Oryza brachyantha (Oryza_brachyantha.v1.4b) ▼ 
Summary
SequenceProtein InformationProtein summaryDomains & featuresVariantsPDB 3D protein modelAlphaFold predicted modelGenetic VariationVariant tableVariant imagePopulation comparisonComparison imageExternal ReferencesGeneral identifiersOligo probesSupporting evidenceID HistoryTranscript historyProtein history.
Chromosome 3: 19,387,778-19,393,186 reverse strand.
This transcript has 8 exons and is annotated with 19 domains and features.
This transcript is a product of gene OB03G34650 Show transcript tableHide transcript table
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1 ATGGTGAAGCGGGAGCTGCTCGCCAGGTGCATGACGTGCCCACTCTGCAACCGCCTCCTC 60 1 ATGGTGAAGCGGGAGCTGCTCGCCAGGTGCATGACGTGCCCACTCTGCAACCGCCTCCTC 60 1 -M--V--K--R--E--L--L--A--R--C--M--T--C--P--L--C--N--R--L--L- 20 61 CGCGACGCCACCACCGTCTCCGAGTGCCTACACACCTTCTGCAGAAAGTGTATATATGAG 120 61 CGCGACGCCACCACCGTCTCCGAGTGCCTACACACCTTCTGCAGAAAGTGTATATATGAG 120 21 -R--D--A--T--T--V--S--E--C--L--H--T--F--C--R--K--C--I--Y--E- 40 121 AAGTTGAATGATGAGGAGGTAGAGTCCTGCCCGGTTTGTAAAATAGATCTTGGCTGCACT 180 121 AAGTTGAATGATGAGGAGGTAGAGTCCTGCCCGGTTTGTAAAATAGATCTTGGCTGCACT 180 41 -K--L--N--D--E--E--V--E--S--C--P--V--C--K--I--D--L--G--C--T- 60 181 CCAGTTGAAAAGCTTAGGGCTGATCACAATATACAAGATGTAAGATCGAAAATATTTCCA 240 181 CCAGTTGAAAAGCTTAGGGCTGATCACAATATACAAGATGTAAGATCGAAAATATTTCCA 240 61 -P--V--E--K--L--R--A--D--H--N--I--Q--D--V--R--S--K--I--F--P- 80 241 TTCAAAAGAAAGAAGATTAGGGCCGAAGAAGTTGCAGCTCCTATTTTACTTCCCAGTAAA 300 241 TTCAAAAGAAAGAAGATTAGGGCCGAAGAAGTTGCAGCTCCTATTTTACTTCCCAGTAAA 300 81 -F--K--R--K--K--I--R--A--E--E--V--A--A--P--I--L--L--P--S--K- 100 301 AGGAAAGAGAGATCTATCTCTTCTTTGGTAGTTGATGCACCTATAGTGACACCAACAGGT 360 301 AGGAAAGAGAGATCTATCTCTTCTTTGGTAGTTGATGCACCTATAGTGACACCAACAGGT 360 101 -R--K--E--R--S--I--S--S--L--V--V--D--A--P--I--V--T--P--T--G- 120 361 TTGACTGGGCGACGGACAAGAGCAGTTACAAGGAAAGCTGCTGCCTTGCGTCTTGTTACA 420 361 TTGACTGGGCGACGGACAAGAGCAGTTACAAGGAAAGCTGCTGCCTTGCGTCTTGTTACA 420 121 -L--T--G--R--R--T--R--A--V--T--R--K--A--A--A--L--R--L--V--T- 140 421 GATGATCCTGTGAAAAAGGAAACTGATAATGGTGAAAAGCATGCTCAGAACTCAAGCTTG 480 421 GATGATCCTGTGAAAAAGGAAACTGATAATGGTGAAAAGCATGCTCAGAACTCAAGCTTG 480 141 -D--D--P--V--K--K--E--T--D--N--G--E--K--H--A--Q--N--S--S--L- 160 481 TCCGCTAATTCGGGCAAAGTGCCACAAACAAGAAGACAGATGTTGGCCAATGCAGAGACA 540 481 TCCGCTAATTCGGGCAAAGTGCCACAAACAAGAAGACAGATGTTGGCCAATGCAGAGACA 540 161 -S--A--N--S--G--K--V--P--Q--T--R--R--Q--M--L--A--N--A--E--T- 180 541 TCAAACCATTCCTCTAATAAAGATACCGAAGGTGATCGCAAGGATCTGGCAGATAAGGCT 600 541 TCAAACCATTCCTCTAATAAAGATACCGAAGGTGATCGCAAGGATCTGGCAGATAAGGCT 600 181 -S--N--H--S--S--N--K--D--T--E--G--D--R--K--D--L--A--D--K--A- 200 601 GATGAGCTCTGGAGACCTTTAAATTGTTTGGTAGAAGCCGCAAACAGGACAAAATCGTTC 660 601 GATGAGCTCTGGAGACCTTTAAATTGTTTGGTAGAAGCCGCAAACAGGACAAAATCGTTC 660 201 -D--E--L--W--R--P--L--N--C--L--V--E--A--A--N--R--T--K--S--F- 220 661 AGATCAAGTTCACAGAGTCCAATTGTTAAGAGAGAGCAACTGAGTGACTCTCTTGGGAGC 720 661 AGATCAAGTTCACAGAGTCCAATTGTTAAGAGAGAGCAACTGAGTGACTCTCTTGGGAGC 720 221 -R--S--S--S--Q--S--P--I--V--K--R--E--Q--L--S--D--S--L--G--S- 240 721 ACATCTGTTAACAAAACAAAATCTAGGGAACATCTGCAGAAATCCAAATTAGAGGATGAC 780 721 ACATCTGTTAACAAAACAAAATCTAGGGAACATCTGCAGAAATCCAAATTAGAGGATGAC 780 241 -T--S--V--N--K--T--K--S--R--E--H--L--Q--K--S--K--L--E--D--D- 260 781 AAGAAAGATGTTCCTTTGCTAAAAAGGAAAAATCAAAGGACTGGGCGGAGGAGAGAACTT 840 781 AAGAAAGATGTTCCTTTGCTAAAAAGGAAAAATCAAAGGACTGGGCGGAGGAGAGAACTT 840 261 -K--K--D--V--P--L--L--K--R--K--N--Q--R--T--G--R--R--R--E--L- 280 841 CATGCCCCATCCGATAAAAAGCCTGACGTTGCAGCTATGCAAAATGAAAAGAAGTTCAGT 900 841 CATGCCCCATCCGATAAAAAGCCTGACGTTGCAGCTATGCAAAATGAAAAGAAGTTCAGT 900 281 -H--A--P--S--D--K--K--P--D--V--A--A--M--Q--N--E--K--K--F--S- 300 901 TCTATATGGTTTTCGCTTGTTGCGTCATTTGAACAGGAAGGAGAGCCACCTTTACCACAA 960 901 TCTATATGGTTTTCGCTTGTTGCGTCATTTGAACAGGAAGGAGAGCCACCTTTACCACAA 960 301 -S--I--W--F--S--L--V--A--S--F--E--Q--E--G--E--P--P--L--P--Q- 320 961 ATACCTTCCCAGTATTTGCGAATAAAAGATGGAAACATACCTGCCTCATCAATCCAGAAG 1020 961 ATACCTTCCCAGTATTTGCGAATAAAAGATGGAAACATACCTGCCTCATCAATCCAGAAG 1020 321 -I--P--S--Q--Y--L--R--I--K--D--G--N--I--P--A--S--S--I--Q--K- 340 1021 TACCTCATGCAGAAGCTCGGCCTTCCTAGTGAGGCAGAGGTTGAAATAAATTGCTGCGGA 1080 1021 TACCTCATGCAGAAGCTCGGCCTTCCTAGTGAGGCAGAGGTTGAAATAAATTGCTGCGGA 1080 341 -Y--L--M--Q--K--L--G--L--P--S--E--A--E--V--E--I--N--C--C--G- 360 1081 CAGCCTGTGAACCCTACACAACCTCTGTGCAATTTAGTAGAGCTGTGGCTGAGGGGACGA 1140 1081 CAGCCTGTGAACCCTACACAACCTCTGTGCAATTTAGTAGAGCTGTGGCTGAGGGGACGA 1140 361 -Q--P--V--N--P--T--Q--P--L--C--N--L--V--E--L--W--L--R--G--R- 380 1141 TCAACACAGATGACACAGACCATGATAGGCTCCCCTGCCAAAGAGTTTGTAATGGTGCTT 1200 1141 TCAACACAGATGACACAGACCATGATAGGCTCCCCTGCCAAAGAGTTTGTAATGGTGCTT 1200 381 -S--T--Q--M--T--Q--T--M--I--G--S--P--A--K--E--F--V--M--V--L- 400 1201 ACTTATGGACGGCCAAAGGCCATTGCACCATGAATGGCTACACAAGGCTCAACCATCTTT 1260 1201 ACTTATGGACGGCCAAAGGCCATTGCACCATGA........................... 1233 401 -T--Y--G--R--P--K--A--I--A--P--*-........................... 410 1261 TCACTGAAAGGTGGGTCCCGTTTCCTGCTTATTGGCAGCCATTTGTTGGGCCAATGGAAG 1320 ............................................................ ............................................................ 1321 AAGAAGAGGTCATCCAAGATAAGCCTTAGTACCTGATACATACATAGGCTCGCAAGTCAG 1380 ............................................................ ............................................................ 1381 AATGTGGCTGGCTCAGCTGGCAGCCAGCCCTTGGCGTCGCATTCATGAATTCATTGATGC 1440 ............................................................ ............................................................ 1441 TATTCGATTCCATTAAGATGTCTTTTTCTTACACTATTTATTATACAAAAATGTGTAAAG 1500 ............................................................ ............................................................ 1501 ATTAACAAAAAAATATGGCTGTGAATTATACCTGTAGGCATTGTTGATGTTTAGGTTGGT 1560 ............................................................ ............................................................ 1561 TATAGAGAGGCATTTGCTTTGTAAGAGATGACTAGACTGGATTGCAAATTGTCTTTGGGC 1620 ............................................................ ............................................................ 1621 CGTATTATTAATTTTTGTAACAGTAGATCTCTATCTTTAAGCTCGTCGAATGGAAACAGT 1680 ............................................................ ............................................................ 1681 TTCATGACTAATATCTTTAGAAGCAAGCAC 1710 .............................. ..............................
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