Transcript: OB11G17870.1
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Description
Ubiquitin-like superfamily protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT2G43210) TAIR;Acc:AT2G43210]
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- OB11G17870.1 2056 540aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
J3N7K1 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 CCCGCGCCACCTCGGCCTCCTCGACATCGAGTCCGTGCTCGTGCCCGCCGCCGCCTGCGC 60
............................................................
............................................................
61 CGATCTACATCCATCCCGCCCGTCGTCCTGCCCG A TG GAG ATG ACA CTT GAT TCC TTG AC 120
..................................ATGGAGATGACACTTGATTCCTTGAC 26
..................................-M--E--M--T--L--D--S--L--T 9
121 A TAC AAA GGT TCC ATT CCA GGT GCA ATC AAC CAA TCA AGA AGG GAT AAA AAA CTC TTT GT 180
27 ATACAAAGGTTCCATTCCAGGTGCAATCAACCAATCAAGAAGGGATAAAAAACTCTTTGT 86
9 --Y--K--G--S--I--P--G--A--I--N--Q--S--R--R--D--K--K--L--F--V 29
181 T GTG TAC ATA TCA G GT GAA GAT GAG GCT TCA AGT AGC TTG GAA CAG TCA ACA CTT GTT AA 240
87 TGTGTACATATCAGGTGAAGATGAGGCTTCAAGTAGCTTGGAACAGTCAACACTTGTTAA 146
29 --V--Y--I--S--G--E--D--E--A--S--S--S--L--E--Q--S--T--L--V--N 49
241 T GAA AGT GTG GCC GAA GTG ATA GGC AAT TGT TGC ATA TTC TTG CAC CTA AAA CAG GGC AA 300
147 TGAAAGTGTGGCCGAAGTGATAGGCAATTGTTGCATATTCTTGCACCTAAAACAGGGCAA 206
49 --E--S--V--A--E--V--I--G--N--C--C--I--F--L--H--L--K--Q--G--N 69
301 T GTT GAT GCA TCA CAA TTT TCA GCT ATA T AC CCA CAG AAA GCT TTC CCA AGT ATA TCT GT 360
207 TGTTGATGCATCACAATTTTCAGCTATATACCCACAGAAAGCTTTCCCAAGTATATCTGT 266
69 --V--D--A--S--Q--F--S--A--I--Y--P--Q--K--A--F--P--S--I--S--V 89
361 A ATT GGC CTG AAT GGA GTT ATG CTA TGG GGT CAT G AG GGA TAT ATT GGC TCG AAA GAT CT 420
267 AATTGGCCTGAATGGAGTTATGCTATGGGGTCATGAGGGATATATTGGCTCGAAAGATCT 326
89 --I--G--L--N--G--V--M--L--W--G--H--E--G--Y--I--G--S--K--D--L 109
421 G AAA GAA AAT ATC GAG AAA GCT TGG GCT ACC CTT CAT GTA CAG G AG ACA GCA GCA GCT TT 480
327 GAAAGAAAATATCGAGAAAGCTTGGGCTACCCTTCATGTACAGGAGACAGCAGCAGCTTT 386
109 --K--E--N--I--E--K--A--W--A--T--L--H--V--Q--E--T--A--A--A--F 129
481 T CTA ACT GCA TCA CTT ACT TCA AGA ATG AAT GAA CAT GTG AAT ACC AGC TCA ACT ACT CT 540
387 TCTAACTGCATCACTTACTTCAAGAATGAATGAACATGTGAATACCAGCTCAACTACTCT 446
129 --L--T--A--S--L--T--S--R--M--N--E--H--V--N--T--S--S--T--T--L 149
541 G CCT ACT CAA GGA GGC TCA TCT GCT GCA GAA AAT CCT TCC TCT TCA TCA AAT CAA TCT AC 600
447 GCCTACTCAAGGAGGCTCATCTGCTGCAGAAAATCCTTCCTCTTCATCAAATCAATCTAC 506
149 --P--T--Q--G--G--S--S--A--A--E--N--P--S--S--S--S--N--Q--S--T 169
