Transcript: BGIOSGA027240-TA
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- BGIOSGA027240-TA 1830 609aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
B8B9B8 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GCA TCA CCG TCA CGT TTT CCA TCT TCG TTC CCA TTT G AG ATC ATG GAG AGT AGT TCT 60
1 ATGGCATCACCGTCACGTTTTCCATCTTCGTTCCCATTTGAGATCATGGAGAGTAGTTCT 60
1 -M--A--S--P--S--R--F--P--S--S--F--P--F--E--I--M--E--S--S--S- 20
61 TCA GAT GTT CAA ATG TCA CAT TGT GCT GAG GAC TTG AAT AGT GAG AGT ACA ATC GAG ATC 120
61 TCAGATGTTCAAATGTCACATTGTGCTGAGGACTTGAATAGTGAGAGTACAATCGAGATC 120
21 -S--D--V--Q--M--S--H--C--A--E--D--L--N--S--E--S--T--I--E--I- 40
121 AAA ATA AAG ACA TTG GAT TCT CAA ACA TAC AAT TTG CGT GTC AAT AAA CGC G TG CCA GTG 180
121 AAAATAAAGACATTGGATTCTCAAACATACAATTTGCGTGTCAATAAACGCGTGCCAGTG 180
41 -K--I--K--T--L--D--S--Q--T--Y--N--L--R--V--N--K--R--V--P--V- 60
181 CCT CTG CTA AAG GAA AAA ATT GCC ACT GTA ACT GGA ATA TTG TCT GAG CAA CAA CGT CTG 240
181 CCTCTGCTAAAGGAAAAAATTGCCACTGTAACTGGAATATTGTCTGAGCAACAACGTCTG 240
61 -P--L--L--K--E--K--I--A--T--V--T--G--I--L--S--E--Q--Q--R--L- 80
241 ATT TGC CGT GGG AGA GTT CTA AAG GAT GAT GAA CTC CTC TCT GCG TAT C AC GTG GAA GAT 300
241 ATTTGCCGTGGGAGAGTTCTAAAGGATGATGAACTCCTCTCTGCGTATCACGTGGAAGAT 300
81 -I--C--R--G--R--V--L--K--D--D--E--L--L--S--A--Y--H--V--E--D- 100
301 GGC CAT ACA TTG CAT CTC GTG GTT AGA CAA CCA GGA CAA TCC GCT ACA TCA GGA AAT GCT 360
301 GGCCATACATTGCATCTCGTGGTTAGACAACCAGGACAATCCGCTACATCAGGAAATGCT 360
101 -G--H--T--L--H--L--V--V--R--Q--P--G--Q--S--A--T--S--G--N--A- 120
361 GGA AAT GAA G G T ACC ACA TCA AAT CCC GCT CGT CGT CGT GGT CCC ACT ATG ACT CGC AGT 420
361 GGAAATGAAGGTACCACATCAAATCCCGCTCGTCGTCGTGGTCCCACTATGACTCGCAGT 420
121 -G--N--E--G--T--T--S--N--P--A--R--R--R--G--P--T--M--T--R--S- 140
421 ATT GTA CTT GAG GCT ATT AAT GTG GGT CAG GGG AGT GAA CTC AGT GTT GCA CAG A GT GGA 480
421 ATTGTACTTGAGGCTATTAATGTGGGTCAGGGGAGTGAACTCAGTGTTGCACAGAGTGGA 480
141 -I--V--L--E--A--I--N--V--G--Q--G--S--E--L--S--V--A--Q--S--G- 160
481 CCA GCA CCT TCT GAT GCC AGA CCT TCA GAA GGT GCA CAA TCT TCA ACG CAA AAT GGT GTC 540
481 CCAGCACCTTCTGATGCCAGACCTTCAGAAGGTGCACAATCTTCAACGCAAAATGGTGTC 540
161 -P--A--P--S--D--A--R--P--S--E--G--A--Q--S--S--T--Q--N--G--V- 180
541 AGG GCT GTA CTT GAT CAA ATG CCG GTT CCA CCA CTT TTC CAG TCT GAA ACG TCA GTT GGG 600
541 AGGGCTGTACTTGATCAAATGCCGGTTCCACCACTTTTCCAGTCTGAAACGTCAGTTGGG 600
