
901 CTC GTG GCG TTC CGC GCC GGC CGC CAG GGG AGC ACG CGC CGT GGC CTC AGG TCG GGA GGC 960
901 CTCGTGGCGTTCCGCGCCGGCCGCCAGGGGAGCACGCGCCGTGGCCTCAGGTCGGGAGGC 960
301 -L--V--A--F--R--A--G--R--Q--G--S--T--R--R--G--L--R--S--G--G- 320
961 GGC GGC GGC GGC GAA GGC AGC AGC CGC GCC GGG AAG AGC GTC CGG CTC GGC CAG TCT GGA 1020
961 GGCGGCGGCGGCGAAGGCAGCAGCCGCGCCGGGAAGAGCGTCCGGCTCGGCCAGTCTGGA 1020
321 -G--G--G--G--E--G--S--S--R--A--G--K--S--V--R--L--G--Q--S--G- 340
1021 CGG TGG CCG TCG TTC CTG GCG CGG ACG TTC TCG GCG AGG CTG CCG GCG TGG GGA TCA AGG 1080
1021 CGGTGGCCGTCGTTCCTGGCGCGGACGTTCTCGGCGAGGCTGCCGGCGTGGGGATCAAGG 1080
341 -R--W--P--S--F--L--A--R--T--F--S--A--R--L--P--A--W--G--S--R- 360
1081 TCG ACG CGG AGG GGC GAC GGC GAC GGG TCC AGC AAG GGC GGC AGG ACT GCC GGC TCC GGC 1140
1081 TCGACGCGGAGGGGCGACGGCGACGGGTCCAGCAAGGGCGGCAGGACTGCCGGCTCCGGC 1140
361 -S--T--R--R--G--D--G--D--G--S--S--K--G--G--R--T--A--G--S--G- 380
1141 GCC GGC GCC GGC GGC AAG TCA GTG GTG TGC GAC GAC CAG GCG TGC GTG GTT GGG CAA CGT 1200
1141 GCCGGCGCCGGCGGCAAGTCAGTGGTGTGCGACGACCAGGCGTGCGTGGTTGGGCAACGT 1200
381 -A--G--A--G--G--K--S--V--V--C--D--D--Q--A--C--V--V--G--Q--R- 400
1201 GTT TGA 1206
1201 GTTTGA 1206
401 -V--*- 401
.
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use