Oryza brachyantha (Oryza_brachyantha.v1.4b)
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This transcript has 12 exons and is annotated with 31 domains and features.

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This transcript is a product of gene OB06G13880 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OB06G13880.12560762aa
 
Protein coding
J3MBJ4 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
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Exons
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Other
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     1 ATGGAGGCGGAGGCGCAGCGGGAGATGGAGGCCGGCAACGCCGCCTACCGCAAGCTCTAC     60
     1 ATGGAGGCGGAGGCGCAGCGGGAGATGGAGGCCGGCAACGCCGCCTACCGCAAGCTCTAC     60
     1 -M--E--A--E--A--Q--R--E--M--E--A--G--N--A--A--Y--R--K--L--Y-     20

                                                                          
    61 CTCGAGACGGCCGTGCGCCACTACACCCGGGGCGCCCGCCTCGACCCCGGCGGCATCTCC    120
    61 CTCGAGACGGCCGTGCGCCACTACACCCGGGGCGCCCGCCTCGACCCCGGCGGCATCTCC    120
    21 -L--E--T--A--V--R--H--Y--T--R--G--A--R--L--D--P--G--G--I--S-     40

                                                                          
   121 TTCCTCACCAACCGCGCCGCCGCCTACCTCCTCATGGGCAAGTACAAGGAATGCGTGAGG    180
   121 TTCCTCACCAACCGCGCCGCCGCCTACCTCCTCATGGGCAAGTACAAGGAATGCGTGAGG    180
    41 -F--L--T--N--R--A--A--A--Y--L--L--M--G--K--Y--K--E--C--V--R-     60

                                                                          
   181 GACTGCGACGAGGCGGTGGAGAGGGGCAGGGAGCTCCGCGCCGACAACAAGCTGGTCGCG    240
   181 GACTGCGACGAGGCGGTGGAGAGGGGCAGGGAGCTCCGCGCCGACAACAAGCTGGTCGCG    240
    61 -D--C--D--E--A--V--E--R--G--R--E--L--R--A--D--N--K--L--V--A-     80

                                                                          
   241 CGGGCGCTGTCGAGGAAGGCGTCGGCGCTGCTCAAGCTCGCCGCCTGCGCCGCGGACTAC    300
   241 CGGGCGCTGTCGAGGAAGGCGTCGGCGCTGCTCAAGCTCGCCGCCTGCGCCGCGGACTAC    300
    81 -R--A--L--S--R--K--A--S--A--L--L--K--L--A--A--C--A--A--D--Y-    100

                                                                          
   301 GAGCCGGCGATCAGGGCGCTGCAGCAGTGGCTGGCCGAGCAGTACAGCGAGGACACGCTA    360
   301 GAGCCGGCGATCAGGGCGCTGCAGCAGTGGCTGGCCGAGCAGTACAGCGAGGACACGCTA    360
   101 -E--P--A--I--R--A--L--Q--Q--W--L--A--E--Q--Y--S--E--D--T--L-    120

                                                                          
   361 GCCAAGCTGGACGAGGCGGAGAAAGCCAGGAAGGAGGTGGAGGAGCAGGAGCGACTCGAT    420
   361 GCCAAGCTGGACGAGGCGGAGAAAGCCAGGAAGGAGGTGGAGGAGCAGGAGCGACTCGAT    420
   121 -A--K--L--D--E--A--E--K--A--R--K--E--V--E--E--Q--E--R--L--D-    140

                                                                          
   421 CAGGAAGCTGCCGATCACCACCGAGACAAAGTGCAATGTGAGGAAACGATTTTTTTTAAT    480
   421 CAGGAAGCTGCCGATCACCACCGAGACAAAGTGCAATGTGAGGAAACGATTTTTTTTAAT    480
   141 -Q--E--A--A--D--H--H--R--D--K--V--Q--C--E--E--T--I--F--F--N-    160

                                                                          
   481 CAGAGAAAGTACCAGGAAGCAGCAATGCACTATACCGAAGCCATGAGAAAGAACCCAAAG    540
   481 CAGAGAAAGTACCAGGAAGCAGCAATGCACTATACCGAAGCCATGAGAAAGAACCCAAAG    540
   161 -Q--R--K--Y--Q--E--A--A--M--H--Y--T--E--A--M--R--K--N--P--K-    180

