Transcript: OB06G13880.1
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- OB06G13880.1 2560 762aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
J3MBJ4 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
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Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG GAG GCG GAG GCG CAG CGG GAG ATG GAG GCC GGC AAC GCC GCC TAC CGC AAG CTC TAC 60
1 ATGGAGGCGGAGGCGCAGCGGGAGATGGAGGCCGGCAACGCCGCCTACCGCAAGCTCTAC 60
1 -M--E--A--E--A--Q--R--E--M--E--A--G--N--A--A--Y--R--K--L--Y- 20
61 CTC GAG ACG GCC GTG CGC CAC TAC ACC CGG GGC GCC CGC CTC GAC CCC GGC GGC ATC TCC 120
61 CTCGAGACGGCCGTGCGCCACTACACCCGGGGCGCCCGCCTCGACCCCGGCGGCATCTCC 120
21 -L--E--T--A--V--R--H--Y--T--R--G--A--R--L--D--P--G--G--I--S- 40
121 TTC CTC ACC AAC CGC GCC GCC GCC TAC CTC CTC ATG GGC AAG T AC AAG GAA TGC GTG AGG 180
121 TTCCTCACCAACCGCGCCGCCGCCTACCTCCTCATGGGCAAGTACAAGGAATGCGTGAGG 180
41 -F--L--T--N--R--A--A--A--Y--L--L--M--G--K--Y--K--E--C--V--R- 60
181 GAC TGC GAC GAG GCG GTG GAG AGG GGC AGG GAG CTC CGC GCC GAC AAC AAG CTG GTC GCG 240
181 GACTGCGACGAGGCGGTGGAGAGGGGCAGGGAGCTCCGCGCCGACAACAAGCTGGTCGCG 240
61 -D--C--D--E--A--V--E--R--G--R--E--L--R--A--D--N--K--L--V--A- 80
241 CGG GCG CTG TCG AGG AAG GCG TCG GCG CTG CTC AAG CTC GCC GCC TGC GCC GCG GAC TAC 300
241 CGGGCGCTGTCGAGGAAGGCGTCGGCGCTGCTCAAGCTCGCCGCCTGCGCCGCGGACTAC 300
81 -R--A--L--S--R--K--A--S--A--L--L--K--L--A--A--C--A--A--D--Y- 100
301 GAG CCG GCG ATC AGG GCG CTG CAG CAG TGG CTG GCC GAG CAG TAC AGC GAG GAC ACG CTA 360
301 GAGCCGGCGATCAGGGCGCTGCAGCAGTGGCTGGCCGAGCAGTACAGCGAGGACACGCTA 360
101 -E--P--A--I--R--A--L--Q--Q--W--L--A--E--Q--Y--S--E--D--T--L- 120
361 GCC AAG CTG GAC GAG GCG GAG AAA GCC AGG AAG GAG GTG GAG GAG CAG GAG CGA CTC GAT 420
361 GCCAAGCTGGACGAGGCGGAGAAAGCCAGGAAGGAGGTGGAGGAGCAGGAGCGACTCGAT 420
121 -A--K--L--D--E--A--E--K--A--R--K--E--V--E--E--Q--E--R--L--D- 140
421 CAG GAA GCT GCC GAT CAC CAC CGA GAC AAA G T G CAA TGT GAG G AA ACG ATT TTT TTT AAT 480
421 CAGGAAGCTGCCGATCACCACCGAGACAAAGTGCAATGTGAGGAAACGATTTTTTTTAAT 480
141 -Q--E--A--A--D--H--H--R--D--K--V--Q--C--E--E--T--I--F--F--N- 160
481 CAG AGA AAG TAC CAG GAA GCA GCA ATG CAC TAT ACC GAA GCC ATG AGA AAG AAC CCA AAG 540
481 CAGAGAAAGTACCAGGAAGCAGCAATGCACTATACCGAAGCCATGAGAAAGAACCCAAAG 540
161 -Q--R--K--Y--Q--E--A--A--M--H--Y--T--E--A--M--R--K--N--P--K- 180
541 GAT CCC AGG C TT TCT TTT AGC AAT AGA GCT CAA TGC CAC ATC TAC CTA GGA GTA TTT CCT 600
541 GATCCCAGGCTTTCTTTTAGCAATAGAGCTCAATGCCACATCTACCTAGGAGTATTTCCT 600
