Transcript: BGIOSGA028758-TA
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- BGIOSGA028758-TA 1503 500aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A2YVP9 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG AGC CAC TAC ACA ATG CAT GCG CAC ATC AAC TAC ACC GCC CTG CCG CCG ACG TCG CCG 60
1 ATGAGCCACTACACAATGCATGCGCACATCAACTACACCGCCCTGCCGCCGACGTCGCCG 60
1 -M--S--H--Y--T--M--H--A--H--I--N--Y--T--A--L--P--P--T--S--P- 20
61 CTG CAG CTC CCG CTT CCG TAC CTC CCG CCG CCT CCT CCG CCG CCG CAG CCG CCA TTG CTG 120
61 CTGCAGCTCCCGCTTCCGTACCTCCCGCCGCCTCCTCCGCCGCCGCAGCCGCCATTGCTG 120
21 -L--Q--L--P--L--P--Y--L--P--P--P--P--P--P--P--Q--P--P--L--L- 40
121 CAG CTC CAG CCG CCG CCG CCG TCG TCG CCG GTG TCG TTT GAC ACG GCG TTC CAG AGC AGG 180
121 CAGCTCCAGCCGCCGCCGCCGTCGTCGCCGGTGTCGTTTGACACGGCGTTCCAGAGCAGG 180
41 -Q--L--Q--P--P--P--P--S--S--P--V--S--F--D--T--A--F--Q--S--R- 60
181 ATC AGC CCT AGC ATC CTG CTG ATA ATC TTG ATC TTG GCT GTT ATT TTC TTC GTC TCC GGG 240
181 ATCAGCCCTAGCATCCTGCTGATAATCTTGATCTTGGCTGTTATTTTCTTCGTCTCCGGG 240
61 -I--S--P--S--I--L--L--I--I--L--I--L--A--V--I--F--F--V--S--G- 80
241 CTC CTG CAT CTG CTC GTC CGG TTC ATC CTC CGC CCG GCG CCG CGT GAC GCC GGC GAC GCC 300
241 CTCCTGCATCTGCTCGTCCGGTTCATCCTCCGCCCGGCGCCGCGTGACGCCGGCGACGCC 300
81 -L--L--H--L--L--V--R--F--I--L--R--P--A--P--R--D--A--G--D--A- 100
301 GAC AGC GGC GAC GCG AAC GTG ACC GCC TTC CAG GGG CAG CTC CAG CAG CTG TTC CAC CTC 360
301 GACAGCGGCGACGCGAACGTGACCGCCTTCCAGGGGCAGCTCCAGCAGCTGTTCCACCTC 360
101 -D--S--G--D--A--N--V--T--A--F--Q--G--Q--L--Q--Q--L--F--H--L- 120
361 CAC GAC GCC GGC GTG GAC CAG TCC TTC ATC GAC ACG CTG CCG GTG TTC CTC TAC GGC GCC 420
361 CACGACGCCGGCGTGGACCAGTCCTTCATCGACACGCTGCCGGTGTTCCTCTACGGCGCC 420
121 -H--D--A--G--V--D--Q--S--F--I--D--T--L--P--V--F--L--Y--G--A- 140
421 GTC GTC GGC GCC GGC AGG AAG GAC CCG TTC GAC TGC GCG GTC TGC CTC TGC GAG TTC GCC 480
421 GTCGTCGGCGCCGGCAGGAAGGACCCGTTCGACTGCGCGGTCTGCCTCTGCGAGTTCGCC 480
141 -V--V--G--A--G--R--K--D--P--F--D--C--A--V--C--L--C--E--F--A- 160
481 GAC GAC GAC CGC CTC CGG CTC CTC CCC AAG TGC AGC CAC GCC TTC CAC GTC GAC TGC ATC 540
481 GACGACGACCGCCTCCGGCTCCTCCCCAAGTGCAGCCACGCCTTCCACGTCGACTGCATC 540
161 -D--D--D--R--L--R--L--L--P--K--C--S--H--A--F--H--V--D--C--I- 180
541 GAC ACG TGG CTG CTG TCG CAC TCC ACC TGC CCG CTC TGC CGC CGC AGC CTC CTC GCC GAC 600
541 GACACGTGGCTGCTGTCGCACTCCACCTGCCCGCTCTGCCGCCGCAGCCTCCTCGCCGAC 600
181 -D--T--W--L--L--S--H--S--T--C--P--L--C--R--R--S--L--L--A--D- 200
601 TTC TCC CCC TAC GGC GGT GGC TGC AGC CCG CTG CTG TTC GTG CTC GAG TCC GGC TCG GAG 660
601 TTCTCCCCCTACGGCGGTGGCTGCAGCCCGCTGCTGTTCGTGCTCGAGTCCGGCTCGGAG 660
201 -F--S--P--Y--G--G--G--C--S--P--L--L--F--V--L--E--S--G--S--E- 220
661 GGC TCC ATC TCC GAT CGC CTC GAC GCG GCG TCG TCG GCT CAT CTC AGC CTC GTC ATG GAG 720
661 GGCTCCATCTCCGATCGCCTCGACGCGGCGTCGTCGGCTCATCTCAGCCTCGTCATGGAG 720
221 -G--S--I--S--D--R--L--D--A--A--S--S--A--H--L--S--L--V--M--E- 240
721 CAG GAG GAA GAA GCA GAG CCG GAA CAG AAG CAT GCA GAG GCG GCG GAG AAG TCG GAC GAG 780