                                                                          
   541 GATCCCAGGCTTTCTTTTAGCAATAGAGCTCAATGCCACATCTACCTAGGAGTATTTCCT    600
   541 GATCCCAGGCTTTCTTTTAGCAATAGAGCTCAATGCCACATCTACCTAGGAGTATTTCCT    600
   181 -D--P--R--L--S--F--S--N--R--A--Q--C--H--I--Y--L--G--V--F--P-    200

                                                                          
   601 GAAGGTCTTGAAGATGCATGTAAATGCATTGAGTTGGATCCTACTTTCCTGAAAGGCTAT    660
   601 GAAGGTCTTGAAGATGCATGTAAATGCATTGAGTTGGATCCTACTTTCCTGAAAGGCTAT    660
   201 -E--G--L--E--D--A--C--K--C--I--E--L--D--P--T--F--L--K--G--Y-    220

                                                                          
   661 CTGCGTAAAGCTAAAGTTCAGTTCCTTATGAACAATTATGAAAATGCTCTGGCAACTTAC    720
   661 CTGCGTAAAGCTAAAGTTCAGTTCCTTATGAACAATTATGAAAATGCTCTGGCAACTTAC    720
   221 -L--R--K--A--K--V--Q--F--L--M--N--N--Y--E--N--A--L--A--T--Y-    240

                                                                          
   721 TTGGAGGGTTTGAAGTGTGACCCAAACAACCTCGAAGTTCTTGATGGCTTGAGGAGATGT    780
   721 TTGGAGGGTTTGAAGTGTGACCCAAACAACCTCGAAGTTCTTGATGGCTTGAGGAGATGT    780
   241 -L--E--G--L--K--C--D--P--N--N--L--E--V--L--D--G--L--R--R--C-    260

                                                                          
   781 GCAGCATGCATTAAAAGGGCTAATGGCGGTGATGCCAGCACAGAGGACTTGAGAGAGATA    840
   781 GCAGCATGCATTAAAAGGGCTAATGGCGGTGATGCCAGCACAGAGGACTTGAGAGAGATA    840
   261 -A--A--C--I--K--R--A--N--G--G--D--A--S--T--E--D--L--R--E--I-    280

                                                                          
   841 TTGGGAGATTTGCATTTGAATGATGATCTGCATAATAAACTGCAAAAATGCATGGATGAA    900
   841 TTGGGAGATTTGCATTTGAATGATGATCTGCATAATAAACTGCAAAAATGCATGGATGAA    900
   281 -L--G--D--L--H--L--N--D--D--L--H--N--K--L--Q--K--C--M--D--E-    300

                                                                          
   901 GCTGCACTGTTGAAGAAGGAAGCATCTGACGAGCGTTTAAAGCGGATTGAATCTGAACGA    960
   901 GCTGCACTGTTGAAGAAGGAAGCATCTGACGAGCGTTTAAAGCGGATTGAATCTGAACGA    960
   301 -A--A--L--L--K--K--E--A--S--D--E--R--L--K--R--I--E--S--E--R-    320

                                                                          
   961 TTGGCCAGGACATTAGAAGACCTGTATTTAAGCCAGGTCCAACAAAGGAAAGAAACGGGG   1020
   961 TTGGCCAGGACATTAGAAGACCTGTATTTAAGCCAGGTCCAACAAAGGAAAGAAACGGGG   1020
   321 -L--A--R--T--L--E--D--L--Y--L--S--Q--V--Q--Q--R--K--E--T--G-    340

                                                                          
  1021 GAATCTCTTTCAAGGGTACAACAAGAGTTTGAACAACTTAAAATGCAGCAAGATGAGGTC   1080
  1021 GAATCTCTTTCAAGGGTACAACAAGAGTTTGAACAACTTAAAATGCAGCAAGATGAGGTC   1080
   341 -E--S--L--S--R--V--Q--Q--E--F--E--Q--L--K--M--Q--Q--D--E--V-    360

                                                                          
  1081 ACCGTGGAACTTCAGAAAGTCAATGAGCTGAACGAGAATCTACTAGGTCAACTCTCTGAA   1140
  1081 ACCGTGGAACTTCAGAAAGTCAATGAGCTGAACGAGAATCTACTAGGTCAACTCTCTGAA   1140
   361 -T--V--E--L--Q--K--V--N--E--L--N--E--N--L--L--G--Q--L--S--E-    380

                                                                          
  1141 TCCAAAGAGTGTTTTGAATGGCTTCTATCGGAGCATGATCACTTGCTACATGAACGAGAT   1200
  1141 TCCAAAGAGTGTTTTGAATGGCTTCTATCGGAGCATGATCACTTGCTACATGAACGAGAT   1200
   381 -S--K--E--C--F--E--W--L--L--S--E--H--D--H--L--L--H--E--R--D-    400