181 -D--P--R--L--S--F--S--N--R--A--Q--C--H--I--Y--L--G--V--F--P- 200
601 GAA GGT CTT GAA GAT GCA TGT AAA TGC ATT GAG TTG GAT CCT ACT TTC CTG AAA GGC TAT 660
601 GAAGGTCTTGAAGATGCATGTAAATGCATTGAGTTGGATCCTACTTTCCTGAAAGGCTAT 660
201 -E--G--L--E--D--A--C--K--C--I--E--L--D--P--T--F--L--K--G--Y- 220
661 CTG CGT AAA GCT AAA GTT CAG TTC CTT ATG AAC AAT TAT GAA AAT GCT CTG GCA ACT TAC 720
661 CTGCGTAAAGCTAAAGTTCAGTTCCTTATGAACAATTATGAAAATGCTCTGGCAACTTAC 720
221 -L--R--K--A--K--V--Q--F--L--M--N--N--Y--E--N--A--L--A--T--Y- 240
721 TTG GAG GGT TTG AAG TGT GAC CCA AAC AAC CTC GAA GTT CTT GAT GGC TTG AGG AG A TGT 780
721 TTGGAGGGTTTGAAGTGTGACCCAAACAACCTCGAAGTTCTTGATGGCTTGAGGAGATGT 780
241 -L--E--G--L--K--C--D--P--N--N--L--E--V--L--D--G--L--R--R--C- 260
781 GCA GCA TGC ATT AAA AGG GCT AAT GGC GGT GAT GCC AGC ACA GAG GAC TTG AGA GAG ATA 840
781 GCAGCATGCATTAAAAGGGCTAATGGCGGTGATGCCAGCACAGAGGACTTGAGAGAGATA 840
261 -A--A--C--I--K--R--A--N--G--G--D--A--S--T--E--D--L--R--E--I- 280
841 TTG G GA GAT TTG CAT TTG AAT GAT GAT CTG CAT AAT AAA CTG CAA AAA TGC ATG GAT GAA 900
841 TTGGGAGATTTGCATTTGAATGATGATCTGCATAATAAACTGCAAAAATGCATGGATGAA 900
281 -L--G--D--L--H--L--N--D--D--L--H--N--K--L--Q--K--C--M--D--E- 300
901 GCT GCA CTG TTG AAG AAG GAA GCA TCT GAC GAG CGT TTA AAG CGG ATT GAA TCT GAA CGA 960
901 GCTGCACTGTTGAAGAAGGAAGCATCTGACGAGCGTTTAAAGCGGATTGAATCTGAACGA 960
301 -A--A--L--L--K--K--E--A--S--D--E--R--L--K--R--I--E--S--E--R- 320
961 TTG G CC AGG ACA TTA GAA GAC CTG TAT TTA AGC CAG GTC CAA CAA AGG AAA GAA ACG GGG 1020
961 TTGGCCAGGACATTAGAAGACCTGTATTTAAGCCAGGTCCAACAAAGGAAAGAAACGGGG 1020
321 -L--A--R--T--L--E--D--L--Y--L--S--Q--V--Q--Q--R--K--E--T--G- 340
1021 GAA TCT CTT TCA AGG GTA CAA CAA GAG TTT GAA CAA CTT AAA ATG CAG CAA GAT GAG GTC 1080
1021 GAATCTCTTTCAAGGGTACAACAAGAGTTTGAACAACTTAAAATGCAGCAAGATGAGGTC 1080
341 -E--S--L--S--R--V--Q--Q--E--F--E--Q--L--K--M--Q--Q--D--E--V- 360
1081 ACC GTG GAA CTT CAG AAA GTC AAT GAG CTG AAC GAG AAT CTA CTA GGT CAA CTC TCT GAA 1140
1081 ACCGTGGAACTTCAGAAAGTCAATGAGCTGAACGAGAATCTACTAGGTCAACTCTCTGAA 1140
361 -T--V--E--L--Q--K--V--N--E--L--N--E--N--L--L--G--Q--L--S--E- 380
1141 TCC AAA GAG TGT TTT GAA TGG CTT CTA TCG GAG CAT GAT CAC TTG CTA CAT GAA CGA GAT 1200
1141 TCCAAAGAGTGTTTTGAATGGCTTCTATCGGAGCATGATCACTTGCTACATGAACGAGAT 1200
381 -S--K--E--C--F--E--W--L--L--S--E--H--D--H--L--L--H--E--R--D- 400
1201 AAT GCA GTC CGA GAG GTT GAA GAA TTA CGT CGG AAA AGA GGC CAA ATG CTT TCA GTT TTG 1260
