Transcript: ORGLA02G0161800.1
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Description
DNA/RNA helicase protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT5G22750) TAIR;Acc:AT5G22750]
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- ORGLA02G0161800.1 3093 1030aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
I1P0W2 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG GGG AAG GAG AGG GGA AGG GAG GAG CAG GTG GCG ACG GTG CGC GCG GTG CTC GGC GAT 60
1 ATGGGGAAGGAGAGGGGAAGGGAGGAGCAGGTGGCGACGGTGCGCGCGGTGCTCGGCGAT 60
1 -M--G--K--E--R--G--R--E--E--Q--V--A--T--V--R--A--V--L--G--D- 20
61 GGG ACG CCG GAG ATG GAC ATC ATC CGC GCG CTC CAC ATG GCC GGC GAC GAC CCC ACC AGG 120
61 GGGACGCCGGAGATGGACATCATCCGCGCGCTCCACATGGCCGGCGACGACCCCACCAGG 120
21 -G--T--P--E--M--D--I--I--R--A--L--H--M--A--G--D--D--P--T--R- 40
121 GCC ATC AAC ATC CTC CTC GAC TTC ACC CAC GGG CCG CCA CCG CCG CCG CCG CCG TCA CCG 180
121 GCCATCAACATCCTCCTCGACTTCACCCACGGGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGTCACCG 180
41 -A--I--N--I--L--L--D--F--T--H--G--P--P--P--P--P--P--P--S--P- 60
181 TCG CCG TCG CCA TCG CCT CCG GCG GGT AAA CCC ACC AAA CCA CAC CCC GAA TCG ACC CCG 240
181 TCGCCGTCGCCATCGCCTCCGGCGGGTAAACCCACCAAACCACACCCCGAATCGACCCCG 240
61 -S--P--S--P--S--P--P--A--G--K--P--T--K--P--H--P--E--S--T--P- 80
241 CCA ACC AAA ACC CCT GCC CGT TCG AAT CCG GCG GCG GCG GCG GCG GCA GAG AAA CCT AGG 300
241 CCAACCAAAACCCCTGCCCGTTCGAATCCGGCGGCGGCGGCGGCGGCAGAGAAACCTAGG 300
81 -P--T--K--T--P--A--R--S--N--P--A--A--A--A--A--A--E--K--P--R- 100
301 CCC AGT GTC GCG CCC GAA TCC ACC AAT GGT GGC GGC GGC GGC GGC GAA CAT TGG TGG TTG 360
301 CCCAGTGTCGCGCCCGAATCCACCAATGGTGGCGGCGGCGGCGGCGAACATTGGTGGTTG 360
101 -P--S--V--A--P--E--S--T--N--G--G--G--G--G--G--E--H--W--W--L- 120
361 GTG GGG AGC GTG GAG ATG GCG GGG CTG TCC ACG TGC AAG GGC CGG CGC GTT GCC TCC GGG 420
361 GTGGGGAGCGTGGAGATGGCGGGGCTGTCCACGTGCAAGGGCCGGCGCGTTGCCTCCGGG 420
121 -V--G--S--V--E--M--A--G--L--S--T--C--K--G--R--R--V--A--S--G- 140
421 GAT GCC GTC ACT TTC TCG TTC CCC AAC TCC CCG GTC GCC GCC GCC GCC GGG GGC AAG AGC 480
421 GATGCCGTCACTTTCTCGTTCCCCAACTCCCCGGTCGCCGCCGCCGCCGGGGGCAAGAGC 480
141 -D--A--V--T--F--S--F--P--N--S--P--V--A--A--A--A--G--G--K--S- 160
481 CGT TCC GGC CGC CCC GCC CTC GTT TCC TGC TCC TCC GAG ATC ATG CGC TTC TCC ACC CCG 540
481 CGTTCCGGCCGCCCCGCCCTCGTTTCCTGCTCCTCCGAGATCATGCGCTTCTCCACCCCG 540
161 -R--S--G--R--P--A--L--V--S--C--S--S--E--I--M--R--F--S--T--P- 180
