Transcript: ORGLA05G0007500.1
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- ORGLA05G0007500.1 1161 386aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 TGG CTT CTT CCT CCC CTT CCT CCT CCT CCT CCC CCC CCT TCC GCC GCC GGT GCC TCC TCC 60
1 TGGCTTCTTCCTCCCCTTCCTCCTCCTCCTCCCCCCCCTTCCGCCGCCGGTGCCTCCTCC 60
1 -W--L--L--P--P--L--P--P--P--P--P--P--P--S--A--A--G--A--S--S- 20
61 TAC TGG TGC TAC AGC TGC GAC CGC TTC GTG CGC GCC CCC GCC CCC CAC GAC GAC TCC GCC 120
61 TACTGGTGCTACAGCTGCGACCGCTTCGTGCGCGCCCCCGCCCCCCACGACGACTCCGCC 120
21 -Y--W--C--Y--S--C--D--R--F--V--R--A--P--A--P--H--D--D--S--A- 40
121 GTC GCC TGC CCG GAC TGC GGC GGC GGC TTC CTC GAG GAG ATG AGC GCG CCC CCG CCG C NN 180
121 GTCGCCTGCCCGGACTGCGGCGGCGGCTTCCTCGAGGAGATGAGCGCGCCCCCGCCGCNN 180
41 -V--A--C--P--D--C--G--G--G--F--L--E--E--M--S--A--P--P--P--X- 60
NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
61 -X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X- 80
NNN NNN NNN GCG GCG GCG GCG GCG GCC GGC GAC CGC TCG CCG TTC AAC CCC GTC ATC GTG 232
NNNNNNNNNGCGGCGGCGGCGGCGGCCGGCGACCGCTCGCCGTTCAACCCCGTCATCGTG 232
81 -X--X--X--A--A--A--A--A--A--G--D--R--S--P--F--N--P--V--I--V- 100
233 CTT CGC CGC TCC CCC GCC GCC GCC GGC GAC GAC GAC TCC CTC GCC GCC GCC ACC AGC TTC 292
233 CTTCGCCGCTCCCCCGCCGCCGCCGGCGACGACGACTCCCTCGCCGCCGCCACCAGCTTC 292
101 -L--R--R--S--P--A--A--A--G--D--D--D--S--L--A--A--A--T--S--F- 120
293 GAG CTC TTC TAC GAC GAC GGC GCG GGC TCC GGC CTC CGC CCG CTC CCG GAG ACC ATG TCG 352
293 GAGCTCTTCTACGACGACGGCGCGGGCTCCGGCCTCCGCCCGCTCCCGGAGACCATGTCG 352
121 -E--L--F--Y--D--D--G--A--G--S--G--L--R--P--L--P--E--T--M--S- 140
353 GAC TTC CTC ATG GGC TCC GGC TTC GAG CGC CTC CTC GAC CAG CTC ACC CAG ATC GAG GCC 412
353 GACTTCCTCATGGGCTCCGGCTTCGAGCGCCTCCTCGACCAGCTCACCCAGATCGAGGCC 412
141 -D--F--L--M--G--S--G--F--E--R--L--L--D--Q--L--T--Q--I--E--A- 160
413 GGC GGC CTC GCC CGC GCC AGG GAG AAC CCA CCG GCC TCC AAG GCC TCC GTC GAG TCC ATG 472
413 GGCGGCCTCGCCCGCGCCAGGGAGAACCCACCGGCCTCCAAGGCCTCCGTCGAGTCCATG 472
161 -G--G--L--A--R--A--R--E--N--P--P--A--S--K--A--S--V--E--S--M- 180
473 CCC ACC GTC ACC ATC GCC GCC TCC CAC GTC GGC GCA GAC TCC CAC TGC GCC GTC TGC AAG 532
473 CCCACCGTCACCATCGCCGCCTCCCACGTCGGCGCAGACTCCCACTGCGCCGTCTGCAAG 532