1201 AATGCAGTCCGAGAGGTTGAAGAATTACGTCGGAAAAGAGGCCAAATGCTTTCAGTTTTG 1260
401 -N--A--V--R--E--V--E--E--L--R--R--K--R--G--Q--M--L--S--V--L- 420
1261 GTT ACA GCG ATG CAC T TT GCA ATA AAG GTG CTC AGA CCT GAT AGT TTA CAG GGG CAA TCA 1320
1261 GTTACAGCGATGCACTTTGCAATAAAGGTGCTCAGACCTGATAGTTTACAGGGGCAATCA 1320
421 -V--T--A--M--H--F--A--I--K--V--L--R--P--D--S--L--Q--G--Q--S- 440
1321 CAG TTC GAA CAA GAG G TT TCT ATC CTT AGT AGA GTG AGA CAC CCT CAC CTT GTG ACT CTC 1380
1321 CAGTTCGAACAAGAGGTTTCTATCCTTAGTAGAGTGAGACACCCTCACCTTGTGACTCTC 1380
441 -Q--F--E--Q--E--V--S--I--L--S--R--V--R--H--P--H--L--V--T--L- 460
1381 TTA GGA GCT TGC TTA GCG TCT TCA ACA CTT GTA TAT GAG TTC CTT CCA AAT GGA AGC CTT 1440
1381 TTAGGAGCTTGCTTAGCGTCTTCAACACTTGTATATGAGTTCCTTCCAAATGGAAGCCTT 1440
461 -L--G--A--C--L--A--S--S--T--L--V--Y--E--F--L--P--N--G--S--L- 480
1441 GAA GAT TTT CTT GTG TGT CCA GAT AAG AGG CAA AAT TTG ACA TGG CAA GTT CGG ATT AGA 1500
1441 GAAGATTTTCTTGTGTGTCCAGATAAGAGGCAAAATTTGACATGGCAAGTTCGGATTAGA 1500
481 -E--D--F--L--V--C--P--D--K--R--Q--N--L--T--W--Q--V--R--I--R- 500
1501 ATT ATT GCT GAG ATA TGT TCA GCA CTG ATC TTC CTG CAT AAG AAT AAA CCT CAC CCA GTT 1560
1501 ATTATTGCTGAGATATGTTCAGCACTGATCTTCCTGCATAAGAATAAACCTCACCCAGTT 1560
501 -I--I--A--E--I--C--S--A--L--I--F--L--H--K--N--K--P--H--P--V- 520
1561 GTT CAT GGA GAT CTT AAG CCT GCT AAC ATC CTC CTT GAT GTT AAT TTG GTC AGT AAG CTC 1620
1561 GTTCATGGAGATCTTAAGCCTGCTAACATCCTCCTTGATGTTAATTTGGTCAGTAAGCTC 1620
521 -V--H--G--D--L--K--P--A--N--I--L--L--D--V--N--L--V--S--K--L- 540
1621 AGT GAC TTT GGT TTT TCT CGT CTC CTA ATC CAG TCC AGC ACC AAT AAC ACC ACC CTG TAC 1680
1621 AGTGACTTTGGTTTTTCTCGTCTCCTAATCCAGTCCAGCACCAATAACACCACCCTGTAC 1680
541 -S--D--F--G--F--S--R--L--L--I--Q--S--S--T--N--N--T--T--L--Y- 560
1681 CGC ACC ATG CAT CCT GTG GGT ACC CCT CTG TAC ATG GAC CCA GAA TTT CTT TCC ACT GGA 1740
1681 CGCACCATGCATCCTGTGGGTACCCCTCTGTACATGGACCCAGAATTTCTTTCCACTGGA 1740
561 -R--T--M--H--P--V--G--T--P--L--Y--M--D--P--E--F--L--S--T--G- 580
1741 GAG TTG ACA CCT CAG TCC GAT GTT TAT TCA TTT GGG ATT GTA GTC TTG CGT CTG TTA ACA 1800
1741 GAGTTGACACCTCAGTCCGATGTTTATTCATTTGGGATTGTAGTCTTGCGTCTGTTAACA 1800
581 -E--L--T--P--Q--S--D--V--Y--S--F--G--I--V--V--L--R--L--L--T- 600
1801 GGC AGG CCT CCT GTT GGT ATA AAG AAG ATT GTG GAG GAT GCA ATG GAG AAA GGC GAC TTG 1860
1801 GGCAGGCCTCCTGTTGGTATAAAGAAGATTGTGGAGGATGCAATGGAGAAAGGCGACTTG 1860
601 -G--R--P--P--V--G--I--K--K--I--V--E--D--A--M--E--K--G--D--L- 620
1861 AAT TCT GTA ATT GAT ACC TCA GTG GGA GAC TGG CCT CAT CTG TAC ATA GAA CAG CTG GCA 1920