541 CGC CAT GGG GAG GTC GGT CGA ATC CCC AAT GAA TGG GCG AGG TGC CTG CTC CCC CTT CTC 600
541 CGCCATGGGGAGGTCGGTCGAATCCCCAATGAATGGGCGAGGTGCCTGCTCCCCCTTCTC 600
181 -R--H--G--E--V--G--R--I--P--N--E--W--A--R--C--L--L--P--L--L- 200
601 AAG GAG GGG AAG ATA AAA ATC GAT GGC GTA TGC AAA TCC GCT CCC GAA GTA CTT AGC ATC 660
601 AAGGAGGGGAAGATAAAAATCGATGGCGTATGCAAATCCGCTCCCGAAGTACTTAGCATC 660
201 -K--E--G--K--I--K--I--D--G--V--C--K--S--A--P--E--V--L--S--I- 220
661 ATG GAC ACT GTC CTC TTG TCC GTA AG T GTC TAC ATC AAC AGC TCA ATG TTT CAT GGC CAA 720
661 ATGGACACTGTCCTCTTGTCCGTAAGTGTCTACATCAACAGCTCAATGTTTCATGGCCAA 720
221 -M--D--T--V--L--L--S--V--S--V--Y--I--N--S--S--M--F--H--G--Q- 240
721 AAG CAA TCG ACA CCC AAG GCT GCT CGG GCT GCT ACC GAG GAT TCC ACG TTT CAT CCG CTG 780
721 AAGCAATCGACACCCAAGGCTGCTCGGGCTGCTACCGAGGATTCCACGTTTCATCCGCTG 780
241 -K--Q--S--T--P--K--A--A--R--A--A--T--E--D--S--T--F--H--P--L- 260
781 CCT GCA CTT TTC AAG TTA ACT GGT CTT TCG CCC TTT AAG AAG GCA GCA TTT ACT CCA GAA 840
781 CCTGCACTTTTCAAGTTAACTGGTCTTTCGCCCTTTAAGAAGGCAGCATTTACTCCAGAA 840
261 -P--A--L--F--K--L--T--G--L--S--P--F--K--K--A--A--F--T--P--E- 280
841 GAT CTC TAT TCC AGA AAG CGT CCG CTT GAA ACA AAG AGC AGT GCA CCT GCC ACA AAG TTG 900
841 GATCTCTATTCCAGAAAGCGTCCGCTTGAAACAAAGAGCAGTGCACCTGCCACAAAGTTG 900
281 -D--L--Y--S--R--K--R--P--L--E--T--K--S--S--A--P--A--T--K--L- 300
901 ACT ACT GAG AAG TTG AGA TTA TCG TCT GAT GGA AAC GAA GAT GAT CAT GCT GAA AGA ATT 960
901 ACTACTGAGAAGTTGAGATTATCGTCTGATGGAAACGAAGATGATCATGCTGAAAGAATT 960
301 -T--T--E--K--L--R--L--S--S--D--G--N--E--D--D--H--A--E--R--I- 320
961 GTT TCA GAT TCA GAA TTG GAT GAT ATA ATT GGA ATC TCA GAC AGT TCT GCT TTG GAG G AA 1020
961 GTTTCAGATTCAGAATTGGATGATATAATTGGAATCTCAGACAGTTCTGCTTTGGAGGAA 1020
321 -V--S--D--S--E--L--D--D--I--I--G--I--S--D--S--S--A--L--E--E- 340
1021 AGG GAC CCC CCT GAT GCT CTG CAG TGT GAT TTA CGC CCT TAT CAG AAG CAG GCA CTT TAT 1080
1021 AGGGACCCCCCTGATGCTCTGCAGTGTGATTTACGCCCTTATCAGAAGCAGGCACTTTAT 1080
341 -R--D--P--P--D--A--L--Q--C--D--L--R--P--Y--Q--K--Q--A--L--Y- 360
1081 TGG ATG ATG CAG CTT GAG AAA GGC AGT TCT TCT CAG GAT GCA GCT ACA ACG CTG CAC CCT 1140
1081 TGGATGATGCAGCTTGAGAAAGGCAGTTCTTCTCAGGATGCAGCTACAACGCTGCACCCT 1140
361 -W--M--M--Q--L--E--K--G--S--S--S--Q--D--A--A--T--T--L--H--P- 380
1141 TGT TGG GAG GCA TAT AAA CTC GAG GAC AA G AGG GAG CTT GTT TTA TAC TTG AAT GTA TTT 1200
1141 TGTTGGGAGGCATATAAACTCGAGGACAAGAGGGAGCTTGTTTTATACTTGAATGTATTT 1200
381 -C--W--E--A--Y--K--L--E--D--K--R--E--L--V--L--Y--L--N--V--F- 400