181 -R--A--V--L--D--Q--M--P--V--P--P--L--F--Q--S--E--T--S--V--G- 200
601 TTA TCA GAA CCA AAC GTC ATT CCT GAT TCG TTG ACC ACA ATT TCT CAG TAC ATT AAC TTT 660
601 TTATCAGAACCAAACGTCATTCCTGATTCGTTGACCACAATTTCTCAGTACATTAACTTT 660
201 -L--S--E--P--N--V--I--P--D--S--L--T--T--I--S--Q--Y--I--N--F- 220
661 TTG AGA GAC TCC TTT AGA AGG GAA GGC TTC CTC GAA AAT G G A CAA ACT CTG AAT AAT GCT 720
661 TTGAGAGACTCCTTTAGAAGGGAAGGCTTCCTCGAAAATGGACAAACTCTGAATAATGCT 720
221 -L--R--D--S--F--R--R--E--G--F--L--E--N--G--Q--T--L--N--N--A- 240
721 GAC CAT GGA ACT GCA GGA AGT GCC CAT GGA GGT GGT ACT CAA AAT CAT GAA AGC CAG CCT 780
721 GACCATGGAACTGCAGGAAGTGCCCATGGAGGTGGTACTCAAAATCATGAAAGCCAGCCT 780
241 -D--H--G--T--A--G--S--A--H--G--G--G--T--Q--N--H--E--S--Q--P- 260
781 GAT TCA GCT TCG GCG CAT GGG CTT CCT ACT GCA GCA TTG CTT GCT GAA ACT ATG CAC TCT 840
781 GATTCAGCTTCGGCGCATGGGCTTCCTACTGCAGCATTGCTTGCTGAAACTATGCACTCT 840
261 -D--S--A--S--A--H--G--L--P--T--A--A--L--L--A--E--T--M--H--S- 280
841 ACT AGA CAA CTT CTT GTT GAG CAT GCT GGA GCA TTG CTA TCT C AA CTA CCA AAT CAG CTA 900
841 ACTAGACAACTTCTTGTTGAGCATGCTGGAGCATTGCTATCTCAACTACCAAATCAGCTA 900
281 -T--R--Q--L--L--V--E--H--A--G--A--L--L--S--Q--L--P--N--Q--L- 300
901 GGA GAT ATT GTG AAT GTA ACT GAT GCT ACA ACA CGG AGG AAC CTT CAA AAC AGT GTA GTC 960
901 GGAGATATTGTGAATGTAACTGATGCTACAACACGGAGGAACCTTCAAAACAGTGTAGTC 960
301 -G--D--I--V--N--V--T--D--A--T--T--R--R--N--L--Q--N--S--V--V- 320
961 AGA TAT GGA GTT CTC ATC CAA TAC CTT GGT TCA TTA CTT CTA GAA CTT GGC CGC ACG ACA 1020
961 AGATATGGAGTTCTCATCCAATACCTTGGTTCATTACTTCTAGAACTTGGCCGCACGACA 1020
321 -R--Y--G--V--L--I--Q--Y--L--G--S--L--L--L--E--L--G--R--T--T- 340
1021 ATG ATG CTG CGT ATA AAT CCT GCA ACT GTA G G A ACA GGA TCT GTT CAA GTG GGC CCA ATA 1080
1021 ATGATGCTGCGTATAAATCCTGCAACTGTAGGAACAGGATCTGTTCAAGTGGGCCCAATA 1080
341 -M--M--L--R--I--N--P--A--T--V--G--T--G--S--V--Q--V--G--P--I- 360
1081 TTT TCT AGT CTT ACT TCA CAT CGC TCT GTT CTG CAC CCA AGA GAT ATT GAC ATC CAT GTC 1140
1081 TTTTCTAGTCTTACTTCACATCGCTCTGTTCTGCACCCAAGAGATATTGACATCCATGTC 1140
361 -F--S--S--L--T--S--H--R--S--V--L--H--P--R--D--I--D--I--H--V- 380
1141 CGC ACG A GT GGG TCT GTG TCT TTA ACT GGT ACT AAC CCA CCT GAG CGG GTT GAG GAA CAT 1200
1141 CGCACGAGTGGGTCTGTGTCTTTAACTGGTACTAACCCACCTGAGCGGGTTGAGGAACAT 1200
381 -R--T--S--G--S--V--S--L--T--G--T--N--P--P--E--R--V--E--E--H- 400
1201 CAA ACA CAA GAT CGT ACA GAT AGA AGT GCA AAT GCT TCA CCT GCA AAC AGT AGT GAA GCA 1260
