Oryza brachyantha (Oryza_brachyantha.v1.4b)
Description

Ubiquitin-like superfamily protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT2G43210) TAIR;Acc:AT2G43210]

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About this transcript

This transcript has 11 exons and is annotated with 17 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene OB11G17870 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OB11G17870.12056540aa
 
Protein coding
J3N7K1 Ensembl Canonical
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     1 CCCGCGCCACCTCGGCCTCCTCGACATCGAGTCCGTGCTCGTGCCCGCCGCCGCCTGCGC     60
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
    61 CGATCTACATCCATCCCGCCCGTCGTCCTGCCCGATGGAGATGACACTTGATTCCTTGAC    120
       ..................................ATGGAGATGACACTTGATTCCTTGAC     26
       ..................................-M--E--M--T--L--D--S--L--T      9

                                                                          
   121 ATACAAAGGTTCCATTCCAGGTGCAATCAACCAATCAAGAAGGGATAAAAAACTCTTTGT    180
    27 ATACAAAGGTTCCATTCCAGGTGCAATCAACCAATCAAGAAGGGATAAAAAACTCTTTGT     86
     9 --Y--K--G--S--I--P--G--A--I--N--Q--S--R--R--D--K--K--L--F--V     29

                                                                          
   181 TGTGTACATATCAGGTGAAGATGAGGCTTCAAGTAGCTTGGAACAGTCAACACTTGTTAA    240
    87 TGTGTACATATCAGGTGAAGATGAGGCTTCAAGTAGCTTGGAACAGTCAACACTTGTTAA    146
    29 --V--Y--I--S--G--E--D--E--A--S--S--S--L--E--Q--S--T--L--V--N     49

                                                                          
   241 TGAAAGTGTGGCCGAAGTGATAGGCAATTGTTGCATATTCTTGCACCTAAAACAGGGCAA    300
   147 TGAAAGTGTGGCCGAAGTGATAGGCAATTGTTGCATATTCTTGCACCTAAAACAGGGCAA    206
    49 --E--S--V--A--E--V--I--G--N--C--C--I--F--L--H--L--K--Q--G--N     69

                                                                          
   301 TGTTGATGCATCACAATTTTCAGCTATATACCCACAGAAAGCTTTCCCAAGTATATCTGT    360
   207 TGTTGATGCATCACAATTTTCAGCTATATACCCACAGAAAGCTTTCCCAAGTATATCTGT    266
    69 --V--D--A--S--Q--F--S--A--I--Y--P--Q--K--A--F--P--S--I--S--V     89

                                                                          
   361 AATTGGCCTGAATGGAGTTATGCTATGGGGTCATGAGGGATATATTGGCTCGAAAGATCT    420
   267 AATTGGCCTGAATGGAGTTATGCTATGGGGTCATGAGGGATATATTGGCTCGAAAGATCT    326
    89 --I--G--L--N--G--V--M--L--W--G--H--E--G--Y--I--G--S--K--D--L    109

                                                                          
   421 GAAAGAAAATATCGAGAAAGCTTGGGCTACCCTTCATGTACAGGAGACAGCAGCAGCTTT    480
   327 GAAAGAAAATATCGAGAAAGCTTGGGCTACCCTTCATGTACAGGAGACAGCAGCAGCTTT    386
   109 --K--E--N--I--E--K--A--W--A--T--L--H--V--Q--E--T--A--A--A--F    129

                                                                          
   481 TCTAACTGCATCACTTACTTCAAGAATGAATGAACATGTGAATACCAGCTCAACTACTCT    540
   387 TCTAACTGCATCACTTACTTCAAGAATGAATGAACATGTGAATACCAGCTCAACTACTCT    446
   129 --L--T--A--S--L--T--S--R--M--N--E--H--V--N--T--S--S--T--T--L    149

                                                                          
   541 GCCTACTCAAGGAGGCTCATCTGCTGCAGAAAATCCTTCCTCTTCATCAAATCAATCTAC    600
   447 GCCTACTCAAGGAGGCTCATCTGCTGCAGAAAATCCTTCCTCTTCATCAAATCAATCTAC    506
   149 --P--T--Q--G--G--S--S--A--A--E--N--P--S--S--S--S--N--Q--S--T    169

