Transcript: ORGLA09G0032900.1
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- ORGLA09G0032900.1 1302 433aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
I1QMQ0 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GCG GAG GGG GAG GGC TCC TCT TCC AG G AGG TGG GCG TTG GGC GAT CCG GAT GTC GTC 60
1 ATGGCGGAGGGGGAGGGCTCCTCTTCCAGGAGGTGGGCGTTGGGCGATCCGGATGTCGTC 60
1 -M--A--E--G--E--G--S--S--S--R--R--W--A--L--G--D--P--D--V--V- 20
61 GAG GTG TCG CCG GAG GCG GCG GCG GCG GCG CGT TGG AGC TCC GCG CGC CTG AAG CGG AAG 120
61 GAGGTGTCGCCGGAGGCGGCGGCGGCGGCGCGTTGGAGCTCCGCGCGCCTGAAGCGGAAG 120
21 -E--V--S--P--E--A--A--A--A--A--R--W--S--S--A--R--L--K--R--K- 40
121 CGC ACG A CT GTT GCT CAC GAA ATA ATT GAT CTC GAC GCC AAT GAT GAT CCT GAT GGA GTT 180
121 CGCACGACTGTTGCTCACGAAATAATTGATCTCGACGCCAATGATGATCCTGATGGAGTT 180
41 -R--T--T--V--A--H--E--I--I--D--L--D--A--N--D--D--P--D--G--V- 60
181 ATG ATA ATT TGT GAG AAG GCG TCG AGT CAC AAG AGT AAT CAT TCT GTT AGT CAT CCT TCG 240
181 ATGATAATTTGTGAGAAGGCGTCGAGTCACAAGAGTAATCATTCTGTTAGTCATCCTTCG 240
61 -M--I--I--C--E--K--A--S--S--H--K--S--N--H--S--V--S--H--P--S- 80
241 GAT TGG CCA AAG CAT CCA AAG AGT GGC TTG GCT GAG GAT GTT CCT GGT CCA AGC CAT CAA 300
241 GATTGGCCAAAGCATCCAAAGAGTGGCTTGGCTGAGGATGTTCCTGGTCCAAGCCATCAA 300
81 -D--W--P--K--H--P--K--S--G--L--A--E--D--V--P--G--P--S--H--Q- 100
301 CCT GGC ACG AGC ACA GTT CTA CCA TGG GGA TGC ACA ACT CCT GGG AGA CCA CGG AAG CAT 360
301 CCTGGCACGAGCACAGTTCTACCATGGGGATGCACAACTCCTGGGAGACCACGGAAGCAT 360
101 -P--G--T--S--T--V--L--P--W--G--C--T--T--P--G--R--P--R--K--H- 120
361 AAG GAA ATT AAA ACC GTG GAT AAT AAA ATT GAT GAG AAG TAT AAG GCA TTT AAG CAG TTT 420
361 AAGGAAATTAAAACCGTGGATAATAAAATTGATGAGAAGTATAAGGCATTTAAGCAGTTT 420
121 -K--E--I--K--T--V--D--N--K--I--D--E--K--Y--K--A--F--K--Q--F- 140
421 GAT ACT GTT ACC GAC CAC AGT GAT CAC TAT TAT TCA ATG TCA GGC AAA GGG AAT GTT CCT 480
421 GATACTGTTACCGACCACAGTGATCACTATTATTCAATGTCAGGCAAAGGGAATGTTCCT 480
141 -D--T--V--T--D--H--S--D--H--Y--Y--S--M--S--G--K--G--N--V--P- 160
481 GAA GTC AAG AAG C CA TCC AAG GGC TGG GTG AGG CGG ATT CAA CAT GAA TGG AAA GTT CTG 540
481 GAAGTCAAGAAGCCATCCAAGGGCTGGGTGAGGCGGATTCAACATGAATGGAAAGTTCTG 540
161 -E--V--K--K--P--S--K--G--W--V--R--R--I--Q--H--E--W--K--V--L- 180
541 GAG AAA GAT TTG CCA G G T ACA ATT TTT GTA CGA GTT TAT GAG GAT AGG ATG GAA CTA CTT 600
541 GAGAAAGATTTGCCAGGTACAATTTTTGTACGAGTTTATGAGGATAGGATGGAACTACTT 600
181 -E--K--D--L--P--G--T--I--F--V--R--V--Y--E--D--R--M--E--L--L- 200
601 AGG GCT GTC ATT GTT GGA CCT GCA GGC ACT CCT TAC CAT GAT GGA CTT TTC TTT TTC GAT 660
601 AGGGCTGTCATTGTTGGACCTGCAGGCACTCCTTACCATGATGGACTTTTCTTTTTCGAT 660
