Oryza brachyantha (Oryza_brachyantha.v1.4b) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 4: 13,632,265-13,636,773 reverse strand.
This transcript has 11 exons and is annotated with 17 domains and features.
This transcript is a product of gene OB04G25580 Show transcript tableHide transcript table
.
1 GAAGCATTGGAGAATTTTAATCATAAATTGACATGTGAAGGAGGAGGAGGCAGACTACCT 60 ............................................................ ............................................................ 61 GTAACTAAAATAATTTCAGTTGGATAATATGGTTGACATAAACCCTGATCACATTTTTGA 120 ............................ATGGTTGACATAAACCCTGATCACATTTTTGA 32 ............................-M--V--D--I--N--P--D--H--I--F--E 11 121 GGTTCCTGACACTCCTGACCGGATACAACAGTCAACATGCCCTGTATCTAGCCCAGCTGC 180 33 GGTTCCTGACACTCCTGACCGGATACAACAGTCAACATGCCCTGTATCTAGCCCAGCTGC 92 11 --V--P--D--T--P--D--R--I--Q--Q--S--T--C--P--V--S--S--P--A--A 31 181 TAGGAGAGGTATCACAAAAGCAGCTGGAAATCCATTTCCACCCCGAAGAATTAGATTTAA 240 93 TAGGAGAGGTATCACAAAAGCAGCTGGAAATCCATTTCCACCCCGAAGAATTAGATTTAA 152 31 --R--R--G--I--T--K--A--A--G--N--P--F--P--P--R--R--I--R--F--K 51 241 GATCCCGAATAGCTCCATCCATGGTCAATCAAGTAGAGACAATGCATCTAGTGTGCCACC 300 153 GATCCCGAATAGCTCCATCCATGGTCAATCAAGTAGAGACAATGCATCTAGTGTGCCACC 212 51 --I--P--N--S--S--I--H--G--Q--S--S--R--D--N--A--S--S--V--P--P 71 301 TGCTCCTTTAGATGCTGGTGATATTTTTAAACAGGCCGAATTGGCACGGTTGCTGCCAGT 360 213 TGCTCCTTTAGATGCTGGTGATATTTTTAAACAGGCCGAATTGGCACGGTTGCTGCCAGT 272 71 --A--P--L--D--A--G--D--I--F--K--Q--A--E--L--A--R--L--L--P--V 91 361 AGAAGACCCTGAAGCAAGATCTACCTCGCTAAAATCAGGTAGGACTATAGGGACATCTGC 420 273 AGAAGACCCTGAAGCAAGATCTACCTCGCTAAAATCAGGTAGGACTATAGGGACATCTGC 332 91 --E--D--P--E--A--R--S--T--S--L--K--S--G--R--T--I--G--T--S--A 111 421 TGAGACTGGAAAAGGGCCTGAAAAACTTGGTTTGGAACAGAGCAGGAACATCTCAAACAA 480 333 TGAGACTGGAAAAGGGCCTGAAAAACTTGGTTTGGAACAGAGCAGGAACATCTCAAACAA 392 111 --E--T--G--K--G--P--E--K--L--G--L--E--Q--S--R--N--I--S--N--N 131 481 TATAAATTCCAGGTGCCAAATCAGAAAAGAGGAGCTTAGTTCACGAGATGCAAATCGCAA 540 393 TATAAATTCCAGGTGCCAAATCAGAAAAGAGGAGCTTAGTTCACGAGATGCAAATCGCAA 452 131 --I--N--S--R--C--Q--I--R--K--E--E--L--S--S--R--D--A--N--R--N 151 541 CAATGCTGGTTTTCTTGGTGTAGGATCAGGTATTCCTACCACGGTCGGAGAACCACGAAA 600 453 CAATGCTGGTTTTCTTGGTGTAGGATCAGGTATTCCTACCACGGTCGGAGAACCACGAAA 