1201 TCA GGC GAT GCC ACC ACT GAA TTT CCT AGT ACA CTG CAA CTT GCA AGA GGA GGG ATT CTG 1260
1201 TCAGGCGATGCCACCACTGAATTTCCTAGTACACTGCAACTTGCAAGAGGAGGGATTCTG 1260
401 -S--G--D--A--T--T--E--F--P--S--T--L--Q--L--A--R--G--G--I--L- 420
1261 GCA GAT GCA ATG GGA CTG GGG AAG ACT ATT ATG ACA ATA GCT CTT CTT CTT GCC GAC TCT 1320
1261 GCAGATGCAATGGGACTGGGGAAGACTATTATGACAATAGCTCTTCTTCTTGCCGACTCT 1320
421 -A--D--A--M--G--L--G--K--T--I--M--T--I--A--L--L--L--A--D--S- 440
1321 AGC AAA GGA TGC ATC ACT ACT CAG CAT TCT ACT CAC ATA TGT GAA GAA GCT AGT GGA CTG 1380
1321 AGCAAAGGATGCATCACTACTCAGCATTCTACTCACATATGTGAAGAAGCTAGTGGACTG 1380
441 -S--K--G--C--I--T--T--Q--H--S--T--H--I--C--E--E--A--S--G--L- 460
1381 GGT GAA TTG CCA ATT CAG CCT CAT GAT GAT GTG AAG AAG CTA GCT ATC CCT TTC TCT TTT 1440
1381 GGTGAATTGCCAATTCAGCCTCATGATGATGTGAAGAAGCTAGCTATCCCTTTCTCTTTT 1440
461 -G--E--L--P--I--Q--P--H--D--D--V--K--K--L--A--I--P--F--S--F- 480
1441 AGT AAG CTT AGG AAA CCT AAA ACC CCG CTT ATT GCA GGC GGC AAT CTA ATT GTC TGC CCA 1500
1441 AGTAAGCTTAGGAAACCTAAAACCCCGCTTATTGCAGGCGGCAATCTAATTGTCTGCCCA 1500
481 -S--K--L--R--K--P--K--T--P--L--I--A--G--G--N--L--I--V--C--P- 500
1501 ATG ACA CTA CTT GGT CAG TGG AAG G CA GAA ATT GAA GCT CAT GCT ACA CCA GGT TCT GTA 1560
1501 ATGACACTACTTGGTCAGTGGAAGGCAGAAATTGAAGCTCATGCTACACCAGGTTCTGTA 1560
501 -M--T--L--L--G--Q--W--K--A--E--I--E--A--H--A--T--P--G--S--V- 520
1561 AGT ATA TAT GTT CAT TAT GGG CAA AAC AGA CCA AAA GAA GCA AAC CTT ATT GGT CAG AGT 1620
1561 AGTATATATGTTCATTATGGGCAAAACAGACCAAAAGAAGCAAACCTTATTGGTCAGAGT 1620
521 -S--I--Y--V--H--Y--G--Q--N--R--P--K--E--A--N--L--I--G--Q--S- 540
1621 GAT ATT GTC CTG ACT ACA TAT GGT GTT CTG TCA TCG GAA TTT TCA AAC GAG AAT TCA ACA 1680
1621 GATATTGTCCTGACTACATATGGTGTTCTGTCATCGGAATTTTCAAACGAGAATTCAACA 1680
541 -D--I--V--L--T--T--Y--G--V--L--S--S--E--F--S--N--E--N--S--T- 560
1681 GAA AGT GGG GGT CTG TAC TCT ATA CAT TGG TTT AGA GTT GTG CTG GAT GAA GCA CAC ATG 1740
1681 GAAAGTGGGGGTCTGTACTCTATACATTGGTTTAGAGTTGTGCTGGATGAAGCACACATG 1740
561 -E--S--G--G--L--Y--S--I--H--W--F--R--V--V--L--D--E--A--H--M- 580
1741 ATA AAA TCT CCC AAA AGT TTA ATA TCC CTC GCT GCT GCT GCT CTT ACG GCT GAT CGG CGT 1800
1741 ATAAAATCTCCCAAAAGTTTAATATCCCTCGCTGCTGCTGCTCTTACGGCTGATCGGCGT 1800
581 -I--K--S--P--K--S--L--I--S--L--A--A--A--A--L--T--A--D--R--R- 600
1801 TGG TGT CTT ACT GGT ACA CCT ATT CAG AAC AAC TTG GAG GAT ATA TAC AGC CTT TTC CGG 1860