201 -R--A--V--I--V--G--P--A--G--T--P--Y--H--D--G--L--F--F--F--D- 220
661 GTA TAT TTC CCT TCC CAG TAT CCC AAG AAA CCT CCA CTA GTG AAC TAC CGC TCG GGA GGG 720
661 GTATATTTCCCTTCCCAGTATCCCAAGAAACCTCCACTAGTGAACTACCGCTCGGGAGGG 720
221 -V--Y--F--P--S--Q--Y--P--K--K--P--P--L--V--N--Y--R--S--G--G- 240
721 TTG CGG CTT AAT CCA AAT CTC TAT GAT AGC GGG AAA GTC TGT CTT AGC CTA TTG AAC ACT 780
721 TTGCGGCTTAATCCAAATCTCTATGATAGCGGGAAAGTCTGTCTTAGCCTATTGAACACT 780
241 -L--R--L--N--P--N--L--Y--D--S--G--K--V--C--L--S--L--L--N--T- 260
781 TGG TCT GGG CAT GGG TGT GAG AAG TGG AAC CCA TCC AAT TCA ACC ATG CTG CAG GTC CTA 840
781 TGGTCTGGGCATGGGTGTGAGAAGTGGAACCCATCCAATTCAACCATGCTGCAGGTCCTA 840
261 -W--S--G--H--G--C--E--K--W--N--P--S--N--S--T--M--L--Q--V--L- 280
841 GTC TCC ATT CAG GCC TTG GTG TTG AAT GCA AAA CCT TAT TTT AAT GAA CCT GGT TAT GCA 900
841 GTCTCCATTCAGGCCTTGGTGTTGAATGCAAAACCTTATTTTAATGAACCTGGTTATGCA 900
281 -V--S--I--Q--A--L--V--L--N--A--K--P--Y--F--N--E--P--G--Y--A- 300
901 GCT TCT GCT AAC ACA CCC CAG GGG GAG AAA ATG TCC ATG GCT TAT AAT GAA TCG ACA TTT 960
901 GCTTCTGCTAACACACCCCAGGGGGAGAAAATGTCCATGGCTTATAATGAATCGACATTT 960
301 -A--S--A--N--T--P--Q--G--E--K--M--S--M--A--Y--N--E--S--T--F- 320
961 CTC CTA TCC TGC AGA ACA ATG CTG TAT TCT CTT CGG AAT CCA CCG AAG C AT TTT GAA GAC 1020
961 CTCCTATCCTGCAGAACAATGCTGTATTCTCTTCGGAATCCACCGAAGCATTTTGAAGAC 1020
321 -L--L--S--C--R--T--M--L--Y--S--L--R--N--P--P--K--H--F--E--D- 340
1021 TTC GCA AGG GTT CAT TTT TGC AAG TAC GGG CGC AAT ATC CTC GTA GGA TGC AAG GCC TAC 1080
1021 TTCGCAAGGGTTCATTTTTGCAAGTACGGGCGCAATATCCTCGTAGGATGCAAGGCCTAC 1080
341 -F--A--R--V--H--F--C--K--Y--G--R--N--I--L--V--G--C--K--A--Y- 360
1081 ATG AAT GGT GCC CAA GTT GGA TGC CTT GCA GGA AAC GGA GTG CAT GAT GTT GAT GAA GGC 1140
1081 ATGAATGGTGCCCAAGTTGGATGCCTTGCAGGAAACGGAGTGCATGATGTTGATGAAGGC 1140
361 -M--N--G--A--Q--V--G--C--L--A--G--N--G--V--H--D--V--D--E--G- 380
1141 GAC AAA AGC TGC TCA GCG AAC TTC AAA GGC TCC TTG AAG ACG TTA TTT GAT GAA CTC ATC 1200
1141 GACAAAAGCTGCTCAGCGAACTTCAAAGGCTCCTTGAAGACGTTATTTGATGAACTCATC 1200
381 -D--K--S--C--S--A--N--F--K--G--S--L--K--T--L--F--D--E--L--I- 400
1201 AAG GAA TTT ACC CGG ATA GGA GTT CAT TGC CAT GAA TTC CAG CCT CAG AGG GTG AAT CCT 1260
1201 AAGGAATTTACCCGGATAGGAGTTCATTGCCATGAATTCCAGCCTCAGAGGGTGAATCCT 1260
401 -K--E--F--T--R--I--G--V--H--C--H--E--F--Q--P--Q--R--V--N--P- 420
1261 GGG TCT ACC AGA GCC AAG GCG GAC ACC ACA TTG AGG CTA TGA 1302
1261 GGGTCTACCAGAGCCAAGGCGGACACCACATTGAGGCTATGA 1302
421 -G--S--T--R--A--K--A--D--T--T--L--R--L--*- 433
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