721 CAGGAGGAAGAAGCAGAGCCGGAACAGAAGCATGCAGAGGCGGCGGAGAAGTCGGACGAG 780
241 -Q--E--E--E--A--E--P--E--Q--K--H--A--E--A--A--E--K--S--D--E- 260
781 GTG GTC GTC TCC GTC AAG CTT GGC AAG TTT CGG AGT CAG GCC ACC GAA GTC GCC GCC GCC 840
781 GTGGTCGTCTCCGTCAAGCTTGGCAAGTTTCGGAGTCAGGCCACCGAAGTCGCCGCCGCC 840
261 -V--V--V--S--V--K--L--G--K--F--R--S--Q--A--T--E--V--A--A--A- 280
841 GGC GGC GGC GGC GGC AGC AGC AGC GCC AAC CCC GAG CAG GAC GTG CGG CGT TGC TAC TCC 900
841 GGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCAGCGCCAACCCCGAGCAGGACGTGCGGCGTTGCTACTCC 900
281 -G--G--G--G--G--S--S--S--A--N--P--E--Q--D--V--R--R--C--Y--S- 300
901 ATG GGG ACG TAC GAG TAC GTC ATG GAC GAG AGG TCT CTG CTC CGC GTC GCC GTG AAG CCG 960
901 ATGGGGACGTACGAGTACGTCATGGACGAGAGGTCTCTGCTCCGCGTCGCCGTGAAGCCG 960
301 -M--G--T--Y--E--Y--V--M--D--E--R--S--L--L--R--V--A--V--K--P- 320
961 CCG ACC AAG AAG CGC CCC ACG ACG CAG ATG CCG GGC CAC CGG GTC GCC ATG TCG GAG TGC 1020
961 CCGACCAAGAAGCGCCCCACGACGCAGATGCCGGGCCACCGGGTCGCCATGTCGGAGTGC 1020
321 -P--T--K--K--R--P--T--T--Q--M--P--G--H--R--V--A--M--S--E--C- 340
1021 GAC TGC CAC TCC AAG CGG GAG AGC TTC CGC GGC CTC GAC GCG CTG CCC GGC GGC AAG CTC 1080
1021 GACTGCCACTCCAAGCGGGAGAGCTTCCGCGGCCTCGACGCGCTGCCCGGCGGCAAGCTC 1080
341 -D--C--H--S--K--R--E--S--F--R--G--L--D--A--L--P--G--G--K--L- 360
1081 GCG CAG GCG CAG CCG CCG AAG CCG CCG GCC AAG GTG GGG AAG AAG GAG AGC TTC TCC TTC 1140
1081 GCGCAGGCGCAGCCGCCGAAGCCGCCGGCCAAGGTGGGGAAGAAGGAGAGCTTCTCCTTC 1140
361 -A--Q--A--Q--P--P--K--P--P--A--K--V--G--K--K--E--S--F--S--F- 380
1141 TCC AAG ATA TGG ATG CGC GGC GCG CCG CGG ATC AGG AAG GAC GGC GCG TCC TCC CGG CGC 1200
1141 TCCAAGATATGGATGCGCGGCGCGCCGCGGATCAGGAAGGACGGCGCGTCCTCCCGGCGC 1200
381 -S--K--I--W--M--R--G--A--P--R--I--R--K--D--G--A--S--S--R--R- 400
1201 GCG TCG TCG TTC CGG CTC TCC TCC GTG CTG CAG CGC GCG GCG AGC GAC GTC GGG GCA ACG 1260
1201 GCGTCGTCGTTCCGGCTCTCCTCCGTGCTGCAGCGCGCGGCGAGCGACGTCGGGGCAACG 1260
401 -A--S--S--F--R--L--S--S--V--L--Q--R--A--A--S--D--V--G--A--T- 420
1261 GCG GCG CCG AAG CCG CTG CGC CCG GAC GTC GTG AGC CCC GTC ACG GAG TCG GAG TAC AAC 1320
1261 GCGGCGCCGAAGCCGCTGCGCCCGGACGTCGTGAGCCCCGTCACGGAGTCGGAGTACAAC 1320
421 -A--A--P--K--P--L--R--P--D--V--V--S--P--V--T--E--S--E--Y--N- 440
1321 GTG TCG GCG TGG GAC AAG AGC GAG AAG AGC GCG AGC GGC AGC GTC GCG GAC TGG GAC CTC 1380
1321 GTGTCGGCGTGGGACAAGAGCGAGAAGAGCGCGAGCGGCAGCGTCGCGGACTGGGACCTC 1380
441 -V--S--A--W--D--K--S--E--K--S--A--S--G--S--V--A--D--W--D--L- 460
1381 GAG TCC GCC GCC GCC ACG GCG GCC GTC CCC GGC GCA GGC GCC GGC AAC GGG CTC AGC TCG 1440
1381 GAGTCCGCCGCCGCCACGGCGGCCGTCCCCGGCGCAGGCGCCGGCAACGGGCTCAGCTCG 1440
461 -E--S--A--A--A--T--A--A--V--P--G--A--G--A--G--N--G--L--S--S- 480
1441 AGG GCC GAC GAG GCG CCG TCG TTC GCG CGG CGG ACG CTG CTG TGG ATC CGA GGA CAC CTG 1500
1441 AGGGCCGACGAGGCGCCGTCGTTCGCGCGGCGGACGCTGCTGTGGATCCGAGGACACCTG 1500
481 -R--A--D--E--A--P--S--F--A--R--R--T--L--L--W--I--R--G--H--L- 500
1501 TGA 1503
1501 TGA 1503
-*- 500
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