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Oryza glaberrima (Oryza_glaberrima_V1)
Location
About this transcript

This transcript has 5 exons, is annotated with 26 domains and features, is associated with 70 variant alleles and maps to 23 oligo probes.

Gene
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  • Name
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-ORGLA11G0071500.1765254aa
 
Protein coding
I1QYX3 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
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Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGGACGGAGGCGGGGCGCACCGCACGCCGGAGGACGTGTTCCGGGACTTCCGCGCGCGG     60
     1 ATGGACGGAGGCGGGGCGCACCGCACGCCGGAGGACGTGTTCCGGGACTTCCGCGCGCGG     60
     1 -M--D--G--G--G--A--H--R--T--P--E--D--V--F--R--D--F--R--A--R-     20

                                                                          
    61 CGGGCCGGGATGATCAAGGCGCTGACCACAGATGTGGAGAAGTTCTACCAGCAGTGCGAC    120
    61 CGGGCCGGGATGATCAAGGCGCTGACCACAGATGTGGAGAAGTTCTACCAGCAGTGCGAC    120
    21 -R--A--G--M--I--K--A--L--T--T--D--V--E--K--F--Y--Q--Q--C--D-     40

                                                                          
   121 CCAGAGAAAGAGAATTTGTGTTTATATGGTCTTCCCAATGAGACATGGGAAGTGAACTTG    180
   121 CCAGAGAAAGAGAATTTGTGTTTATATGGTCTTCCCAATGAGACATGGGAAGTGAACTTG    180
    41 -P--E--K--E--N--L--C--L--Y--G--L--P--N--E--T--W--E--V--N--L-     60

                                                                          
   181 CCTGCTGAGGAGGTTCCTCCAGAGCTTCCAGAACCAGCTCTGGGAATTAATTTTGCTCGG    240
   181 CCTGCTGAGGAGGTTCCTCCAGAGCTTCCAGAACCAGCTCTGGGAATTAATTTTGCTCGG    240
    61 -P--A--E--E--V--P--P--E--L--P--E--P--A--L--G--I--N--F--A--R-     80

                                                                          
   241 GATGGGATGGATGAGAAAGACTGGCTGTCACTTGTTGCGGTTCATAGTGATACCTGGCTG    300
   241 GATGGGATGGATGAGAAAGACTGGCTGTCACTTGTTGCGGTTCATAGTGATACCTGGCTG    300
    81 -D--G--M--D--E--K--D--W--L--S--L--V--A--V--H--S--D--T--W--L-    100

                                                                          
   301 CTAGCAGTAGCCTTTTACTTTGGAGCAAGATTCGGGTTTGACAAAGAATCCAGGAAACGG    360
   301 CTAGCAGTAGCCTTTTACTTTGGAGCAAGATTCGGGTTTGACAAAGAATCCAGGAAACGG    360
   101 -L--A--V--A--F--Y--F--G--A--R--F--G--F--D--K--E--S--R--K--R-    120

                                                                          
   361 CTTTTTAGCATGATTAACAACCTTCCAACCATATATGAGGTTGTCACTGGGACTGCAAAG    420
   361 CTTTTTAGCATGATTAACAACCTTCCAACCATATATGAGGTTGTCACTGGGACTGCAAAG    420
   121 -L--F--S--M--I--N--N--L--P--T--I--Y--E--V--V--T--G--T--A--K-    140

                                                                          
   421 AAGCAGAGCAAAGAAAAAACCCCCAAGACCAGTGGCAAGAGCAATAAATCCGGCACGAAG    480
   421 AAGCAGAGCAAAGAAAAAACCCCCAAGACCAGTGGCAAGAGCAATAAATCCGGCACGAAG    480
   141 -K--Q--S--K--E--K--T--P--K--T--S--G--K--S--N--K--S--G--T--K-    160

                                                                          
   481 CCATCGCGCCAGCCGGAACCCAACTCTAGGGGTCCAAAGATGCCACCTCCAAAGGATGAG    540
   481 CCATCGCGCCAGCCGGAACCCAACTCTAGGGGTCCAAAGATGCCACCTCCAAAGGATGAG    540
   161 -P--S--R--Q--P--E--P--N--S--R--G--P--K--M--P--P--P--K--D--E-    180

                                                                          
   541 GATGATAGCGGAGGTGAGGAAGAGGAGGAAGAAGAAGATCACGAAAACACATTATGTGGT    600
   541 GATGATAGCGGAGGTGAGGAAGAGGAGGAAGAAGAAGATCACGAAAACACATTATGTGGT    600
   181 -D--D--S--G--G--E--E--E--E--E--E--E--D--H--E--N--T--L--C--G-    200

                                                                          
   601 GCATGTGGTGACAACTATGGACAGGATGAGTTCTGGATCTGCTGCGATGCTTGTGAGACA    660
   601 GCATGTGGTGACAACTATGGACAGGATGAGTTCTGGATCTGCTGCGATGCTTGTGAGACA    660
   201 -A--C--G--D--N--Y--G--Q--D--E--F--W--I--C--C--D--A--C--E--T-    220

                                                                          
   661 TGGTTCCACGGTAAGTGTGTCAAGATAACCCCTGCCAAGGCTGAGCACATCAAGCACTAC    720
   661 TGGTTCCACGGTAAGTGTGTCAAGATAACCCCTGCCAAGGCTGAGCACATCAAGCACTAC    720
   221 -W--F--H--G--K--C--V--K--I--T--P--A--K--A--E--H--I--K--H--Y-    240

                                                                          
   721 AAGTGCCCGAACTGCAGCAGTAGTAGCAAGAGAGCCAGAGCTTGA                   765
   721 AAGTGCCCGAACTGCAGCAGTAGTAGCAAGAGAGCCAGAGCTTGA                   765
   241 -K--C--P--N--C--S--S--S--S--K--R--A--R--A--*-                   254