1861 AATTCTGTAATTGATACCTCAGTGGGAGACTGGCCTCATCTGTACATAGAACAGCTGGCA 1920
621 -N--S--V--I--D--T--S--V--G--D--W--P--H--L--Y--I--E--Q--L--A- 640
1921 TAC CTT GCT CTC AGA TGC ACT GAG TTG AGC AGG AGG TGC CGC CCT GAT CTT TCA GGT GAG 1980
1921 TACCTTGCTCTCAGATGCACTGAGTTGAGCAGGAGGTGCCGCCCTGATCTTTCAGGTGAG 1980
641 -Y--L--A--L--R--C--T--E--L--S--R--R--C--R--P--D--L--S--G--E- 660
1981 GTG TGG GAA ATA GTT GAG GGC ATA AGG GAT GCT GCA TTA TCT TCA CCT TCA TCC TCT AGA 2040
1981 GTGTGGGAAATAGTTGAGGGCATAAGGGATGCTGCATTATCTTCACCTTCATCCTCTAGA 2040
661 -V--W--E--I--V--E--G--I--R--D--A--A--L--S--S--P--S--S--S--R- 680
2041 TCA ATG CAG GAT CAG AAC AGT GCA CCA TCA TAT TTC ATC TGT CCT ATA TCT CAG GAT ATC 2100
2041 TCAATGCAGGATCAGAACAGTGCACCATCATATTTCATCTGTCCTATATCTCAGGATATC 2100
681 -S--M--Q--D--Q--N--S--A--P--S--Y--F--I--C--P--I--S--Q--D--I- 700
2101 ATG GAT GAT CCT CAC ATT GCA GCA GAT GGA TTC ACC TAC GAA GCC GAT GCC ATC AGG AGT 2160
2101 ATGGATGATCCTCACATTGCAGCAGATGGATTCACCTACGAAGCCGATGCCATCAGGAGT 2160
701 -M--D--D--P--H--I--A--A--D--G--F--T--Y--E--A--D--A--I--R--S- 720
2161 TGG CTC TGC GCT GGT CAT GAC ACA TCT CCA ATG ACC AAC TTG CGA CTT GAA CAC GAG GAA 2220
2161 TGGCTCTGCGCTGGTCATGACACATCTCCAATGACCAACTTGCGACTTGAACACGAGGAA 2220
721 -W--L--C--A--G--H--D--T--S--P--M--T--N--L--R--L--E--H--E--E- 740
2221 CTC ATC CCG AAT CGT GCA CTA CGT TCT GCT ATT CAG GAG TGG CTC CAG CAG CAC AAC ATG 2280
2221 CTCATCCCGAATCGTGCACTACGTTCTGCTATTCAGGAGTGGCTCCAGCAGCACAACATG 2280
741 -L--I--P--N--R--A--L--R--S--A--I--Q--E--W--L--Q--Q--H--N--M- 760
2281 GCG CTG TAG CCAACTTCCTCCCATATGTGAAGCAAGTGGTACCAACTGTATAGAATTAAC 2340
2281 GCGCTGTAG................................................... 2289
761 -A--L--*-................................................... 762
2341 AGACCCCTAAGGCAAGTTCGGTATGCCTTCTTTATGCAGGTATGTAACTAGTATAGTAGC 2400
............................................................
............................................................
2401 ATGTAATGTGAAGGCAGTGTTGGGCAAAGCCCAGTAACTTCGATATGTAGTGAGGACAAA 2460
............................................................
............................................................
2461 ACCTGTATGCGTGTAGTGTAGGTATGGCTATGACTCTTGAGGACAACTAATGTCGAATCT 2520
............................................................
............................................................
2521 TAGTTTGATAATGTGTATATCAACCGTAATGTTGCATGTG 2560
........................................
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