Transcript: BGIOSGA010170-TA
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Description
Histone-binding protein MSI1 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT5G58230) UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O22467]
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- BGIOSGA010170-TA 1536 511aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A2XJZ7 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GCG GCG TTT GAG AAA GTG AGG GCG AAG GTG GCG GCG TTT GAG AAA GGG AGG GCG AAG 60
1 ATGGCGGCGTTTGAGAAAGTGAGGGCGAAGGTGGCGGCGTTTGAGAAAGGGAGGGCGAAG 60
1 -M--A--A--F--E--K--V--R--A--K--V--A--A--F--E--K--G--R--A--K- 20
61 GTG GCG GCG TTT GAG AAA GGG AGG GCA AAG GTG GCG GCG TTT GAG AAA GGG AGG GCG AAG 120
61 GTGGCGGCGTTTGAGAAAGGGAGGGCAAAGGTGGCGGCGTTTGAGAAAGGGAGGGCGAAG 120
21 -V--A--A--F--E--K--G--R--A--K--V--A--A--F--E--K--G--R--A--K- 40
121 ATG GCG GCG TTT GAG AAA GGG AGG GCG AAG ATG GCG GCG TTT GAG AAA GGA AGG GTG AAG 180
121 ATGGCGGCGTTTGAGAAAGGGAGGGCGAAGATGGCGGCGTTTGAGAAAGGAAGGGTGAAG 180
41 -M--A--A--F--E--K--G--R--A--K--M--A--A--F--E--K--G--R--V--K- 60
181 AAG GCG AAT ACG TCA GGG ACG AAG ATG GCG AAT ACG TTG GTA GGG ATC ACG GAG GAG CAG 240
181 AAGGCGAATACGTCAGGGACGAAGATGGCGAATACGTTGGTAGGGATCACGGAGGAGCAG 240
61 -K--A--N--T--S--G--T--K--M--A--N--T--L--V--G--I--T--E--E--Q- 80
241 GAT GAT ATG AAG ATG AAG ATG GCG GCG TTT GAG AAA GGA AGG ACG AAG GTG GAT AAG TTG 300
241 GATGATATGAAGATGAAGATGGCGGCGTTTGAGAAAGGAAGGACGAAGGTGGATAAGTTG 300
81 -D--D--M--K--M--K--M--A--A--F--E--K--G--R--T--K--V--D--K--L- 100
301 GGG ACG AAG ATG GTG AAT ATG TCG T GG CTT CCT GGT CAG GAT CAA CAT CAG AAG ATG GTG 360
301 GGGACGAAGATGGTGAATATGTCGTGGCTTCCTGGTCAGGATCAACATCAGAAGATGGTG 360
101 -G--T--K--M--V--N--M--S--W--L--P--G--Q--D--Q--H--Q--K--M--V- 120
361 CTT GGC ACA CAT CAC CCG CAA AAC TCT GAA AAA TCT CCC AAT TAC CTA ATA ATT GCA CAA 420
361 CTTGGCACACATCACCCGCAAAACTCTGAAAAATCTCCCAATTACCTAATAATTGCACAA 420
121 -L--G--T--H--H--P--Q--N--S--E--K--S--P--N--Y--L--I--I--A--Q- 140
421 GCT CAA CTA TCT TGT GAT GAT GAT GAG GAC ATA GAA TAC CCT TGT GGT GAT GTT GAG GAT 480
421 GCTCAACTATCTTGTGATGATGATGAGGACATAGAATACCCTTGTGGTGATGTTGAGGAT 480
141 -A--Q--L--S--C--D--D--D--E--D--I--E--Y--P--C--G--D--V--E--D- 160
481 ATG GAA TAC TGT GAA TCT GAC GAT GCT AAC AGT GGC TTG TAT GGT GCA GGA TCC AGC AAG 540
481 ATGGAATACTGTGAATCTGACGATGCTAACAGTGGCTTGTATGGTGCAGGATCCAGCAAG 540
161 -M--E--Y--C--E--S--D--D--A--N--S--G--L--Y--G--A--G--S--S--K- 180
541 G TG CAA ATA GTT CAA CAG ATA AAT CAT GAT GGA GAG GTT AAT CGA GCT CGG TAT ATG CCC 600
541 GTGCAAATAGTTCAACAGATAAATCATGATGGAGAGGTTAATCGAGCTCGGTATATGCCC 600
181 -V--Q--I--V--Q--Q--I--N--H--D--G--E--V--N--R--A--R--Y--M--P- 200
601 CAG AAT TCA TTT ATA ATT GCT ACC AAG ACA GTC AGT GCA GAA GTA TAT GTC TTT GAT TAT 660
601 CAGAATTCATTTATAATTGCTACCAAGACAGTCAGTGCAGAAGTATATGTCTTTGATTAT 660
201 -Q--N--S--F--I--I--A--T--K--T--V--S--A--E--V--Y--V--F--D--Y- 220
661 AGC AAG CAC CCA TCA AAG CCT CCA TTG GAT GGT GCA TGC AAT CCT GAC TTA CGG CTG AAG 720
661 AGCAAGCACCCATCAAAGCCTCCATTGGATGGTGCATGCAATCCTGACTTACGGCTGAAG 720
221 -S--K--H--P--S--K--P--P--L--D--G--A--C--N--P--D--L--R--L--K- 240
