Transcript: BGIOSGA023192-TA
.
Show/hide columns (1 hidden)
- BGIOSGA023192-TA 1146 381aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A2YEM7 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG GGT TAC AAC GAG CTG ATT CCG GGG TTG CCG GAG GAG GTG GCG AGG GAG TGC CTC ATC 60
1 ATGGGTTACAACGAGCTGATTCCGGGGTTGCCGGAGGAGGTGGCGAGGGAGTGCCTCATC 60
1 -M--G--Y--N--E--L--I--P--G--L--P--E--E--V--A--R--E--C--L--I- 20
61 CGG GTG GGG TTC GAC CAG CTG CCG GCG GTG CGC CGC ATC TCG CGC CAG TGG AAG GCG GAG 120
61 CGGGTGGGGTTCGACCAGCTGCCGGCGGTGCGCCGCATCTCGCGCCAGTGGAAGGCGGAG 120
21 -R--V--G--F--D--Q--L--P--A--V--R--R--I--S--R--Q--W--K--A--E- 40
121 GTG GAG TCG CTG GCG TAC AAC CGC CTG AGG AAG GCG GAG GGC CTG GCG CGC CCG GCG CTC 180
121 GTGGAGTCGCTGGCGTACAACCGCCTGAGGAAGGCGGAGGGCCTGGCGCGCCCGGCGCTC 180
41 -V--E--S--L--A--Y--N--R--L--R--K--A--E--G--L--A--R--P--A--L- 60
181 GCG CTG GTG CAG GCG CGG CGT GAG CTC GCC GAG GCG GGC CCG GCG GCG GAC AAG CAG TCG 240
181 GCGCTGGTGCAGGCGCGGCGTGAGCTCGCCGAGGCGGGCCCGGCGGCGGACAAGCAGTCG 240
61 -A--L--V--Q--A--R--R--E--L--A--E--A--G--P--A--A--D--K--Q--S- 80
241 TCG GCC GGC GGT GTG CCG GGG AAC TCG TAC CGG ATG GTG CTG TTG GAC CCG GCG GAG GGG 300
241 TCGGCCGGCGGTGTGCCGGGGAACTCGTACCGGATGGTGCTGTTGGACCCGGCGGAGGGG 300
81 -S--A--G--G--V--P--G--N--S--Y--R--M--V--L--L--D--P--A--E--G- 100
301 AGG TGG ACG CCG CTG CCG GAG GTG GGT GGA GCG AGT GGG AGC TTG CCG CTG TTC TGC CAG 360
301 AGGTGGACGCCGCTGCCGGAGGTGGGTGGAGCGAGTGGGAGCTTGCCGCTGTTCTGCCAG 360
101 -R--W--T--P--L--P--E--V--G--G--A--S--G--S--L--P--L--F--C--Q- 120
361 GTG GCG GCG GTG GAT GGC GGT GTG GAG GGG AGG AAG CGG CTG GTG GTC GTC GGC GGC TGG 420
361 GTGGCGGCGGTGGATGGCGGTGTGGAGGGGAGGAAGCGGCTGGTGGTCGTCGGCGGCTGG 420
121 -V--A--A--V--D--G--G--V--E--G--R--K--R--L--V--V--V--G--G--W- 140
421 GAC CCG GAG ACG TGG GCG CCG ACG GAC TCG GTG CTC GTG TAT GAC TTC CTC ACG GGC GCG 480
421 GACCCGGAGACGTGGGCGCCGACGGACTCGGTGCTCGTGTATGACTTCCTCACGGGCGCG 480
141 -D--P--E--T--W--A--P--T--D--S--V--L--V--Y--D--F--L--T--G--A- 160
481 TGG CGC CGT GGC GCG GCC ATG CCG GGC CCG CGC CGG TCG TTC TTC GCG TGC GCC GCC GTC 540
481 TGGCGCCGTGGCGCGGCCATGCCGGGCCCGCGCCGGTCGTTCTTCGCGTGCGCCGCCGTC 540
161 -W--R--R--G--A--A--M--P--G--P--R--R--S--F--F--A--C--A--A--V- 180
541 GGC GGG AAG GTG TTC GTC GCC GGT GGC CAC GAC GAG GAG AAG AAC GCC CTT CGA TCG GCG 600
