Oryza brachyantha (Oryza_brachyantha.v1.4b)
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About this transcript

This transcript has 12 exons and is annotated with 14 domains and features.

Gene

This transcript is a product of gene OB03G13660 Show transcript tableHide transcript table

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NameTranscript IDbpProteinBiotypeUniProtRefSeqFlags
-OB03G13660.1894297aa
 
Protein coding
J3LJZ0 -Ensembl Canonical
Variants
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     1 ATGGAGATGGACCTGGCAATCGAGCAGTACGGGTGTGTGCATTACAGGAGGAAATGCAAG     60
     1 ATGGAGATGGACCTGGCAATCGAGCAGTACGGGTGTGTGCATTACAGGAGGAAATGCAAG     60
     1 -M--E--M--D--L--A--I--E--Q--Y--G--C--V--H--Y--R--R--K--C--K-     20

                                                                          
    61 ATAAGGGCGCCCTGCTGCGGCGAGGTCTTCGGTTGCAGGCACTGCCACAACGAAGTGAAG    120
    61 ATAAGGGCGCCCTGCTGCGGCGAGGTCTTCGGTTGCAGGCACTGCCACAACGAAGTGAAG    120
    21 -I--R--A--P--C--C--G--E--V--F--G--C--R--H--C--H--N--E--V--K-     40

                                                                          
   121 GACTCGTTGGAGGTCAGCATCAGCGACCGCCACGAGATCCCTCGCCATGAAATCAAGCTG    180
   121 GACTCGTTGGAGGTCAGCATCAGCGACCGCCACGAGATCCCTCGCCATGAAATCAAGCTG    180
    41 -D--S--L--E--V--S--I--S--D--R--H--E--I--P--R--H--E--I--K--L-     60

                                                                          
   181 GTTATCTGCTCTGTTTGCAACAAAGAACAGGATGTACAACAGGATTGCTCAAATTGCGGG    240
   181 GTTATCTGCTCTGTTTGCAACAAAGAACAGGATGTACAACAGGATTGCTCAAATTGCGGG    240
    61 -V--I--C--S--V--C--N--K--E--Q--D--V--Q--Q--D--C--S--N--C--G-     80

                                                                          
   241 GCATGCCTGGGTAAATATTTCTGTGCAAAATGCAACTTTTATGATGATGATCTGTCAAAG    300
   241 GCATGCCTGGGTAAATATTTCTGTGCAAAATGCAACTTTTATGATGATGATCTGTCAAAG    300
    81 -A--C--L--G--K--Y--F--C--A--K--C--N--F--Y--D--D--D--L--S--K-    100

                                                                          
   301 AACCAATTTCATTGTGATGGATGCGGCATATGTAGAACTGGTGGTGCAGAGAATTTCTTT    360
   301 AACCAATTTCATTGTGATGGATGCGGCATATGTAGAACTGGTGGTGCAGAGAATTTCTTT    360
   101 -N--Q--F--H--C--D--G--C--G--I--C--R--T--G--G--A--E--N--F--F-    120

                                                                          
   361 CACTGTGACAAATGTGGATGTTGCTATAGCTATGTGCTGAAGGATTCTCATCGTTGTGTG    420
   361 CACTGTGACAAATGTGGATGTTGCTATAGCTATGTGCTGAAGGATTCTCATCGTTGTGTG    420
   121 -H--C--D--K--C--G--C--C--Y--S--Y--V--L--K--D--S--H--R--C--V-    140

                                                                          
   421 GAGAGAGCAATGCATCACAACTGCCCTGTATGCTTCGAGTATTTATTTGACTCGACAAAA    480
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   141 -E--R--A--M--H--H--N--C--P--V--C--F--E--Y--L--F--D--S--T--K-    160

                                                                          
   481 GACATCAGTGCACTGCACTGTGGACACACGATTCATCTGGAATGCCTATACGAGTTAAGA    540
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   161 -D--I--S--A--L--H--C--G--H--T--I--H--L--E--C--L--Y--E--L--R-    180

                                                                          
   541 TCCCATAAACAGTTTTCATGCCCAGTCTGCCTGAGGTCTGCTTGTGACATGTCCCATGCA    600
   541 TCCCATAAACAGTTTTCATGCCCAGTCTGCCTGAGGTCTGCTTGTGACATGTCCCATGCA    600
   181 -S--H--K--Q--F--S--C--P--V--C--L--R--S--A--C--D--M--S--H--A-    200

                                                                          
   601 TGGCAAAAGCTTGATCAAGAGGTTGCAGCATCACCGATGCCAGCGATTTATCAGAAGAAG    660
   601 TGGCAAAAGCTTGATCAAGAGGTTGCAGCATCACCGATGCCAGCGATTTATCAGAAGAAG    660
   201 -W--Q--K--L--D--Q--E--V--A--A--S--P--M--P--A--I--Y--Q--K--K-    220

                                                                          
   661 ATGGTATGTGAATCCGGTCACTTTCGTTCTTCAGTTAAACCAGGTAAGTATATGCTGAAC    720
   661 ATGGTATGTGAATCCGGTCACTTTCGTTCTTCAGTTAAACCAGGTAAGTATATGCTGAAC    720
   221 -M--V--C--E--S--G--H--F--R--S--S--V--K--P--G--K--Y--M--L--N-    240

                                                                          
   721 AAAAAATGTTTTGGTTATTTTGGATGCAGATATGGATCCTTTGCAACGATTGCCGGAAGA    780
   721 AAAAAATGTTTTGGTTATTTTGGATGCAGATATGGATCCTTTGCAACGATTGCCGGAAGA    780
   241 -K--K--C--F--G--Y--F--G--C--R--Y--G--S--F--A--T--I--A--G--R-    260

                                                                          
   781 CATCAAACGTGCAGTTTCACATCTTGGGACACAAGTGCCCCGGATGCAGCTCTTACAACA    840
   781 CATCAAACGTGCAGTTTCACATCTTGGGACACAAGTGCCCCGGATGCAGCTCTTACAACA    840
   261 -H--Q--T--C--S--F--T--S--W--D--T--S--A--P--D--A--A--L--T--T-    280

                                                                          
   841 CCCGGCAGACCAGAGGCGACCCGGCGGCATGCTCCAGAGTCTGAAGAACAGTGA          894
   841 CCCGGCAGACCAGAGGCGACCCGGCGGCATGCTCCAGAGTCTGAAGAACAGTGA          894
   281 -P--G--R--P--E--A--T--R--R--H--A--P--E--S--E--E--Q--*-          297