Transcript: ORGLA07G0001200.1
.
Description
BTB/POZ/MATH-domains containing protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT2G39760) TAIR;Acc:AT2G39760]
Show/hide columns (1 hidden)
- ORGLA07G0001200.1 1188 395aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
I1Q7C0 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG ACG GCG GCG GCG TCG TGG TCC CGG TCG GTG ACG GAG ACG GTG CGG GGG TCT CAC CAG 60
1 ATGACGGCGGCGGCGTCGTGGTCCCGGTCGGTGACGGAGACGGTGCGGGGGTCTCACCAG 60
1 -M--T--A--A--A--S--W--S--R--S--V--T--E--T--V--R--G--S--H--Q- 20
61 TAC ACG GTG AAG GGG TTC TCG ATG GCG AAG GGC GTA GGG GCC GGG CGG TAC GTG AGC AGC 120
61 TACACGGTGAAGGGGTTCTCGATGGCGAAGGGCGTAGGGGCCGGGCGGTACGTGAGCAGC 120
21 -Y--T--V--K--G--F--S--M--A--K--G--V--G--A--G--R--Y--V--S--S- 40
121 GAC ACC TTC GCG GTG GGC GGC TAC CAC TGG GCC GTC TAC CTC TAC CCC GAC GGC AAG AAC 180
121 GACACCTTCGCGGTGGGCGGCTACCACTGGGCCGTCTACCTCTACCCCGACGGCAAGAAC 180
41 -D--T--F--A--V--G--G--Y--H--W--A--V--Y--L--Y--P--D--G--K--N- 60
181 CCC GAG GAC AAC GCC AAC TAC GTC TCC GTC TTC GTC GCC CTC GCC TCC GAC GGC GCC GAC 240
181 CCCGAGGACAACGCCAACTACGTCTCCGTCTTCGTCGCCCTCGCCTCCGACGGCGCCGAC 240
61 -P--E--D--N--A--N--Y--V--S--V--F--V--A--L--A--S--D--G--A--D- 80
241 GTC CGC GCC CTC TTC GAG CTC ACC CTC CTC GAC CAG TCC GGC CGC GGC CGC CAC AAG GTC 300
241 GTCCGCGCCCTCTTCGAGCTCACCCTCCTCGACCAGTCCGGCCGCGGCCGCCACAAGGTC 300
81 -V--R--A--L--F--E--L--T--L--L--D--Q--S--G--R--G--R--H--K--V- 100
301 CAC TCC CAC TTC GAC CGA TCC CTC CAG GCC GGA CCC TAC ACC CTC AAG TAC CGA GGC TCC 360
301 CACTCCCACTTCGACCGATCCCTCCAGGCCGGACCCTACACCCTCAAGTACCGAGGCTCC 360
101 -H--S--H--F--D--R--S--L--Q--A--G--P--Y--T--L--K--Y--R--G--S- 120
361 ATG TG G GGC TAC AAG CGC TTC TAC CGA AGA TCA CTC TTA GAA TCA TCC GAC TTT CTC AAG 420
361 ATGTGGGGCTACAAGCGCTTCTACCGAAGATCACTCTTAGAATCATCCGACTTTCTCAAG 420
121 -M--W--G--Y--K--R--F--Y--R--R--S--L--L--E--S--S--D--F--L--K- 140
421 GAC GAC TGC CTC GTT ATG AAC TGC ACT GTA GGC GTC GTC AAG AAC CGT CTC GAA ACA CCA 480
421 GACGACTGCCTCGTTATGAACTGCACTGTAGGCGTCGTCAAGAACCGTCTCGAAACACCA 480
141 -D--D--C--L--V--M--N--C--T--V--G--V--V--K--N--R--L--E--T--P- 160
481 AAG AAC ATC CAC ATC AAT ATT CCT CCA TCC GAC ATG GGC CGT TGC TTC AAC AAC CTC CTC 540
481 AAGAACATCCACATCAATATTCCTCCATCCGACATGGGCCGTTGCTTCAACAACCTCCTC 540
161 -K--N--I--H--I--N--I--P--P--S--D--M--G--R--C--F--N--N--L--L- 180
541 AAT CTC CGC ATC GGC TGT GAC GTA TCT TTT GAG GTG GGT GAT GAA AGA GTC CAG GCG CAC 600
