Oryza sativa Indica Group (ASM465v1)
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About this transcript

This transcript has 1 exon, is annotated with 13 domains and features, is associated with 2 variant alleles and maps to 46 oligo probes.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-BGIOSGA023192-TA1146381aa
 
Protein coding
A2YEM7 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Variants
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Other
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Markup
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     1 ATGGGTTACAACGAGCTGATTCCGGGGTTGCCGGAGGAGGTGGCGAGGGAGTGCCTCATC     60
     1 ATGGGTTACAACGAGCTGATTCCGGGGTTGCCGGAGGAGGTGGCGAGGGAGTGCCTCATC     60
     1 -M--G--Y--N--E--L--I--P--G--L--P--E--E--V--A--R--E--C--L--I-     20

                                                                          
    61 CGGGTGGGGTTCGACCAGCTGCCGGCGGTGCGCCGCATCTCGCGCCAGTGGAAGGCGGAG    120
    61 CGGGTGGGGTTCGACCAGCTGCCGGCGGTGCGCCGCATCTCGCGCCAGTGGAAGGCGGAG    120
    21 -R--V--G--F--D--Q--L--P--A--V--R--R--I--S--R--Q--W--K--A--E-     40

                                                                          
   121 GTGGAGTCGCTGGCGTACAACCGCCTGAGGAAGGCGGAGGGCCTGGCGCGCCCGGCGCTC    180
   121 GTGGAGTCGCTGGCGTACAACCGCCTGAGGAAGGCGGAGGGCCTGGCGCGCCCGGCGCTC    180
    41 -V--E--S--L--A--Y--N--R--L--R--K--A--E--G--L--A--R--P--A--L-     60

                                                                          
   181 GCGCTGGTGCAGGCGCGGCGTGAGCTCGCCGAGGCGGGCCCGGCGGCGGACAAGCAGTCG    240
   181 GCGCTGGTGCAGGCGCGGCGTGAGCTCGCCGAGGCGGGCCCGGCGGCGGACAAGCAGTCG    240
    61 -A--L--V--Q--A--R--R--E--L--A--E--A--G--P--A--A--D--K--Q--S-     80

                                                                          
   241 TCGGCCGGCGGTGTGCCGGGGAACTCGTACCGGATGGTGCTGTTGGACCCGGCGGAGGGG    300
   241 TCGGCCGGCGGTGTGCCGGGGAACTCGTACCGGATGGTGCTGTTGGACCCGGCGGAGGGG    300
    81 -S--A--G--G--V--P--G--N--S--Y--R--M--V--L--L--D--P--A--E--G-    100

                                                                          
   301 AGGTGGACGCCGCTGCCGGAGGTGGGTGGAGCGAGTGGGAGCTTGCCGCTGTTCTGCCAG    360
   301 AGGTGGACGCCGCTGCCGGAGGTGGGTGGAGCGAGTGGGAGCTTGCCGCTGTTCTGCCAG    360
   101 -R--W--T--P--L--P--E--V--G--G--A--S--G--S--L--P--L--F--C--Q-    120

                                                                          
   361 GTGGCGGCGGTGGATGGCGGTGTGGAGGGGAGGAAGCGGCTGGTGGTCGTCGGCGGCTGG    420
   361 GTGGCGGCGGTGGATGGCGGTGTGGAGGGGAGGAAGCGGCTGGTGGTCGTCGGCGGCTGG    420
   121 -V--A--A--V--D--G--G--V--E--G--R--K--R--L--V--V--V--G--G--W-    140

                                                                          
   421 GACCCGGAGACGTGGGCGCCGACGGACTCGGTGCTCGTGTATGACTTCCTCACGGGCGCG    480
   421 GACCCGGAGACGTGGGCGCCGACGGACTCGGTGCTCGTGTATGACTTCCTCACGGGCGCG    480
   141 -D--P--E--T--W--A--P--T--D--S--V--L--V--Y--D--F--L--T--G--A-    160

                                                                          
   481 TGGCGCCGTGGCGCGGCCATGCCGGGCCCGCGCCGGTCGTTCTTCGCGTGCGCCGCCGTC    540
   481 TGGCGCCGTGGCGCGGCCATGCCGGGCCCGCGCCGGTCGTTCTTCGCGTGCGCCGCCGTC    540
   161 -W--R--R--G--A--A--M--P--G--P--R--R--S--F--F--A--C--A--A--V-    180

