Transcript: OB06G21110.1
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Description
ankyrin repeat family protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT2G04740) TAIR;Acc:AT2G04740]
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- OB06G21110.1 1981 622aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
- A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 A TG GAC CAC CGG CCG CAG GAA ACG CGG GGG GAG CAG CAG CTC GCC GGC GGC ATC GAC GTC 60
1 ATGGACCACCGGCCGCAGGAAACGCGGGGGGAGCAGCAGCTCGCCGGCGGCATCGACGTC 60
1 -M--D--H--R--P--Q--E--T--R--G--E--Q--Q--L--A--G--G--I--D--V- 20
61 GAG GTC GAG CTC GAC CCT GAG GAC CTC CAG CCG TCG GTG CCC CTC AAG AAG GTC CCC GCG 120
61 GAGGTCGAGCTCGACCCTGAGGACCTCCAGCCGTCGGTGCCCCTCAAGAAGGTCCCCGCG 120
21 -E--V--E--L--D--P--E--D--L--Q--P--S--V--P--L--K--K--V--P--A- 40
121 GGG GAC CTC TTC GAG GCG GCG CGC GCG GGC GAC TGN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN NNN 180
121 GGGGACCTCTTCGAGGCGGCGCGCGCGGGCGACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN 180
41 -G--D--L--F--E--A--A--R--A--G--D--X--X--X--X--X--X--X--X--X- 60
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61 -X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X- 80
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81 -X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X- 100
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101 -X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X- 120
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121 -X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X- 140
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141 -X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X- 160
NNN NNN NNN NNN CCC CCG CCG CTC GCG CCG CTG CCC GCC GCG CTC CGG GCC ACG TTC CTC 233
NNNNNNNNNNNNCCCCCGCCGCTCGCGCCGCTGCCCGCCGCGCTCCGGGCCACGTTCCTC 233
161 -X--X--X--X--P--P--P--L--A--P--L--P--A--A--L--R--A--T--F--L- 180
234 GCC TGC CCC GCC AAC CGC TCC GCC TTC CTC GAG ATG CTC CAG TGG AGC GCC GGC TCC GAC 293
234 GCCTGCCCCGCCAACCGCTCCGCCTTCCTCGAGATGCTCCAGTGGAGCGCCGGCTCCGAC 293
181 -A--C--P--A--N--R--S--A--F--L--E--M--L--Q--W--S--A--G--S--D- 200
294 GCT GCC GCC CTT GCC ACT GCC GCC G GA TTT GGG CCA ATG GAT AAT GCA TCA AGC ACT AGC 353
294 GCTGCCGCCCTTGCCACTGCCGCCGGATTTGGGCCAATGGATAATGCATCAAGCACTAGC 353
201 -A--A--A--L--A--T--A--A--G--F--G--P--M--D--N--A--S--S--T--S- 220
354 CTA TTC CCT CCA GAC ATT ACA TTC TAT GTG GAT GGG AAA CCA GTT GAA GCT CAT CGG GCC 413
