Oryza glaberrima (Oryza_glaberrima_V1)
Description

MIEL1 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT5G18650) UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178UJV2]

Location
About this transcript

This transcript has 12 exons, is annotated with 18 domains and features, is associated with 19 variant alleles and maps to 42 oligo probes.

Gene
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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-ORGLA03G0165100.1783260aa
 
Protein coding
I1PBA5 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
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Variants
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Other
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Markup
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     1 ATGGAGCTCGACGACGCGTCTCGCCACGGATTCGGCAGGATGGGATTTGGATGCAAGCAC     60
     1 ATGGAGCTCGACGACGCGTCTCGCCACGGATTCGGCAGGATGGGATTTGGATGCAAGCAC     60
     1 -M--E--L--D--D--A--S--R--H--G--F--G--R--M--G--F--G--C--K--H-     20

                                                                          
    61 TACAGGAGGAGGTGCAGGATCCGGGCGCCGTGCTGCAACGACGTCTTCCACTGCCGCCAT    120
    61 TACAGGAGGAGGTGCAGGATCCGGGCGCCGTGCTGCAACGACGTCTTCCACTGCCGCCAT    120
    21 -Y--R--R--R--C--R--I--R--A--P--C--C--N--D--V--F--H--C--R--H-     40

                                                                          
   121 TGCCACAACGAGTCCACGAAAGACGGCCACGAGCTCGATCGGCACGCGGTTGAATCGGTT    180
   121 TGCCACAACGAGTCCACGAAAGACGGCCACGAGCTCGATCGGCACGCGGTTGAATCGGTT    180
    41 -C--H--N--E--S--T--K--D--G--H--E--L--D--R--H--A--V--E--S--V-     60

                                                                          
   181 ATCTGTCTCGTCTGTGACACCGAGCAGCCGGTTGCGCAAGTGTGCTACAACTGCGGCGTT    240
   181 ATCTGTCTCGTCTGTGACACCGAGCAGCCGGTTGCGCAAGTGTGCTACAACTGCGGCGTT    240
    61 -I--C--L--V--C--D--T--E--Q--P--V--A--Q--V--C--Y--N--C--G--V-     80

                                                                          
   241 TGCATGGGCGAGTACTTCTGCAGCGCGTGCAAATTCTTCGACGACGACGTTGACAGGGAA    300
   241 TGCATGGGCGAGTACTTCTGCAGCGCGTGCAAATTCTTCGACGACGACGTTGACAGGGAA    300
    81 -C--M--G--E--Y--F--C--S--A--C--K--F--F--D--D--D--V--D--R--E-    100

                                                                          
   301 CACTTCCACTGCCAAGATTGCGGCATCTGCAGAGTTGGAGGGAAGGATAACTTCTTCCAC    360
   301 CACTTCCACTGCCAAGATTGCGGCATCTGCAGAGTTGGAGGGAAGGATAACTTCTTCCAC    360
   101 -H--F--H--C--Q--D--C--G--I--C--R--V--G--G--K--D--N--F--F--H-    120

                                                                          
   361 TGCGAAAAATGTGGATCATGCTACTCGGTCAGCCTGCGCGACAAGCACTGCTGCATCGAG    420
   361 TGCGAAAAATGTGGATCATGCTACTCGGTCAGCCTGCGCGACAAGCACTGCTGCATCGAG    420
   121 -C--E--K--C--G--S--C--Y--S--V--S--L--R--D--K--H--C--C--I--E-    140

                                                                          
   421 AACTCCATGAAGAACAACTGCCCCATCTGTTACGAGTATCTGTTTGACTCTCTAAGGGAG    480
   421 AACTCCATGAAGAACAACTGCCCCATCTGTTACGAGTATCTGTTTGACTCTCTAAGGGAG    480
   141 -N--S--M--K--N--N--C--P--I--C--Y--E--Y--L--F--D--S--L--R--E-    160

                                                                          
   481 ACGTCCGTGCTCAGATGTGGGCACACGATGCACCTGCAATGCTTCCACGAGATGCTGAAG    540
   481 ACGTCCGTGCTCAGATGTGGGCACACGATGCACCTGCAATGCTTCCACGAGATGCTGAAG    540
   161 -T--S--V--L--R--C--G--H--T--M--H--L--Q--C--F--H--E--M--L--K-    180

                                                                          
   541 CACGACAAGTTCTCTTGTCCCATATGCTCGATGCCTATCTTTGACATGGACAAGTTCTTG    600
   541 CACGACAAGTTCTCTTGTCCCATATGCTCGATGCCTATCTTTGACATGGACAAGTTCTTG    600
   181 -H--D--K--F--S--C--P--I--C--S--M--P--I--F--D--M--D--K--F--L-    200

                                                                          
   601 AGGGCTTTGGACGCTGAGATTGAAGCAAATATGCTGCACATAGATTACATGGGAAAGGGA    660
   601 AGGGCTTTGGACGCTGAGATTGAAGCAAATATGCTGCACATAGATTACATGGGAAAGGGA    660
   201 -R--A--L--D--A--E--I--E--A--N--M--L--H--I--D--Y--M--G--K--G-    220

                                                                          
   661 TGGATCGTGTGCAACGACTGCAGGGACACGACGCAGGTGTACGCGAGGGTGGCAGGGCAC    720
   661 TGGATCGTGTGCAACGACTGCAGGGACACGACGCAGGTGTACGCGAGGGTGGCAGGGCAC    720
   221 -W--I--V--C--N--D--C--R--D--T--T--Q--V--Y--A--R--V--A--G--H-    240

                                                                          
   721 AAGTGCTGCCATTGCCAGTCTCACAACACCTGCAGGGTGGCTGCCCCGGTGCTCCCTGCT    780
   721 AAGTGCTGCCATTGCCAGTCTCACAACACCTGCAGGGTGGCTGCCCCGGTGCTCCCTGCT    780
   241 -K--C--C--H--C--Q--S--H--N--T--C--R--V--A--A--P--V--L--P--A-    260

                                                                          
   781 TAA                                                             783
   781 TAA                                                             783
       -*-                                                             260