1801 TGGTGTCTTACTGGTACACCTATTCAGAACAACTTGGAGGATATATACAGCCTTTTCCGG 1860
601 -W--C--L--T--G--T--P--I--Q--N--N--L--E--D--I--Y--S--L--F--R- 620
1861 TTT TTG AGG GTT GAA CCG TGG AGG AAC TGG TCT TT G TGG CAT AAA CTT GTG CAA AAA CCA 1920
1861 TTTTTGAGGGTTGAACCGTGGAGGAACTGGTCTTTGTGGCATAAACTTGTGCAAAAACCA 1920
621 -F--L--R--V--E--P--W--R--N--W--S--L--W--H--K--L--V--Q--K--P- 640
1921 TAT GAA GAA GGC GAT GAA AGA GGT TTA AAG CTA GTA CAG TCC ATT TTG AAG CCA ATA ATG 1980
1921 TATGAAGAAGGCGATGAAAGAGGTTTAAAGCTAGTACAGTCCATTTTGAAGCCAATAATG 1980
641 -Y--E--E--G--D--E--R--G--L--K--L--V--Q--S--I--L--K--P--I--M- 660
1981 TTG AGA AGG AAT AAA AAC AGC ACA GAC AAG GAA GGA AG A CCA ATC CTT ATT TTA CCC CCA 2040
1981 TTGAGAAGGAATAAAAACAGCACAGACAAGGAAGGAAGACCAATCCTTATTTTACCCCCA 2040
661 -L--R--R--N--K--N--S--T--D--K--E--G--R--P--I--L--I--L--P--P- 680
2041 GCA AAT ATC GAA GTC AAA TAC TGT GAT TTG TCA GAG ACT GAG AAG GAT TTC TAT GAT GCT 2100
2041 GCAAATATCGAAGTCAAATACTGTGATTTGTCAGAGACTGAGAAGGATTTCTATGATGCT 2100
681 -A--N--I--E--V--K--Y--C--D--L--S--E--T--E--K--D--F--Y--D--A- 700
2101 CTG TTT CGA CGA TCT AAG GTG AAA TTT GAT CAA TTC GTG GAA CAA GGA AGG GTC TTG CAC 2160
2101 CTGTTTCGACGATCTAAGGTGAAATTTGATCAATTCGTGGAACAAGGAAGGGTCTTGCAC 2160
701 -L--F--R--R--S--K--V--K--F--D--Q--F--V--E--Q--G--R--V--L--H- 720
2161 AAT TAT GCT TCA ATT TTG GAG TTG CTT TTG CGC CTT CGG CAG TGT TGT GAC CAC CCA TTT 2220
2161 AATTATGCTTCAATTTTGGAGTTGCTTTTGCGCCTTCGGCAGTGTTGTGACCACCCATTT 2220
721 -N--Y--A--S--I--L--E--L--L--L--R--L--R--Q--C--C--D--H--P--F- 740
2221 CTT GTT CTT AG T CGT GGA GAT ACA CAG GAG TTT GCT GAC CTA AAC AAA CTT GCA AAG CGT 2280
2221 CTTGTTCTTAGTCGTGGAGATACACAGGAGTTTGCTGACCTAAACAAACTTGCAAAGCGT 2280
741 -L--V--L--S--R--G--D--T--Q--E--F--A--D--L--N--K--L--A--K--R- 760
2281 TTC TTG CAT GGT GGT AAT GGT GCT GTG AAT GGT GAC TCT TCT CTT CCC TCC AGA GCT TAC 2340
2281 TTCTTGCATGGTGGTAATGGTGCTGTGAATGGTGACTCTTCTCTTCCCTCCAGAGCTTAC 2340
761 -F--L--H--G--G--N--G--A--V--N--G--D--S--S--L--P--S--R--A--Y- 780
2341 ATT GAG GAA GTT GTC CAG GAA CTG CAG AAA GGT GAA GGG GAG TGT CCC ATA TGC CTG GAA 2400
2341 ATTGAGGAAGTTGTCCAGGAACTGCAGAAAGGTGAAGGGGAGTGTCCCATATGCCTGGAA 2400
781 -I--E--E--V--V--Q--E--L--Q--K--G--E--G--E--C--P--I--C--L--E- 800
2401 GCC TTT GAG GAT GCT GTA TTG ACT CCC TGT GCT CAC CGT TTA TGC CGA GAA TGT CTC TTG 2460
2401 GCCTTTGAGGATGCTGTATTGACTCCCTGTGCTCACCGTTTATGCCGAGAATGTCTCTTG 2460
801 -A--F--E--D--A--V--L--T--P--C--A--H--R--L--C--R--E--C--L--L- 820