601 A GGA ACT TCT GGA CCA AGT GGA TTT GCT AAT TCT ACT GGT TCA GCA GCA CAG CCA CCT AG 660
507 AGGAACTTCTGGACCAAGTGGATTTGCTAATTCTACTGGTTCAGCAGCACAGCCACCTAG 566
169 --G--T--S--G--P--S--G--F--A--N--S--T--G--S--A--A--Q--P--P--R 189
661 A AGC ACG AGC CAT GAT G AA ATT CGG AGG ACA AGT GAA AAG GAA TGC TCA AAT TTA GAT TT 720
567 AAGCACGAGCCATGATGAAATTCGGAGGACAAGTGAAAAGGAATGCTCAAATTTAGATTT 626
189 --S--T--S--H--D--E--I--R--R--T--S--E--K--E--C--S--N--L--D--L 209
721 A GGT CCA GGT AAT AAA ACT GTT AAA GAA AAG CCA GAT TCA GAT AGT GCC CAA GTA AAA GG 780
627 AGGTCCAGGTAATAAAACTGTTAAAGAAAAGCCAGATTCAGATAGTGCCCAAGTAAAAGG 686
209 --G--P--G--N--K--T--V--K--E--K--P--D--S--D--S--A--Q--V--K--G 229
781 T TCT ATG TCA GAT CAT CCA AGG AGC TCA AAC ATG GAA GGC CAT GCA AAT CCA GAT CAA AC 840
687 TTCTATGTCAGATCATCCAAGGAGCTCAAACATGGAAGGCCATGCAAATCCAGATCAAAC 746
229 --S--M--S--D--H--P--R--S--S--N--M--E--G--H--A--N--P--D--Q--T 249
841 A AGC AAT ACA ACA TCA CTT AAA CAG AAA AAC AAA ATC AAT GAT GGT TGC ACC AAA GTT TC 900
747 AAGCAATACAACATCACTTAAACAGAAAAACAAAATCAATGATGGTTGCACCAAAGTTTC 806
249 --S--N--T--T--S--L--K--Q--K--N--K--I--N--D--G--C--T--K--V--S 269
901 C TCG GAG TCG GCT CCT AGC ACA ACA GCT AGT AGA GCT AAA TCT TCG AAG ATA GCT GCG GT 960
807 CTCGGAGTCGGCTCCTAGCACAACAGCTAGTAGAGCTAAATCTTCGAAGATAGCTGCGGT 866
269 --S--E--S--A--P--S--T--T--A--S--R--A--K--S--S--K--I--A--A--V 289
961 T CAA GGG AAG GCA ACA ACC ACC AGC ATC CCT ATC AAA CCT GCC CGA TCT TTG GTG AAG TC 1020
867 TCAAGGGAAGGCAACAACCACCAGCATCCCTATCAAACCTGCCCGATCTTTGGTGAAGTC 926
289 --Q--G--K--A--T--T--T--S--I--P--I--K--P--A--R--S--L--V--K--S 309
1021 A AAT GAC ATT CAG CTG GTC ATT CGC ATT CCT GAT GGA CCT AGT CTG CAG ATT AAA CTG AC 1080
927 AAATGACATTCAGCTGGTCATTCGCATTCCTGATGGACCTAGTCTGCAGATTAAACTGAC 986
309 --N--D--I--Q--L--V--I--R--I--P--D--G--P--S--L--Q--I--K--L--T 329
1081 A AAA GAT GAT AAC TTA AGG AAG GTG AAA AAT TTT GTG GAT GAA AAC TAT GCT AAT GGG GC 1140
987 AAAAGATGATAACTTAAGGAAGGTGAAAAATTTTGTGGATGAAAACTATGCTAATGGGGC 1046
329 --K--D--D--N--L--R--K--V--K--N--F--V--D--E--N--Y--A--N--G--A 349
1141 T GGA TCC TAT GAT CTT GCT ATG CTT TAT CCA AGA AAA GTT TTC ACC GAA CAA G AT ATG GA 1200
1047 TGGATCCTATGATCTTGCTATGCTTTATCCAAGAAAAGTTTTCACCGAACAAGATATGGA 1106
349 --G--S--Y--D--L--A--M--L--Y--P--R--K--V--F--T--E--Q--D--M--E 369
1201 A GCC ACG TTG CAT GAA CTG GGT ATT GAA ACC CGC CAG GCT CTC ACT GTT GTT CCA CAT CA 1260
1107 AGCCACGTTGCATGAACTGGGTATTGAAACCCGCCAGGCTCTCACTGTTGTTCCACATCA 1166
369 --A--T--L--H--E--L--G--I--E--T--R--Q--A--L--T--V--V--P--H--H 389
