Oryza sativa Indica Group (ASM465v1)
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About this transcript

This transcript has 8 exons, is annotated with 9 domains and features, is associated with 12 variant alleles and maps to 50 oligo probes.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-BGIOSGA007603-TA627208aa
 
Protein coding
A2X1A0 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Variants
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Other
  • UTR
Markup
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     1 ATGGAAGGTGTTGTTGTGAGGAGGGTGATCCCTTCGGACAACAGTTGCCTCTTCAATGCT     60
     1 ATGGAAGGTGTTGTTGTGAGGAGGGTGATCCCTTCGGACAACAGTTGCCTCTTCAATGCT     60
     1 -M--E--G--V--V--V--R--R--V--I--P--S--D--N--S--C--L--F--N--A-     20

                                                                          
    61 GTTGGGTATGTCATGGAGCATAACAGGAACAAGGCTTCTGAGCTCAGACAGGTTATAGCA    120
    61 GTTGGGTATGTCATGGAGCATAACAGGAACAAGGCTTCTGAGCTCAGACAGGTTATAGCA    120
    21 -V--G--Y--V--M--E--H--N--R--N--K--A--S--E--L--R--Q--V--I--A-     40

                                                                          
   121 GCAGCAGTTGCTAGTGATCCTGCAAAGTACAGTGAAGTTTTTCTTGGAAAACCAAATGAA    180
   121 GCAGCAGTTGCTAGTGATCCTGCAAAGTACAGTGAAGTTTTTCTTGGAAAACCAAATGAA    180
    41 -A--A--V--A--S--D--P--A--K--Y--S--E--V--F--L--G--K--P--N--E-     60

                                                                          
   181 GCGTACTGTGCTTGGATTTTGGATTCTGAAAAGTGGGGAGGTGCCATTGAACTTTCTATC    240
   181 GCGTACTGTGCTTGGATTTTGGATTCTGAAAAGTGGGGAGGTGCCATTGAACTTTCTATC    240
    61 -A--Y--C--A--W--I--L--D--S--E--K--W--G--G--A--I--E--L--S--I-     80

                                                                          
   241 CTATCGGAATATTATGGGCGTGAAATTGCTGCATATGACATCCAGACAACCCGCTGTGAT    300
   241 CTATCGGAATATTATGGGCGTGAAATTGCTGCATATGACATCCAGACAACCCGCTGTGAT    300
    81 -L--S--E--Y--Y--G--R--E--I--A--A--Y--D--I--Q--T--T--R--C--D-    100

                                                                          
   301 CTGTATGGTCAGGAGAAGAACTACACTGAGCGAACTATGCTCATCTATGATGGGCTGCAT    360
   301 CTGTATGGTCAGGAGAAGAACTACACTGAGCGAACTATGCTCATCTATGATGGGCTGCAT    360
   101 -L--Y--G--Q--E--K--N--Y--T--E--R--T--M--L--I--Y--D--G--L--H-    120

                                                                          
   361 TATGATGCTTTAGCTATGTCACCATTTGAAGGTGCACCGGAAGAATTTGATCAGACTATC    420
   361 TATGATGCTTTAGCTATGTCACCATTTGAAGGTGCACCGGAAGAATTTGATCAGACTATC    420
   121 -Y--D--A--L--A--M--S--P--F--E--G--A--P--E--E--F--D--Q--T--I-    140

                                                                          
   421 TTCCCTGTCGACCACAAATGGTCGATTGGCCCAGTAGAGGGCCTTGCTCTTAACTTCGTG    480
   421 TTCCCTGTCGACCACAAATGGTCGATTGGCCCAGTAGAGGGCCTTGCTCTTAACTTCGTG    480
   141 -F--P--V--D--H--K--W--S--I--G--P--V--E--G--L--A--L--N--F--V-    160

                                                                          
   481 AAGGATGAAAAGAGGAAGAGGAGCTACACAGACACTGCAAACTTCACCTTGCGCTGTGGC    540
   481 AAGGATGAAAAGAGGAAGAGGAGCTACACAGACACTGCAAACTTCACCTTGCGCTGTGGC    540
   161 -K--D--E--K--R--K--R--S--Y--T--D--T--A--N--F--T--L--R--C--G-    180

                                                                          
   541 GTCTGCCAAATTGGTGTGATTGGTCAAAAGGAAGCCGTTGAACATGCTCAGGCCACTGGA    600
   541 GTCTGCCAAATTGGTGTGATTGGTCAAAAGGAAGCCGTTGAACATGCTCAGGCCACTGGA    600
   181 -V--C--Q--I--G--V--I--G--Q--K--E--A--V--E--H--A--Q--A--T--G-    200

                                                                          
   601 CATGTCAACTTCCAAGAATACAAATGA                                     627
   601 CATGTCAACTTCCAAGAATACAAATGA                                     627
   201 -H--V--N--F--Q--E--Y--K--*-                                     208