181 -P--T--V--T--I--A--A--S--H--V--G--A--D--S--H--C--A--V--C--K- 200
533 GAG CCC TTC GAG CTC GGC GAC GAG GCC AGG GAG ATG CCC TGC AGC CAC ATC TAC CAC CAG 592
533 GAGCCCTTCGAGCTCGGCGACGAGGCCAGGGAGATGCCCTGCAGCCACATCTACCACCAG 592
201 -E--P--F--E--L--G--D--E--A--R--E--M--P--C--S--H--I--Y--H--Q- 220
593 GAC TGC ATC CTC CCA TGG CTC GCG CTC CGC AAC TCC TGC CCG GTC TGC CGC CAC GAG ATG 652
593 GACTGCATCCTCCCATGGCTCGCGCTCCGCAACTCCTGCCCGGTCTGCCGCCACGAGATG 652
221 -D--C--I--L--P--W--L--A--L--R--N--S--C--P--V--C--R--H--E--M- 240
653 CCC ACC GAC GCC GCC CGC CCG CGG CCC AGC AAT GCC GGC ACA GAG GAG GAG ACG GTC GGC 712
653 CCCACCGACGCCGCCCGCCCGCGGCCCAGCAATGCCGGCACAGAGGAGGAGACGGTCGGC 712
241 -P--T--D--A--A--R--P--R--P--S--N--A--G--T--E--E--E--T--V--G- 260
713 CTC ACC ATC TGG AGG CTG CCC GGA GGC GGC TTC GCC GTC GGT AGG TTC GCC GGA GGG AGG 772
713 CTCACCATCTGGAGGCTGCCCGGAGGCGGCTTCGCCGTCGGTAGGTTCGCCGGAGGGAGG 772
261 -L--T--I--W--R--L--P--G--G--G--F--A--V--G--R--F--A--G--G--R- 280
773 AGG CCC GAG GAG AGG GAG CTT CCA GTT GTG TAC ACC GAG ATG GAT GGA GGG TTC AAC AAC 832
773 AGGCCCGAGGAGAGGGAGCTTCCAGTTGTGTACACCGAGATGGATGGAGGGTTCAACAAC 832
281 -R--P--E--E--R--E--L--P--V--V--Y--T--E--M--D--G--G--F--N--N- 300
833 GGC GGC GCG CCG AGG AGG ATC TCC TGG GGT TCG AGG CAG AGC CGA TCG ACG GAG AGG AGT 892
833 GGCGGCGCGCCGAGGAGGATCTCCTGGGGTTCGAGGCAGAGCCGATCGACGGAGAGGAGT 892
301 -G--G--A--P--R--R--I--S--W--G--S--R--Q--S--R--S--T--E--R--S- 320
893 GCC ATT AGG CGC ATC TTC CGC AAT GTG TTC TCG TGC TTT GGT CGC AGC CAT TCG TCG AAT 952
893 GCCATTAGGCGCATCTTCCGCAATGTGTTCTCGTGCTTTGGTCGCAGCCATTCGTCGAAT 952
321 -A--I--R--R--I--F--R--N--V--F--S--C--F--G--R--S--H--S--S--N- 340
953 TCT CAG GCC TCG TCT TCG CAT TCG AGG CCG GAG TTG AAC GAT GCG TCT GAC CGG AGC GCC 1012
953 TCTCAGGCCTCGTCTTCGCATTCGAGGCCGGAGTTGAACGATGCGTCTGACCGGAGCGCC 1012
341 -S--Q--A--S--S--S--H--S--R--P--E--L--N--D--A--S--D--R--S--A- 360
1013 GTG TTC AGC CAT GGC TCA AGA AGC CGG AGC ACG AGC TGG AGG CTC GAA GAT GGC CAT GCC 1072
1013 GTGTTCAGCCATGGCTCAAGAAGCCGGAGCACGAGCTGGAGGCTCGAAGATGGCCATGCC 1072
361 -V--F--S--H--G--S--R--S--R--S--T--S--W--R--L--E--D--G--H--A- 380
1073 GAC GCC ATG GTG CAA AGA TAG 1093
1073 GACGCCATGGTGCAAAGATAG 1093
381 -D--A--M--V--Q--R--*- 386
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