512 151 --N--A--G--F--L--G--V--G--S--G--I--P--T--T--V--G--E--P--R--N 171 601 CAGAATGGGGACTATTACTTTTAATAAGTTGAAGGAAGTAGTAGGTGCAGATGTTTGTTC 660 513 CAGAATGGGGACTATTACTTTTAATAAGTTGAAGGAAGTAGTAGGTGCAGATGTTTGTTC 572 171 --R--M--G--T--I--T--F--N--K--L--K--E--V--V--G--A--D--V--C--S 191 661 AGTATCAAGTTTCAGAGAGGACAAAGGGGAAGAGACCACTGACAAGGGCACTACAGGACT 720 573 AGTATCAAGTTTCAGAGAGGACAAAGGGGAAGAGACCACTGACAAGGGCACTACAGGACT 632 191 --V--S--S--F--R--E--D--K--G--E--E--T--T--D--K--G--T--T--G--L 211 721 TTCAAGCTCTACACTGAGCATTGTTCCTCGAAGGCATGTGGGCCAAAGAAAGCTGGTGCG 780 633 TTCAAGCTCTACACTGAGCATTGTTCCTCGAAGGCATGTGGGCCAAAGAAAGCTGGTGCG 692 211 --S--S--S--T--L--S--I--V--P--R--R--H--V--G--Q--R--K--L--V--R 231 781 GAATGGTTGTATTTCTCCCTCCAACATAGCCAAAAGAAGTCTGAAAGTTGACGAAAAACG 840 693 GAATGGTTGTATTTCTCCCTCCAACATAGCCAAAAGAAGTCTGAAAGTTGACGAAAAACG 752 231 --N--G--C--I--S--P--S--N--I--A--K--R--S--L--K--V--D--E--K--R 251 841 AGAAATGTGCTCTACAAGTCGACTCTTACGCTATCCAGATAATGAGGTTGATGTTTTTGA 900 753 AGAAATGTGCTCTACAAGTCGACTCTTACGCTATCCAGATAATGAGGTTGATGTTTTTGA 812 251 --E--M--C--S--T--S--R--L--L--R--Y--P--D--N--E--V--D--V--F--E 271 901 GAAGGGAAACGTGATAGATCTTACGGATAACTCACCTGCAATAAGAAGGCAGGGTAACAC 960 813 GAAGGGAAACGTGATAGATCTTACGGATAACTCACCTGCAATAAGAAGGCAGGGTAACAC 872 271 --K--G--N--V--I--D--L--T--D--N--S--P--A--I--R--R--Q--G--N--T 291 961 TTCAACTGATATGGAAAAAAGGTCAGGGAGAAAGTTGGCAATACCCAGAGCTGGGGAGGC 1020 873 TTCAACTGATATGGAAAAAAGGTCAGGGAGAAAGTTGGCAATACCCAGAGCTGGGGAGGC 932 291 --S--T--D--M--E--K--R--S--G--R--K--L--A--I--P--R--A--G--E--A 311 1021 TGTAATTCCACTGGCTGCAAATCAAGTAAACAGTAGCATTTTTTCTGAAGGTAGTAACAG 1080 933 TGTAATTCCACTGGCTGCAAATCAAGTAAACAGTAGCATTTTTTCTGAAGGTAGTAACAG 992 311 --V--I--P--L--A--A--N--Q--V--N--S--S--I--F--S--E--G--S--N--S 331 1081 TAAAGGAAAAGAAATTTCCCATGATGGCATGAGTGGTAAGCAGTCTGGAGAGGCTTATAT 1140 993 TAAAGGAAAAGAAATTTCCCATGATGGCATGAGTGGTAAGCAGTCTGGAGAGGCTTATAT 1052 331 --K--G--K--E--I--S--H--D--G--M--S--G--K--Q--S--G--E--A--Y--I 351 1141 CAGAAGGGTTTGTCCAAGATCCATGGGAGATTCTTCTTCTGTTGCAAACAATGACCACAC 1200 1053 CAGAAGGGTTTGTCCAAGATCCATGGGAGATTCTTCTTCTGTTGCAAACAATGACCACAC 1112 351 --R--R--V--C--P--R--S--M--G--D--S--S--S--V--A--N--N--D--H--T 371 1201 TGGTATATATTCTGAGCATTGTTGGAGAACAACACACAATAATACAAGTATATTGCCCAT 1260 1113 