Transcript: BGIOSGA017971-TA
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Description
Histone deacetylase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A2Y543 ]
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- BGIOSGA017971-TA 1179 392aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A2Y543 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GAG TCG TCC GCC TCC TCC TCG GCC GCG GTG GCG GCG GAG GGG GCG CCG GCG ACG GGG 60
1 ATGGAGTCGTCCGCCTCCTCCTCGGCCGCGGTGGCGGCGGAGGGGGCGCCGGCGACGGGG 60
1 -M--E--S--S--A--S--S--S--A--A--V--A--A--E--G--A--P--A--T--G- 20
61 GAG CAG CTG GCG GTG TTC TGG CAC GAG GGC ATG GTG GCC CAC GAC GCC GGC CGC GGC GTG 120
61 GAGCAGCTGGCGGTGTTCTGGCACGAGGGCATGGTGGCCCACGACGCCGGCCGCGGCGTG 120
21 -E--Q--L--A--V--F--W--H--E--G--M--V--A--H--D--A--G--R--G--V- 40
121 TTC GAC TCG GGC CGC GAC CCG GGC TTC CTC GAC GTG CTC GAC CAG CAC CCG GAG AAC GCC 180
121 TTCGACTCGGGCCGCGACCCGGGCTTCCTCGACGTGCTCGACCAGCACCCGGAGAACGCC 180
41 -F--D--S--G--R--D--P--G--F--L--D--V--L--D--Q--H--P--E--N--A- 60
181 GAC CGC GTC CGC AAC ATG GTC TCC ATC CTC CGC CGC GGC CCC ATC GCG CGC TTC ATC TCC 240
181 GACCGCGTCCGCAACATGGTCTCCATCCTCCGCCGCGGCCCCATCGCGCGCTTCATCTCC 240
61 -D--R--V--R--N--M--V--S--I--L--R--R--G--P--I--A--R--F--I--S- 80
241 TGG CAC TCC GGC CGC CCC GCC CAC GCC GCC GAG CTC CTC TCC TTC CAC TCC GCC G A A TAC 300
241 TGGCACTCCGGCCGCCCCGCCCACGCCGCCGAGCTCCTCTCCTTCCACTCCGCCGAATAC 300
81 -W--H--S--G--R--P--A--H--A--A--E--L--L--S--F--H--S--A--E--Y- 100
301 ATA GAG GAG CTC GTG CAA GCA AAT GCC GTT GGT GCC AAG AAG CTG TGT GAA GGC ACT TTC 360
301 ATAGAGGAGCTCGTGCAAGCAAATGCCGTTGGTGCCAAGAAGCTGTGTGAAGGCACTTTC 360
101 -I--E--E--L--V--Q--A--N--A--V--G--A--K--K--L--C--E--G--T--F- 120
361 TTG AAC CCT GGA TCC TGG GGT GCT GCG CTT CTG GCG GCT GGA ACA ACT TTA TCA GCG ATG 420
361 TTGAACCCTGGATCCTGGGGTGCTGCGCTTCTGGCGGCTGGAACAACTTTATCAGCGATG 420
121 -L--N--P--G--S--W--G--A--A--L--L--A--A--G--T--T--L--S--A--M- 140
421 AAG CAC ATA CTA GAT GGA CAT GCC AAG ATT GCC TAT GCG TTG GTC CGC CCC CCT GGC CAT 480
421 AAGCACATACTAGATGGACATGCCAAGATTGCCTATGCGTTGGTCCGCCCCCCTGGCCAT 480
141 -K--H--I--L--D--G--H--A--K--I--A--Y--A--L--V--R--P--P--G--H- 160
481 CAT GCG CAA CCG GAC CGT GCT GAT GGT TAC TGC TTC CTG AAC AAT GCT GGG CTT GCA GTG 540
481 CATGCGCAACCGGACCGTGCTGATGGTTACTGCTTCCTGAACAATGCTGGGCTTGCAGTG 540
161 -H--A--Q--P--D--R--A--D--G--Y--C--F--L--N--N--A--G--L--A--V- 180
541 AAG CTG GCT CTG GAT TCA GGA CGC AGA AAG GTT GCT GTT GTT GAT ATT GAC GTG CAC TAT 600
