Transcript: ORGLA02G0016300.1
.
Description
ARABIDOPSIS TRITHORAX-RELATED PROTEIN 6 [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT5G24330) TAIR;Acc:AT5G24330]
Show/hide columns (1 hidden)
- ORGLA02G0016300.1 1086 361aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
I1NWQ7 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup Variants are filtered by consequence type ▼ ▲
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup Variants are filtered by consequence type
R
1 A TG GGG CCC GCG ACG CCG CTG CGC CGC CG ACG AGG GCG CGG CCG GCC GCC ACC AGG GCG 60
1 ATGGGGCCCGCGACGCCGCTGCGCCGCCGGACGAGGGCGCGGCCGGCCGCCACCAGGGCG 60
1 -M--G--P--A--T--P--L--R--R--R--T--R--A--R--P--A--A--T--R--A- 20
61 GAG GGC GGC AGC GGC GGC GAC GGC GAC GAC GAC GAC GTT CGC TGC GAG GCG TGC GGG TCC 120
61 GAGGGCGGCAGCGGCGGCGACGGCGACGACGACGACGTTCGCTGCGAGGCGTGCGGGTCC 120
21 -E--G--G--S--G--G--D--G--D--D--D--D--V--R--C--E--A--C--G--S- 40
121 GGG GAG TCG GCG GCG GAG CTG CTG CTG TGC GAT GGC TGC GAC CGT GGC CTC CAC ATC TTC 180
121 GGGGAGTCGGCGGCGGAGCTGCTGCTGTGCGATGGCTGCGACCGTGGCCTCCACATCTTC 180
41 -G--E--S--A--A--E--L--L--L--C--D--G--C--D--R--G--L--H--I--F- 60
181 TGC CTC CGC CCC ATC CTC CCG CGC GTC CCC GCC GGC GAC TGG TTC TGC CCC TCC TGC GCC 240
181 TGCCTCCGCCCCATCCTCCCGCGCGTCCCCGCCGGCGACTGGTTCTGCCCCTCCTGCGCC 240
61 -C--L--R--P--I--L--P--R--V--P--A--G--D--W--F--C--P--S--C--A- 80
241 TCG CCG TCG CCG CAC TCC AAG AAA TCA CAC GCG GCC AAG AAG CCC AAG C AG TTC CCG CTG 300
241 TCGCCGTCGCCGCACTCCAAGAAATCACACGCGGCCAAGAAGCCCAAGCAGTTCCCGCTG 300
81 -S--P--S--P--H--S--K--K--S--H--A--A--K--K--P--K--Q--F--P--L- 100
301 GTC CAG ACG AAG ATC GTG GAT TTC TTC AAG ATC CAG AGG GGC CCG GCG GCG GCG CTG GCG 360
301 GTCCAGACGAAGATCGTGGATTTCTTCAAGATCCAGAGGGGCCCGGCGGCGGCGCTGGCG 360
101 -V--Q--T--K--I--V--D--F--F--K--I--Q--R--G--P--A--A--A--L--A- 120
Y Y
361 GCG GCG GCG GAG TCG TCG GAG GGG AAG AAG AGG AAG CGG AAG G G GGT GGC AT CGC TTG 420
361 GCGGCGGCGGAGTCGTCGGAGGGGAAGAAGAGGAAGCGGAAGGCGGGTGGCATTCGCTTG 420
121 -A--A--A--E--S--S--E--G--K--K--R--K--R--K- -A- -G--G--I--R--L- 140
421 GTC TCC AAG AAG AAG AGG AAG CTT CTC CCC TTC AAC CCC AGC GAC GAC CCG GCG AGG CGC 480
421 GTCTCCAAGAAGAAGAGGAAGCTTCTCCCCTTCAACCCCAGCGACGACCCGGCGAGGCGC 480
141 -V--S--K--K--K--R--K--L--L--P--F--N--P--S--D--D--P--A--R--R- 160
Y
481 CTC CGC CAG ATG GCG TCG CTC GCC ACG GCG CT ACC GCC ACC GGC GCC GTC TTC AGC AAC 540