                                                                          
   601 AGGAACTTCTGGACCAAGTGGATTTGCTAATTCTACTGGTTCAGCAGCACAGCCACCTAG    660
   507 AGGAACTTCTGGACCAAGTGGATTTGCTAATTCTACTGGTTCAGCAGCACAGCCACCTAG    566
   169 --G--T--S--G--P--S--G--F--A--N--S--T--G--S--A--A--Q--P--P--R    189

                                                                          
   661 AAGCACGAGCCATGATGAAATTCGGAGGACAAGTGAAAAGGAATGCTCAAATTTAGATTT    720
   567 AAGCACGAGCCATGATGAAATTCGGAGGACAAGTGAAAAGGAATGCTCAAATTTAGATTT    626
   189 --S--T--S--H--D--E--I--R--R--T--S--E--K--E--C--S--N--L--D--L    209

                                                                          
   721 AGGTCCAGGTAATAAAACTGTTAAAGAAAAGCCAGATTCAGATAGTGCCCAAGTAAAAGG    780
   627 AGGTCCAGGTAATAAAACTGTTAAAGAAAAGCCAGATTCAGATAGTGCCCAAGTAAAAGG    686
   209 --G--P--G--N--K--T--V--K--E--K--P--D--S--D--S--A--Q--V--K--G    229

                                                                          
   781 TTCTATGTCAGATCATCCAAGGAGCTCAAACATGGAAGGCCATGCAAATCCAGATCAAAC    840
   687 TTCTATGTCAGATCATCCAAGGAGCTCAAACATGGAAGGCCATGCAAATCCAGATCAAAC    746
   229 --S--M--S--D--H--P--R--S--S--N--M--E--G--H--A--N--P--D--Q--T    249

                                                                          
   841 AAGCAATACAACATCACTTAAACAGAAAAACAAAATCAATGATGGTTGCACCAAAGTTTC    900
   747 AAGCAATACAACATCACTTAAACAGAAAAACAAAATCAATGATGGTTGCACCAAAGTTTC    806
   249 --S--N--T--T--S--L--K--Q--K--N--K--I--N--D--G--C--T--K--V--S    269

                                                                          
   901 CTCGGAGTCGGCTCCTAGCACAACAGCTAGTAGAGCTAAATCTTCGAAGATAGCTGCGGT    960
   807 CTCGGAGTCGGCTCCTAGCACAACAGCTAGTAGAGCTAAATCTTCGAAGATAGCTGCGGT    866
   269 --S--E--S--A--P--S--T--T--A--S--R--A--K--S--S--K--I--A--A--V    289

                                                                          
   961 TCAAGGGAAGGCAACAACCACCAGCATCCCTATCAAACCTGCCCGATCTTTGGTGAAGTC   1020
   867 TCAAGGGAAGGCAACAACCACCAGCATCCCTATCAAACCTGCCCGATCTTTGGTGAAGTC    926
   289 --Q--G--K--A--T--T--T--S--I--P--I--K--P--A--R--S--L--V--K--S    309

                                                                          
  1021 AAATGACATTCAGCTGGTCATTCGCATTCCTGATGGACCTAGTCTGCAGATTAAACTGAC   1080
   927 AAATGACATTCAGCTGGTCATTCGCATTCCTGATGGACCTAGTCTGCAGATTAAACTGAC    986
   309 --N--D--I--Q--L--V--I--R--I--P--D--G--P--S--L--Q--I--K--L--T    329

                                                                          
  1081 AAAAGATGATAACTTAAGGAAGGTGAAAAATTTTGTGGATGAAAACTATGCTAATGGGGC   1140
   987 AAAAGATGATAACTTAAGGAAGGTGAAAAATTTTGTGGATGAAAACTATGCTAATGGGGC   1046
   329 --K--D--D--N--L--R--K--V--K--N--F--V--D--E--N--Y--A--N--G--A    349

                                                                          
  1141 TGGATCCTATGATCTTGCTATGCTTTATCCAAGAAAAGTTTTCACCGAACAAGATATGGA   1200
  1047 TGGATCCTATGATCTTGCTATGCTTTATCCAAGAAAAGTTTTCACCGAACAAGATATGGA   1106
   349 --G--S--Y--D--L--A--M--L--Y--P--R--K--V--F--T--E--Q--D--M--E    369

                                                                          
  1201 AGCCACGTTGCATGAACTGGGTATTGAAACCCGCCAGGCTCTCACTGTTGTTCCACATCA   1260
  1107 AGCCACGTTGCATGAACTGGGTATTGAAACCCGCCAGGCTCTCACTGTTGTTCCACATCA   1166
   369 --A--T--L--H--E--L--G--I--E--T--R--Q--A--L--T--V--V--P--H--H    389

