Oryza glaberrima (Oryza_glaberrima_V1)
Description

Defective in cullin neddylation protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:I1Q0Z4]

About this transcript

This transcript has 11 exons, is annotated with 11 domains and features and maps to 43 oligo probes.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-ORGLA03G0416800.1753250aa
 
Protein coding
I1Q0Z4 Ensembl Canonical
Codons
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     1 ATGCATAAGCTGGGGAGAGGAAGCCGCGACAAGGTGCAGCAGTTCATGACCATAACTGGT     60
     1 ATGCATAAGCTGGGGAGAGGAAGCCGCGACAAGGTGCAGCAGTTCATGACCATAACTGGT     60
     1 -M--H--K--L--G--R--G--S--R--D--K--V--Q--Q--F--M--T--I--T--G-     20

                                                                          
    61 GCGAGTGAGAAGGTCGCCCTTCAGGCCCTGAAAGCTAGTGATTGGCACTTGGAAGGAGCT    120
    61 GCGAGTGAGAAGGTCGCCCTTCAGGCCCTGAAAGCTAGTGATTGGCACTTGGAAGGAGCT    120
    21 -A--S--E--K--V--A--L--Q--A--L--K--A--S--D--W--H--L--E--G--A-     40

                                                                          
   121 TTTGATTTTTTCTACAGCCAACCACAAATTTCTCTAACGAACTCTCGGCATCTTGAAGAT    180
   121 TTTGATTTTTTCTACAGCCAACCACAAATTTCTCTAACGAACTCTCGGCATCTTGAAGAT    180
    41 -F--D--F--F--Y--S--Q--P--Q--I--S--L--T--N--S--R--H--L--E--D-     60

                                                                          
   181 CTGTACAACAGATACAAAGAACCTGATGTTGATATGATCATGGTGGAAGGTGTATCTCAG    240
   181 CTGTACAACAGATACAAAGAACCTGATGTTGATATGATCATGGTGGAAGGTGTATCTCAG    240
    61 -L--Y--N--R--Y--K--E--P--D--V--D--M--I--M--V--E--G--V--S--Q-     80

                                                                          
   241 TTTTGCACTGATCTTCAGGTGGATCCCCAGGATATTGTTATGCTTGTCATATCATGGCAC    300
   241 TTTTGCACTGATCTTCAGGTGGATCCCCAGGATATTGTTATGCTTGTCATATCATGGCAC    300
    81 -F--C--T--D--L--Q--V--D--P--Q--D--I--V--M--L--V--I--S--W--H-    100

                                                                          
   301 ATGAAAGCTGCCACAATGTGTGAATTTACTCGCCAGGAATTCATTGGTGGACTGCAGTCA    360
   301 ATGAAAGCTGCCACAATGTGTGAATTTACTCGCCAGGAATTCATTGGTGGACTGCAGTCA    360
   101 -M--K--A--A--T--M--C--E--F--T--R--Q--E--F--I--G--G--L--Q--S-    120

                                                                          
   361 ATTGGGGTGGATTCAATTGAAAAGCTCCGTGAGAAATTGCCATCTTTACGGGCTGAGATA    420
   361 ATTGGGGTGGATTCAATTGAAAAGCTCCGTGAGAAATTGCCATCTTTACGGGCTGAGATA    420
   121 -I--G--V--D--S--I--E--K--L--R--E--K--L--P--S--L--R--A--E--I-    140

                                                                          
   421 AAAGATGACCATAAATTCCGTGAGATATACAACTTTGCTTTTGCTTGGGCTAGGGAAAAG    480
   421 AAAGATGACCATAAATTCCGTGAGATATACAACTTTGCTTTTGCTTGGGCTAGGGAAAAG    480
   141 -K--D--D--H--K--F--R--E--I--Y--N--F--A--F--A--W--A--R--E--K-    160

                                                                          
   481 GGTCAAAAATCTCTCGGACTGGAGACTGCTCTTGGAATGTGGCAGTTGCTCTTTGCTGAA    540
   481 GGTCAAAAATCTCTCGGACTGGAGACTGCTCTTGGAATGTGGCAGTTGCTCTTTGCTGAA    540
   161 -G--Q--K--S--L--G--L--E--T--A--L--G--M--W--Q--L--L--F--A--E-    180

                                                                          
   541 AGGCACTGGCCCCTTATCGACCATTGGTGCCAGTTTTTACAGGTGAGGCATAATAAAGCC    600
   541 AGGCACTGGCCCCTTATCGACCATTGGTGCCAGTTTTTACAGGTGAGGCATAATAAAGCC    600
   181 -R--H--W--P--L--I--D--H--W--C--Q--F--L--Q--V--R--H--N--K--A-    200

                                                                          
   601 ATTTCTAGGGACACATGGTCTCAACTGTTGGAATTTGTCAAGACGATCGATCCACAGTTA    660
   601 ATTTCTAGGGACACATGGTCTCAACTGTTGGAATTTGTCAAGACGATCGATCCACAGTTA    660
   201 -I--S--R--D--T--W--S--Q--L--L--E--F--V--K--T--I--D--P--Q--L-    220

                                                                          
   661 TCCAACTACGACGAAGAAGGTGCTTGGCCCTACCTAATAGATGAATTTGTGGAGTACCTA    720
   661 TCCAACTACGACGAAGAAGGTGCTTGGCCCTACCTAATAGATGAATTTGTGGAGTACCTA    720
   221 -S--N--Y--D--E--E--G--A--W--P--Y--L--I--D--E--F--V--E--Y--L-    240

                                                                          
   721 ACCGAGAATGGATTCGTTCAGCTTAGGAAGTGA                               753
   721 ACCGAGAATGGATTCGTTCAGCTTAGGAAGTGA                               753
   241 -T--E--N--G--F--V--Q--L--R--K--*-                               250