481 CTCCGCCAGATGGCGTCGCTCGCCACGGCGCTCACCGCCACCGGCGCCGTCTTCAGCAAC 540
161 -L--R--Q--M--A--S--L--A--T--A--L--T--A--T--G--A--V--F--S--N- 180
K
541 GAG CTC ACC TAC GTC CCC GGC ATG GC CCC CGC GCC GCC AAC CGC GCC GCC CTC GAA TCC 600
541 GAGCTCACCTACGTCCCCGGCATGGCGCCCCGCGCCGCCAACCGCGCCGCCCTCGAATCC 600
181 -E--L--T--Y--V--P--G--M--A--P--R--A--A--N--R--A--A--L--E--S- 200
601 GGC GGA ATG CAG G TG CTA CCA AAG GAG GAC GTC GAG ACG CTG AAT CTG TGC AAG AGG ATG 660
601 GGCGGAATGCAGGTGCTACCAAAGGAGGACGTCGAGACGCTGAATCTGTGCAAGAGGATG 660
201 -G--G--M--Q--V--L--P--K--E--D--V--E--T--L--N--L--C--K--R--M- 220
S
661 ATG GCG AGA GGC GAG TGG CCG CCT CTC CTC GTC GT TAC GAC CCC GTC GAG GGG TTC ACC 720
661 ATGGCGAGAGGCGAGTGGCCGCCTCTCCTCGTCGTCTACGACCCCGTCGAGGGGTTCACC 720
221 -M--A--R--G--E--W--P--P--L--L--V--V--Y--D--P--V--E--G--F--T- 240
721 GTG GAG GCG GAC AGG TTC ATC AAG GAT CTC ACC ATC ATC ACC GAG TAC GTC GGC GAC GTC 780
721 GTGGAGGCGGACAGGTTCATCAAGGATCTCACCATCATCACCGAGTACGTCGGCGACGTC 780
241 -V--E--A--D--R--F--I--K--D--L--T--I--I--T--E--Y--V--G--D--V- 260
781 GAC TAC CTG ACC CGC CGC GAG CAC GAC GAC GGC GAC AGC ATG ATG ACC CTG CTG TCG GCG 840
781 GACTACCTGACCCGCCGCGAGCACGACGACGGCGACAGCATGATGACCCTGCTGTCGGCG 840
261 -D--Y--L--T--R--R--E--H--D--D--G--D--S--M--M--T--L--L--S--A- 280
R
841 CC ACG CCG TCG AGG AGC CTC GTC ATC TGC CCC GAC AAG CGG AGC AAC ATC GCT CGC TTC 900
841 GCCACGCCGTCGAGGAGCCTCGTCATCTGCCCCGACAAGCGGAGCAACATCGCTCGCTTC 900
281 -A- -T--P--S--R--S--L--V--I--C--P--D--K--R--S--N--I--A--R--F- 300
901 ATC AAT GGC ATC AAC AAC CAC ACT CC A GAT GGC CGG AAG AAG CAG AAT CTC AAG TGC GTC 960
901 ATCAATGGCATCAACAACCACACTCCAGATGGCCGGAAGAAGCAGAATCTCAAGTGCGTC 960
301 -I--N--G--I--N--N--H--T--P--D--G--R--K--K--Q--N--L--K--C--V- 320
R
961 CGC TTC GAC GTC GGC GGC GAG TGC CGG GTG CTC TTG GTG GCG AAC AGG GAC ATC TCC AA 1020
961 CGCTTCGACGTCGGCGGCGAGTGCCGGGTGCTCTTGGTGGCGAACAGGGACATCTCCAAG 1020
321 -R--F--D--V--G--G--E--C--R--V--L--L--V--A--N--R--D--I--S--K- 340
1021 GGG GAG AGG CTG TAC TAC GAT TAC AAT GGA TCG GAG CAT GAG TAC CCA ACC CAC CAT TTT 1080
1021 GGGGAGAGGCTGTACTACGATTACAATGGATCGGAGCATGAGTACCCAACCCACCATTTT 1080
341 -G--E--R--L--Y--Y--D--Y--N--G--S--E--H--E--Y--P--T--H--H--F- 360
1081 GTA TGA 1086
1081 GTATGA 1086
361 -V--*- 361
.
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use