Transcript: OB06G10110.1
.
Show/hide columns (1 hidden)
- OB06G10110.1 1299 432aa Gene/transcipt that contains an open reading frame (ORF). Protein coding
J3MAG7 A single transcript chosen for a gene which is the most conserved, most highly expressed, has the longest coding sequence and is represented in other key resources, such as NCBI and UniProt. This is defined in detail on http://www.ensembl.org/info/genome/genebuild/canonical.html Ensembl Canonical,
.
Codons Alternating codons Alternating codons Exons Variants Other Markup ▼ ▲
1 ATG CAG TAC ATG GGT CTA GTA GGA AAG TGG GCC TCG GTT CGA GAT CCT TCT GGG AGC AGG 60
1 ATGCAGTACATGGGTCTAGTAGGAAAGTGGGCCTCGGTTCGAGATCCTTCTGGGAGCAGG 60
1 -M--Q--Y--M--G--L--V--G--K--W--A--S--V--R--D--P--S--G--S--R- 20
61 AGG CTA TGG CCC ACT GTC AGT GAC AGC AGG TGG ACA CGT ACA CGC CAT CTC CTC CTC TTC 120
61 AGGCTATGGCCCACTGTCAGTGACAGCAGGTGGACACGTACACGCCATCTCCTCCTCTTC 120
21 -R--L--W--P--T--V--S--D--S--R--W--T--R--T--R--H--L--L--L--F- 40
121 TTC TTC TTC TCC TCG ATC TCA TAC CTT CTC CCC TTC CTC CCA ATT TCC CAA AGA CTT TGG 180
121 TTCTTCTTCTCCTCGATCTCATACCTTCTCCCCTTCCTCCCAATTTCCCAAAGACTTTGG 180
41 -F--F--F--S--S--I--S--Y--L--L--P--F--L--P--I--S--Q--R--L--W- 60
181 TGC AGG GAG GGA GGG CGA CAG ATT GGT TTG GTA GCA GTT GAG TTG CTG AAT TCT TTC TTC 240
181 TGCAGGGAGGGAGGGCGACAGATTGGTTTGGTAGCAGTTGAGTTGCTGAATTCTTTCTTC 240
61 -C--R--E--G--G--R--Q--I--G--L--V--A--V--E--L--L--N--S--F--F- 80
241 TAT CTA GCT CTA GCT CCC ATC GGT ATC GGG CTC CTC CAT TTT CCG GCG GCG GCG GCG GCC 300
241 TATCTAGCTCTAGCTCCCATCGGTATCGGGCTCCTCCATTTTCCGGCGGCGGCGGCGGCC 300
81 -Y--L--A--L--A--P--I--G--I--G--L--L--H--F--P--A--A--A--A--A- 100
301 ATG TCG TCT GCG GCT CAT CCG CAG CGC TTC TAC TGC CAT CAG TGC GAA CGC AAC GTC CCC 360
301 ATGTCGTCTGCGGCTCATCCGCAGCGCTTCTACTGCCATCAGTGCGAACGCAACGTCCCC 360
101 -M--S--S--A--A--H--P--Q--R--F--Y--C--H--Q--C--E--R--N--V--P- 120
361 ATC GCC CCG CCC ACC TCC CCC GAC GCC GAC GTC CTC TGC CCG CTC TGC GGT GGA GGA TTC 420
361 ATCGCCCCGCCCACCTCCCCCGACGCCGACGTCCTCTGCCCGCTCTGCGGTGGAGGATTC 420
121 -I--A--P--P--T--S--P--D--A--D--V--L--C--P--L--C--G--G--G--F- 140
421 GTC GAG GAG GCG GGG CTT GGG GAG GGC ACT AAC CCT AGC CCA CAC CCT GCC GCC TTC CTG 480
421 GTCGAGGAGGCGGGGCTTGGGGAGGGCACTAACCCTAGCCCACACCCTGCCGCCTTCCTG 480
141 -V--E--E--A--G--L--G--E--G--T--N--P--S--P--H--P--A--A--F--L- 160
481 CCA CAC CCC TTC TTC CCC TTT GCC TCC CCT TCC TTC GAT CTC CGC CAC CCT AGC GAC CTC 540
481 CCACACCCCTTCTTCCCCTTTGCCTCCCCTTCCTTCGATCTCCGCCACCCTAGCGACCTC 540
161 -P--H--P--F--F--P--F--A--S--P--S--F--D--L--R--H--P--S--D--L- 180
541 AAC GCC TTC TTC GGC CCC CCC TCC CCC GCG CCC GCG CCC GCA CCT TCG GCA TCC ACC CAC 600
541 AACGCCTTCTTCGGCCCCCCCTCCCCCGCGCCCGCGCCCGCACCTTCGGCATCCACCCAC 600
181 -N--A--F--F--G--P--P--S--P--A--P--A--P--A--P--S--A--S--T--H- 200
601 TTC GAC CCC TCC AAC TTC CTC CAT GAC CAT TTC ACC GGC CTC CTC TCT GGC GGC GCC ACC 660