                                                                          
  1201 AATGCAGTCCGAGAGGTTGAAGAATTACGTCGGAAAAGAGGCCAAATGCTTTCAGTTTTG   1260
  1201 AATGCAGTCCGAGAGGTTGAAGAATTACGTCGGAAAAGAGGCCAAATGCTTTCAGTTTTG   1260
   401 -N--A--V--R--E--V--E--E--L--R--R--K--R--G--Q--M--L--S--V--L-    420

                                                                          
  1261 GTTACAGCGATGCACTTTGCAATAAAGGTGCTCAGACCTGATAGTTTACAGGGGCAATCA   1320
  1261 GTTACAGCGATGCACTTTGCAATAAAGGTGCTCAGACCTGATAGTTTACAGGGGCAATCA   1320
   421 -V--T--A--M--H--F--A--I--K--V--L--R--P--D--S--L--Q--G--Q--S-    440

                                                                          
  1321 CAGTTCGAACAAGAGGTTTCTATCCTTAGTAGAGTGAGACACCCTCACCTTGTGACTCTC   1380
  1321 CAGTTCGAACAAGAGGTTTCTATCCTTAGTAGAGTGAGACACCCTCACCTTGTGACTCTC   1380
   441 -Q--F--E--Q--E--V--S--I--L--S--R--V--R--H--P--H--L--V--T--L-    460

                                                                          
  1381 TTAGGAGCTTGCTTAGCGTCTTCAACACTTGTATATGAGTTCCTTCCAAATGGAAGCCTT   1440
  1381 TTAGGAGCTTGCTTAGCGTCTTCAACACTTGTATATGAGTTCCTTCCAAATGGAAGCCTT   1440
   461 -L--G--A--C--L--A--S--S--T--L--V--Y--E--F--L--P--N--G--S--L-    480

                                                                          
  1441 GAAGATTTTCTTGTGTGTCCAGATAAGAGGCAAAATTTGACATGGCAAGTTCGGATTAGA   1500
  1441 GAAGATTTTCTTGTGTGTCCAGATAAGAGGCAAAATTTGACATGGCAAGTTCGGATTAGA   1500
   481 -E--D--F--L--V--C--P--D--K--R--Q--N--L--T--W--Q--V--R--I--R-    500

                                                                          
  1501 ATTATTGCTGAGATATGTTCAGCACTGATCTTCCTGCATAAGAATAAACCTCACCCAGTT   1560
  1501 ATTATTGCTGAGATATGTTCAGCACTGATCTTCCTGCATAAGAATAAACCTCACCCAGTT   1560
   501 -I--I--A--E--I--C--S--A--L--I--F--L--H--K--N--K--P--H--P--V-    520

                                                                          
  1561 GTTCATGGAGATCTTAAGCCTGCTAACATCCTCCTTGATGTTAATTTGGTCAGTAAGCTC   1620
  1561 GTTCATGGAGATCTTAAGCCTGCTAACATCCTCCTTGATGTTAATTTGGTCAGTAAGCTC   1620
   521 -V--H--G--D--L--K--P--A--N--I--L--L--D--V--N--L--V--S--K--L-    540

                                                                          
  1621 AGTGACTTTGGTTTTTCTCGTCTCCTAATCCAGTCCAGCACCAATAACACCACCCTGTAC   1680
  1621 AGTGACTTTGGTTTTTCTCGTCTCCTAATCCAGTCCAGCACCAATAACACCACCCTGTAC   1680
   541 -S--D--F--G--F--S--R--L--L--I--Q--S--S--T--N--N--T--T--L--Y-    560

                                                                          
  1681 CGCACCATGCATCCTGTGGGTACCCCTCTGTACATGGACCCAGAATTTCTTTCCACTGGA   1740
  1681 CGCACCATGCATCCTGTGGGTACCCCTCTGTACATGGACCCAGAATTTCTTTCCACTGGA   1740
   561 -R--T--M--H--P--V--G--T--P--L--Y--M--D--P--E--F--L--S--T--G-    580

                                                                          
  1741 GAGTTGACACCTCAGTCCGATGTTTATTCATTTGGGATTGTAGTCTTGCGTCTGTTAACA   1800
  1741 GAGTTGACACCTCAGTCCGATGTTTATTCATTTGGGATTGTAGTCTTGCGTCTGTTAACA   1800
   581 -E--L--T--P--Q--S--D--V--Y--S--F--G--I--V--V--L--R--L--L--T-    600

