Oryza brachyantha (Oryza_brachyantha.v1.4b) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 8: 244,478-248,231 forward strand.
This transcript has 6 exons and is annotated with 21 domains and features.
This transcript is a product of gene OB08G10390 Show transcript tableHide transcript table
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1 GGGGTTTCTTGCGTGATTTCGACCTCAAGATGTCGTCTTTCCTCCAAACCACCATCCATT 60 ............................................................ ............................................................ 61 TTAGTGTTCCGGTGGTGATCCAGTTCAACTTATTTTCGGAGAGTGCTCGGGCAAAATTTG 120 ............................................................ ............................................................ 121 GGAGAAGGGATAGATTAGGTTTTTGTCTGCGGTTTGGAGAGTTCTCTTCATGATGTGGCA 180 ............................................................ ............................................................ 181 ATCTAAAAATAAAAGGAACCGATGTTTTCCATACAGCTGCAAAAATTGTTTGCGTCAGTC 240 ............................................................ ............................................................ 241 CATAACGTACTGCTCCTGATGTTTATTTCGTAGGCTCAATTTTGGATTGCTATTGCAGGC 300 ............................................................ ............................................................ 301 CTTATAGCTGATCGGTCGATTGGTGTTCAAGTGAAGCCGTTTTAAGTTTTAAAGTGGCGG 360 ............................................................ ............................................................ 361 GTCTGAATTCACTCTTCTCTTCTACAGTATTGCCAAAGGATAATTGCTCTAGTAAAATGA 420 ........................................................ATGA 4 ........................................................-M-- 1 421 ACTGTACAAAAGGAGGGAGAGTTCCCCTTTTGTTTCCCGCACTCATTTGTCTCATGGCCC 480 5 ACTGTACAAAAGGAGGGAGAGTTCCCCTTTTGTTTCCCGCACTCATTTGTCTCATGGCCC 64 2 N--C--T--K--G--G--R--V--P--L--L--F--P--A--L--I--C--L--M--A-- 21 481 AGCTGGGGGCTTGCAATGTGGTGCTGATGGCGAATAACATGACCTTGTCATTTGATGACG 540 65 AGCTGGGGGCTTGCAATGTGGTGCTGATGGCGAATAACATGACCTTGTCATTTGATGACG 124 22 Q--L--G--A--C--N--V--V--L--M--A--N--N--M--T--L--S--F--D--D-- 41 541 TCGAGGCAACTTTTGCTCCAGCAGTGAAAGATTCAGGTGTAAAAGGTGCAATCTACACTG 600 125 TCGAGGCAACTTTTGCTCCAGCAGTGAAAGATTCAGGTGTAAAAGGTGCAATCTACACTG 184 42 V--E--A--T--F--A--P--A--V--K--D--S--G--V--K--G--A--I--Y--T-- 61 601 TGGAACCTCTGGATGCATGTAGTCCATTGAGAAAGAAAGCAGTCGATGGTCCTGCTTCAC 660 185 TGGAACCTCTGGATGCATGTAGTCCATTGAGAAAGAAAGCAGTCGATGGTCCTGCTTCAC 244 62 V--E--P--L--D--A--C--S--P--L--R--K--K--A--V--D--G--P--A--S-- 81 661 CATTTGCACTGGTAATAAGAGGTGGCTGCCAATTTGACGATAAAGTTAGAAATGCACAGA 720 245 CATTTGCACTGGTAATAAGAGGTGGCTGCCAATTTGACGATAAAGTTAGAAATGCACAGA 304 82 P--F--A--L--V--I--R--G--G--C--Q--F--D--D--K--V--R--N--A--Q-- 101 721 ATGCCGGATTCAAGGCCGTGATAGTATATGATAATGAAGACAGCGGCGCTCTCGTTTCAA 