1201 CAAACACAAGATCGTACAGATAGAAGTGCAAATGCTTCACCTGCAAACAGTAGTGAAGCA 1260
401 -Q--T--Q--D--R--T--D--R--S--A--N--A--S--P--A--N--S--S--E--A- 420
1261 TTT GCC AGG GGT TAC AGC CG A ATT CAA CAA AGA GCA TAC ACT AAC GCT CAA GTT GCC CAT 1320
1261 TTTGCCAGGGGTTACAGCCGAATTCAACAAAGAGCATACACTAACGCTCAAGTTGCCCAT 1320
421 -F--A--R--G--Y--S--R--I--Q--Q--R--A--Y--T--N--A--Q--V--A--H- 440
1321 AGT GCT AAT CAG ATA CCG AAT CCA CAG ACA TCT CAG TAT CAT GAA GCA G GT ACT CTA GGA 1380
1321 AGTGCTAATCAGATACCGAATCCACAGACATCTCAGTATCATGAAGCAGGTACTCTAGGA 1380
441 -S--A--N--Q--I--P--N--P--Q--T--S--Q--Y--H--E--A--G--T--L--G- 460
1381 TCT CCT GTT GAT ATC AAT GCA GAA AAC GGC ACT CAG ACT TCC CCT GGG GAG CAG AAT GGC 1440
1381 TCTCCTGTTGATATCAATGCAGAAAACGGCACTCAGACTTCCCCTGGGGAGCAGAATGGC 1440
461 -S--P--V--D--I--N--A--E--N--G--T--Q--T--S--P--G--E--Q--N--G- 480
1441 CAG GGG CCT TTT TCT CAG TTG ATG GAT AGT ATC CCT TGG ATT GCA TCA CTC TTT TCT GGG 1500
1441 CAGGGGCCTTTTTCTCAGTTGATGGATAGTATCCCTTGGATTGCATCACTCTTTTCTGGG 1500
481 -Q--G--P--F--S--Q--L--M--D--S--I--P--W--I--A--S--L--F--S--G- 500
1501 GAA AAT TCT CGA GTA AAT GGC GCA AAT CAG CAT GCA CCG GCT TCT GCT GAG CAG GTA GAT 1560
1501 GAAAATTCTCGAGTAAATGGCGCAAATCAGCATGCACCGGCTTCTGCTGAGCAGGTAGAT 1560
501 -E--N--S--R--V--N--G--A--N--Q--H--A--P--A--S--A--E--Q--V--D- 520
1561 GGT AGA AAT CAT GGA GCA CCA GAA GTG TCA GGA GTC AGT GAT GAG GGT CTA CGG TTC GCT 1620
1561 GGTAGAAATCATGGAGCACCAGAAGTGTCAGGAGTCAGTGATGAGGGTCTACGGTTCGCT 1620
521 -G--R--N--H--G--A--P--E--V--S--G--V--S--D--E--G--L--R--F--A- 540
1621 AGC TTA GTT CGC CAA ATT ATG CCA TTT ATT TCC CAA GTT GAG TCA CAT CAT CAA AGT GCC 1680
1621 AGCTTAGTTCGCCAAATTATGCCATTTATTTCCCAAGTTGAGTCACATCATCAAAGTGCC 1680
541 -S--L--V--R--Q--I--M--P--F--I--S--Q--V--E--S--H--H--Q--S--A- 560
1681 TCA GCA GTC AGT AGC AGC ACC CCT TCA CAG GCT GCA CAT GGG AAC TTG AAT ACT GCA AGA 1740
1681 TCAGCAGTCAGTAGCAGCACCCCTTCACAGGCTGCACATGGGAACTTGAATACTGCAAGA 1740
561 -S--A--V--S--S--S--T--P--S--Q--A--A--H--G--N--L--N--T--A--R- 580
1741 GCT GGT CCA AGT CAT TCC AGG AGT TCA CAT CAA CAT AAC CGT GAT CCA GTT GAT GGA CCT 1800
1741 GCTGGTCCAAGTCATTCCAGGAGTTCACATCAACATAACCGTGATCCAGTTGATGGACCT 1800
581 -A--G--P--S--H--S--R--S--S--H--Q--H--N--R--D--P--V--D--G--P- 600
1801 AAT TCT AAA AGG CAA AG A ACA AGT GAG TGA 1830
1801 AATTCTAAAAGGCAAAGAACAAGTGAGTGA 1830
601 -N--S--K--R--Q--R--T--S--E--*- 609
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