721 GGA CAT AAC TCT GAA GGA TAT GGA CTG TCT TGG AGT ATA TTT AAG GAG GGC CAT TTG TTG 780
721 GGACATAACTCTGAAGGATATGGACTGTCTTGGAGTATATTTAAGGAGGGCCATTTGTTG 780
241 -G--H--N--S--E--G--Y--G--L--S--W--S--I--F--K--E--G--H--L--L- 260
781 AGT GGA TCT GAT GAT GCT CAA ATT TGC TTA TGG GAC ATC AAA GCA AAT AGT AAA AAC AAA 840
781 AGTGGATCTGATGATGCTCAAATTTGCTTATGGGACATCAAAGCAAATAGTAAAAACAAA 840
261 -S--G--S--D--D--A--Q--I--C--L--W--D--I--K--A--N--S--K--N--K- 280
841 ACC CTT GAC GCT CTT CAG ATT TTT AAG TAT CAT GAT GGT GTC GTT GAA GAT GTT GCC TGG 900
841 ACCCTTGACGCTCTTCAGATTTTTAAGTATCATGATGGTGTCGTTGAAGATGTTGCCTGG 900
281 -T--L--D--A--L--Q--I--F--K--Y--H--D--G--V--V--E--D--V--A--W- 300
901 CAT TTG AGG CAT GAA TAC TTG TTT GGC TCA GTT GGT GAT GAT CAC AAT TTG CTA ATT TGG 960
901 CATTTGAGGCATGAATACTTGTTTGGCTCAGTTGGTGATGATCACAATTTGCTAATTTGG 960
301 -H--L--R--H--E--Y--L--F--G--S--V--G--D--D--H--N--L--L--I--W- 320
961 GAT TTA CGT TCT CCT GTG TCT ACT AAG CCT GTA CAG TCT GTG GCG GCA CAC CAG GGT GAG 1020
961 GATTTACGTTCTCCTGTGTCTACTAAGCCTGTACAGTCTGTGGCGGCACACCAGGGTGAG 1020
321 -D--L--R--S--P--V--S--T--K--P--V--Q--S--V--A--A--H--Q--G--E- 340
1021 G TG AAT TGT CTG GCT TTC AAC CCC TTC AAT GAA TGG GTT GTT GCA ACT GGA TCA ACT GAC 1080
1021 GTGAATTGTCTGGCTTTCAACCCCTTCAATGAATGGGTTGTTGCAACTGGATCAACTGAC 1080
341 -V--N--C--L--A--F--N--P--F--N--E--W--V--V--A--T--G--S--T--D- 360
1081 AAG ACC GTG AAT TGT CTG GCT TTC AAC CCC TTC AAT GAA TGG GTT GTT GCA ACT GGT TCA 1140
1081 AAGACCGTGAATTGTCTGGCTTTCAACCCCTTCAATGAATGGGTTGTTGCAACTGGTTCA 1140
361 -K--T--V--N--C--L--A--F--N--P--F--N--E--W--V--V--A--T--G--S- 380
1141 ACT GAC AAG ACC GTG AAA CTA TTT GAT CTT CGG AAG ATT GAT ACT TCC CTA CAC ACC TTT 1200
1141 ACTGACAAGACCGTGAAACTATTTGATCTTCGGAAGATTGATACTTCCCTACACACCTTT 1200
381 -T--D--K--T--V--K--L--F--D--L--R--K--I--D--T--S--L--H--T--F- 400
1201 GAT TGC CAC AA G GAG GAA GTA TTT CAA GTT GGA TGG AGC CCA AAG AAT GAG ACT ATA CTT 1260
1201 GATTGCCACAAGGAGGAAGTATTTCAAGTTGGATGGAGCCCAAAGAATGAGACTATACTT 1260
401 -D--C--H--K--E--E--V--F--Q--V--G--W--S--P--K--N--E--T--I--L- 420
1261 GCA TCT TGT TGT CTT GGC AGA AGG TTA ATG GTC TGG GAT TTA AGC AG G ATT GAC CAG GAA 1320
1261 GCATCTTGTTGTCTTGGCAGAAGGTTAATGGTCTGGGATTTAAGCAGGATTGACCAGGAA 1320
421 -A--S--C--C--L--G--R--R--L--M--V--W--D--L--S--R--I--D--Q--E- 440
1321 CAG ACA CCG GAG GAT GCG GAA GAT GGT CCT CCG GAG CTC CTG TTC ATT CAT GGA GGC CAT 1380
1321 CAGACACCGGAGGATGCGGAAGATGGTCCTCCGGAGCTCCTGTTCATTCATGGAGGCCAT 1380
441 -Q--T--P--E--D--A--E--D--G--P--P--E--L--L--F--I--H--G--G--H- 460
1381 ACA AGC AAG ATC TCC GAC TTC TCC TGG AAC CCG TGC GAG GAC TGG GTG ATT GCT AGC GTC 1440
1381 ACAAGCAAGATCTCCGACTTCTCCTGGAACCCGTGCGAGGACTGGGTGATTGCTAGCGTC 1440
461 -T--S--K--I--S--D--F--S--W--N--P--C--E--D--W--V--I--A--S--V- 480
1441 GCT GAG GAC AAC ATC CTT CAG ATA TGG CAA ATG GCA GAG AAC ATC TAC CAT GAC GAG GAT 1500
1441 GCTGAGGACAACATCCTTCAGATATGGCAAATGGCAGAGAACATCTACCATGACGAGGAT 1500
481 -A--E--D--N--I--L--Q--I--W--Q--M--A--E--N--I--Y--H--D--E--D- 500
1501 GAT GTG CCG ACT GAT GAC CCG GCC AAG GCT CCC TGA 1536
1501 GATGTGCCGACTGATGACCCGGCCAAGGCTCCCTGA 1536
501 -D--V--P--T--D--D--P--A--K--A--P--*- 511
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