TGGTATATATTCTGAGCATTGTTGGAGAACAACACACAATAATACAAGTATATTGCCCAT 1172 371 --G--I--Y--S--E--H--C--W--R--T--T--H--N--N--T--S--I--L--P--M 391 1261 GTCACTATCAGGAGACAACAATAACTCAATTAATGGAGCAGACAACAATAATTCAATTGA 1320 1173 GTCACTATCAGGAGACAACAATAACTCAATTAATGGAGCAGACAACAATAATTCAATTGA 1232 391 --S--L--S--G--D--N--N--N--S--I--N--G--A--D--N--N--N--S--I--D 411 1321 TGGAGCAACCACATTGCAGACTGCAACTGTTAATAAAACAATAAGGATCAGTAATAGAAA 1380 1233 TGGAGCAACCACATTGCAGACTGCAACTGTTAATAAAACAATAAGGATCAGTAATAGAAA 1292 411 --G--A--T--T--L--Q--T--A--T--V--N--K--T--I--R--I--S--N--R--K 431 1381 GAGGAAGCACATCCCAAGTTCTTACCATCCTGCTGAAAGCTCTAGTTCTTTAGATCAACC 1440 1293 GAGGAAGCACATCCCAAGTTCTTACCATCCTGCTGAAAGCTCTAGTTCTTTAGATCAACC 1352 431 --R--K--H--I--P--S--S--Y--H--P--A--E--S--S--S--S--L--D--Q--P 451 1441 TAGAGTTGCATCATTGGGCTCAACATCTGCTAGAAATCGTATCACACACCGTTGTCATAT 1500 1353 TAGAGTTGCATCATTGGGCTCAACATCTGCTAGAAATCGTATCACACACCGTTGTCATAT 1412 451 --R--V--A--S--L--G--S--T--S--A--R--N--R--I--T--H--R--C--H--I 471 1501 TCCTGTAGTGGATATTGATGACATATGCTCTCCTGAAGTTAGATCTACTTCAAGTGGGAT 1560 1413 TCCTGTAGTGGATATTGATGACATATGCTCTCCTGAAGTTAGATCTACTTCAAGTGGGAT 1472 471 --P--V--V--D--I--D--D--I--C--S--P--E--V--R--S--T--S--S--G--I 491 1561 TGATGGCAGCAATCAAACCTTGGTAGATCCTAACATAAGAGAACAATTGGAGTCTGATGA 1620 1473 TGATGGCAGCAATCAAACCTTGGTAGATCCTAACATAAGAGAACAATTGGAGTCTGATGA 1532 491 --D--G--S--N--Q--T--L--V--D--P--N--I--R--E--Q--L--E--S--D--E 511 1621 GTTATTGGCTCGCCAACTTCAGGAGCAGCTTTACAATGAAACTCCTCATGTTGTTCCTGC 1680 1533 GTTATTGGCTCGCCAACTTCAGGAGCAGCTTTACAATGAAACTCCTCATGTTGTTCCTGC 1592 511 --L--L--A--R--Q--L--Q--E--Q--L--Y--N--E--T--P--H--V--V--P--A 531 1681 GGAAGAGATCGATGCAATCATAGCAATGTCACTTCAAAATGAAGAGAATGCACAGCAAAC 1740 1593 GGAAGAGATCGATGCAATCATAGCAATGTCACTTCAAAATGAAGAGAATGCACAGCAAAC 1652 531 --E--E--I--D--A--I--I--A--M--S--L--Q--N--E--E--N--A--Q--Q--T 551 1741 ATCTAGAGCTACGAGGCGGTTCCAAAACACTACGAGAGGTACACGGGTAATGCGTTCAAG 1800 1653 ATCTAGAGCTACGAGGCGGTTCCAAAACACTACGAGAGGTACACGGGTAATGCGTTCAAG 1712 551 --S--R--A--T--R--R--F--Q--N--T--T--R--G--T--R--V--M--R--S--S 571 1801 TGCTTCCCAGCATGCTAATAGGGTTGTATATGACTCAGCAAACAGAAGAACAATTTACCA 1860 1713 TGCTTCCCAGCATGCTAATAGGGTTGTATATGACTCAGCAAACAGAAGAACAATTTACCA 1772 571 --A--S--Q--H--A--N--R--V--V--Y--D--S--A--N--R--R--T--I--Y--Q 591 