780 305 ATGCCGGATTCAAGGCCGTGATAGTATATGATAATGAAGACAGCGGCGCTCTCGTTTCAA 364 102 N--A--G--F--K--A--V--I--V--Y--D--N--E--D--S--G--A--L--V--S-- 121 781 TGGCTGGGAGCTCTTCTGGGATCCAGATATATGCGGTATTCCTCTCTAAGGCTTCAGGAG 840 365 TGGCTGGGAGCTCTTCTGGGATCCAGATATATGCGGTATTCCTCTCTAAGGCTTCAGGAG 424 122 M--A--G--S--S--S--G--I--Q--I--Y--A--V--F--L--S--K--A--S--G-- 141 841 AGGTGTTAAAGAAATATTCAGATAAGACTGATGTAGAGGTGTGGATACTACCAGTATATG 900 425 AGGTGTTAAAGAAATATTCAGATAAGACTGATGTAGAGGTGTGGATACTACCAGTATATG 484 142 E--V--L--K--K--Y--S--D--K--T--D--V--E--V--W--I--L--P--V--Y-- 161 901 AAAGCTCAGCTTGGTCTATCATGGCAATTTCTTTCACATCGCTGCTTGCTATGGCTGCTG 960 485 AAAGCTCAGCTTGGTCTATCATGGCAATTTCTTTCACATCGCTGCTTGCTATGGCTGCTG 544 162 E--S--S--A--W--S--I--M--A--I--S--F--T--S--L--L--A--M--A--A-- 181 961 TTCTAGCGACTTATTTCTTTGTGAGAAGACACCAGATAAGGCGGGACAGGAGAAGGATTC 1020 545 TTCTAGCGACTTATTTCTTTGTGAGAAGACACCAGATAAGGCGGGACAGGAGAAGGATTC 604 182 V--L--A--T--Y--F--F--V--R--R--H--Q--I--R--R--D--R--R--R--I-- 201 1021 CTGTAACTCAGGAATTTCATGGAATGAGCAGTCAATTAGTTAAAGCAATGCCGAGTCTTA 1080 605 CTGTAACTCAGGAATTTCATGGAATGAGCAGTCAATTAGTTAAAGCAATGCCGAGTCTTA 664 202 P--V--T--Q--E--F--H--G--M--S--S--Q--L--V--K--A--M--P--S--L-- 221 1081 TCTTTACAAAAGTGCAAGAAGACAACAGTACATCATCATCTTGTGCCATTTGCTTGGAAG 1140 665 TCTTTACAAAAGTGCAAGAAGACAACAGTACATCATCATCTTGTGCCATTTGCTTGGAAG 724 222 I--F--T--K--V--Q--E--D--N--S--T--S--S--S--C--A--I--C--L--E-- 241 1141 ACTACAGTTTCGGAGAAAAACTAAGAGTGTTGCCTTGTCATCACAAGTTCCATGCGACTT 1200 725 ACTACAGTTTCGGAGAAAAACTAAGAGTGTTGCCTTGTCATCACAAGTTCCATGCGACTT 784 242 D--Y--S--F--G--E--K--L--R--V--L--P--C--H--H--K--F--H--A--T-- 261 1201 GTGTGGACATGTGGCTGACCTCTTGGAAAACATTCTGCCCTGTGTGCAAGAGAGATGCAA 1260 785 GTGTGGACATGTGGCTGACCTCTTGGAAAACATTCTGCCCTGTGTGCAAGAGAGATGCAA 844 262 C--V--D--M--W--L--T--S--W--K--T--F--C--P--V--C--K--R--D--A-- 281 1261 GTGCTGGAACCTCAAAGCCCCCTGCATCAGAGTTTACCCCTTTGCTTTCCTCTATTATTC 1320 845 GTGCTGGAACCTCAAAGCCCCCTGCATCAGAGTTTACCCCTTTGCTTTCCTCTATTATTC 904 282 S--A--G--T--S--K--P--P--A--S--E--F--T--P--L--L--S--S--I--I-- 301 1321 ACCTTCCCGCTGAATCAACAGCTTTGTCTTCTTTCCGGTCAGCAGTGGCAGCATCTCCCC 1380 905 ACCTTCCCGCTGAATCAACAGCTTTGTCTTCTTTCCGGTCAGCAGTGGCAGCATCTCCCC 964 302 H--L--P--A--E--S--T--A--L--S--S--F--R--S--A--V--A--A--S--P-- 321 1381 CTAGGCCAATAAGACATCATCCTTCATCACAGTTCACATCCCGCGCTTACTCCATTTCCA 1440 965 CTAGGCCAATAAGACATCATCCTTCATCACAGTTCACATCCCGCGCTTACTCCATTTCCA 1024 322 P--R--P--I--R--H--H--P--S--S--Q--F--T--S--R--A--Y--S--I--S-- 341 1441 GTGCCCCCCGTACTTATAATCCCCAAAGATATTATACTAACCCACCTCTTATTAGTACAA 1500 1025 GTGCCCCCCGTACTTATAATCCCCAAAGATATTATACTAACCCACCTCTTATTAGTACAA 1084 342 S--A--P--R--T--Y--N--P--Q--R--Y--Y--T--N--P--P--L--I--S--T-- 361 1501 GTAGAAGCAATGTAGACCTTGCAAATATGTTCTCACACTCCGCACCAAGCATCCATGCAT 1560 1085 GTAGAAGCAATGTAGACCTTGCAAATATGTTCTCACACTCCGCACCAAGCATCCATGCAT 1144 362 S--R--S--N--V--D--L--A--N--M--F--S--H--S--A--P--S--I--H--A-- 381 1561 TCTCTGAGAGGTGGTCATTTGTCTCTACCGATCAACATCGGGTATAGAATGCCACATGTC 1620 1145 TCTCTGAGAGGTGGTCATTTGTCTCTACCGATCAACATCGGGTATAG............. 