541 GGCGGGAAGGTGTTCGTCGCCGGTGGCCACGACGAGGAGAAGAACGCCCTTCGATCGGCG 600
181 -G--G--K--V--F--V--A--G--G--H--D--E--E--K--N--A--L--R--S--A- 200
601 CTG GCG TAC GAC CCG GAC GCC GAC GCG TGG GCC GCG CTC CCC GAC ATG GCG GAG GAG CGC 660
601 CTGGCGTACGACCCGGACGCCGACGCGTGGGCCGCGCTCCCCGACATGGCGGAGGAGCGC 660
201 -L--A--Y--D--P--D--A--D--A--W--A--A--L--P--D--M--A--E--E--R- 220
661 GAC GAG CCG CGC GGG CTC TGC GTC GAC GGC AAG TTC CTG GTC GTC GGC GGG TAC CCG ACG 720
661 GACGAGCCGCGCGGGCTCTGCGTCGACGGCAAGTTCCTGGTCGTCGGCGGGTACCCGACG 720
221 -D--E--P--R--G--L--C--V--D--G--K--F--L--V--V--G--G--Y--P--T- 240
721 CCG GCG CAG GGG CGA TTC GTC GGC TCC GCC GAG TGG TTC GAC CCG GCG ACG TCC ACC TGG 780
721 CCGGCGCAGGGGCGATTCGTCGGCTCCGCCGAGTGGTTCGACCCGGCGACGTCCACCTGG 780
241 -P--A--Q--G--R--F--V--G--S--A--E--W--F--D--P--A--T--S--T--W- 260
781 TCC GCC GTC CAA GAA GGC TTC GTC GAC GAC GGC GCG TGC CCG AGA ACC TGC AGC GCC GCC 840
781 TCCGCCGTCCAAGAAGGCTTCGTCGACGACGGCGCGTGCCCGAGAACCTGCAGCGCCGCC 840
261 -S--A--V--Q--E--G--F--V--D--D--G--A--C--P--R--T--C--S--A--A- 280
841 CCC GAG GCC GGA GAC CGC ATG TAC ATG CTC CGC GAC GGG CAC CTC GTG GCG CGC CAC GGC 900
841 CCCGAGGCCGGAGACCGCATGTACATGCTCCGCGACGGGCACCTCGTGGCGCGCCACGGC 900
281 -P--E--A--G--D--R--M--Y--M--L--R--D--G--H--L--V--A--R--H--G- 300
901 GCC ATC TCC TCC GCC CCC GCG GCG TGG CGG CCC GTG GCG CCG GTG CCG GAG GAC GCG CGC 960
901 GCCATCTCCTCCGCCCCCGCGGCGTGGCGGCCCGTGGCGCCGGTGCCGGAGGACGCGCGC 960
301 -A--I--S--S--A--P--A--A--W--R--P--V--A--P--V--P--E--D--A--R- 320
961 ACC GCG GCG GCC GTT TCC GTC ATC CCC GAC GGC CGC GTC GTG GTC ATC GGG TCC GAC TGC 1020
961 ACCGCGGCGGCCGTTTCCGTCATCCCCGACGGCCGCGTCGTGGTCATCGGGTCCGACTGC 1020
321 -T--A--A--A--V--S--V--I--P--D--G--R--V--V--V--I--G--S--D--C- 340
1021 CAC GGC GGC GAC CAG ACG GTG TAC ACG CTG CGG GAG GAG GCC GGC AAG CCC GCG TCG TGG 1080
1021 CACGGCGGCGACCAGACGGTGTACACGCTGCGGGAGGAGGCCGGCAAGCCCGCGTCGTGG 1080
341 -H--G--G--D--Q--T--V--Y--T--L--R--E--E--A--G--K--P--A--S--W- 360
1081 GCG CGC GCG CCG GCG CCG CCC GAG TTC TCC GGG CAC GTC CAG GCC GCC TGC CTT CTA GAA 1140
1081 GCGCGCGCGCCGGCGCCGCCCGAGTTCTCCGGGCACGTCCAGGCCGCCTGCCTTCTAGAA 1140
361 -A--R--A--P--A--P--P--E--F--S--G--H--V--Q--A--A--C--L--L--E- 380
1141 ATC TGA 1146
1141 ATCTGA 1146
381 -I--*- 381
.
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use