                                                                          
   541 GGCGGGAAGGTGTTCGTCGCCGGTGGCCACGACGAGGAGAAGAACGCCCTTCGATCGGCG    600
   541 GGCGGGAAGGTGTTCGTCGCCGGTGGCCACGACGAGGAGAAGAACGCCCTTCGATCGGCG    600
   181 -G--G--K--V--F--V--A--G--G--H--D--E--E--K--N--A--L--R--S--A-    200

                                                                          
   601 CTGGCGTACGACCCGGACGCCGACGCGTGGGCCGCGCTCCCCGACATGGCGGAGGAGCGC    660
   601 CTGGCGTACGACCCGGACGCCGACGCGTGGGCCGCGCTCCCCGACATGGCGGAGGAGCGC    660
   201 -L--A--Y--D--P--D--A--D--A--W--A--A--L--P--D--M--A--E--E--R-    220

                                                                          
   661 GACGAGCCGCGCGGGCTCTGCGTCGACGGCAAGTTCCTGGTCGTCGGCGGGTACCCGACG    720
   661 GACGAGCCGCGCGGGCTCTGCGTCGACGGCAAGTTCCTGGTCGTCGGCGGGTACCCGACG    720
   221 -D--E--P--R--G--L--C--V--D--G--K--F--L--V--V--G--G--Y--P--T-    240

                                                                          
   721 CCGGCGCAGGGGCGATTCGTCGGCTCCGCCGAGTGGTTCGACCCGGCGACGTCCACCTGG    780
   721 CCGGCGCAGGGGCGATTCGTCGGCTCCGCCGAGTGGTTCGACCCGGCGACGTCCACCTGG    780
   241 -P--A--Q--G--R--F--V--G--S--A--E--W--F--D--P--A--T--S--T--W-    260

                                                                          
   781 TCCGCCGTCCAAGAAGGCTTCGTCGACGACGGCGCGTGCCCGAGAACCTGCAGCGCCGCC    840
   781 TCCGCCGTCCAAGAAGGCTTCGTCGACGACGGCGCGTGCCCGAGAACCTGCAGCGCCGCC    840
   261 -S--A--V--Q--E--G--F--V--D--D--G--A--C--P--R--T--C--S--A--A-    280

                                                                          
   841 CCCGAGGCCGGAGACCGCATGTACATGCTCCGCGACGGGCACCTCGTGGCGCGCCACGGC    900
   841 CCCGAGGCCGGAGACCGCATGTACATGCTCCGCGACGGGCACCTCGTGGCGCGCCACGGC    900
   281 -P--E--A--G--D--R--M--Y--M--L--R--D--G--H--L--V--A--R--H--G-    300

                                                                          
   901 GCCATCTCCTCCGCCCCCGCGGCGTGGCGGCCCGTGGCGCCGGTGCCGGAGGACGCGCGC    960
   901 GCCATCTCCTCCGCCCCCGCGGCGTGGCGGCCCGTGGCGCCGGTGCCGGAGGACGCGCGC    960
   301 -A--I--S--S--A--P--A--A--W--R--P--V--A--P--V--P--E--D--A--R-    320

                                                                          
   961 ACCGCGGCGGCCGTTTCCGTCATCCCCGACGGCCGCGTCGTGGTCATCGGGTCCGACTGC   1020
   961 ACCGCGGCGGCCGTTTCCGTCATCCCCGACGGCCGCGTCGTGGTCATCGGGTCCGACTGC   1020
   321 -T--A--A--A--V--S--V--I--P--D--G--R--V--V--V--I--G--S--D--C-    340

                                                                          
  1021 CACGGCGGCGACCAGACGGTGTACACGCTGCGGGAGGAGGCCGGCAAGCCCGCGTCGTGG   1080
  1021 CACGGCGGCGACCAGACGGTGTACACGCTGCGGGAGGAGGCCGGCAAGCCCGCGTCGTGG   1080
   341 -H--G--G--D--Q--T--V--Y--T--L--R--E--E--A--G--K--P--A--S--W-    360

                                                                          
  1081 GCGCGCGCGCCGGCGCCGCCCGAGTTCTCCGGGCACGTCCAGGCCGCCTGCCTTCTAGAA   1140
  1081 GCGCGCGCGCCGGCGCCGCCCGAGTTCTCCGGGCACGTCCAGGCCGCCTGCCTTCTAGAA   1140
   361 -A--R--A--P--A--P--P--E--F--S--G--H--V--Q--A--A--C--L--L--E-    380

                                                                          
  1141 ATCTGA                                                         1146
  1141 ATCTGA                                                         1146
   381 -I--*-                                                          381