Oryza brachyantha (Oryza_brachyantha.v1.4b)
Description

ankyrin repeat family protein [Source:Projected from Arabidopsis thaliana (AT2G04740) TAIR;Acc:AT2G04740]

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About this transcript

This transcript has 6 exons and is annotated with 18 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene OB06G21110 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeRefSeqFlags
-OB06G21110.11981622aa
 
Protein coding
-Ensembl Canonical
Codons
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  • Alternating codons
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     1 ATGGACCACCGGCCGCAGGAAACGCGGGGGGAGCAGCAGCTCGCCGGCGGCATCGACGTC     60
     1 ATGGACCACCGGCCGCAGGAAACGCGGGGGGAGCAGCAGCTCGCCGGCGGCATCGACGTC     60
     1 -M--D--H--R--P--Q--E--T--R--G--E--Q--Q--L--A--G--G--I--D--V-     20

                                                                          
    61 GAGGTCGAGCTCGACCCTGAGGACCTCCAGCCGTCGGTGCCCCTCAAGAAGGTCCCCGCG    120
    61 GAGGTCGAGCTCGACCCTGAGGACCTCCAGCCGTCGGTGCCCCTCAAGAAGGTCCCCGCG    120
    21 -E--V--E--L--D--P--E--D--L--Q--P--S--V--P--L--K--K--V--P--A-     40

                                                                          
   121 GGGGACCTCTTCGAGGCGGCGCGCGCGGGCGACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN    180
   121 GGGGACCTCTTCGAGGCGGCGCGCGCGGGCGACTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN    180
    41 -G--D--L--F--E--A--A--R--A--G--D--X--X--X--X--X--X--X--X--X-     60

                                                                          
       NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN       
       NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN       
    61 -X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X-     80

                                                                          
       NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN       
       NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN       
    81 -X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X-    100

                                                                          
       NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN       
       NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN       
   101 -X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X-    120

                                                                          
       NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN       
       NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN       
   121 -X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X-    140

                                                                          
       NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN       
       NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN       
   141 -X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X--X-    160

                                                                          
       NNNNNNNNNNNNCCCCCGCCGCTCGCGCCGCTGCCCGCCGCGCTCCGGGCCACGTTCCTC    233
       NNNNNNNNNNNNCCCCCGCCGCTCGCGCCGCTGCCCGCCGCGCTCCGGGCCACGTTCCTC    233
   161 -X--X--X--X--P--P--P--L--A--P--L--P--A--A--L--R--A--T--F--L-    180

                                                                          
   234 GCCTGCCCCGCCAACCGCTCCGCCTTCCTCGAGATGCTCCAGTGGAGCGCCGGCTCCGAC    293
   234 GCCTGCCCCGCCAACCGCTCCGCCTTCCTCGAGATGCTCCAGTGGAGCGCCGGCTCCGAC    293
   181 -A--C--P--A--N--R--S--A--F--L--E--M--L--Q--W--S--A--G--S--D-    200

                                                                          
   294 GCTGCCGCCCTTGCCACTGCCGCCGGATTTGGGCCAATGGATAATGCATCAAGCACTAGC    353
   294 GCTGCCGCCCTTGCCACTGCCGCCGGATTTGGGCCAATGGATAATGCATCAAGCACTAGC    353
   201 -A--A--A--L--A--T--A--A--G--F--G--P--M--D--N--A--S--S--T--S-    220

                                                                          
   354 CTATTCCCTCCAGACATTACATTCTATGTGGATGGGAAACCAGTTGAAGCTCATCGGGCC    413
   354 CTATTCCCTCCAGACATTACATTCTATGTGGATGGGAAACCAGTTGAAGCTCATCGGGCC    413
   221 -L--F--P--P--D--I--T--F--Y--V--D--G--K--P--V--E--A--H--R--A-    240

                                                                          
   414 ATTCTTTGTTCCCGGTCATCGTTCTTTCGACAAAAATTCAAGACAGACTGGAAAAACAGG    473
   414 ATTCTTTGTTCCCGGTCATCGTTCTTTCGACAAAAATTCAAGACAGACTGGAAAAACAGG    473
   241 -I--L--C--S--R--S--S--F--F--R--Q--K--F--K--T--D--W--K--N--R-    260