541 AATCTCCGCATCGGCTGTGACGTATCTTTTGAGGTGGGTGATGAAAGAGTCCAGGCGCAC 600
181 -N--L--R--I--G--C--D--V--S--F--E--V--G--D--E--R--V--Q--A--H- 200
601 AAG TGG ATT CTT GCT GCC CGC TCC CCT GTA TTC AAA GCC CAA TTC TTT GGT CCT ATT GGG 660
601 AAGTGGATTCTTGCTGCCCGCTCCCCTGTATTCAAAGCCCAATTCTTTGGTCCTATTGGG 660
201 -K--W--I--L--A--A--R--S--P--V--F--K--A--Q--F--F--G--P--I--G- 220
661 AAT CCT GAC CTA CAC ACA GTC ATT GTC GAG GAT GTA GAA CCT CTT GTC TTC AAG G CA ATG 720
661 AATCCTGACCTACACACAGTCATTGTCGAGGATGTAGAACCTCTTGTCTTCAAGGCAATG 720
221 -N--P--D--L--H--T--V--I--V--E--D--V--E--P--L--V--F--K--A--M- 240
721 GTG AAT TTC ATA TAC TCT GAT GAA CTT CCT AGT ATT CAT GAA CTA GCT GGA TCT GTC TCA 780
721 GTGAATTTCATATACTCTGATGAACTTCCTAGTATTCATGAACTAGCTGGATCTGTCTCA 780
241 -V--N--F--I--Y--S--D--E--L--P--S--I--H--E--L--A--G--S--V--S- 260
781 ACT TGG ACA TCG ACA GTA GTA GTA CAG CAT TTG TTG GCG GCT GCT GAC AGA TAT GGA CTA 840
781 ACTTGGACATCGACAGTAGTAGTACAGCATTTGTTGGCGGCTGCTGACAGATATGGACTA 840
261 -T--W--T--S--T--V--V--V--Q--H--L--L--A--A--A--D--R--Y--G--L- 280
841 GAT CGG CTA CGT CTG CTA TGC GAG GAA AAG TTA TGT GAT GAA CTC ACT GCT GAA ACA GTT 900
841 GATCGGCTACGTCTGCTATGCGAGGAAAAGTTATGTGATGAACTCACTGCTGAAACAGTT 900
281 -D--R--L--R--L--L--C--E--E--K--L--C--D--E--L--T--A--E--T--V- 300
901 GCA ACA ACC TTA GCC CTA GCT GAA CAA CAT CAT TGT ACT CAG CTG AAA TCT GCT TGT CTG 960
901 GCAACAACCTTAGCCCTAGCTGAACAACATCATTGTACTCAGCTGAAATCTGCTTGTCTG 960
301 -A--T--T--L--A--L--A--E--Q--H--H--C--T--Q--L--K--S--A--C--L- 320
961 AAG TTC ACT GCT GTT CGG GAA AAT CTG GGA G CT GTG ATG GAG ACA GAA GGA TTT AAT TAC 1020
961 AAGTTCACTGCTGTTCGGGAAAATCTGGGAGCTGTGATGGAGACAGAAGGATTTAATTAC 1020
321 -K--F--T--A--V--R--E--N--L--G--A--V--M--E--T--E--G--F--N--Y- 340
1021 TTG GAG GAG ACA TGC CCG TCC CTG CTA TCT GAC TTG TTA GCT ACT GTC GCA GTA GTG GAT 1080
1021 TTGGAGGAGACATGCCCGTCCCTGCTATCTGACTTGTTAGCTACTGTCGCAGTAGTGGAT 1080
341 -L--E--E--T--C--P--S--L--L--S--D--L--L--A--T--V--A--V--V--D- 360
1081 GAT GAT GCT GCG TCA TTC AAC CGG AAG AGG GGA GTC GGT GGT AAC GAA GGA GCG AAT CCT 1140
1081 GATGATGCTGCGTCATTCAACCGGAAGAGGGGAGTCGGTGGTAACGAAGGAGCGAATCCT 1140
361 -D--D--A--A--S--F--N--R--K--R--G--V--G--G--N--E--G--A--N--P- 380
1141 GTG GAG AGC GTG GAG GCT AGT GAT AGG CGC ATC CGC AGG AGG GTT TAG 1188
1141 GTGGAGAGCGTGGAGGCTAGTGATAGGCGCATCCGCAGGAGGGTTTAG 1188
381 -V--E--S--V--E--A--S--D--R--R--I--R--R--R--V--*- 395
.
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use