                                                                          
  1801 GGCAGGCCTCCTGTTGGTATAAAGAAGATTGTGGAGGATGCAATGGAGAAAGGCGACTTG   1860
  1801 GGCAGGCCTCCTGTTGGTATAAAGAAGATTGTGGAGGATGCAATGGAGAAAGGCGACTTG   1860
   601 -G--R--P--P--V--G--I--K--K--I--V--E--D--A--M--E--K--G--D--L-    620

                                                                          
  1861 AATTCTGTAATTGATACCTCAGTGGGAGACTGGCCTCATCTGTACATAGAACAGCTGGCA   1920
  1861 AATTCTGTAATTGATACCTCAGTGGGAGACTGGCCTCATCTGTACATAGAACAGCTGGCA   1920
   621 -N--S--V--I--D--T--S--V--G--D--W--P--H--L--Y--I--E--Q--L--A-    640

                                                                          
  1921 TACCTTGCTCTCAGATGCACTGAGTTGAGCAGGAGGTGCCGCCCTGATCTTTCAGGTGAG   1980
  1921 TACCTTGCTCTCAGATGCACTGAGTTGAGCAGGAGGTGCCGCCCTGATCTTTCAGGTGAG   1980
   641 -Y--L--A--L--R--C--T--E--L--S--R--R--C--R--P--D--L--S--G--E-    660

                                                                          
  1981 GTGTGGGAAATAGTTGAGGGCATAAGGGATGCTGCATTATCTTCACCTTCATCCTCTAGA   2040
  1981 GTGTGGGAAATAGTTGAGGGCATAAGGGATGCTGCATTATCTTCACCTTCATCCTCTAGA   2040
   661 -V--W--E--I--V--E--G--I--R--D--A--A--L--S--S--P--S--S--S--R-    680

                                                                          
  2041 TCAATGCAGGATCAGAACAGTGCACCATCATATTTCATCTGTCCTATATCTCAGGATATC   2100
  2041 TCAATGCAGGATCAGAACAGTGCACCATCATATTTCATCTGTCCTATATCTCAGGATATC   2100
   681 -S--M--Q--D--Q--N--S--A--P--S--Y--F--I--C--P--I--S--Q--D--I-    700

                                                                          
  2101 ATGGATGATCCTCACATTGCAGCAGATGGATTCACCTACGAAGCCGATGCCATCAGGAGT   2160
  2101 ATGGATGATCCTCACATTGCAGCAGATGGATTCACCTACGAAGCCGATGCCATCAGGAGT   2160
   701 -M--D--D--P--H--I--A--A--D--G--F--T--Y--E--A--D--A--I--R--S-    720

                                                                          
  2161 TGGCTCTGCGCTGGTCATGACACATCTCCAATGACCAACTTGCGACTTGAACACGAGGAA   2220
  2161 TGGCTCTGCGCTGGTCATGACACATCTCCAATGACCAACTTGCGACTTGAACACGAGGAA   2220
   721 -W--L--C--A--G--H--D--T--S--P--M--T--N--L--R--L--E--H--E--E-    740

                                                                          
  2221 CTCATCCCGAATCGTGCACTACGTTCTGCTATTCAGGAGTGGCTCCAGCAGCACAACATG   2280
  2221 CTCATCCCGAATCGTGCACTACGTTCTGCTATTCAGGAGTGGCTCCAGCAGCACAACATG   2280
   741 -L--I--P--N--R--A--L--R--S--A--I--Q--E--W--L--Q--Q--H--N--M-    760

                                                                          
  2281 GCGCTGTAGCCAACTTCCTCCCATATGTGAAGCAAGTGGTACCAACTGTATAGAATTAAC   2340
  2281 GCGCTGTAG...................................................   2289
   761 -A--L--*-...................................................    762

                                                                          
  2341 AGACCCCTAAGGCAAGTTCGGTATGCCTTCTTTATGCAGGTATGTAACTAGTATAGTAGC   2400
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2401 ATGTAATGTGAAGGCAGTGTTGGGCAAAGCCCAGTAACTTCGATATGTAGTGAGGACAAA   2460
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2461 ACCTGTATGCGTGTAGTGTAGGTATGGCTATGACTCTTGAGGACAACTAATGTCGAATCT   2520
       ............................................................       
       ............................................................       

                                                                          
  2521 TAGTTTGATAATGTGTATATCAACCGTAATGTTGCATGTG                       2560
       ........................................                           
       ........................................