1191 382 F--S--E--R--W--S--F--V--S--T--D--Q--H--R--V--*-............. 396 1621 TCTCGTTCTGAATACGGATCTGCCAGCCTGGGTACTTCCCATTCTCACCATGAGTCTCCG 1680 ............................................................ ............................................................ 1681 AGTTATTATCGTAGCTCTTTGGGCCAGCAACACCCTTACCCGATGCACCGCAGAGAGTCA 1740 ............................................................ ............................................................ 1741 GGGCCAAGCCTGTTTACTATGGTGCCCCAGTCACCACAATAGGGTCAGCAACAGCACCCT 1800 ............................................................ ............................................................ 1801 GGTGAATCGGTGAGAAATCTATCATCTATGGTTCAACTCAATAATAATTACACCAGGTCC 1860 ............................................................ ............................................................ 1861 ATGTACAACATTGTCGTGATTGTAATCGAAGCTTGTGTGCTGTGACATCGGATCAGTCAC 1920 ............................................................ ............................................................ 1921 TACCAAGATGTTGACTACTCTTGCGAAGTTAACTGTTTCACGAACAGTTGTGCAATATAT 1980 ............................................................ ............................................................ 1981 CAGAACATCTTATTTGATACAGAACTAGCAGGTTCATATAGGAACTATTTAATTACTGGC 2040 ............................................................ ............................................................ 2041 ATCCACTATGGTGATCGAACAAGGTTACTTCAATTGTCTGTAAGAGGGAAAATTGGTGAT 2100 ............................................................ ............................................................ 2101 CTTAAACCCGAAGAAATACTTCCTGAGTTTTTGACGAACCAAATGTCCATCCGTCCATAA 2160 ............................................................ ............................................................ 2161 GGAATGGTTTGACTGCGTATAATTTGAGGCTTGTATTATAGCTGATGATTATAGAGTTGG 2220 ............................................................ ............................................................ 2221 TGTAGTGGTCTGTTTCTTTTTAGCTACTGTTTTGACATGTGTATAAACTATTATAGCTTT 2280 ............................................................ ............................................................ 2281 AACAATAATTTGTTACTCGGTGAATGTTTTGTAGCTCTCTAATACTTTTTCTGATCTTGG 2340 ............................................................ ............................................................ 2341 ATATATGTGTAAGTG 2355 ............... ...............
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