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Oryza brachyantha (Oryza_brachyantha.v1.4b)
Location
About this transcript

This transcript has 2 exons and is annotated with 27 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene OB06G10110 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtFlags
-OB06G10110.11299432aa
 
Protein coding
J3MAG7 Ensembl Canonical
Codons
  • Alternating codons
  • Alternating codons
Exons
  • An exon
  • Another exon
Variants
  • loading
Other
  • UTR
Markup
  • loading
                                                                          
     1 ATGCAGTACATGGGTCTAGTAGGAAAGTGGGCCTCGGTTCGAGATCCTTCTGGGAGCAGG     60
     1 ATGCAGTACATGGGTCTAGTAGGAAAGTGGGCCTCGGTTCGAGATCCTTCTGGGAGCAGG     60
     1 -M--Q--Y--M--G--L--V--G--K--W--A--S--V--R--D--P--S--G--S--R-     20

                                                                          
    61 AGGCTATGGCCCACTGTCAGTGACAGCAGGTGGACACGTACACGCCATCTCCTCCTCTTC    120
    61 AGGCTATGGCCCACTGTCAGTGACAGCAGGTGGACACGTACACGCCATCTCCTCCTCTTC    120
    21 -R--L--W--P--T--V--S--D--S--R--W--T--R--T--R--H--L--L--L--F-     40

                                                                          
   121 TTCTTCTTCTCCTCGATCTCATACCTTCTCCCCTTCCTCCCAATTTCCCAAAGACTTTGG    180
   121 TTCTTCTTCTCCTCGATCTCATACCTTCTCCCCTTCCTCCCAATTTCCCAAAGACTTTGG    180
    41 -F--F--F--S--S--I--S--Y--L--L--P--F--L--P--I--S--Q--R--L--W-     60

                                                                          
   181 TGCAGGGAGGGAGGGCGACAGATTGGTTTGGTAGCAGTTGAGTTGCTGAATTCTTTCTTC    240
   181 TGCAGGGAGGGAGGGCGACAGATTGGTTTGGTAGCAGTTGAGTTGCTGAATTCTTTCTTC    240
    61 -C--R--E--G--G--R--Q--I--G--L--V--A--V--E--L--L--N--S--F--F-     80

                                                                          
   241 TATCTAGCTCTAGCTCCCATCGGTATCGGGCTCCTCCATTTTCCGGCGGCGGCGGCGGCC    300
   241 TATCTAGCTCTAGCTCCCATCGGTATCGGGCTCCTCCATTTTCCGGCGGCGGCGGCGGCC    300
    81 -Y--L--A--L--A--P--I--G--I--G--L--L--H--F--P--A--A--A--A--A-    100

                                                                          
   301 ATGTCGTCTGCGGCTCATCCGCAGCGCTTCTACTGCCATCAGTGCGAACGCAACGTCCCC    360
   301 ATGTCGTCTGCGGCTCATCCGCAGCGCTTCTACTGCCATCAGTGCGAACGCAACGTCCCC    360
   101 -M--S--S--A--A--H--P--Q--R--F--Y--C--H--Q--C--E--R--N--V--P-    120

                                                                          
   361 ATCGCCCCGCCCACCTCCCCCGACGCCGACGTCCTCTGCCCGCTCTGCGGTGGAGGATTC    420
   361 ATCGCCCCGCCCACCTCCCCCGACGCCGACGTCCTCTGCCCGCTCTGCGGTGGAGGATTC    420
   121 -I--A--P--P--T--S--P--D--A--D--V--L--C--P--L--C--G--G--G--F-    140

                                                                          
   421 GTCGAGGAGGCGGGGCTTGGGGAGGGCACTAACCCTAGCCCACACCCTGCCGCCTTCCTG    480
   421 GTCGAGGAGGCGGGGCTTGGGGAGGGCACTAACCCTAGCCCACACCCTGCCGCCTTCCTG    480
   141 -V--E--E--A--G--L--G--E--G--T--N--P--S--P--H--P--A--A--F--L-    160

                                                                          
   481 CCACACCCCTTCTTCCCCTTTGCCTCCCCTTCCTTCGATCTCCGCCACCCTAGCGACCTC    540
   481 CCACACCCCTTCTTCCCCTTTGCCTCCCCTTCCTTCGATCTCCGCCACCCTAGCGACCTC    540
   161 -P--H--P--F--F--P--F--A--S--P--S--F--D--L--R--H--P--S--D--L-    180

                                                                          
   541 AACGCCTTCTTCGGCCCCCCCTCCCCCGCGCCCGCGCCCGCACCTTCGGCATCCACCCAC    600
   541 AACGCCTTCTTCGGCCCCCCCTCCCCCGCGCCCGCGCCCGCACCTTCGGCATCCACCCAC    600
   181 -N--A--F--F--G--P--P--S--P--A--P--A--P--A--P--S--A--S--T--H-    200