2461 TCT AGT TGG CGG AGT GCA TCA GCA GGC CTT TGT CCT GTC TGT AG A AAG TCT ATG AGC AAG 2520
2461 TCTAGTTGGCGGAGTGCATCAGCAGGCCTTTGTCCTGTCTGTAGAAAGTCTATGAGCAAG 2520
821 -S--S--W--R--S--A--S--A--G--L--C--P--V--C--R--K--S--M--S--K- 840
2521 CAG GAT CTT ATT ACT GCT CCA ACT GAC AAT CGT TTT CAA ATT GAT GTC GAG AAG AAC TGG 2580
2521 CAGGATCTTATTACTGCTCCAACTGACAATCGTTTTCAAATTGATGTCGAGAAGAACTGG 2580
841 -Q--D--L--I--T--A--P--T--D--N--R--F--Q--I--D--V--E--K--N--W- 860
2581 GTT GAG TCT TCC AAG ATT TCT TTC CTT CTA CAG GAG CTA GAA GTT CTT CGC ACT TCT GGT 2640
2581 GTTGAGTCTTCCAAGATTTCTTTCCTTCTACAGGAGCTAGAAGTTCTTCGCACTTCTGGT 2640
861 -V--E--S--S--K--I--S--F--L--L--Q--E--L--E--V--L--R--T--S--G- 880
2641 GCA AAG AGC ATC ATT TTT AGC CAG TGG ACT GCA TTT CTG GAT CTC TTA CAA ATT CCA CTT 2700
2641 GCAAAGAGCATCATTTTTAGCCAGTGGACTGCATTTCTGGATCTCTTACAAATTCCACTT 2700
881 -A--K--S--I--I--F--S--Q--W--T--A--F--L--D--L--L--Q--I--P--L- 900
2701 TCC AG A CAT AAT TTC TCA TTT GCT AGA CTG GAT GGA ACC TTG AAT CTT CAG CAG AGA GAG 2760
2701 TCCAGACATAATTTCTCATTTGCTAGACTGGATGGAACCTTGAATCTTCAGCAGAGAGAG 2760
901 -S--R--H--N--F--S--F--A--R--L--D--G--T--L--N--L--Q--Q--R--E- 920
2761 AAA GTA ATC AAG GAG TTT TCT GAG GAC AAA AGC ATT TTG G TT CTG CTT ATG TCC CTG AAA 2820
2761 AAAGTAATCAAGGAGTTTTCTGAGGACAAAAGCATTTTGGTTCTGCTTATGTCCCTGAAA 2820
921 -K--V--I--K--E--F--S--E--D--K--S--I--L--V--L--L--M--S--L--K- 940
2821 GCT GGT GGT GTT GGA ATA AAC CTA ACT GCT GCA TCT AAT GCA TTT GTC ATG GAT CCT TGG 2880
2821 GCTGGTGGTGTTGGAATAAACCTAACTGCTGCATCTAATGCATTTGTCATGGATCCTTGG 2880
941 -A--G--G--V--G--I--N--L--T--A--A--S--N--A--F--V--M--D--P--W- 960
2881 TGG AAT CCT GCT GTT GAA GAA CAA GCT ATC ATG CGG ATC CAT CGA ATT GGT CAA ACA AAG 2940
2881 TGGAATCCTGCTGTTGAAGAACAAGCTATCATGCGGATCCATCGAATTGGTCAAACAAAG 2940
961 -W--N--P--A--V--E--E--Q--A--I--M--R--I--H--R--I--G--Q--T--K- 980
2941 AGT GTT TCC ATC AAA AGA TTC ATC GTC AAG GGC ACT GTC GAG GAA CGA ATG GAG GCT GTG 3000
2941 AGTGTTTCCATCAAAAGATTCATCGTCAAGGGCACTGTCGAGGAACGAATGGAGGCTGTG 3000
981 -S--V--S--I--K--R--F--I--V--K--G--T--V--E--E--R--M--E--A--V- 1000
3001 CAG GCT CGT AAG CAG CGA ATG ATT TCT GGA GCT TTG ACA GAT CAG GAA GTA CGC AGC GCA 3060
3001 CAGGCTCGTAAGCAGCGAATGATTTCTGGAGCTTTGACAGATCAGGAAGTACGCAGCGCA 3060
1001 -Q--A--R--K--Q--R--M--I--S--G--A--L--T--D--Q--E--V--R--S--A- 1020
3061 CGT ATA GAA GAA CTG AAG ATG CTT TTC TCC TGA 3093
3061 CGTATAGAAGAACTGAAGATGCTTTTCTCCTGA 3093
1021 -R--I--E--E--L--K--M--L--F--S--*- 1030
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