541 AAGCTGGCTCTGGATTCAGGACGCAGAAAGGTTGCTGTTGTTGATATTGACGTGCACTAT 600
181 -K--L--A--L--D--S--G--R--R--K--V--A--V--V--D--I--D--V--H--Y- 200
601 GGA AAT GGC ACT GCA GAG GGC TTC TAC CAC ACA GAC AGC GTG CTG ACG ATC TCT CTT CAC 660
601 GGAAATGGCACTGCAGAGGGCTTCTACCACACAGACAGCGTGCTGACGATCTCTCTTCAC 660
201 -G--N--G--T--A--E--G--F--Y--H--T--D--S--V--L--T--I--S--L--H- 220
661 ATG AAG CAT GGT TCA TGG GGT CCA TCA CAT CCC CAG AGT GGC TCG GTG GAT GAG ATT GGT 720
661 ATGAAGCATGGTTCATGGGGTCCATCACATCCCCAGAGTGGCTCGGTGGATGAGATTGGT 720
221 -M--K--H--G--S--W--G--P--S--H--P--Q--S--G--S--V--D--E--I--G- 240
721 GAA GGC AGG GGT CTT GGG TAC AAT CTC AAT ATT CCT TTG CCT AAT GGC AGT GGG GAT GCA 780
721 GAAGGCAGGGGTCTTGGGTACAATCTCAATATTCCTTTGCCTAATGGCAGTGGGGATGCA 780
241 -E--G--R--G--L--G--Y--N--L--N--I--P--L--P--N--G--S--G--D--A- 260
781 GGG TAT GAG TAT GCG ATG AAT GAA TTA GTT GTT CCA GCC ATA GAG AAG TTT CGT CCT GAG 840
781 GGGTATGAGTATGCGATGAATGAATTAGTTGTTCCAGCCATAGAGAAGTTTCGTCCTGAG 840
261 -G--Y--E--Y--A--M--N--E--L--V--V--P--A--I--E--K--F--R--P--E- 280
841 CTT TTG GTT TTT GTT GTT GGC CAA GAT TCT AGT ACG T TT GAT CCC AAT GGA AGA CAG TGC 900
841 CTTTTGGTTTTTGTTGTTGGCCAAGATTCTAGTACGTTTGATCCCAATGGAAGACAGTGC 900
281 -L--L--V--F--V--V--G--Q--D--S--S--T--F--D--P--N--G--R--Q--C- 300
901 TTA ACC ATG GAT GGT TAT CGG AAA ATT GGG CAA ATA ATG AGA GGC ATG GCT GAT CAA CAC 960
901 TTAACCATGGATGGTTATCGGAAAATTGGGCAAATAATGAGAGGCATGGCTGATCAACAC 960
301 -L--T--M--D--G--Y--R--K--I--G--Q--I--M--R--G--M--A--D--Q--H- 320
961 AGC AAT GGT CAA ATA TTG ATC GTG CAG GAA GGG GGT TAT CAC ATC AGC TAT TCG GCA TAT 1020
961 AGCAATGGTCAAATATTGATCGTGCAGGAAGGGGGTTATCACATCAGCTATTCGGCATAT 1020
321 -S--N--G--Q--I--L--I--V--Q--E--G--G--Y--H--I--S--Y--S--A--Y- 340
1021 TGT CTG CAT GCA ACA CTA GAA GGT GTT CTG AAT CTA CAA GCC CCG TTG CTT GAT GAT CCA 1080
1021 TGTCTGCATGCAACACTAGAAGGTGTTCTGAATCTACAAGCCCCGTTGCTTGATGATCCA 1080
341 -C--L--H--A--T--L--E--G--V--L--N--L--Q--A--P--L--L--D--D--P- 360
1081 ATC GCC TAT TAT CCA GAG GAT GAG AAA TAC ACC ATG AAA GTT GTG GAC ATC ATG AAG AAA 1140
1081 ATCGCCTATTATCCAGAGGATGAGAAATACACCATGAAAGTTGTGGACATCATGAAGAAA 1140
361 -I--A--Y--Y--P--E--D--E--K--Y--T--M--K--V--V--D--I--M--K--K- 380
1141 TGC TGG AAA GAA TCT ATT CCA TTC TTG AAG GAC ATA TAG 1179
1141 TGCTGGAAAGAATCTATTCCATTCTTGAAGGACATATAG 1179
381 -C--W--K--E--S--I--P--F--L--K--D--I--*- 392
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