                                                                          
   474 AATGAAGTGAGATTTTCAAGCCAGAAGTTGTCTTTTGGTGCCTTATACAGCCTTATCCAT    533
   474 AATGAAGTGAGATTTTCAAGCCAGAAGTTGTCTTTTGGTGCCTTATACAGCCTTATCCAT    533
   261 -N--E--V--R--F--S--S--Q--K--L--S--F--G--A--L--Y--S--L--I--H-    280

                                                                          
   534 TTCTTCTATTCTGATAGACTCGAAGTAGATGTGGATGACATGGAAAATTTGGCACGTATG    593
   534 TTCTTCTATTCTGATAGACTCGAAGTAGATGTGGATGACATGGAAAATTTGGCACGTATG    593
   281 -F--F--Y--S--D--R--L--E--V--D--V--D--D--M--E--N--L--A--R--M-    300

                                                                          
   594 TGCAAAGTTTGTAAGTGTGAAGAGTTGCAAAAGATATTGGATAATGAAGTTGCTCATCAG    653
   594 TGCAAAGTTTGTAAGTGTGAAGAGTTGCAAAAGATATTGGATAATGAAGTTGCTCATCAG    653
   301 -C--K--V--C--K--C--E--E--L--Q--K--I--L--D--N--E--V--A--H--Q-    320

                                                                          
   654 AAATATGCAGAGTACAAGTCACCGAGAGTAGATTTGGACAGTTCACAGAAGCGCTTCATT    713
   654 AAATATGCAGAGTACAAGTCACCGAGAGTAGATTTGGACAGTTCACAGAAGCGCTTCATT    713
   321 -K--Y--A--E--Y--K--S--P--R--V--D--L--D--S--S--Q--K--R--F--I-    340

                                                                          
   714 TTAAATTGGCAATCCTTGCCAGAGGAAGATCGGCTTCCCTCGGCACTACAGCGTATTCTA    773
   714 TTAAATTGGCAATCCTTGCCAGAGGAAGATCGGCTTCCCTCGGCACTACAGCGTATTCTA    773
   341 -L--N--W--Q--S--L--P--E--E--D--R--L--P--S--A--L--Q--R--I--L-    360

                                                                          
   774 GAGGATTGCCTAGCTAACTCAAGAGAACAAGATTGTTATAACGATGAATCAAATGAAATG    833
   774 GAGGATTGCCTAGCTAACTCAAGAGAACAAGATTGTTATAACGATGAATCAAATGAAATG    833
   361 -E--D--C--L--A--N--S--R--E--Q--D--C--Y--N--D--E--S--N--E--M-    380

                                                                          
   834 AGCAGAGACTCTGGGGTGGATGCTGCTGCTGATCTTTATATAAAAGTATGTGATAAGGTT    893
   834 AGCAGAGACTCTGGGGTGGATGCTGCTGCTGATCTTTATATAAAAGTATGTGATAAGGTT    893
   381 -S--R--D--S--G--V--D--A--A--A--D--L--Y--I--K--V--C--D--K--V-    400

                                                                          
   894 TTCCATTGCCATCAGGTGATTTTAGCCTCAAGATCAGAATACTTTAAAGCCAGGCTATTT    953
   894 TTCCATTGCCATCAGGTGATTTTAGCCTCAAGATCAGAATACTTTAAAGCCAGGCTATTT    953
   401 -F--H--C--H--Q--V--I--L--A--S--R--S--E--Y--F--K--A--R--L--F-    420

                                                                          
   954 AGAAACATGGAATATCTTGAAGTTGAGAGTGGTGAAGCAACTCAAAATATTCCTTTTCTT   1013
   954 AGAAACATGGAATATCTTGAAGTTGAGAGTGGTGAAGCAACTCAAAATATTCCTTTTCTT   1013
   421 -R--N--M--E--Y--L--E--V--E--S--G--E--A--T--Q--N--I--P--F--L-    440

                                                                          
  1014 GAAGAGTTCGACTTGAGTACAGAAGCATTTGAAAAGGTGCTTGAATATATGTATACTGAT   1073
  1014 GAAGAGTTCGACTTGAGTACAGAAGCATTTGAAAAGGTGCTTGAATATATGTATACTGAT   1073
   441 -E--E--F--D--L--S--T--E--A--F--E--K--V--L--E--Y--M--Y--T--D-    460