                                                                          
   601 TTCGACCCCTCCAACTTCCTCCATGACCATTTCACCGGCCTCCTCTCTGGCGGCGCCACC    660
   601 TTCGACCCCTCCAACTTCCTCCATGACCATTTCACCGGCCTCCTCTCTGGCGGCGCCACC    660
   201 -F--D--P--S--N--F--L--H--D--H--F--T--G--L--L--S--G--G--A--T-    220

                                                                          
   661 ATCCAGATCGTCCTCGAGGGCTCCTCCGCTTCCTTCCCCGGTGCCTCCTCCGGGATCAGC    720
   661 ATCCAGATCGTCCTCGAGGGCTCCTCCGCTTCCTTCCCCGGTGCCTCCTCCGGGATCAGC    720
   221 -I--Q--I--V--L--E--G--S--S--A--S--F--P--G--A--S--S--G--I--S-    240

                                                                          
   721 CTCGGCGACTACTTTGTCGGCTCCGGCCTCGAGCAGCTCATCCAGCAGCTCGCTGAGAAC    780
   721 CTCGGCGACTACTTTGTCGGCTCCGGCCTCGAGCAGCTCATCCAGCAGCTCGCTGAGAAC    780
   241 -L--G--D--Y--F--V--G--S--G--L--E--Q--L--I--Q--Q--L--A--E--N-    260

                                                                          
   781 GATCCCAACCGCTACGGCACCCCTCCTGCCGCCAAGTCCGCTGTCGCCGCACTCCCTGAC    840
   781 GATCCCAACCGCTACGGCACCCCTCCTGCCGCCAAGTCCGCTGTCGCCGCACTCCCTGAC    840
   261 -D--P--N--R--Y--G--T--P--P--A--A--K--S--A--V--A--A--L--P--D-    280

                                                                          
   841 GTCGCCGTCTCCGCCGACATGATGGCCGCCGATGGAGGGGCCCAGTGCGCCGTCTGCATG    900
   841 GTCGCCGTCTCCGCCGACATGATGGCCGCCGATGGAGGGGCCCAGTGCGCCGTCTGCATG    900
   281 -V--A--V--S--A--D--M--M--A--A--D--G--G--A--Q--C--A--V--C--M-    300

                                                                          
   901 GACGACTTCCACCTTGGCGCTGATGCCAAGCAGCTCCCCTGCAAACATGTCTTCCACAAG    960
   901 GACGACTTCCACCTTGGCGCTGATGCCAAGCAGCTCCCCTGCAAACATGTCTTCCACAAG    960
   301 -D--D--F--H--L--G--A--D--A--K--Q--L--P--C--K--H--V--F--H--K-    320

                                                                          
   961 GATTGCATCCTCCCCTGGCTCGACCTGCACAGCTCCTGCCCCGTTTGCCGCTTTGAGCTG   1020
   961 GATTGCATCCTCCCCTGGCTCGACCTGCACAGCTCCTGCCCCGTTTGCCGCTTTGAGCTG   1020
   321 -D--C--I--L--P--W--L--D--L--H--S--S--C--P--V--C--R--F--E--L-    340

                                                                          
  1021 CCCACAGATGACCCTGACCACGGCCACCGCCGGGGATCTGACCAGCCCACCGCAGCAGCA   1080
  1021 CCCACAGATGACCCTGACCACGGCCACCGCCGGGGATCTGACCAGCCCACCGCAGCAGCA   1080
   341 -P--T--D--D--P--D--H--G--H--R--R--G--S--D--Q--P--T--A--A--A-    360

                                                                          
  1081 GCAGCAGCAGCAGCTGCAGCTGCCGCCACCCCTTCGCCCAGGGTGGCAGAGAGAAGGTTC   1140
  1081 GCAGCAGCAGCAGCTGCAGCTGCCGCCACCCCTTCGCCCAGGGTGGCAGAGAGAAGGTTC   1140
   361 -A--A--A--A--A--A--A--A--A--T--P--S--P--R--V--A--E--R--R--F-    380

                                                                          
  1141 AGGATATCGCTGCCATGGCCTCTCCGGGCTGCGTTTGGTGGCCAGGCGGAGAGCAGCAAT   1200
  1141 AGGATATCGCTGCCATGGCCTCTCCGGGCTGCGTTTGGTGGCCAGGCGGAGAGCAGCAAT   1200
   381 -R--I--S--L--P--W--P--L--R--A--A--F--G--G--Q--A--E--S--S--N-    400

                                                                          
  1201 CCTACCAACCAGGATCCTGTTGGTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTGCTGGCAACAACAAT   1260
  1201 CCTACCAACCAGGATCCTGTTGGTGGCTCTGGCTCTGGCTCTGGTGCTGGCAACAACAAT   1260
   401 -P--T--N--Q--D--P--V--G--G--S--G--S--G--S--G--A--G--N--N--N-    420

                                                                          
  1261 GCGACTGACAGTCATCATGGCTACGATGATCTGGACTGA                        1299
  1261 GCGACTGACAGTCATCATGGCTACGATGATCTGGACTGA                        1299
   421 -A--T--D--S--H--H--G--Y--D--D--L--D--*-                         432