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Oryza sativa Indica Group (ASM465v1)
Location
About this transcript

This transcript has 1 exon, is annotated with 23 domains and features, is associated with 6 variant alleles and maps to 20 oligo probes.

Gene
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  • Name
  • Transcript ID
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  • UniProt
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-BGIOSGA028758-TA1503500aa
 
Protein coding
A2YVP9 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
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Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGAGCCACTACACAATGCATGCGCACATCAACTACACCGCCCTGCCGCCGACGTCGCCG     60
     1 ATGAGCCACTACACAATGCATGCGCACATCAACTACACCGCCCTGCCGCCGACGTCGCCG     60
     1 -M--S--H--Y--T--M--H--A--H--I--N--Y--T--A--L--P--P--T--S--P-     20

                                                                          
    61 CTGCAGCTCCCGCTTCCGTACCTCCCGCCGCCTCCTCCGCCGCCGCAGCCGCCATTGCTG    120
    61 CTGCAGCTCCCGCTTCCGTACCTCCCGCCGCCTCCTCCGCCGCCGCAGCCGCCATTGCTG    120
    21 -L--Q--L--P--L--P--Y--L--P--P--P--P--P--P--P--Q--P--P--L--L-     40

                                                                          
   121 CAGCTCCAGCCGCCGCCGCCGTCGTCGCCGGTGTCGTTTGACACGGCGTTCCAGAGCAGG    180
   121 CAGCTCCAGCCGCCGCCGCCGTCGTCGCCGGTGTCGTTTGACACGGCGTTCCAGAGCAGG    180
    41 -Q--L--Q--P--P--P--P--S--S--P--V--S--F--D--T--A--F--Q--S--R-     60

                                                                          
   181 ATCAGCCCTAGCATCCTGCTGATAATCTTGATCTTGGCTGTTATTTTCTTCGTCTCCGGG    240
   181 ATCAGCCCTAGCATCCTGCTGATAATCTTGATCTTGGCTGTTATTTTCTTCGTCTCCGGG    240
    61 -I--S--P--S--I--L--L--I--I--L--I--L--A--V--I--F--F--V--S--G-     80

                                                                          
   241 CTCCTGCATCTGCTCGTCCGGTTCATCCTCCGCCCGGCGCCGCGTGACGCCGGCGACGCC    300
   241 CTCCTGCATCTGCTCGTCCGGTTCATCCTCCGCCCGGCGCCGCGTGACGCCGGCGACGCC    300
    81 -L--L--H--L--L--V--R--F--I--L--R--P--A--P--R--D--A--G--D--A-    100

                                                                          
   301 GACAGCGGCGACGCGAACGTGACCGCCTTCCAGGGGCAGCTCCAGCAGCTGTTCCACCTC    360
   301 GACAGCGGCGACGCGAACGTGACCGCCTTCCAGGGGCAGCTCCAGCAGCTGTTCCACCTC    360
   101 -D--S--G--D--A--N--V--T--A--F--Q--G--Q--L--Q--Q--L--F--H--L-    120

                                                                          
   361 CACGACGCCGGCGTGGACCAGTCCTTCATCGACACGCTGCCGGTGTTCCTCTACGGCGCC    420
   361 CACGACGCCGGCGTGGACCAGTCCTTCATCGACACGCTGCCGGTGTTCCTCTACGGCGCC    420
   121 -H--D--A--G--V--D--Q--S--F--I--D--T--L--P--V--F--L--Y--G--A-    140

                                                                          
   421 GTCGTCGGCGCCGGCAGGAAGGACCCGTTCGACTGCGCGGTCTGCCTCTGCGAGTTCGCC    480
   421 GTCGTCGGCGCCGGCAGGAAGGACCCGTTCGACTGCGCGGTCTGCCTCTGCGAGTTCGCC    480
   141 -V--V--G--A--G--R--K--D--P--F--D--C--A--V--C--L--C--E--F--A-    160