354 CTATTCCCTCCAGACATTACATTCTATGTGGATGGGAAACCAGTTGAAGCTCATCGGGCC 413
221 -L--F--P--P--D--I--T--F--Y--V--D--G--K--P--V--E--A--H--R--A- 240
414 ATT CTT TGT TCC CGG TCA TCG TTC TTT CGA CAA AAA TTC AAG ACA GAC TGG AAA AAC AGG 473
414 ATTCTTTGTTCCCGGTCATCGTTCTTTCGACAAAAATTCAAGACAGACTGGAAAAACAGG 473
241 -I--L--C--S--R--S--S--F--F--R--Q--K--F--K--T--D--W--K--N--R- 260
474 AAT GAA GTG AGA TTT TCA AGC CAG AAG TTG TCT TTT GGT GCC TTA TAC AGC CTT ATC CAT 533
474 AATGAAGTGAGATTTTCAAGCCAGAAGTTGTCTTTTGGTGCCTTATACAGCCTTATCCAT 533
261 -N--E--V--R--F--S--S--Q--K--L--S--F--G--A--L--Y--S--L--I--H- 280
534 TTC TTC TAT TCT GAT AGA CTC GAA GTA GAT GTG GAT GAC ATG GAA AAT TTG GCA CGT ATG 593
534 TTCTTCTATTCTGATAGACTCGAAGTAGATGTGGATGACATGGAAAATTTGGCACGTATG 593
281 -F--F--Y--S--D--R--L--E--V--D--V--D--D--M--E--N--L--A--R--M- 300
594 TGC AAA GTT TGT AAG TGT GAA GAG TTG CAA AAG ATA TTG GAT AAT GAA GTT GCT CAT CAG 653
594 TGCAAAGTTTGTAAGTGTGAAGAGTTGCAAAAGATATTGGATAATGAAGTTGCTCATCAG 653
301 -C--K--V--C--K--C--E--E--L--Q--K--I--L--D--N--E--V--A--H--Q- 320
654 AAA TAT GCA GAG TAC AAG TCA CCG AGA GTA GAT TTG GAC AGT TCA CAG AAG CGC TTC ATT 713
654 AAATATGCAGAGTACAAGTCACCGAGAGTAGATTTGGACAGTTCACAGAAGCGCTTCATT 713
321 -K--Y--A--E--Y--K--S--P--R--V--D--L--D--S--S--Q--K--R--F--I- 340
714 TTA AAT TGG CAA TCC TTG CCA GAG GAA GAT CGG CTT CCC TCG GCA CTA CAG CGT ATT CTA 773
714 TTAAATTGGCAATCCTTGCCAGAGGAAGATCGGCTTCCCTCGGCACTACAGCGTATTCTA 773
341 -L--N--W--Q--S--L--P--E--E--D--R--L--P--S--A--L--Q--R--I--L- 360
774 GAG GAT TGC CTA GCT AAC TCA AGA GAA CAA GAT TGT TAT AAC GAT GAA TCA AAT GAA ATG 833
774 GAGGATTGCCTAGCTAACTCAAGAGAACAAGATTGTTATAACGATGAATCAAATGAAATG 833
361 -E--D--C--L--A--N--S--R--E--Q--D--C--Y--N--D--E--S--N--E--M- 380
834 AGC AGA GAC TCT GGG GTG GAT GCT GCT GCT GAT CTT TAT ATA AAA GTA TGT GAT AAG GTT 893
834 AGCAGAGACTCTGGGGTGGATGCTGCTGCTGATCTTTATATAAAAGTATGTGATAAGGTT 893
381 -S--R--D--S--G--V--D--A--A--A--D--L--Y--I--K--V--C--D--K--V- 400
894 TTC CAT TGC CAT CAG GTG ATT TTA GCC TCA AGA TCA GAA TAC TTT AAA GCC AGG CTA TTT 953
894 TTCCATTGCCATCAGGTGATTTTAGCCTCAAGATCAGAATACTTTAAAGCCAGGCTATTT 953
401 -F--H--C--H--Q--V--I--L--A--S--R--S--E--Y--F--K--A--R--L--F- 420
954 AGA AAC ATG GAA TAT CTT GAA GTT GAG AGT GGT GAA GCA ACT CAA AAT ATT CCT TTT CTT 1013
954 AGAAACATGGAATATCTTGAAGTTGAGAGTGGTGAAGCAACTCAAAATATTCCTTTTCTT 1013
421 -R--N--M--E--Y--L--E--V--E--S--G--E--A--T--Q--N--I--P--F--L- 440