                                                                          
  1261 TAAACCTATTCGAGCAGCAAAGCGCCAATCATCATCATCACCTGCCCATGATGTGGACAT   1320
  1167 TAAACCTATTCGAGCAGCAAAGCGCCAATCATCATCATCACCTGCCCATGATGTGGACAT   1226
   389 --K--P--I--R--A--A--K--R--Q--S--S--S--S--P--A--H--D--V--D--I    409

                                                                          
  1321 CAATATGGATGGGGACAGTTCAGGTGGTTGGGGATATGTTGGTTATCTGAGAACCGCCCT   1380
  1227 CAATATGGATGGGGACAGTTCAGGTGGTTGGGGATATGTTGGTTATCTGAGAACCGCCCT   1286
   409 --N--M--D--G--D--S--S--G--G--W--G--Y--V--G--Y--L--R--T--A--L    429

                                                                          
  1381 TTCGTTCGTGAATCCCCTGTCCTACCTGAGAGCAAATGCTGCCCCATCAAACCCTGACCA   1440
  1287 TTCGTTCGTGAATCCCCTGTCCTACCTGAGAGCAAATGCTGCCCCATCAAACCCTGACCA   1346
   429 --S--F--V--N--P--L--S--Y--L--R--A--N--A--A--P--S--N--P--D--Q    449

                                                                          
  1441 GTTGGTGAACCAGGGCTCGCAGCAGTACAGACCGAGCTCTGGACCCTGGAGGAGTCATCC   1500
  1347 GTTGGTGAACCAGGGCTCGCAGCAGTACAGACCGAGCTCTGGACCCTGGAGGAGTCATCC   1406
   449 --L--V--N--Q--G--S--Q--Q--Y--R--P--S--S--G--P--W--R--S--H--P    469

                                                                          
  1501 TGGAGTGGAGACTGCTTCAGAAAGCGCGGCTGTCGCTGGTAACGGGAGCCAAGATGCAGC   1560
  1407 TGGAGTGGAGACTGCTTCAGAAAGCGCGGCTGTCGCTGGTAACGGGAGCCAAGATGCAGC   1466
   469 --G--V--E--T--A--S--E--S--A--A--V--A--G--N--G--S--Q--D--A--A    489

                                                                          
  1561 TAGGGATAGTAGCTCCGGGAGTACGTTGAGGAGGAGGCCGAGGCAATTCGGTGGCAACAT   1620
  1467 TAGGGATAGTAGCTCCGGGAGTACGTTGAGGAGGAGGCCGAGGCAATTCGGTGGCAACAT   1526
   489 --R--D--S--S--S--G--S--T--L--R--R--R--P--R--Q--F--G--G--N--I    509

                                                                          
  1621 CCACAGTTTGAGAAGCGATGACCAAGGCCCATCTGACGATAGGAATGTTTACTGGAATGG   1680
  1527 CCACAGTTTGAGAAGCGATGACCAAGGCCCATCTGACGATAGGAATGTTTACTGGAATGG   1586
   509 --H--S--L--R--S--D--D--Q--G--P--S--D--D--R--N--V--Y--W--N--G    529

                                                                          
  1681 AAACTCTACAGAGTTTGGCGGCGAAGACAAGAAATGAGGGCGGGCGGCAGCAATATGAAA   1740
  1587 AAACTCTACAGAGTTTGGCGGCGAAGACAAGAAATGA.......................   1623
   529 --N--S--T--E--F--G--G--E--D--K--K--*-.......................    540

                                                                          
  1741 TATTCGAATATATATAGACCTGAACCAATAACACGATCTATAGTAGGTGAATAAATGCAG   1800
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1801 TCCGCGATGTTAAAATTCATTAGCTCAAAAATGTCGCCTTATAGTGTAATTTATTATAAT   1860
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1861 TGGGTGGTACAGTACAGTACAATGCATCTGATCATTTGCTGTCATGGTGATATTTCCCTA   1920
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1921 GTCTCACCTGTATATTTGTGGCAAATGTGTGTGTACCTTCCATGGAGTCGTGAAAGTAAA   1980
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1981 CACCAAACCCTATATTTTGGAAAAGAAGGTTTTTTTTAATACGGCTTAAAAGCGGCAAAT   2040
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2041 TCAGGCCTGGTGTACA                                               2056
       ................                                                   
       ................