                                                                          
   481 GACGACGACCGCCTCCGGCTCCTCCCCAAGTGCAGCCACGCCTTCCACGTCGACTGCATC    540
   481 GACGACGACCGCCTCCGGCTCCTCCCCAAGTGCAGCCACGCCTTCCACGTCGACTGCATC    540
   161 -D--D--D--R--L--R--L--L--P--K--C--S--H--A--F--H--V--D--C--I-    180

                                                                          
   541 GACACGTGGCTGCTGTCGCACTCCACCTGCCCGCTCTGCCGCCGCAGCCTCCTCGCCGAC    600
   541 GACACGTGGCTGCTGTCGCACTCCACCTGCCCGCTCTGCCGCCGCAGCCTCCTCGCCGAC    600
   181 -D--T--W--L--L--S--H--S--T--C--P--L--C--R--R--S--L--L--A--D-    200

                                                                          
   601 TTCTCCCCCTACGGCGGTGGCTGCAGCCCGCTGCTGTTCGTGCTCGAGTCCGGCTCGGAG    660
   601 TTCTCCCCCTACGGCGGTGGCTGCAGCCCGCTGCTGTTCGTGCTCGAGTCCGGCTCGGAG    660
   201 -F--S--P--Y--G--G--G--C--S--P--L--L--F--V--L--E--S--G--S--E-    220

                                                                          
   661 GGCTCCATCTCCGATCGCCTCGACGCGGCGTCGTCGGCTCATCTCAGCCTCGTCATGGAG    720
   661 GGCTCCATCTCCGATCGCCTCGACGCGGCGTCGTCGGCTCATCTCAGCCTCGTCATGGAG    720
   221 -G--S--I--S--D--R--L--D--A--A--S--S--A--H--L--S--L--V--M--E-    240

                                                                          
   721 CAGGAGGAAGAAGCAGAGCCGGAACAGAAGCATGCAGAGGCGGCGGAGAAGTCGGACGAG    780
   721 CAGGAGGAAGAAGCAGAGCCGGAACAGAAGCATGCAGAGGCGGCGGAGAAGTCGGACGAG    780
   241 -Q--E--E--E--A--E--P--E--Q--K--H--A--E--A--A--E--K--S--D--E-    260

                                                                          
   781 GTGGTCGTCTCCGTCAAGCTTGGCAAGTTTCGGAGTCAGGCCACCGAAGTCGCCGCCGCC    840
   781 GTGGTCGTCTCCGTCAAGCTTGGCAAGTTTCGGAGTCAGGCCACCGAAGTCGCCGCCGCC    840
   261 -V--V--V--S--V--K--L--G--K--F--R--S--Q--A--T--E--V--A--A--A-    280

                                                                          
   841 GGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCAGCGCCAACCCCGAGCAGGACGTGCGGCGTTGCTACTCC    900
   841 GGCGGCGGCGGCGGCAGCAGCAGCGCCAACCCCGAGCAGGACGTGCGGCGTTGCTACTCC    900
   281 -G--G--G--G--G--S--S--S--A--N--P--E--Q--D--V--R--R--C--Y--S-    300

                                                                          
   901 ATGGGGACGTACGAGTACGTCATGGACGAGAGGTCTCTGCTCCGCGTCGCCGTGAAGCCG    960
   901 ATGGGGACGTACGAGTACGTCATGGACGAGAGGTCTCTGCTCCGCGTCGCCGTGAAGCCG    960
   301 -M--G--T--Y--E--Y--V--M--D--E--R--S--L--L--R--V--A--V--K--P-    320

                                                                          
   961 CCGACCAAGAAGCGCCCCACGACGCAGATGCCGGGCCACCGGGTCGCCATGTCGGAGTGC   1020
   961 CCGACCAAGAAGCGCCCCACGACGCAGATGCCGGGCCACCGGGTCGCCATGTCGGAGTGC   1020
   321 -P--T--K--K--R--P--T--T--Q--M--P--G--H--R--V--A--M--S--E--C-    340