1014 GAA GAG TTC GAC TTG AGT ACA GAA GCA TTT GAA AAG GTG CTT GAA TAT AT G TAT ACT GAT 1073
1014 GAAGAGTTCGACTTGAGTACAGAAGCATTTGAAAAGGTGCTTGAATATATGTATACTGAT 1073
441 -E--E--F--D--L--S--T--E--A--F--E--K--V--L--E--Y--M--Y--T--D- 460
1074 AAG CTA GAG CAT ATG GAT CCT AAC CAG GCT GAA GAA TTA TTT GAT ATT GCT TCA AGA TAC 1133
1074 AAGCTAGAGCATATGGATCCTAACCAGGCTGAAGAATTATTTGATATTGCTTCAAGATAC 1133
461 -K--L--E--H--M--D--P--N--Q--A--E--E--L--F--D--I--A--S--R--Y- 480
1134 CTG CTA TTC CCC CTT AAA CGA GTT GTG GCC GAT ATA CTT TTG ACA TAT CTG GAG CAT GTT 1193
1134 CTGCTATTCCCCCTTAAACGAGTTGTGGCCGATATACTTTTGACATATCTGGAGCATGTT 1193
481 -L--L--F--P--L--K--R--V--V--A--D--I--L--L--T--Y--L--E--H--V- 500
1194 TCA CCT GCA GAA CTG TGC CAC TGG CTA ATG TTA TCA GAC AT C TAT GAT GTT GTG AAA ATA 1253
1194 TCACCTGCAGAACTGTGCCACTGGCTAATGTTATCAGACATCTATGATGTTGTGAAAATA 1253
501 -S--P--A--E--L--C--H--W--L--M--L--S--D--I--Y--D--V--V--K--I- 520
1254 AGG GAG TAT TGC TTG GAT GTC ATC GCT TGC AAT TTT GAG ATG TTC GCA GAC ACA AGA GAA 1313
1254 AGGGAGTATTGCTTGGATGTCATCGCTTGCAATTTTGAGATGTTCGCAGACACAAGAGAA 1313
521 -R--E--Y--C--L--D--V--I--A--C--N--F--E--M--F--A--D--T--R--E- 540
1314 TTC CGG GCA TTA CTT TTG ACA CTT CCA CCA CCA TCT GGA GAT GAC TCA TTA CGA ACA ACT 1373
1314 TTCCGGGCATTACTTTTGACACTTCCACCACCATCTGGAGATGACTCATTACGAACAACT 1373
541 -F--R--A--L--L--L--T--L--P--P--P--S--G--D--D--S--L--R--T--T- 560
1374 CGT CCC AGT GAA CCT GGT ACG GCA GGA AAC ACT GAT GAA GGC AAC CTT CTT GAT GAT TTG 1433
1374 CGTCCCAGTGAACCTGGTACGGCAGGAAACACTGATGAAGGCAACCTTCTTGATGATTTG 1433
561 -R--P--S--E--P--G--T--A--G--N--T--D--E--G--N--L--L--D--D--L- 580
1434 CGT GAG AAA TGG TTA GAA GCA GAG GCT GCT GAG CTA GAC GAG AGA GAT GAG AGT GCA AAG 1493
1434 CGTGAGAAATGGTTAGAAGCAGAGGCTGCTGAGCTAGACGAGAGAGATGAGAGTGCAAAG 1493
581 -R--E--K--W--L--E--A--E--A--A--E--L--D--E--R--D--E--S--A--K- 600
1494 TTG TTT GAT AGG CGA TTG GAG ATG CTT ATG CTT GTA GCG GAA CAA GAA GTC AAT GAT GAC 1553
1494 TTGTTTGATAGGCGATTGGAGATGCTTATGCTTGTAGCGGAACAAGAAGTCAATGATGAC 1553
601 -L--F--D--R--R--L--E--M--L--M--L--V--A--E--Q--E--V--N--D--D- 620
1554 AAT GCT TAA C TCCACTGTGAATTGGTACTGTACATTTTCGTGCATCTCTGTTTTTGAAGT 1613
1554 AATGCTTAA................................................... 1562
621 -N--A--*-................................................... 622
1614 CTTCATTGCAGGTGCTTTAATGTTTTTCAGTTTGTGAACTTAGTCTTAACTAAAGAGTGA 1673
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1674 T 1674
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