Oryza sativa Indica Group (ASM465v1)
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This transcript has 5 exons, is annotated with 12 domains and features, is associated with 29 variant alleles and maps to 33 oligo probes.

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-BGIOSGA012473-TA939312aa
 
Protein coding
B8AMH5 Ensembl Canonical
Variants
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     1 ATGGAGGCCACGGCGAAGTACAACCGGGGCAACCCGGCGGTGAAGCGGATCCTTCAGGAG     60
     1 ATGGAGGCCACGGCGAAGTACAACCGGGGCAACCCGGCGGTGAAGCGGATCCTTCAGGAG     60
     1 -M--E--A--T--A--K--Y--N--R--G--N--P--A--V--K--R--I--L--Q--E-     20

                                                                          
    61 GTCAAGGAGATGCAGTCCAACCCGTCCCCGGACTTCATGGCCATGCCCCTCGAGGACATC    120
    61 GTCAAGGAGATGCAGTCCAACCCGTCCCCGGACTTCATGGCCATGCCCCTCGAGGACATC    120
    21 -V--K--E--M--Q--S--N--P--S--P--D--F--M--A--M--P--L--E--D--I-     40

                                                                          
   121 TTCGAGTGGCAATTTGCGATCCTGGGGCCACGAGACAGTGAGTTTGAGGGAGGAATCTAC    180
   121 TTCGAGTGGCAATTTGCGATCCTGGGGCCACGAGACAGTGAGTTTGAGGGAGGAATCTAC    180
    41 -F--E--W--Q--F--A--I--L--G--P--R--D--S--E--F--E--G--G--I--Y-     60

                                                                          
   181 CATGGAAGGATCCAGCTGCCATCGGACTATCCATTTAAGCCACCATCATTCATGCTGCTC    240
   181 CATGGAAGGATCCAGCTGCCATCGGACTATCCATTTAAGCCACCATCATTCATGCTGCTC    240
    61 -H--G--R--I--Q--L--P--S--D--Y--P--F--K--P--P--S--F--M--L--L-     80

                                                                          
   241 ACGCCAAGTGGAAGATTTGAGATTCAAAAGAAGATTTGTTTGAGCATATCCAATTACCAC    300
   241 ACGCCAAGTGGAAGATTTGAGATTCAAAAGAAGATTTGTTTGAGCATATCCAATTACCAC    300
    81 -T--P--S--G--R--F--E--I--Q--K--K--I--C--L--S--I--S--N--Y--H-    100

                                                                          
   301 CCTGAGCACTGGCAACCATCATGGAGTGTGCGCACAGCTCTTGTAGCTTTGATTGCATTC    360
   301 CCTGAGCACTGGCAACCATCATGGAGTGTGCGCACAGCTCTTGTAGCTTTGATTGCATTC    360
   101 -P--E--H--W--Q--P--S--W--S--V--R--T--A--L--V--A--L--I--A--F-    120

                                                                          
   361 ATGCCAACACCAGGTGGTGGGGCCTTGGGTTCGTTGGACTTCAAAAAGGAAGATAGACGG    420
   361 ATGCCAACACCAGGTGGTGGGGCCTTGGGTTCGTTGGACTTCAAAAAGGAAGATAGACGG    420
   121 -M--P--T--P--G--G--G--A--L--G--S--L--D--F--K--K--E--D--R--R-    140

                                                                          
   421 GCACTAGCTATCAAATCGCGTGAAACACCACCAAAGTTTGGCTCTGCAGAACGCCAAAAA    480
   421 GCACTAGCTATCAAATCGCGTGAAACACCACCAAAGTTTGGCTCTGCAGAACGCCAAAAA    480
   141 -A--L--A--I--K--S--R--E--T--P--P--K--F--G--S--A--E--R--Q--K-    160

                                                                          
   481 GTAATTGATGAGATCCATGAGCAAATGCTCGGTAGGGCTCCCCCTGTTCCTCAGCTGCTG    540
   481 GTAATTGATGAGATCCATGAGCAAATGCTCGGTAGGGCTCCCCCTGTTCCTCAGCTGCTG    540
   161 -V--I--D--E--I--H--E--Q--M--L--G--R--A--P--P--V--P--Q--L--L-    180

                                                                          
   541 ACAAATGAAACTAATGAGGAGACTAACCAATTGCCTGCATCTGATGCTTCTGATGAGCAT    600
   541 ACAAATGAAACTAATGAGGAGACTAACCAATTGCCTGCATCTGATGCTTCTGATGAGCAT    600
   181 -T--N--E--T--N--E--E--T--N--Q--L--P--A--S--D--A--S--D--E--H-    200

                                                                          
   601 GCACACAAGGCAGTTGGAGGCGTGAACACGGCTGGGTCCAACTCAGACTCTGTTAATAAT    660
   601 GCACACAAGGCAGTTGGAGGCGTGAACACGGCTGGGTCCAACTCAGACTCTGTTAATAAT    660
   201 -A--H--K--A--V--G--G--V--N--T--A--G--S--N--S--D--S--V--N--N-    220

                                                                          
   661 GACCTTCCAAGGCCTGATTCTGAGTCAGAAATTGTACAACACATTGTTGAAGGTCGGACA    720
   661 GACCTTCCAAGGCCTGATTCTGAGTCAGAAATTGTACAACACATTGTTGAAGGTCGGACA    720
   221 -D--L--P--R--P--D--S--E--S--E--I--V--Q--H--I--V--E--G--R--T-    240

                                                                          
   721 GAAGGGGTTAGCAACCATTCAAGGGCCAACTTGAGCAGAGAAAACATTCCAAGAGTTGCT    780
   721 GAAGGGGTTAGCAACCATTCAAGGGCCAACTTGAGCAGAGAAAACATTCCAAGAGTTGCT    780
   241 -E--G--V--S--N--H--S--R--A--N--L--S--R--E--N--I--P--R--V--A-    260

                                                                          
   781 CCAACGCCACAGAATCCTGTTGTTGCAATCCAGAAGCCAAAGCATGACAGATTATTGACC    840
   781 CCAACGCCACAGAATCCTGTTGTTGCAATCCAGAAGCCAAAGCATGACAGATTATTGACC    840
   261 -P--T--P--Q--N--P--V--V--A--I--Q--K--P--K--H--D--R--L--L--T-    280

                                                                          
   841 TTGGCTGCATTTGGACTCACTCTTGCTATTATGGCCCTTGTGATCAAGAAGTTCTTCAAA    900
   841 TTGGCTGCATTTGGACTCACTCTTGCTATTATGGCCCTTGTGATCAAGAAGTTCTTCAAA    900
   281 -L--A--A--F--G--L--T--L--A--I--M--A--L--V--I--K--K--F--F--K-    300

                                                                          
   901 ATCAATGGTCTGGCCGGTTACATTGAGGGCAAGTTTTAG                         939
   901 ATCAATGGTCTGGCCGGTTACATTGAGGGCAAGTTTTAG                         939
   301 -I--N--G--L--A--G--Y--I--E--G--K--F--*-                         312