601 TTCGACCCCTCCAACTTCCTCCATGACCATTTCACCGGCCTCCTCTCTGGCGGCGCCACC 660
201 -F--D--P--S--N--F--L--H--D--H--F--T--G--L--L--S--G--G--A--T- 220
661 ATC CAG ATC GTC CTC GAG GGC TCC TCC GCT TCC TTC CCC GGT GCC TCC TCC GGG ATC AGC 720
661 ATCCAGATCGTCCTCGAGGGCTCCTCCGCTTCCTTCCCCGGTGCCTCCTCCGGGATCAGC 720
221 -I--Q--I--V--L--E--G--S--S--A--S--F--P--G--A--S--S--G--I--S- 240
721 CTC GGC GAC TAC TTT GTC GGC TCC GGC CTC GAG CAG CTC ATC CAG CAG CTC GCT GAG AAC 780
721 CTCGGCGACTACTTTGTCGGCTCCGGCCTCGAGCAGCTCATCCAGCAGCTCGCTGAGAAC 780
241 -L--G--D--Y--F--V--G--S--G--L--E--Q--L--I--Q--Q--L--A--E--N- 260
781 GAT CCC AAC CGC TAC GGC ACC CCT CCT GCC GCC AAG TCC GCT GTC GCC GCA CTC CCT GAC 840
781 GATCCCAACCGCTACGGCACCCCTCCTGCCGCCAAGTCCGCTGTCGCCGCACTCCCTGAC 840
261 -D--P--N--R--Y--G--T--P--P--A--A--K--S--A--V--A--A--L--P--D- 280
841 GTC GCC GTC TCC GCC GAC ATG ATG GCC GCC GAT GGA GGG GCC CAG TGC GCC GTC TGC ATG 900
841 GTCGCCGTCTCCGCCGACATGATGGCCGCCGATGGAGGGGCCCAGTGCGCCGTCTGCATG 900
281 -V--A--V--S--A--D--M--M--A--A--D--G--G--A--Q--C--A--V--C--M- 300
901 GAC GAC TTC CAC CTT GGC GCT GAT GCC AAG CAG CTC CCC TGC AAA CAT GTC TTC CAC AAG 960
901 GACGACTTCCACCTTGGCGCTGATGCCAAGCAGCTCCCCTGCAAACATGTCTTCCACAAG 960
301 -D--D--F--H--L--G--A--D--A--K--Q--L--P--C--K--H--V--F--H--K- 320
961 GAT TGC ATC CTC CCC TGG CTC GAC CTG CAC AGC TCC TGC CCC GTT TGC CGC TTT GAG CTG 1020
961 GATTGCATCCTCCCCTGGCTCGACCTGCACAGCTCCTGCCCCGTTTGCCGCTTTGAGCTG 1020
321 -D--C--I--L--P--W--L--D--L--H--S--S--C--P--V--C--R--F--E--L- 340
1021 CCC ACA GAT GAC CCT GAC CAC GGC CAC CGC CGG GGA TCT GAC CAG CCC ACC GCA GCA GCA 1080
1021 CCCACAGATGACCCTGACCACGGCCACCGCCGGGGATCTGACCAGCCCACCGCAGCAGCA 1080
341 -P--T--D--D--P--D--H--G--H--R--R--G--S--D--Q--P--T--A--A--A- 360
1081 GCA GCA GCA GCA GCT GCA GCT GC C GCC ACC CCT TCG CCC AGG GTG GCA GAG AGA AGG TTC 1140
1081 GCAGCAGCAGCAGCTGCAGCTGCCGCCACCCCTTCGCCCAGGGTGGCAGAGAGAAGGTTC 1140
361 -A--A--A--A--A--A--A--A--A--T--P--S--P--R--V--A--E--R--R--F- 380
1141 AGG ATA TCG CTG CCA TGG CCT CTC CGG GCT GCG TTT GGT GGC CAG GCG GAG AGC AGC AAT 1200
1141 AGGATATCGCTGCCATGGCCTCTCCGGGCTGCGTTTGGTGGCCAGGCGGAGAGCAGCAAT 1200
381 -R--I--S--L--P--W--P--L--R--A--A--F--G--G--Q--A--E--S--S--N- 400
1201 CCT ACC AAC CAG GAT CCT GTT GGT GGC TCT GGC TCT GGC TCT GGT GCT GGC AAC AAC AAT 1260
1201 CCTACCAACCAGGATCCTGTTGGTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTGCTGGCAACAACAAT 1260
401 -P--T--N--Q--D--P--V--G--G--S--G--S--G--S--G--A--G--N--N--N- 420
1261 GCG ACT GAC AGT CAT CAT GGC TAC GAT GAT CTG GAC TGA 1299
1261 GCGACTGACAGTCATCATGGCTACGATGATCTGGACTGA 1299
421 -A--T--D--S--H--H--G--Y--D--D--L--D--*- 432
.
.
This website requires cookies, and the limited processing of your personal data in order to function. By using the site you are agreeing to this as outlined in our Privacy Policy and Terms of Use