Transcript: ORGLA03G0165100.1
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Description
MIEL1 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT5G18650) UniProtKB/TrEMBL;Acc:A0A178UJV2]
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- ORGLA03G0165100.1 783 260aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
I1PBA5 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG GAG CTC GAC GAC GCG TCT CGC CAC GGA TTC GGC AGG ATG GGA TTT GG A TGC AAG CAC 60
1 ATGGAGCTCGACGACGCGTCTCGCCACGGATTCGGCAGGATGGGATTTGGATGCAAGCAC 60
1 -M--E--L--D--D--A--S--R--H--G--F--G--R--M--G--F--G--C--K--H- 20
61 TAC AGG AGG AGG TGC AGG ATC CGG GCG CCG TGC TGC AAC GAC GTC TTC CAC TGC CGC CAT 120
61 TACAGGAGGAGGTGCAGGATCCGGGCGCCGTGCTGCAACGACGTCTTCCACTGCCGCCAT 120
21 -Y--R--R--R--C--R--I--R--A--P--C--C--N--D--V--F--H--C--R--H- 40
121 TGC CAC AAC GAG TCC ACG A AA GAC GGC CAC GAG CTC GAT CGG CAC GCG GTT GAA TCG GTT 180
121 TGCCACAACGAGTCCACGAAAGACGGCCACGAGCTCGATCGGCACGCGGTTGAATCGGTT 180
41 -C--H--N--E--S--T--K--D--G--H--E--L--D--R--H--A--V--E--S--V- 60
181 ATC TGT CTC GTC TGT GAC ACC GAG CAG CCG GTT GCG CAA GTG TGC TAC AAC TGC GGC GTT 240
181 ATCTGTCTCGTCTGTGACACCGAGCAGCCGGTTGCGCAAGTGTGCTACAACTGCGGCGTT 240
61 -I--C--L--V--C--D--T--E--Q--P--V--A--Q--V--C--Y--N--C--G--V- 80
241 TGC ATG GGC GAG TAC TTC TGC AGC GCG TGC AAA TTC TTC GAC GAC GAC G TT GAC AGG GAA 300
241 TGCATGGGCGAGTACTTCTGCAGCGCGTGCAAATTCTTCGACGACGACGTTGACAGGGAA 300
81 -C--M--G--E--Y--F--C--S--A--C--K--F--F--D--D--D--V--D--R--E- 100
301 CAC TTC CAC TGC CAA GAT TGC GGC ATC TGC AG A GTT GGA GGG AAG GAT AAC TTC TTC CAC 360
301 CACTTCCACTGCCAAGATTGCGGCATCTGCAGAGTTGGAGGGAAGGATAACTTCTTCCAC 360
101 -H--F--H--C--Q--D--C--G--I--C--R--V--G--G--K--D--N--F--F--H- 120
361 TGC GAA AAA TGT G GA TCA TGC TAC TCG GTC AGC CTG CGC GAC AAG CAC TGC TGC ATC GAG 420
361 TGCGAAAAATGTGGATCATGCTACTCGGTCAGCCTGCGCGACAAGCACTGCTGCATCGAG 420
121 -C--E--K--C--G--S--C--Y--S--V--S--L--R--D--K--H--C--C--I--E- 140
421 AAC TCC ATG AAG AAC AAC TGC CCC ATC TGT TAC GAG T AT CTG TTT GAC TCT CTA AGG GAG 480
421 AACTCCATGAAGAACAACTGCCCCATCTGTTACGAGTATCTGTTTGACTCTCTAAGGGAG 480
141 -N--S--M--K--N--N--C--P--I--C--Y--E--Y--L--F--D--S--L--R--E- 160
481 ACG TCC GTG CTC AGA TGT GGG CAC ACG ATG CAC CTG CAA TGC TTC CAC GAG ATG CTG AAG 540
481 ACGTCCGTGCTCAGATGTGGGCACACGATGCACCTGCAATGCTTCCACGAGATGCTGAAG 540
161 -T--S--V--L--R--C--G--H--T--M--H--L--Q--C--F--H--E--M--L--K- 180
541 CAC GAC AA G TTC TCT TGT CCC ATA TGC TCG ATG CCT ATC TTT GAC ATG GAC AAG TTC TTG 600
541 CACGACAAGTTCTCTTGTCCCATATGCTCGATGCCTATCTTTGACATGGACAAGTTCTTG 600
181 -H--D--K--F--S--C--P--I--C--S--M--P--I--F--D--M--D--K--F--L- 200
601 AGG GCT TTG GAC GCT GAG A TT GAA GCA AAT ATG CTG CAC ATA GAT TAC ATG GGA AAG GGA 660
601 AGGGCTTTGGACGCTGAGATTGAAGCAAATATGCTGCACATAGATTACATGGGAAAGGGA 660
201 -R--A--L--D--A--E--I--E--A--N--M--L--H--I--D--Y--M--G--K--G- 220
661 TGG ATC GTG TGC AAC GAC TGC AGG GAC ACG ACG CAG GTG TAC GCG AGG GTG GCA GGG CAC 720
661 TGGATCGTGTGCAACGACTGCAGGGACACGACGCAGGTGTACGCGAGGGTGGCAGGGCAC 720
221 -W--I--V--C--N--D--C--R--D--T--T--Q--V--Y--A--R--V--A--G--H- 240
721 AAG TGC TGC CAT TGC CAG TCT CAC AAC ACC TGC AGG GTG GCT GCC CCG GTG CTC CCT GCT 780
721 AAGTGCTGCCATTGCCAGTCTCACAACACCTGCAGGGTGGCTGCCCCGGTGCTCCCTGCT 780
241 -K--C--C--H--C--Q--S--H--N--T--C--R--V--A--A--P--V--L--P--A- 260
781 TAA 783
781 TAA 783
-*- 260
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