1261 T AAA CCT ATT CGA GCA GCA AAG CGC CAA TCA TCA TCA TCA CCT GCC CAT GAT GTG GAC AT 1320
1167 TAAACCTATTCGAGCAGCAAAGCGCCAATCATCATCATCACCTGCCCATGATGTGGACAT 1226
389 --K--P--I--R--A--A--K--R--Q--S--S--S--S--P--A--H--D--V--D--I 409
1321 C AAT ATG GAT GGG GAC AGT TCA GGT GGT TGG GGA TAT GTT GGT TAT CTG AGA ACC GCC CT 1380
1227 CAATATGGATGGGGACAGTTCAGGTGGTTGGGGATATGTTGGTTATCTGAGAACCGCCCT 1286
409 --N--M--D--G--D--S--S--G--G--W--G--Y--V--G--Y--L--R--T--A--L 429
1381 T TCG TTC GTG AAT CCC CTG TCC TAC CTG AGA GCA AAT GCT GCC CCA TCA AAC CCT GAC CA 1440
1287 TTCGTTCGTGAATCCCCTGTCCTACCTGAGAGCAAATGCTGCCCCATCAAACCCTGACCA 1346
429 --S--F--V--N--P--L--S--Y--L--R--A--N--A--A--P--S--N--P--D--Q 449
1441 G TTG GTG AAC CAG GGC TCG CAG CAG TAC A GA CCG AGC TCT GGA CCC TGG AGG AGT CAT CC 1500
1347 GTTGGTGAACCAGGGCTCGCAGCAGTACAGACCGAGCTCTGGACCCTGGAGGAGTCATCC 1406
449 --L--V--N--Q--G--S--Q--Q--Y--R--P--S--S--G--P--W--R--S--H--P 469
1501 T GGA GTG GAG ACT GCT TCA GAA AGC GCG GCT GTC GCT GGT AAC GGG AGC CAA GAT GCA GC 1560
1407 TGGAGTGGAGACTGCTTCAGAAAGCGCGGCTGTCGCTGGTAACGGGAGCCAAGATGCAGC 1466
469 --G--V--E--T--A--S--E--S--A--A--V--A--G--N--G--S--Q--D--A--A 489
1561 T AGG GAT AGT AGC TCC GGG AGT ACG TTG AGG AGG AGG CCG AGG CAA TTC GGT GGC AAC AT 1620
1467 TAGGGATAGTAGCTCCGGGAGTACGTTGAGGAGGAGGCCGAGGCAATTCGGTGGCAACAT 1526
489 --R--D--S--S--S--G--S--T--L--R--R--R--P--R--Q--F--G--G--N--I 509
1621 C CAC AGT TTG AGA AGC GAT GAC CAA GGC CCA TCT GAC GAT AGG AAT GTT TAC TGG AAT GG 1680
1527 CCACAGTTTGAGAAGCGATGACCAAGGCCCATCTGACGATAGGAATGTTTACTGGAATGG 1586
509 --H--S--L--R--S--D--D--Q--G--P--S--D--D--R--N--V--Y--W--N--G 529
1681 A AAC TCT ACA GAG TTT GGC GGC GAA GAC AAG AAA TGA GGGCGGGCGGCAGCAATATGAAA 1740
1587 AAACTCTACAGAGTTTGGCGGCGAAGACAAGAAATGA....................... 1623
529 --N--S--T--E--F--G--G--E--D--K--K--*-....................... 540
1741 TATTCGAATATATATAGACCTGAACCAATAACACGATCTATAGTAGGTGAATAAATGCAG 1800
............................................................
............................................................
1801 TCCGCGATGTTAAAATTCATTAGCTCAAAAATGTCGCCTTATAGTGTAATTTATTATAAT 1860
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1861 TGGGTGGTACAGTACAGTACAATGCATCTGATCATTTGCTGTCATGGTGATATTTCCCTA 1920
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1921 GTCTCACCTGTATATTTGTGGCAAATGTGTGTGTACCTTCCATGGAGTCGTGAAAGTAAA 1980
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1981 CACCAAACCCTATATTTTGGAAAAGAAGGTTTTTTTTAATACGGCTTAAAAGCGGCAAAT 2040
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2041 TCAGGCCTGGTGTACA 2056
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