1861 GAGAGTTCTTTCCAGATACCCTGCTGCACATATTCAACCCAATATTGATTTAAACGATTA 1920 1773 GAGAGTTCTTTCCAGATACCCTGCTGCACATATTCAACCCAATATTGATTTAAACGATTA 1832 591 --R--V--L--S--R--Y--P--A--A--H--I--Q--P--N--I--D--L--N--D--Y 611 1921 TGATGCGCTGCTTGCATTAGATGAAAATAACCACCAGCATGCTGGTGCATCAGAAAGTCA 1980 1833 TGATGCGCTGCTTGCATTAGATGAAAATAACCACCAGCATGCTGGTGCATCAGAAAGTCA 1892 611 --D--A--L--L--A--L--D--E--N--N--H--Q--H--A--G--A--S--E--S--Q 631 1981 GATAAATAATTTACCTCAGTCGGTAGTCCAGTCAAATAACATTGAAGAGCCGTGTGCAGT 2040 1893 GATAAATAATTTACCTCAGTCGGTAGTCCAGTCAAATAACATTGAAGAGCCGTGTGCAGT 1952 631 --I--N--N--L--P--Q--S--V--V--Q--S--N--N--I--E--E--P--C--A--V 651 2041 TTGTCTTGAAAATCCCTCTATTGGAGATACGATCCGTCGTTTGCCATGCTTTCACATGTT 2100 1953 TTGTCTTGAAAATCCCTCTATTGGAGATACGATCCGTCGTTTGCCATGCTTTCACATGTT 2012 651 --C--L--E--N--P--S--I--G--D--T--I--R--R--L--P--C--F--H--M--F 671 2101 CCATAAAGAGTGCATAGACGAATGGCTACGAAGAAAGAAACTATGCCCAGTTTGTAAGTC 2160 2013 CCATAAAGAGTGCATAGACGAATGGCTACGAAGAAAGAAACTATGCCCAGTTTGTAAGTC 2072 671 --H--K--E--C--I--D--E--W--L--R--R--K--K--L--C--P--V--C--K--S 691 2161 TGGGATCACATAAAGGTAATCAATGCATCTCCATGATTGATTATTCTGTTCGCAGACCCG 2220 2073 TGGGATCACATAA............................................... 2085 691 --G--I--T--*-............................................... 694 2221 AGAGAACAGAAGGAAGTCACCTGCAACAGTGGGGTTGTGTTTCATCTTTAGACAGTGGTA 2280 ............................................................ ............................................................ 2281 CTGTCGAGTGGTTGCAACTTGCAATCTTGCAGAGCCTTGTTCTACTGCCTTCGGTGCCAA 2340 ............................................................ ............................................................ 2341 TACTCTGTTTTGTAGGTTTAGGCACAATATTTTGTATATCTATAATTTTCATTCACCAAT 2400 ............................................................ ............................................................ 2401 TGGCAAACAAGGGAAATAGTCGATTAATCTTGCCTGTCACAGCAAGACATGATGAAAATG 2460 ............................................................ ............................................................ 2461 TG 2462 .. ..
.
.
Ensembl Plants release 60 - October 2024 © EMBL-EBI EMBL-EBI
.
.
![[RSS logo]](/i/rss_icon_16.png "Ensembl blog"){kind=icon}
![[twitter logo]](/i/twitter.png "Follow us on Twitter!")