                                                                          
  1074 AAGCTAGAGCATATGGATCCTAACCAGGCTGAAGAATTATTTGATATTGCTTCAAGATAC   1133
  1074 AAGCTAGAGCATATGGATCCTAACCAGGCTGAAGAATTATTTGATATTGCTTCAAGATAC   1133
   461 -K--L--E--H--M--D--P--N--Q--A--E--E--L--F--D--I--A--S--R--Y-    480

                                                                          
  1134 CTGCTATTCCCCCTTAAACGAGTTGTGGCCGATATACTTTTGACATATCTGGAGCATGTT   1193
  1134 CTGCTATTCCCCCTTAAACGAGTTGTGGCCGATATACTTTTGACATATCTGGAGCATGTT   1193
   481 -L--L--F--P--L--K--R--V--V--A--D--I--L--L--T--Y--L--E--H--V-    500

                                                                          
  1194 TCACCTGCAGAACTGTGCCACTGGCTAATGTTATCAGACATCTATGATGTTGTGAAAATA   1253
  1194 TCACCTGCAGAACTGTGCCACTGGCTAATGTTATCAGACATCTATGATGTTGTGAAAATA   1253
   501 -S--P--A--E--L--C--H--W--L--M--L--S--D--I--Y--D--V--V--K--I-    520

                                                                          
  1254 AGGGAGTATTGCTTGGATGTCATCGCTTGCAATTTTGAGATGTTCGCAGACACAAGAGAA   1313
  1254 AGGGAGTATTGCTTGGATGTCATCGCTTGCAATTTTGAGATGTTCGCAGACACAAGAGAA   1313
   521 -R--E--Y--C--L--D--V--I--A--C--N--F--E--M--F--A--D--T--R--E-    540

                                                                          
  1314 TTCCGGGCATTACTTTTGACACTTCCACCACCATCTGGAGATGACTCATTACGAACAACT   1373
  1314 TTCCGGGCATTACTTTTGACACTTCCACCACCATCTGGAGATGACTCATTACGAACAACT   1373
   541 -F--R--A--L--L--L--T--L--P--P--P--S--G--D--D--S--L--R--T--T-    560

                                                                          
  1374 CGTCCCAGTGAACCTGGTACGGCAGGAAACACTGATGAAGGCAACCTTCTTGATGATTTG   1433
  1374 CGTCCCAGTGAACCTGGTACGGCAGGAAACACTGATGAAGGCAACCTTCTTGATGATTTG   1433
   561 -R--P--S--E--P--G--T--A--G--N--T--D--E--G--N--L--L--D--D--L-    580

                                                                          
  1434 CGTGAGAAATGGTTAGAAGCAGAGGCTGCTGAGCTAGACGAGAGAGATGAGAGTGCAAAG   1493
  1434 CGTGAGAAATGGTTAGAAGCAGAGGCTGCTGAGCTAGACGAGAGAGATGAGAGTGCAAAG   1493
   581 -R--E--K--W--L--E--A--E--A--A--E--L--D--E--R--D--E--S--A--K-    600

                                                                          
  1494 TTGTTTGATAGGCGATTGGAGATGCTTATGCTTGTAGCGGAACAAGAAGTCAATGATGAC   1553
  1494 TTGTTTGATAGGCGATTGGAGATGCTTATGCTTGTAGCGGAACAAGAAGTCAATGATGAC   1553
   601 -L--F--D--R--R--L--E--M--L--M--L--V--A--E--Q--E--V--N--D--D-    620

                                                                          
  1554 AATGCTTAACTCCACTGTGAATTGGTACTGTACATTTTCGTGCATCTCTGTTTTTGAAGT   1613
  1554 AATGCTTAA...................................................   1562
   621 -N--A--*-...................................................    622

                                                                          
  1614 CTTCATTGCAGGTGCTTTAATGTTTTTCAGTTTGTGAACTTAGTCTTAACTAAAGAGTGA   1673
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  1674 T                                                              1674
       .                                                                  
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