                                                                          
  1021 GACTGCCACTCCAAGCGGGAGAGCTTCCGCGGCCTCGACGCGCTGCCCGGCGGCAAGCTC   1080
  1021 GACTGCCACTCCAAGCGGGAGAGCTTCCGCGGCCTCGACGCGCTGCCCGGCGGCAAGCTC   1080
   341 -D--C--H--S--K--R--E--S--F--R--G--L--D--A--L--P--G--G--K--L-    360

                                                                          
  1081 GCGCAGGCGCAGCCGCCGAAGCCGCCGGCCAAGGTGGGGAAGAAGGAGAGCTTCTCCTTC   1140
  1081 GCGCAGGCGCAGCCGCCGAAGCCGCCGGCCAAGGTGGGGAAGAAGGAGAGCTTCTCCTTC   1140
   361 -A--Q--A--Q--P--P--K--P--P--A--K--V--G--K--K--E--S--F--S--F-    380

                                                                          
  1141 TCCAAGATATGGATGCGCGGCGCGCCGCGGATCAGGAAGGACGGCGCGTCCTCCCGGCGC   1200
  1141 TCCAAGATATGGATGCGCGGCGCGCCGCGGATCAGGAAGGACGGCGCGTCCTCCCGGCGC   1200
   381 -S--K--I--W--M--R--G--A--P--R--I--R--K--D--G--A--S--S--R--R-    400

                                                                          
  1201 GCGTCGTCGTTCCGGCTCTCCTCCGTGCTGCAGCGCGCGGCGAGCGACGTCGGGGCAACG   1260
  1201 GCGTCGTCGTTCCGGCTCTCCTCCGTGCTGCAGCGCGCGGCGAGCGACGTCGGGGCAACG   1260
   401 -A--S--S--F--R--L--S--S--V--L--Q--R--A--A--S--D--V--G--A--T-    420

                                                                          
  1261 GCGGCGCCGAAGCCGCTGCGCCCGGACGTCGTGAGCCCCGTCACGGAGTCGGAGTACAAC   1320
  1261 GCGGCGCCGAAGCCGCTGCGCCCGGACGTCGTGAGCCCCGTCACGGAGTCGGAGTACAAC   1320
   421 -A--A--P--K--P--L--R--P--D--V--V--S--P--V--T--E--S--E--Y--N-    440

                                                                          
  1321 GTGTCGGCGTGGGACAAGAGCGAGAAGAGCGCGAGCGGCAGCGTCGCGGACTGGGACCTC   1380
  1321 GTGTCGGCGTGGGACAAGAGCGAGAAGAGCGCGAGCGGCAGCGTCGCGGACTGGGACCTC   1380
   441 -V--S--A--W--D--K--S--E--K--S--A--S--G--S--V--A--D--W--D--L-    460

                                                                          
  1381 GAGTCCGCCGCCGCCACGGCGGCCGTCCCCGGCGCAGGCGCCGGCAACGGGCTCAGCTCG   1440
  1381 GAGTCCGCCGCCGCCACGGCGGCCGTCCCCGGCGCAGGCGCCGGCAACGGGCTCAGCTCG   1440
   461 -E--S--A--A--A--T--A--A--V--P--G--A--G--A--G--N--G--L--S--S-    480

                                                                          
  1441 AGGGCCGACGAGGCGCCGTCGTTCGCGCGGCGGACGCTGCTGTGGATCCGAGGACACCTG   1500
  1441 AGGGCCGACGAGGCGCCGTCGTTCGCGCGGCGGACGCTGCTGTGGATCCGAGGACACCTG   1500
   481 -R--A--D--E--A--P--S--F--A--R--R--T--L--L--W--I--R--G--H--L-    500

                                                                          
  1501 TGA                                                            1503
  1501 TGA                                                            1503
       -*-                                                             500